Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
GTF3C1
Идентификаторы
ПсевдонимыGTF3C1 , TFIIIC , TFIIIC220, TFIIICalpha, субъединица 1 общего фактора транскрипции IIIC
Внешние идентификаторыOMIM: 603246 MGI: 107887 HomoloGene: 31040 Генные карты : GTF3C1
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человека) [1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение GTF3C1
Геномное расположение GTF3C1
Группа16п12.1Начинать27 459 555 п.н. [1]
Конец27 549 913 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 7 (мышь)
Chr.Хромосома 7 (мышь) [2]
Хромосома 7 (мышь)
Геномное расположение GTF3C1
Геномное расположение GTF3C1
Группа7 F3 | 7 69,01 смНачинать125 640 954 п.н. [2]
Конец125 707 780 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE GTF3C1 202320 в формате fs.png

PBB GE GTF3C1 35671 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с ДНК
• Связывание с белком GO: 0001948
• Активность фактора транскрипции, связывание с ядерной РНК-полимеразой III
• Связывание с ДНК, специфичное для промоторной последовательности РНК-полимеразы III типа 1
• Связывание с ДНК-промоторной последовательностью РНК-полимеразы III типа 2
Сотовый компонент• комплекс фактора транскрипции TFIIIC
• ядрышко
• мембрана
• ядро клетки
• нуклеоплазма
• рибонуклеопротеин
Биологический процесс• тРНК транскрипции от РНК - полимеразы III , промотор
• рРНК транскрипции
• тРНК транскрипции
• транскрипции ДНК-шаблонный
• транскрипции от РНК - полимеразы III промотора
• регулирование транскрипции с РНК - полимеразы III промотор
• инициации транскрипции от РНК - полимеразы III , промотор
• 5S класс рРНК транскрипции от Промотор РНК-полимеразы III типа 1
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

2975

233863

Ансамбль

ENSG00000077235

ENSMUSG00000032777

UniProt

Q12789

Q8K284

RefSeq (мРНК)

NM_001286242
NM_001520

NM_207239

RefSeq (белок)

NP_001273171
NP_001511

NP_997122

Расположение (UCSC)Chr 16: 27.46 - 27.55 МбChr 7: 125,64 - 125,71 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Общий фактор транскрипции 3C полипептид 1 представляет собой белок , который у человека кодируется GTF3C1 гена . [5] [6] [7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что GTF3C1 взаимодействует с GTF3C4 . [8]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000077235 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032777 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Lagna G, R Ковельман, Sukegawa Дж, Рёдер RG (май 1994 г.). «Клонирование и характеристика эволюционно дивергентной ДНК-связывающей субъединицы TFIIIC млекопитающих» . Мол. Клетка. Биол . 14 (5): 3053–64. DOI : 10.1128 / mcb.14.5.3053 . PMC 358673 . PMID 8164661 .  
  6. ^ L'Etoile ND, Fahnestock ML, Shen Y, Aebersold R, Berk AJ (апрель 1994). «Связывающая субъединица B-бокса фактора транскрипции IIIC» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (5): 1652–6. Bibcode : 1994PNAS ... 91.1652L . DOI : 10.1073 / pnas.91.5.1652 . PMC 43221 . PMID 8127861 .  
  7. ^ «Ген Entrez: общий фактор транскрипции GTF3C1 IIIC, полипептид 1, альфа 220 кДа» .
  8. ^ Се YJ, Кунду ТК, Ван Z, Ковельман R, Рёдер RG (ноябрь 1999 г.). «Субъединица TFIIIC90 TFIIIC взаимодействует с множеством компонентов аппарата РНК-полимеразы III и обладает гистон-специфической ацетилтрансферазной активностью» . Мол. Клетка. Биол . 19 (11): 7697–704. DOI : 10.1128 / mcb.19.11.7697 . PMC 84812 . PMID 10523658 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Джанг К.Л., Коллинз М.К., Лачман Д.С. (1992). «Белок tat вируса иммунодефицита человека увеличивает транскрипцию повторяющихся последовательностей Alu человека за счет увеличения активности клеточного фактора транскрипции TFIIIC». J. Acquir. Иммунодефицит. Syndr . 5 (11): 1142–7. PMID  1403646 .
  • Ковельман Р, Рёдер РГ (1992). «Очистка и характеристика двух форм человеческого фактора транскрипции IIIC». J. Biol. Chem . 267 (34): 24446–56. PMID  1447193 .
  • Ван З., Рёдер Р.Г. (1998). «ДНК-топоизомераза I и РС4 могут взаимодействовать с TFIIIC человека, способствуя как точной терминации, так и повторной инициации транскрипции РНК-полимеразой III». Мол. Cell . 1 (5): 749–57. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80074-X . PMID  9660958 .
  • Лофтус Б.Дж., Ким Ю.Дж., Снеддон В.П., Калуш Ф., Брэндон Р., Фурманн Дж., Мейсон Т., Кросби М.Л., Барнстед М., Кронин Л., Деслаттес Мейс А., Цао И., Сюй RX, Канг Х.Л., Митчелл С., Эйхлер Э., Харрис ПК, Вентер Дж. К., Адамс Мэриленд (1999). «Дупликации генома и другие особенности в 12 Mb последовательности ДНК из хромосомы 16p и 16q человека». Геномика . 60 (3): 295–308. DOI : 10.1006 / geno.1999.5927 . PMID  10493829 .
  • Се Й.Дж., Кунду Т.К., Ван З., Ковельман Р., Рёдер Р.Г. (1999). «Субъединица TFIIIC90 TFIIIC взаимодействует с множеством компонентов аппарата РНК-полимеразы III и обладает гистон-специфической ацетилтрансферазной активностью» . Мол. Клетка. Биол . 19 (11): 7697–704. DOI : 10.1128 / mcb.19.11.7697 . PMC  84812 . PMID  10523658 .
  • Мейснер В., Томае Р., Сейфарт К.Х. (2002). «Активность фактора транскрипции IIIC1 нарушается во время дифференцировки клеток F9» . J. Biol. Chem . 277 (9): 7148–56. DOI : 10.1074 / jbc.M108721200 . PMID  11741993 .
  • Zhan Y, Hegde R, Srinivasula SM, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (2002). «Белки, содержащие эффекторный домен смерти DEDD и FLAME-3, образуют ядерные комплексы с субъединицей TFIIIC102 человеческого фактора транскрипции IIIC» . Смерть клетки отличается . 9 (4): 439–47. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4401038 . PMID  11965497 .
  • Везер С., Риман Дж., Зайфарт К. Х., Мейснер В. (2003). «Сборка и выделение промежуточных стадий транскрипционных комплексов, образованных на гене 5S рРНК человека» . Nucleic Acids Res . 31 (9): 2408–16. DOI : 10.1093 / NAR / gkg345 . PMC  154231 . PMID  12711686 .
  • Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . DOI : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC  514446 . PMID  15302935 .
  • Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. DOI : 10,1038 / НБТ1240 . PMID  16964243 . S2CID  14294292 .
  • Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983 . S2CID  7827573 .
  • Дюме-Одело Х, Марк С., Дюрье-Гайяр С., Лефевр О, Журден С., Прохазкова М., Пфлигер А., Тейхманн М. (2007). «Идентификация, молекулярное клонирование и характеристика шестой субъединицы человеческого фактора транскрипции TFIIIC» . J. Biol. Chem . 282 (23): 17179–89. DOI : 10.1074 / jbc.M611542200 . PMID  17409385 .

Внешние ссылки [ править ]

  • GTF3C1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .