Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
GCM1
Белок GCM1 PDB 1odh.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1ODH

Идентификаторы
ПсевдонимыGCM1 , GCMA, hGCMa, в глиальных клетках отсутствует гомолог 1, в глиальных клетках отсутствует фактор транскрипции 1
Внешние идентификаторыOMIM : 603715 MGI : 108045 HomoloGene : 2702 GeneCards : GCM1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человека) [1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение GCM1
Геномное расположение GCM1
Группа6п12.1Начинать53 126 961 п.н. [1]
Конец53 148 841 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 9 (мышь)
Chr.Хромосома 9 (мышь) [2]
Хромосома 9 (мышь)
Геномное расположение GCM1
Геномное расположение GCM1
Группа9 E1 | 9 43,49 смНачинать78 051 924 п.н. [2]
Конец78 065 624 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE GCM1 206269 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с ДНК
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• Связывание с ионами цинка
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК -связывающий активатора транскрипции активность, РНК - полимеразы II , специфичные
• транскрипционный фактор связывания
• гистондеацетилазу связывания
• ион металла связывания
• ГО: 0000980 РНК - полимеразы цис-регуляторной области ДНК последовательности специфических II связывания
• ГО: связывание белка 0001948
• ГО: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент• комплекс регуляторов транскрипции
• ядро клетки
Биологический процесс• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• морфогенез анатомической структуры
• позитивная регуляция образования синцития путем слияния плазматической мембраны
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция, ДНК-шаблон
• развитие многоклеточного организма
• ветвление, участвующее в морфогенезе лабиринтного слоя
• обязательство судьбы астроцита
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• глиогенез
• регуляция дифференцировки клеток, участвующих в развитии эмбриональной плаценты
• дифференцировка клеток, участвующих в развитии эмбриональной плаценты
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

8521

14531

Ансамбль

ENSG00000137270

ENSMUSG00000023333

UniProt

Q9NP62

P70348

RefSeq (мРНК)

NM_003643

NM_008103

RefSeq (белок)

NP_003634

NP_032129

Расположение (UCSC)Chr 6: 53.13 - 53.15 МбChr 9: 78.05 - 78.07 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Хорион-специфический фактор транскрипции GCMa является белком , который, в организме человека , кодируется GCM1 геном . [5] [6]

Этот ген кодирует ДНК-связывающий белок с мотивом gcm ( отсутствующий мотив глиальной клетки ). Кодируемый белок является гомологом отсутствующего гена глиальных клеток дрозофилы (gcm). Этот белок связывается с GCM-мотивом (A / G) CCCGCAT, новой последовательностью среди известных мишеней ДНК-связывающих белков. N-концевой ДНК-связывающий домен обеспечивает уникальную ДНК-связывающую активность этого белка. [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000137270 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023333 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Akiyama Y, Hosoya T, Poole AM, Hotta Y (январь 1997 г.). «Мотив gcm: новый ДНК-связывающий мотив, консервативный у дрозофилы и млекопитающих» . Proc Natl Acad Sci USA . 93 (25): 14912–6. DOI : 10.1073 / pnas.93.25.14912 . PMC 26236 . PMID 8962155 .  
  6. ^ a b «Ген Entrez: глиальные клетки GCM1, у которых отсутствует гомолог 1 (Drosophila)» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Ямада К., Огава Х., Хонда С. и др. (1999). «Белок с мотивом GCM участвует в специфической для плаценты экспрессии гена ароматазы человека» . J. Biol. Chem . 274 (45): 32279–86. DOI : 10.1074 / jbc.274.45.32279 . PMID  10542267 .
  • Nait-Oumesmar B, Copperman AB, Lazzarini RA (2000). «Плацентарная экспрессия и хромосомная локализация гена Gcm 1 человека» . J. Histochem. Cytochem . 48 (7): 915–22. DOI : 10.1177 / 002215540004800704 . PMID  10858268 .
  • Ямада К., Огава Х., Тамия Г. и др. (2001). «Геномная организация, хромосомная локализация и полная последовательность ДНК в 22 т.п.н. человеческого GCMa / GCM1, гена плацентоспецифического фактора транскрипции». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 278 (1): 134–9. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.3775 . PMID  11071865 .
  • Ю Ц., Шен К., Лин М. и др. (2003). «GCMa регулирует опосредованное синцитином слияние трофобластов» . J. Biol. Chem . 277 (51): 50062–8. DOI : 10.1074 / jbc.M209316200 . PMID  12397062 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека» . Природа . 425 (6960): 805–11. Bibcode : 2003Natur.425..805M . DOI : 10,1038 / природа02055 . PMID  14574404 .
  • Chen CP, Chen CY, Yang YC и др. (2005). «Снижение экспрессии гена GCM1 плаценты (отсутствие глиальных клеток) при преэклампсии». Плацента . 25 (5): 413–21. DOI : 10.1016 / j.placenta.2003.10.014 . PMID  15081636 .
  • Бачик Д., Саткунаратнам А., Наит-Оумесмар Б. и др. (2004). «Сложные паттерны мРНК и белка GCM1 в ворсинчатых и вневорсинчатых клетках трофобласта плаценты человека». Плацента . 25 (6): 553–9. DOI : 10.1016 / j.placenta.2003.12.004 . PMID  15135239 .
  • Шуберт С.В., Кардаш Э., Хан М.А. и др. (2005). «Взаимодействие, кооперативная модуляция промотора и почечная колокализация GCMa и Pitx2» . J. Biol. Chem . 279 (48): 50358–65. DOI : 10.1074 / jbc.M404587200 . PMID  15385555 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Ян Ч.С., Ю Ц., Чуанг Х.С. и др. (2005). «FBW2 нацелен на GCMa в систему деградации убиквитин-протеасома» . J. Biol. Chem . 280 (11): 10083–90. DOI : 10.1074 / jbc.M413986200 . PMID  15640526 .
  • Knerr I, Schubert SW, Wich C, et al. (2005). «Стимуляция GCMa и синцитина с помощью цАМФ-опосредованной передачи сигналов PKA в человеческих трофобластических клетках в нормоксических и гипоксических условиях» . FEBS Lett . 579 (18): 3991–8. DOI : 10.1016 / j.febslet.2005.06.029 . PMID  16004993 . S2CID  46648257 .
  • Чанг Ч.В., Чуанг Х.С., Ю Ц. и др. (2005). «Стимуляция транскрипционной активности GCMa с помощью передачи сигналов циклического AMP / протеинкиназы A приписывается CBP-опосредованному ацетилированию GCMa» . Мол. Клетка. Биол . 25 (19): 8401–14. DOI : 10.1128 / MCB.25.19.8401-8414.2005 . PMC  1265739 . PMID  16166624 .
  • Чуанг ХК, Чанг Ч.В., Чанг Г.Д. и др. (2006). «Гистоновая деацетилаза 3 связывается с фактором транскрипции GCMa и регулирует его» . Nucleic Acids Res . 34 (5): 1459–69. DOI : 10.1093 / NAR / gkl048 . PMC  1401512 . PMID  16528103 .
  • Фудзито Н., Самура О, Михару Н. и др. (2007). «Увеличение количества мРНК плаценты 1 (PLAC1) и глиальных клеток 1 (GCM1) у матерей с преэклампсией». Hiroshima J. Med. Sci . 55 (1): 9–15. PMID  16594548 .
  • Чжоу С.К., Чанг С., Лю Дж. Х. и др. (2007). «Небольшая модификация убиквитин-подобного модификатора регулирует активность связывания ДНК глиальной клетки, у которой отсутствует гомолог a Drosophila». J. Biol. Chem . 282 (37): 27239–49. DOI : 10.1074 / jbc.M700351200 . PMID  17646165 .


  • v
  • т
  • е