• развитие вегетативной нервной системы • среднего мозга-заднего мозга граница морфогенез • регуляция транскрипции ДНК-шаблонных • Развитие таламуса • заднего мозга развитие • транскрипции от РНК - полимеразы II промотор • трубки морфогенез • транскрипции ДНК-шаблонных • развитие нервной системы • Развитие мозжечка • мозжечковая пролиферация предшественников гранулярных клеток • ведение аксонов • развитие нейронов переднего мозга • развитие границ среднего и заднего мозга • развитие ромбомера 2 • морфогенез внутреннего уха • миграция клеток нервного гребня • ветвление, участвующее в морфогенезе кровеносных сосудов • клеточная пролиферация • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция развития нервной системы
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
2637
14472
Ансамбль
ENSG00000168505
ENSMUSG00000034486
UniProt
P52951
P48031
RefSeq (мРНК)
NM_001485 NM_001301687
NM_010262
RefSeq (белок)
NP_001288616 NP_001476
NP_034392
Расположение (UCSC)
Chr 2: 236.17 - 236.17 Мб
Chr 1: 89.93 - 89.93 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Гомеобоксные белки Gbx2 является белком , который в организме человека кодируется Gbx2 геном . [5] [6] [7]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Резюме
2 Функция
3 Исследования на животных
4 ссылки
5 Дальнейшее чтение
Резюме [ править ]
Гаструляционный мозг Homeobox 2, или широко известный как GBX2, представляет собой тип фактора транскрипции, который помогает в организации среднего и заднего мозга во время гаструляции. Задний мозг разбивается на семь или восемь ромбомеров во время гаструляции, а GBX2 отвечает за ромбомеры с первого по третий. GBX2 также принимает участие в передаче сигналов и экспрессии других генов. Было сказано, что существует пороговое требование для количества GBX2, поэтому то, что происходит, зависит от выраженной суммы. Напр., Определенные количества GBX2 необходимы для регуляции формирования переднего и заднего паттернов в заднем мозге. Если конкретный порог не достигнут, формирование паттерна не происходит. Так обстоит дело с другими генами, которые он помогает экспрессировать, как FGF8. С каждым геном связаны определенные заболевания.Мелкоклеточная карцинома толстой кишки и синдром Optiz-Gbbb, которые вызывают аномалии по всей средней линии тела, являются заболеваниями, наиболее тесно связанными с геном GBX2.[8]
Функция [ править ]
Гомеобокс 2 головного мозга (GBX2) представляет собой ген гомеобокса , участвующий в нормальном развитии ромбомеров 1-3, которые являются областью среднего / заднего мозга. Этот ген является зависимым от дозы фактором транскрипции, участвующим в регуляции правильной экспрессии других генов. Экспрессия GBX2 происходит во время гаструляции и продолжает экспрессироваться на более поздних стадиях эмбриогенеза . На этих различных этапах GBX2 отвечает за несколько важных процессов. В нервной пластинкестадия GBX2 необходима для того, чтобы передние предшественники заднего мозга выжили и сформировались правильно. Также на этой стадии развития GBX2 необходим для правильной регуляции экспрессии различных генов, необходимой для раннего установления паттерна A / P в нервной пластинке. На ранних стадиях морфогенеза головного мозга GBX2 необходим как для нормального развития переднего заднего мозга, так и для правильного формирования организатора среднего / заднего мозга. Из-за воздействия на организатор среднего / заднего мозга GBX2 участвует в позиционировании домена экспрессии истмического FGF8.. Поскольку это ген, зависящий от дозы, различное количество гена, присутствующего в определенном месте, может вызывать разные результаты. На FGF8 влияют разные дозировки в том месте, где он экспрессируется. Отсутствие GBX2 вызывает сдвиг экспрессии FGF8 каудально, а избыточная экспрессия GBX2 вызывает сдвиг экспрессии FGF8 рострально. Не все ромбомеры, в которых экспрессируется GBX2, требуют одинаковой строгости регулирования дозы. Из трех ромбомеров 2 предъявляются самые строгие требования к дозировке.
Исследования на животных [ править ]
Нокаут гена GBX2 вызывает неспособность сформироваться многих структур, таких как истмические ядра, мозжечок, двигательный нерв V и многие другие производные ромбомеров 1-3. Эмбрионы с нокаутом гена GBX2 будут продолжать развиваться и достигнут доношенной беременности. Дети рождаются, но если экспрессия GBX2 отсутствует, все они умирают вскоре после рождения. [9] [10]
Нокдаун гена gbx2 приводит к усечению передней части заднего мозга, а также к аномальным скоплениям клеточных тел в r2 и r3, которые связаны с проблемами в черепном нерве V. Было показано, что любые структуры, полученные из r1-r3, будут подвергаться неблагоприятному воздействию мутации или недостатки в gbx2. Эти структуры включают дугу аорты и правую подключичную артерию, которые при неправильном развитии могут привести к сердечно-сосудистым дефектам в дополнение к черепно-лицевым дефектам из-за неправильного развития черепного нерва V. [11]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000168505 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034486 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Kowenz-Leutz Е, г - н Р, Нисс К, Leutz А (октябрь 1997). «Ген гомеобокса GBX2, мишень онкогена myb, опосредует аутокринный рост и дифференцировку моноцитов». Cell . 91 (2): 185–95. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80401-8 . PMID 9346236 . S2CID 15954797 .
↑ Lin X, Swaroop A, Vaccarino FM, Murtha MT, Haas M, Ji X, Ruddle FH, Leckman JF (февраль 1996 г.). «Характеристика и анализ последовательности гена GBX2, содержащего гомеобокс человека». Геномика . 31 (3): 335–42. DOI : 10.1006 / geno.1996.0056 . PMID 8838315 .
^ Waters, ST «Пороговое требование для уровней Gbx2 в развитии заднего мозга». Развитие, т. 133, нет. 10, 2006, стр. 1991–2000., DOI: 10.1242 / dev.02364.
^ Wassarman KM, Lewandoski M, Campbell K, Джойнер А.Л., Рубинштейн JL, Мартинес S, Мартин GR (август 1997). «Спецификация переднего заднего мозга и создание нормального организатора среднего / заднего мозга зависит от функции гена Gbx2». Развитие . 124 (15): 2923–34. PMID 9247335 .
^ Waters ST, Lewandoski M (май 2006). «Пороговое требование для уровней Gbx2 в развитии заднего мозга» . Развитие . 133 (10): 1991–2000. DOI : 10.1242 / dev.02364 . PMID 16651541 .
^ Накаяма Y, Kikuta Н, Канеи М, Ёшикава К, КАВАМУРА А, Кобаяши К, Ван Z, Хан А, Каваками К, Yamasu К (2013). «Gbx2 функционирует как репрессор транскрипции, чтобы регулировать спецификацию и морфогенез соединения среднего и заднего мозга в зависимости от дозы и стадии» . Механизмы развития . 130 (11–12): 532–52. DOI : 10.1016 / j.mod.2013.07.004 . PMID 23933069 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Берроуз-Гарсия Дж., Ситтараман В., Чандрасекхар А., Waters ST (апрель 2011 г.). «Эволюционно законсервированная функция Gbx2 в развитии переднего заднего мозга» . Динамика развития . 240 (4): 828–38. DOI : 10.1002 / dvdy.22589 . PMID 21360792 . S2CID 19225250 .
Heimbucher T, Murko C, Bajoghli B., Aghaallaei N, Huber A, Stebegg R, Eberhard D, Fink M, Simeone A, Czerny T. (январь 2007 г.). «Gbx2 и Otx2 взаимодействуют с доменом WD40 корепрессоров Groucho / Tle» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (1): 340–51. DOI : 10.1128 / MCB.00811-06 . PMC 1800652 . PMID 17060451 .
Глинский Г.В., Березовская О., Глинский А.Б. (июнь 2005 г.). «Анализ микроматрицы идентифицирует сигнатуру смерти от рака, предсказывающую неэффективность терапии у пациентов с несколькими типами рака» . Журнал клинических исследований . 115 (6): 1503–21. DOI : 10.1172 / JCI23412 . PMC 1136989 . PMID 15931389 .
Гао А.С., Лу В., Айзекс Дж. Т. (февраль 2000 г.). «Повышенная экспрессия GBX2 стимулирует рост клеток рака предстательной железы человека посредством усиления транскрипции гена интерлейкина 6». Клинические исследования рака . 6 (2): 493–7. PMID 10690529 .
Гао А.С., Лу В., Айзекс Дж. Т. (апрель 1998 г.). «Подавление экспрессии гомеобокса гена GBX2 ингибирует клоногенную способность и онкогенность рака предстательной железы человека». Исследования рака . 58 (7): 1391–4. PMID 9537237 .
Мацуи Т., Хираи М., Хирано М., Куросава Ю. (декабрь 1993 г.). «Комплекс HOX, соседствующий с геном EVX, а также два других гомеобокс-содержащих гена, класс GBX и класс EN, расположены на тех же хромосомах 2 и 7 у человека». Письма FEBS . 336 (1): 107–10. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (93) 81620-F . PMID 7903253 . S2CID 34546387 .
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также дефицит фактора транскрипции / корегулятора
Эта статья о гене на хромосоме 2 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .