Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
GLI3
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4BLD

Идентификаторы
ПсевдонимыGLI3 , ACLS, GCPS, GLI3-190, GLI3FL, PAP-A, PAPA, PAPA1, PAPB, PHS, PPDIV, цинковый палец семейства GLI 3
Внешние идентификаторыOMIM: 165240 MGI: 95729 HomoloGene: 139 Генные карты : GLI3
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек) [1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение GLI3
Геномное расположение GLI3
Группа7п14.1Начинать41 960 949 п.н. [1]
Конец42 237 870 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 13 (мышь)
Chr.Хромосома 13 (мышь) [2]
Хромосома 13 (мышь)
Геномное расположение GLI3
Геномное расположение GLI3
Группа13 A1 | 13 5,43 смНачинать15 463 235 п.н. [2]
Конец15 730 026 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE GLI3 205201 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, РНК специфично для полимеразы II
• связывание гистондеацетилазы
• связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II
• связывание с ионами металла
• GO: 0000980 Цис-регуляторная область РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности связывание ДНК
• связывание бета-катенина
• связывание хроматина
• GO: 0001948 Связывание с белками
• Связывание с гистонацетилтрансферазой
• Связывание с нуклеиновой кислотой
• Связывание с ДНК
• Последовательно-специфическое связывание ДНК
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II
• Связывание медиаторного комплекса
Сотовый компонент• цитоплазма
• цитозоль
• комплекс репрессора транскрипции
• ядро клетки
• ядерное пятнышко
• проекция клетки
• медиаторный комплекс
• ресничка
• аксонема GO: 0035085
• нуклеоплазма
• основание ресничек
• верхушка ресничек
Биологический процесс• морфогенез эмбриональной скелетной системы
• процесс спецификации паттерна
• развитие латерального полукружного канала
• негативная регуляция дифференцировки нейронов
• дифференцировка Т-клеток в тимусе
• развитие языка
• морфогенез носа
• морфогенез зрительного нерва
• сглаженный сигнальный путь, участвующий в спецификации интернейронов вентрального спинного мозга
• анатомическая структура образование, участвующее в морфогенезе
• дифференцировка олигодендроцитов
• морфогенез задней кишки
• формирование дорсального / вентрального паттерна спинного мозга
• процесс апоптоза тимоцитов
• развитие молочной железы
• развитие конечностей
• одонтогенез дентинсодержащего зуба
• позитивная регуляция дифференцировки хондроцитов
• эмбриональный морфогенез пищеварительного тракта
• развитие внутреннего уха
• развитие метанефроса
• дифференцировка меланоцитов
• негативная регуляция канонического пути передачи сигналов Wnt
• негативная регуляция пролиферация клеток
• регуляция апоптотического процесса
• позитивная регуляция пролиферации нейробластов
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• морфогенез конечности
• отрицательное регулирование сглаженного сигнального пути
• развитие почки
• развития легких
• развития трубки
• развития эмбриональных органов
• боковой ганглионарный бугорок пролиферации клеток
• негативной регуляции клеточной дифференцировки
• эмбриональная цифры морфогенез
• отрицательное регулирование альфа-бета - дифференцировки Т - клеток
• в эмбриональное развитие матки
• транскрипция, ДНК-шаблон
• отрицательный отбор Т-лимфоцитов тимуса
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• развитие сердца
• развитие центральной нервной системы
• развитие конечного мозга
• ветвление, участвующее в морфогенезе зачатка мочеточника
• эмбриональный морфогенез конечности
• развитие нервной трубки
• позитивная регуляция импорта белка в ядро
• сглаживание сигнальных путей
• развитие глазного типа по типу камеры
• дифференциация двигательных нейронов спинного мозга
• положительная регуляция дифференцировки альфа-бета Т-клеток
• морфогенез ламбдовидного шва
• регуляция развития костей
• развитие неба
• формирование проксимального / дистального паттерна
• развитие анатомической структуры
• заживление ран
• негативная регуляция апоптотического процесса
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• ответ на эстроген
• миграция, управляемая радиальной глией коры головного мозга
• позитивная регуляция дифференцировки остеобластов
• рост в процессе развития
• паллий развитие
• спецификация молочной железы
• морфогенез фронтального шва
• развитие переднего полукружного канала
• регуляция экспрессии генов
• отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• формирование дорсального / вентрального паттерна
• морфогенез ветвления эпителиальной трубки
• эмбриональное развитие пищеварительного тракта
• развитие субпаллиума
• морфогенез сагиттального шва
• формирование дорсального / вентрального паттерна переднего мозга
• обработка белков
• управление аксонами
• развитие мозга
• сглаженный сигнальный путь, участвующий в формировании паттерна дорсальной / вентральной нервной трубки
• дифференцировка радиальных глиальных клеток переднего мозга
• регуляция пролиферации клеток
• сглаженный сигнальный путь, участвующий в спецификации судьбы клеток моторных нейронов спинного мозга
• формирование слоя в коре головного мозга
• эмбриональный морфогенез
• развитие артерий
• дифференцировка клеток, участвующих в развитии почек
• регуляция дифференцировки клеток
• развитие переднего мозга
• обязательство судьбы нейрона
• развитие гиппокампа
• тип камеры морфогенез глаза
• спецификация переднего / заднего паттернов
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• развитие предстательной железы
• регенерация печени
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

2737

14634

Ансамбль

ENSG00000106571

ENSMUSG00000021318

UniProt

P10071

Q61602

RefSeq (мРНК)

NM_000168

NM_008130

RefSeq (белок)

NP_000159

NP_032156

Расположение (UCSC)Chr 7: 41.96 - 42.24 МбChr 13: 15.46 - 15.73 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Цинковый палец белка Gli3 является белком , который в организме человека кодируется Gli3 гена . [5] [6]

Этот ген кодирует белок, который принадлежит к подклассу белков « цинковых пальцев» C2H2-типа семейства Gli. Они характеризуются как ДНК-связывающие факторы транскрипции и являются медиаторами передачи сигналов Sonic hedgehog (Shh) . Белок, кодируемый этим геном, локализуется в цитоплазме и активирует экспрессию гена патченного гомолога дрозофилы ( PTCH1 ). Также считается, что он играет роль во время эмбриогенеза . [6]

Роль в развитии [ править ]

Gli3 является известным репрессором транскрипции, но также может иметь положительную транскрипционную функцию. [7] [8] Gli3 репрессирует dHand и Gremlin , которые участвуют в развитии пальцев . [9] Имеются данные о том, что Shh- контролируемый процессинг (например, расщепление) регулирует транскрипционную активность Gli3 аналогично активности Ci . [8] Мутантные мыши Gli3 имеют множество аномалий, включая дефекты ЦНС и легких, а также полидактилию конечностей . [10] [11] [12] [13][14] В развивающихся зачатках конечностей мышей дерепрессия Gli3 преимущественно регулирует гены-мишени Shh. [15]

Ассоциация болезней [ править ]

Мутации в этом гене были связаны с несколькими заболеваниями, включая синдром цефалополисиндактилии Грейга, синдром Паллистера-Холла, преаксиальную полидактилию типа IV и постаксиальную полидактилию типов A1 и B. [6] Изменения числа копий ДНК, которые способствуют увеличению конверсии онкогенов. Gli1–3 в активаторы транскрипции с помощью сигнального пути Hedgehog включены в общегеномный паттерн, который, как было установлено, коррелирует с исходом для пациентов с астроцитомой. [16] [17]

Имеются данные о том, что аутосомно- доминантное заболевание синдром цефалополисиндактилии Грейга (GCPS), которое влияет на развитие конечностей и черепно-лицевых органов у людей , вызвано транслокациями в гене GLI3. [18]

Взаимодействие с Gli1 и Gli2 [ править ]

Независимый суперэкспрессия Gli1 и Gli2 в мышах моделей приводят к образованию базально - клеточный рак (BCC). Показано, что нокаут Gli1 ведет к подобным эмбриональным уродствам, что и сверхэкспрессия Gli1, но не к образованию BCC. Сверхэкспрессия Gli3 у трансгенных мышей и лягушек не приводит к развитию BCC-подобных опухолей и, как полагают, не играет роли в образовании BCC опухоли . [19]

Сверхэкспрессия Gli1 и Gli2 приводит к образованию BCC в моделях мышей, и в обоих случаях была предложена одноэтапная модель образования опухоли. Это также указывает на то, что избыточная экспрессия Gli1 и / или Gli2 жизненно важна для образования BCC. Совместная сверхэкспрессия Gli1 с Gli2 и Gli2 с Gli3 ведет к порокам развития и смерти трансгенных мышей, соответственно, но не к образованию BCC. Это предполагает, что избыточная экспрессия более чем одного белка Gli не является необходимой для образования BCC.

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что GLI3 взаимодействует с CREBBP [20] SUFU , [21] ZIC1 , [22] и ZIC2 . [22]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000106571 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021318 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Ruppert JM, Фогельштейна B, Arheden K, Кинзлер KW (октябрь 1990). «GLI3 кодирует белок массой 190 килодальтон с множеством областей сходства с GLI» . Молекулярная и клеточная биология . 10 (10): 5408–15. DOI : 10.1128 / mcb.10.10.5408 . PMC 361243 . PMID 2118997 .  
  6. ^ a b c «Ген Энтреса: GLI3, член семьи GLI-Круппеля, GLI3 (синдром цефалополисиндактилии Грейга)» .
  7. ^ Taipale J, Бичи PA (май 2001). «Пути передачи сигналов Hedgehog и Wnt при раке». Природа . 411 (6835): 349–54. Bibcode : 2001Natur.411..349T . DOI : 10.1038 / 35077219 . PMID 11357142 . S2CID 4414768 .  
  8. ^ a b Джейкоб Дж, Бриско Дж (август 2003 г.). «Белки Gli и контроль формирования паттерна спинного мозга» . EMBO Reports . 4 (8): 761–5. DOI : 10.1038 / sj.embor.embor896 . PMC 1326336 . PMID 12897799 .  
  9. ^ те Велшер П., Фернандес-Теран М., Рос М.А., Зеллер Р. (февраль 2002 г.). «Взаимный генетический антагонизм с участием GLI3 и dHAND формирует паттерн мезенхимы зачатка конечностей позвоночных до передачи сигналов SHH» . Гены и развитие . 16 (4): 421–6. DOI : 10,1101 / gad.219202 . PMC 155343 . PMID 11850405 .  
  10. Перейти ↑ Rash BG, Grove EA (октябрь 2007 г.). "Моделирование спинного мозга: роль звукового ежа?" . Журнал неврологии . 27 (43): 11595–603. DOI : 10.1523 / jneurosci.3204-07.2007 . PMC 6673221 . PMID 17959802 .  
  11. ^ Франц Т (1994). «Гомозиготные мутантные мыши Extra-toes (Xt) демонстрируют роль гена Gli-3 в развитии переднего мозга». Acta Anatomica . 150 (1): 38–44. DOI : 10.1159 / 000147600 . PMID 7976186 . 
  12. ↑ Grove EA, Tole S, Limon J, Yip L, Ragsdale CW (июнь 1998 г.). «Подол эмбриональной коры головного мозга определяется экспрессией множества генов Wnt и нарушен у Gli3-дефицитных мышей». Развитие . 125 (12): 2315–25. PMID 9584130 . 
  13. Перейти ↑ Hui CC, Joyner AL (март 1993). «Мышиная модель синдрома цефалополисиндактилии Грейга: мутация extra-toesJ содержит внутригенную делецию гена Gli3». Генетика природы . 3 (3): 241–6. DOI : 10,1038 / NG0393-241 . PMID 8387379 . S2CID 345712 .  
  14. ^ Schimmang Т, Lemaistre М, Vortkamp А, Ruther U (ноябрь 1992 г.). «Экспрессия гена цинкового пальца Gli3 нарушена в морфогенетических мутантных мышах extra-toes (Xt)». Развитие . 116 (3): 799–804. PMID 1289066 . 
  15. ^ Левандовски JP, Du F, Чжан S, Powell MB, Валькенштейн К.Н., Ji H, Vokes SA (октябрь 2015). «Пространственно-временная регуляция генов-мишеней GLI в зачатке конечностей млекопитающих» . Dev. Биол . 406 (1): 92–103. DOI : 10.1016 / j.ydbio.2015.07.022 . PMC 4587286 . PMID 26238476 .  
  16. ^ Айелло К.А., Ponnapalli С.П., Alter O (сентябрь 2018). «Математически универсальный и биологически последовательный генотип астроцитомы кодирует трансформацию и предсказывает фенотип выживания» . APL Bioengineering . 2 (3): 031909. DOI : 10,1063 / 1,5037882 . PMC 6215493 . PMID 30397684 .  
  17. ↑ Aiello KA, Alter O (октябрь 2016 г.). «Платформно-независимый геномный паттерн изменений числа копий ДНК, предсказывающий выживание астроцитомы и ответ на лечение, выявленный GSVD, сформулированный в виде сравнительного спектрального разложения» . PLOS ONE . 11 (10): e0164546. Bibcode : 2016PLoSO..1164546A . DOI : 10.1371 / journal.pone.0164546 . PMC 5087864 . PMID 27798635 .  
  18. ^ Böse J, L Grotewold, Рутером U (май 2002). «Фенотип синдрома Паллистера-Холла у мышей, мутантных по Gli3». Молекулярная генетика человека . 11 (9): 1129–35. DOI : 10.1093 / HMG / 11.9.1129 . PMID 11978771 . 
  19. ^ Dahmane Н, Ли Дж, Робинс Р, Р Геллер, Руис я Altaba А (октябрь 1997 г.). «Активация фактора транскрипции Gli1 и сигнального пути Sonic hedgehog в опухолях кожи». Природа . 389 (6653): 876–81. Bibcode : 1997Natur.389..876D . DOI : 10.1038 / 39918 . PMID 9349822 . S2CID 4424572 .  
  20. ^ Даи Р, Akimaru Н, Танака Y, Маекав Т, Nakafuku М, Ишии S (март 1999 г.). «Sonic Hedgehog-индуцированная активация промотора Gli1 опосредуется GLI3» . Журнал биологической химии . 274 (12): 8143–52. DOI : 10.1074 / jbc.274.12.8143 . PMID 10075717 . 
  21. ^ Humke EW, Дорн К.В., Milenkovic L, Скотт MP, Rohatgi R (апрель 2010). «Вывод сигналов Hedgehog контролируется динамической ассоциацией между супрессором Fused и белками Gli» . Гены и развитие . 24 (7): 670–82. DOI : 10,1101 / gad.1902910 . PMC 2849124 . PMID 20360384 .  
  22. ^ a b Коябу Ю., Наката К., Мидзугиши К., Аруга Дж., Микошиба К. (март 2001 г.). «Физические и функциональные взаимодействия между белками Zic и Gli» . Журнал биологической химии . 276 (10): 6889–92. DOI : 10.1074 / jbc.C000773200 . PMID 11238441 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о синдроме Паллистера-Холла
  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о синдроме цефалополисиндактилии Грейга
  • GLI3 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .