Трифункциональный фермента бета - субъединица, митохондриальная (ТР-бета) , также известный как 3-кетоацил-СоА тиолаза , ацетил-СоА - ацилтрансфераза , или бета-ketothiolase представляет собой фермент , который у человека кодируется HADHB гена . [5]
HADHB | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | HADHB , ECHB, MSTP029, MTPB, TP-BETA, гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа / 3-кетоацил-КоА-тиолаза / еноил-КоА-гидратаза (трифункциональный белок), бета-субъединица, бета-субъединица трифункционального мультиферментного комплекса гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 143450 MGI : 2136381 HomoloGene : 153 GeneCards : HADHB | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 2: 26.24 - 26.29 Мб | Chr 5: 30.16 - 30.18 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
HADHB является субъединицей митохондриального трифункционального белка и обладает тиолазной активностью.
Состав
Ген HADHB расположен на хромосоме 2 , его конкретное местоположение - 2p23. [5] Ген содержит 17 экзонов. HADHB кодирует белок 51,2 кДа, состоящий из 474 аминокислот ; 124 пептида были обнаружены с помощью данных масс-спектрометрии . [6] [7]
Функция
Этот ген кодирует бета-субъединицу митохондриального трифункционального белка, катализатора митохондриального бета-окисления длинноцепочечных жирных кислот . Белок HADHB катализирует конечную стадию бета-окисления, в котором 3-кетоацил - СоА - расщепляется тиольной группой другой молекулы коэнзима А . Тиол вставлен между С-2 и С-3, что дает молекулу ацетил-КоА и молекулу ацил-КоА , которая на два атома углерода короче.
Кодируемый белок также может связывать РНК и снижает стабильность некоторых мРНК . Гены альфа- и бета-субъединиц митохондриального трифункционального белка расположены рядом друг с другом в геноме человека в ориентации «голова к голове». [5]
Клиническое значение
Мутации в этом гене, наряду с мутациями в HADHA , приводят к трехфункциональной недостаточности белка . [5] Мутации в обоих генах имеют сходные клинические проявления. [8] Трифункциональная белковая недостаточность характеризуется сниженной активностью длинноцепочечной 3-гидроксиацил-КоА дегидрогеназы (LCHAD), длинноцепочечной еноил-КоА гидратазы и длинноцепочечной тиолазы. Этот дефицит можно разделить на 3 основных клинических фенотипа: неонатальное начало тяжелого летального состояния, приводящего к синдрому внезапной детской смерти (СВДС), [9] младенческое начало печеночного синдрома Рейе и позднее подростковое начало, в первую очередь, скелетная миопатия . [10] Кроме того, у некоторых присутствующих были симптомы, связанные с миопатией, рецидивирующим и эпизодическим рабдомиолизом и сенсомоторной аксональной нейропатией . [11] В некоторых случаях симптомы дефицита могут проявляться в виде дилатационной кардиомиопатии , застойной сердечной недостаточности и дыхательной недостаточности. Дефицит проявляется в виде водянки плода и HELLP-синдрома у плода. [12] Сложная гетерозиготная мутация гена HADHB может вызывать аксональную болезнь Шарко-Мари- Зуба , которая является неврологическим заболеванием, которое показывает, что мутации в этом гене могут приводить к дефицитам, которые присутствуют в новых формах, которые в настоящее время не описаны. [13]
Взаимодействия
HADHB является функциональной молекулярной мишенью ERα в митохондриях, и взаимодействие может играть важную роль в эстроген- опосредованном метаболизме липидов у животных и людей. [14] Кроме того, было показано, что HADHB связывается с дистальной 3'-нетранслируемой областью мРНК ренина, тем самым регулируя экспрессию белка ренина. [15]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000138029 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059447 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ а б в г «Ген Entrez: гидроксиацил-кофермент А дегидрогеназа / 3-кетоацил-кофермент А тиолаза / еноил-кофермент А гидратаза (трифункциональный белок)» .
- ^ ] Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины с помощью специализированной базы знаний» . Циркуляционные исследования . 113 (9): 1043–53. DOI : 10,1161 / CIRCRESAHA.113.301151 . PMC 4076475 . PMID 23965338 .
- ^ «Трифункциональная ферментная субъединица бета, митохондриальная» . Атлас кардиоорганических белков (COPaKB) . Архивировано из оригинала 4 марта 2016 года . Проверено 23 марта 2015 года .
- ^ Spiekerkoetter, U; Хучуа, Z; Юэ, Z; Беннетт, MJ; Штраус, AW (февраль 2004 г.). «Общая недостаточность трифункционального белка митохондрий (TFP) в результате мутаций альфа- или бета-субъединицы проявляет сходные фенотипы, поскольку мутации в любой из субъединиц изменяют экспрессию комплекса TFP и оборот субъединицы» . Педиатрические исследования . 55 (2): 190–6. DOI : 10.1203 / 01.pdr.0000103931.80055.06 . PMID 14630990 .
- ^ Sonta, SI; Сандберг, AA (1977). «Хромосомы и причинно-следственная связь рака и лейкемии человека: XXVIII. Значение подробных исследований хромосом на большом количестве клеток в ХМЛ». Американский журнал гематологии . 3 (2): 121–6. DOI : 10.1002 / ajh.2830030202 . PMID 272120 . S2CID 13141165 .
- ^ Spiekerkoetter, U; Вс, В; Хучуа, Z; Беннетт, MJ; Штраус, AW (июнь 2003 г.). «Молекулярная и фенотипическая гетерогенность митохондриальной трифункциональной белковой недостаточности из-за мутаций бета-субъединицы». Человеческая мутация . 21 (6): 598–607. DOI : 10.1002 / humu.10211 . PMID 12754706 . S2CID 85671653 .
- ^ ден Бур, Мэн; Диониси-Вичи, К; Чакрапани, А; van Thuijl, AO; Wanders, RJ; Вейбург, ФА (июнь 2003 г.). «Митохондриальная трифункциональная белковая недостаточность: тяжелое нарушение окисления жирных кислот с сердечным и неврологическим поражением». Журнал педиатрии . 142 (6): 684–9. DOI : 10.1067 / mpd.2003.231 . PMID 12838198 .
- ^ Джексон, S; Kler, RS; Бартлетт, К; Бриггс, H; Биндофф, Луизиана; Пурфарзам, М; Гарднер-Медвин, Д; Тернбулл, DM (октябрь 1992 г.). «Комбинированный ферментативный дефект митохондриального окисления жирных кислот» . Журнал клинических исследований . 90 (4): 1219–25. DOI : 10,1172 / jci115983 . PMC 443162 . PMID 1401059 .
- ^ Hong, YB; Ли, JH; Парк, JM; Choi, YR; Хен, YS; Юн, BR; Ю, JH; Ку, Н; Юнг, Южная Каролина; Чанг, кВт; Чой, Б.О. (5 декабря 2013 г.). «Сложная гетерозиготная мутация в гене HADHB вызывает аксональную болезнь Шарко-Мари-Зуба» . BMC Medical Genetics . 14 : 125. DOI : 10,1186 / 1471-2350-14-125 . PMC 4029087 . PMID 24314034 .
- ^ Чжоу, Z; Чжоу, Дж; Du, Y (июль 2012 г.). «Рецептор эстрогена альфа взаимодействует с митохондриальным белком HADHB и влияет на активность бета-окисления» . Молекулярная и клеточная протеомика . 11 (7): M111.011056. DOI : 10.1074 / mcp.m111.011056 . PMC 3394935 . PMID 22375075 .
- ^ Адамс, диджей; Беверидж, диджей; ван дер Вейден, L; Mangs, H; Лидман, П.Дж.; Моррис, Би Джей (7 ноября 2003 г.). «HADHB, HuR и CP1 связываются с дистальной 3'-нетранслируемой областью мРНК ренина человека и дифференциально модулируют экспрессию ренина» . Журнал биологической химии . 278 (45): 44894–903. DOI : 10,1074 / jbc.m307782200 . PMID 12933794 .
дальнейшее чтение
- Ван Р., Ян З., Чжу Дж. М. и др. (2006). «[Скрининг мутации G1528C в гене трифункционального белка митохондрий у беременных женщин с тяжелой преэклампсией и новорожденных]». Чжунхуа Фу Чан Кэ За Чжи . 41 (10): 672–5. PMID 17199921 .
- Aboulaich N; Вайнонен Дж. П.; Strålfors P; Венер А.В. (2004). «Векторная протеомика выявляет нацеливание, фосфорилирование и специфическую фрагментацию полимеразы I и фактора высвобождения транскрипта (PTRF) на поверхности кавеол в адипоцитах человека» . Biochem. Дж . 383 (Pt 2): 237–48. DOI : 10.1042 / BJ20040647 . PMC 1134064 . PMID 15242332 .
- Adams DJ, Beveridge DJ, van der Weyden L и др. (2003). «HADHB, HuR и CP1 связываются с дистальной 3'-нетранслируемой областью мРНК ренина человека и дифференциально модулируют экспрессию ренина» . J. Biol. Chem . 278 (45): 44894–903. DOI : 10.1074 / jbc.M307782200 . PMID 12933794 .
- Spiekerkoetter U, Khuchua Z, Yue Z и др. (2004). «Общая недостаточность трифункционального белка митохондрий (TFP) в результате мутаций альфа- или бета-субъединицы проявляет сходные фенотипы, поскольку мутации в любой из субъединиц изменяют экспрессию комплекса TFP и оборот субъединицы» . Педиатр. Res . 55 (2): 190–6. DOI : 10,1203 / 01.PDR.0000103931.80055.06 . PMID 14630990 .
- Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Genome Res . 16 (1): 55–65. DOI : 10.1101 / gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
- Богенхаген Д.Ф., Руссо Д., Берк С. (2008). «Слоистая структура нуклеоидов митохондриальной ДНК человека» . J. Biol. Chem . 283 (6): 3665–75. DOI : 10.1074 / jbc.M708444200 . PMID 18063578 .
- Миддлтон Б. (1994). «Митохондриальный длинноцепочечный трифункциональный фермент: 2-еноил-КоА-гидратаза, 3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназа и 3-оксоацил-КоА-тиолаза». Biochem. Soc. Пер . 22 (2): 427–31. DOI : 10,1042 / bst0220427 . PMID 7958339 .
- Чжао Ю., Мэн Х.М., Вэй Ю.Дж. и др. (2003). «Клонирование и характеристика новой кардиоспецифической киназы, которая специфически взаимодействует с сердечным тропонином I.». J. Mol. Med . 81 (5): 297–304. DOI : 10.1007 / s00109-003-0427-х . PMID 12721663 . S2CID 13468188 .
- Берендс К., Сова М.Э., Гиги С.П., Харпер Дж. В. (2010). «Сетевая организация системы аутофагии человека» . Природа . 466 (7302): 68–76. Bibcode : 2010Natur.466 ... 68В . DOI : 10,1038 / природа09204 . PMC 2901998 . PMID 20562859 .
- Пурэвсурэн Дж., Фукао Т., Хасегава Й. и др. (2009). «Клинические и молекулярные аспекты японских пациентов с митохондриальной трифункциональной белковой недостаточностью». Мол. Genet. Метаб . 98 (4): 372–7. DOI : 10.1016 / j.ymgme.2009.07.011 . PMID 19699128 .
- Хиллиер Л.В., Грейвс Т.А., Фултон Р.С. и др. (2005). «Создание и аннотация последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека» . Природа . 434 (7034): 724–31. Bibcode : 2005Natur.434..724H . DOI : 10,1038 / природа03466 . PMID 15815621 .
- Spiekerkoetter U, Sun B, Khuchua Z и др. (2003). «Молекулярная и фенотипическая гетерогенность митохондриальной трифункциональной белковой недостаточности из-за мутаций бета-субъединицы». Гм. Мутат . 21 (6): 598–607. DOI : 10.1002 / humu.10211 . PMID 12754706 . S2CID 85671653 .
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
- Фулд Б., Гарлатти В., Нойман Э. и др. (2010). «Структурная и функциональная характеристика рекомбинантного трифункционального белка митохондрий человека». Биохимия . 49 (39): 8608–17. DOI : 10.1021 / bi100742w . PMID 20825197 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Ibdah JA, Tein I, Dionisi-Vici C, et al. (1998). «Умеренный трифункциональный дефицит белка связан с прогрессирующей невропатией и миопатией и предполагает новую корреляцию генотип-фенотип» . J. Clin. Инвестируйте . 102 (6): 1193–9. DOI : 10.1172 / JCI2091 . PMC 509102 . PMID 9739053 .
- Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л. и др. (2003). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Biotechnol . 21 (5): 566–9. DOI : 10.1038 / nbt810 . PMID 12665801 . S2CID 23783563 .
- Хендриксон С.Л., Лаутенбергер Дж. А., Чинн Л. В. и др. (2010). «Генетические варианты в ядерно-кодируемых митохондриальных генах влияют на прогрессирование СПИДа» . PLOS ONE . 5 (9): e12862. Bibcode : 2010PLoSO ... 512862H . DOI : 10.1371 / journal.pone.0012862 . PMC 2943476 . PMID 20877624 .
- Frackowiak J, Mazur-Kolecka B, Kaczmarski W, Dickson D (2001). «Отложение бета-амилоида в сосудах при болезни Альцгеймера связано со сниженной экспрессией L-3-гидроксиацил-кофермента А дегидрогеназы (ERAB) в головном мозге». Brain Res . 907 (1–2): 44–53. DOI : 10.1016 / S0006-8993 (01) 02497-0 . PMID 11430884 . S2CID 22800813 .
Внешние ссылки
- СМИ, связанные с HADHB на Викискладе?
- HADHB + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .