Связанный с драгоценными камнями белок 5

БЛИЗНЕЦ 5

Идентификаторы

GEMIN5 , GEMIN-5, белок, связанный с ядерной органеллой драгоценного камня 5

Внешние идентификаторы

OMIM : 607005 MGI : 2449311 HomoloGene : 9155 GeneCards : GEMIN5

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 5 (человека) ^[1]

Группа	5q33.2	Начинать	154 887 411 п.н. ^[1]
Группа	5q33.2	Конец	154 938 211 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 11 (мышь) ^[2]

Группа	11 \| 11 B1.3	Начинать	58 120 002 п.н. ^[2]
Группа	11 \| 11 B1.3	Конец	58 168 539 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• мяРНК связывания • ГО: связывание белка 0001948 • РНК 7-метилгуанозин колпачок связывания • связывание мРНК 3'-UTR • связывание U1 мяРНК • U4 мяРНК связывания • U4atac мяРНК связывания • связывания рибосом • связывания РНК
Сотовый компонент	• цитоплазма • комплекс SMN • белковый комплекс SMN-Sm • цитозоль • ядерное тело • мембрана • близнецы из спиральных тел • нуклеоплазма • ядро клетки • цитозольная большая субъединица рибосомы • комплекс SMN-Gemin2
Биологический процесс	• сплайсинг мРНК через сплайсосомы • процессинг мРНК • сплайсинг РНК • сборка сплайсосомных snRNP • ядерный импорт • биосинтез белка • регуляция трансляции • сборка макромолекулярных комплексов
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


25929


216766

Ансамбль


ENSG00000082516


ENSMUSG00000037275

UniProt


Q8TEQ6


Q8BX17

RefSeq (мРНК)


NM_015465 NM_001252156


NM_001166669 NM_001166670 NM_001166671 NM_172558 NM_001374702

RefSeq (белок)


NP_001239085 NP_056280


NP_001160141 NP_001160142 NP_001160143 NP_766146 NP_001361631

Расположение (UCSC)

Chr 5: 154,89 - 154,94 Мб

Chr 11: 58.12 - 58.17 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Gem-ассоциированный белок 5 представляет собой белок , который у человека кодируется GEMIN5 гена . ^[5]^[6]

Функция [ править ]

Связанный с гемом белок 5 является частью SMN, большого белкового комплекса, локализованного как в цитоплазме, так и в ядре, который играет роль в цитоплазматической сборке малых ядерных рибонуклеопротеидов (snRNP). Другие члены этого комплекса включают SMN (MIM 600354), гем-связанный белок 2 (SIP1; MIM 602595), GEMIN3 (DDX20; MIM 606168) и GEMIN4 (MIM 606969). ^[6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что GEMIN5 взаимодействует с DDX20 ^[5]^[7] и SMN1 . ^[5]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000082516 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037275 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b c Gubitz AK, Mourelatos Z, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (февраль 2002 г.). «Gemin5, новый компонент белка с повторами WD в комплексе SMN, который связывает белки Sm» . J Biol Chem . 277 (7): 5631–6. DOI : 10.1074 / jbc.M109448200 . PMID 11714716 .
^ a b «Ген Entrez: GEMIN5 gem (ядерная органелла) связанный белок 5» .
^ Mourelatos Z, Dostie J, Paushkin S, Шарма А, Charroux В, Абель л, Rappsilber Дж, Манн М, Дреифасс G (март 2002). «miRNPs: новый класс рибонуклеопротеидов, содержащий множество микроРНК» . Genes Dev . 16 (6): 720–8. DOI : 10,1101 / gad.974702 . PMC 155365 . PMID 11914277 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Баккон Дж., Пеллиццони Л., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфусс Дж. (2002). «Идентификация и характеристика Gemin7, нового компонента выживания комплекса двигательных нейронов» . J. Biol. Chem . 277 (35): 31957–62. DOI : 10.1074 / jbc.M203478200 . PMID 12065586 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 101 (33): 12130–5. DOI : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Й, Ирие Р., Кусида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Genome Res . 16 (1): 55–65. DOI : 10.1101 / gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
Battle DJ, Lau CK, Wan L, Deng H, Lotti F, Dreyfuss G (2006). «Белок Gemin5 комплекса SMN идентифицирует мяРНК» . Мол. Cell . 23 (2): 273–9. DOI : 10.1016 / j.molcel.2006.05.036 . PMID 16857593 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. DOI : 10,1038 / NBT1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
Ким Е.К., Но КТ, Юн ДжХ, Чо ДжХ, Юн К.В., Дрейфус Дж., Чой Э.Дж. (2007). «Положительная регуляция ASK1-опосредованного пути передачи сигналов NH (2) -концевой киназы c-Jun с помощью WD-повтора белка Gemin5» . Смерть клетки отличается . 14 (8): 1518–28. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4402157 . PMID 17541429 .
Хао ле Т., Фуллер Х.Р., Лам ле Т., Ле Т.Т., Бургес А.Х., Моррис Г.Э. (2007). «Отсутствие gemin5 из комплексов SMN в ядерных тельцах Кахала» . BMC Cell Biol . 8 : 28. DOI : 10,1186 / 1471-2121-8-28 . PMC 1939999 . PMID 17640370 .
Battle DJ, Kasim M, Wang J, Dreyfuss G (2007). "SMN-независимые субъединицы комплекса SMN. Идентификация малых ядерных промежуточных звеньев сборки рибонуклеопротеидов" . J. Biol. Chem . 282 (38): 27953–9. DOI : 10.1074 / jbc.M702317200 . PMID 17640873 .

Эта статья о гене в хромосоме 5 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000082516 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037275 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11714716-5] Gubitz AK, Mourelatos Z, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (февраль 2002 г.). «Gemin5, новый компонент белка с повторами WD в комплексе SMN, который связывает белки Sm» . J Biol Chem . 277 (7): 5631–6. DOI : 10.1074 / jbc.M109448200 . PMID 11714716 .

[entrez-6] «Ген Entrez: GEMIN5 gem (ядерная органелла) связанный белок 5» .

[pmid11914277-7] Mourelatos Z, Dostie J, Paushkin S, Шарма А, Charroux В, Абель л, Rappsilber Дж, Манн М, Дреифасс G (март 2002). «miRNPs: новый класс рибонуклеопротеидов, содержащий множество микроРНК» . Genes Dev . 16 (6): 720–8. DOI : 10,1101 / gad.974702 . PMC 155365 . PMID 11914277 .

[1]