• активность димеризации белка • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор транскрипции • связывание гистондеацетилазы • связывание фактора транскрипции • связывание с белком GO: 0001948 • связывание с последовательностью специфической ДНК • связывание шаперона • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфическая для РНК-полимеразы II • Связывание с N-блоком • Активность гомодимеризации белков • Связывание ДНК • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Связывание с ДНК активность фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • Активность корепрессора транскрипции GO: 0001106 • Связывание E-бокса • Связывание двухцепочечной ДНК, специфичное для последовательности
Сотовый компонент
• цитоплазма • внутриклеточное • ядро клетки • нуклеоплазма
Биологический процесс
• процесс спецификации паттерна • определение судьбы слуховых рецепторных клеток • морфогенез границы среднего и заднего мозга • организация стереоцилий рецептора внутреннего уха • негативная регуляция дифференцировки нейронов • морфогенез метанефрических канальцев нефрона • клеточный морфогенез, участвующий в дифференцировке нейронов • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • латеральное торможение • развитие клеток нервного гребня сердца, участвующих в морфогенезе тракта оттока • негативная регуляция дифференцировки стволовых клеток • дифференцировка слуховых рецепторных клеток • негативная регуляция дифференцировки про-B-клеток • негативная регуляция дифференцировки рецепторных клеток внутреннего уха • регуляция нейрогенеза • позитивная регуляция сигнального пути Notch • развитие улитки • обязательство клеточной судьбы • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие легких • негативная регуляция дифференцировки слуховых рецепторных клеток • негативная регуляция дифференцировки клеток • развитие кровеносных сосудов лабиринтного слоя • внутриутробное эмбриональное развитие • созревание клеток • развитие аденогипофиза • регуляция времени дифференцировки нейронов • регуляция дифференцировки жировых клеток • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие конечного мозга • позитивная регуляция пролиферации Т-клеток • развитие нервной трубки • развитие поджелудочной железы • морфогенез заднего мозга • сглаженный сигнальный путь • негативная регуляция дифференцировки нейроэндокринных клеток желудка • морфогенез зачатка мочеточника • регуляция дифференцировки слуховых рецепторных клеток • развитие глазодвигательного нерва • регуляция времени дифференцировки клеток • развитие нервной системы • клеточная адгезия • положительная регуляция сигнального пути BMP • развитие среднего мозга • установление полярности эпителиальных клеток • развитие гипофиза • морфогенез тела в форме запятой • поддержание популяции соматических стволовых клеток • развитие блокового нерва • морфогенез аорты • негативная регуляция дифференцировки нейронов переднего мозга • негативная регуляция дифференцировки A-клеток поджелудочной железы • регуляция пролиферации кардиобластов вторичного поля сердца • развитие общего желчного протока • развитие почечных интерстициальных фибробластов • дифференцировка радиальных глиальных клеток переднего мозга • S-образный морфогенез тела • развитие сосудистой сети клубочков • развитие печени • регуляция пролиферации эпителиальных клеток • миграция клеток • положительная регуляция транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • морфогенез межжелудочковой перегородки • негативная регуляция дифференцировки олигодендроцитов • морфогенез восходящей аорты • морфогенез тракта оттока • позитивная регуляция дифференцировки астроцитов • развитие желудочковой перегородки • развитие гладкомышечных клеток сосудов • морфогенез эмбриональной сердечной трубки • позитивная регуляция каскада JAK-STAT • сигнальный путь Notch • позитивная регуляция митотического клеточного цикла, эмбриональная • негативная регуляция транскрипции , ДНК-шаблон • развитие тимуса • позитивная регуляция связывания ДНК • негативная регуляция пролиферации глиальных клеток • поддержание популяции нейрональных стволовых клеток • положительное регулирование пролиферации клеток • негативной регуляции транскрипции с РНК - полимеразы II промотор • артерии морфогенез • глоточной морфогенез арки артерии • положительное регулирование фосфорилирования тирозина белка STAT • макромолекулярный комплекс сборки • регуляция JAK-STAT каскада • сомитогенез • дифференцировка клеток • передняя / задняя спецификация паттерна • отрицательная регуляция детерминации клеточной судьбы
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
3280
15205
Ансамбль
ENSG00000114315
ENSMUSG00000022528
UniProt
Q14469
P35428
RefSeq (мРНК)
NM_005524
NM_008235
RefSeq (белок)
NP_005515
NP_032261
Расположение (UCSC)
Chr 3: 194.14 - 194.14 Мб
Chr 16: 30.06 - 30.07 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Фактор транскрипции Hes1 (волосатые и энхансер сплит-1) представляет собой белок , который кодируется Hes1 гена , и является гомолог у млекопитающих волосистой гена в дрозофилы . [5] [6] HES1 является одним из семи членов семейства генов Hes (HES1-7). Гены Hes кодируют ядерные белки, подавляющие транскрипцию. [7]
Этот белок принадлежит к семейству основных факторов транскрипции спираль-петля-спираль (bHLH) . Это репрессор транскрипции генов, для транскрипции которых требуется белок bHLH. Белок имеет определенный тип основного домена, который содержит белок, прерывающий спираль, который связывается с областью промотора N-бокса, а не с каноническим блоком энхансера (E-бокс) . [6] Являясь членом семейства bHLH, он является репрессором транскрипции, который влияет на пролиферацию и дифференцировку клеток в эмбриогенезе . [7] HES1 регулирует свою экспрессию через цикл отрицательной обратной связи и колеблется примерно с 2-часовой периодичностью. [8]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Структура
2 взаимодействия
3 HES1 и стволовые клетки
3.1 Нейронное развитие
3.2 Взаимодействие с путем Notch
3.3 Пищеварительная система
4 ссылки
5 Дальнейшее чтение
6 Внешние ссылки
Структура [ править ]
В генах Hes есть три консервативных домена, которые обеспечивают транскрипционные функции: домен bHLH, домен Orange и мотив WRPW. Гены Hes отличаются от других факторов bHLH тем, что они имеют остаток пролина в середине основной области связывания ДНК. Было высказано предположение, что этот пролин придает Hes белкам уникальную способность связывать ДНК. В то время как большинство факторов bHLH связываются с консенсусной последовательностью E-бокса (CANNTG), которая присутствует в промоторной области генов-мишеней, факторы Hes связываются более предпочтительно с сайтом класса C или N-боксом (CACNAG). [7] Оранжевый домен служит для регулирования выбора гетеродимерных партнеров bHLH . [9] С-концевойДомен WRPW подавляет транскрипцию. [10]
Взаимодействия [ править ]
Подобно другим белкам HES, Hes1, как было показано, взаимодействует с корепрессорами, кодируемыми трансдуцин -подобными генами E (spl) (TLE) и геном, связанным с Groucho (Grg), оба гомологами Drosophila groucho . [11] Поскольку Граучо у Drosophila ингибирует транскрипцию, рекрутируя гистоновую деацетилазу, вполне вероятно, что комплекс Hes-Groucho активно блокирует транскрипцию, отключая хроматин. Белки Hes также гетеродимеризуются с репрессорами bHLH, такими как Hey1 и Hey2 , процесс, который также блокирует транскрипцию. Факторы Hes также гетеродимеризуются с активаторами bHLH, такими как E47, также известный как Tcfe2a, и Mash1, также известный как Ascl1., оба из которых являются гомологами млекопитающих пронейральных генов у Drosophila . Гетеродимерные комплексы E47-Hes и Mash1-Hes не могут связывать ДНК и, следовательно, репрессировать транскрипцию. [7]
Hes1 также взаимодействует с TLE2 [12] и сиртуином 1 . [13]
HES1 и стволовые клетки [ править ]
HES1 влияет на поддержание определенных стволовых клеток и клеток-предшественников . В частности, HES1 влияет на время дифференцировки путем репрессии активаторов bHLH и определяет судьбу бинарных клеток. Было показано, что HES1 играет большую роль как в нервной , так и в пищеварительной системах. Было показано, что HES1 частично влияет на эти две системы через сигнальный путь Notch.
Нейронное развитие [ править ]
HES1 экспрессируется как в нейроэпителиальных клетках, так и в клетках радиальной глии , как в нервных стволовых клетках. Экспрессия Hes1 , наряду с экспрессией Hes5 , охватывает большую часть развивающегося эмбриона в эмбриональный день 10.5. [14] После этого экспрессия Hes1 ограничивается субвентрикулярной зоной . У мышей с нокаутом HES1 (KO) Mash1 компенсаторно активируется, и нейрогенез ускоряется. Действительно, если экспрессия Hes1 , Hes3 и Hes5гены подавляются, экспрессия пронейральных генов увеличивается, и, хотя нейрогенез ускоряется, нервные стволовые клетки преждевременно истощаются. Напротив, если эти гены HES сверхэкспрессируются, нейрогенез подавляется. [15] Таким образом, гены HES1 участвуют только в поддержании, а не в создании нервных стволовых клеток.
Кроме того, HES1 может направлять нервные стволовые клетки по одному из двух путей дифференцировки. HES1 может поддерживать нервные стволовые клетки, экспрессирующие Pax6 , но приводит клетки, которые являются Pax6-негативными, к участию в дифференцировке астроцитов . [16] Эпигенетические модификации, такие как метилирование ДНК, также влияют на способность HES1 управлять дифференцировкой. Деметилирование сайтов-мишеней HES1 в промоторной области астроцит-специфичных генов ускоряет дифференцировку астроцитов. [15] Колебательная природа Hes1экспрессия также играет роль в определении судьбы дифференцировки. Эмбриональные стволовые клетки с высоким содержанием HES1, которые получили сигнал дифференцировки, часто принимали мезодермальную судьбу, в то время как клетки с низким уровнем HES1, которые получали сигнал дифференцировки, дифференцировались в нейрональные клетки. Эти результаты были подтверждены с помощью количественной ПЦР, которая показала, что клетки с высоким содержанием HES1 показали высокие уровни экспрессии Brachyury и Fgf5 (оба из которых высоко экспрессируются в типах мезодермальных клеток) со сравнительно низкими уровнями генов, экспрессируемых в нервных клетках, таких как нестин . Напротив, клетки с низким содержанием HES1 показали высокие уровни экспрессии генов, участвующих в нейральной индукции, и низкие уровни экспрессии генов, участвующих в дифференцировке мезодермы. [17]Циклическое изменение уровней HES1 также способствует поддержанию нервных клеток-предшественников, регулируя колебания нейрогенина 2 (Ngn2) и Dll1. [18] Уровни Hes1 колеблются с разной частотой в разных частях центральной нервной системы: HES1 постоянно экспрессируется на высоких уровнях в границах, но колеблется в компартментах. Это говорит о том, что чередующиеся уровни HES1 могут вызывать различия в характеристиках анатомических элементов центральной нервной системы. [7]
Взаимодействие с путем Notch [ править ]
HES1 также играет важную роль в сигнальном пути Notch . [19] В отсутствие передачи сигналов Notch RBPJ ингибирует экспрессию HES1. Однако после обработки сигналов Notch внутри клетки плазматическая мембрана высвобождает внутриклеточный домен Notch, который перемещается в ядро, где он связывается с RBPJ. Связывание вызывает конформационное изменение, которое приводит к диссоциации ко-репрессоров и позволяет коактиваторам связываться. Затем новый активирующий комплекс вызывает экспрессию HES1. Передача сигналов Notch активирует экспрессию HES1. Было показано , что HES1 нацелен по крайней мере на лиганды Notch: Dll1 , Jagged1 (Jag1) и Neurogenin-2. [15] , [17] Dll1, как и в случае с другими лигандами Notch, было показано, что они индуцируют нейральную дифференцировку, а связывание Dll1 с HES1 блокирует нейральную дифференцировку и ведет к поддержанию нервных стволовых клеток и нервных клеток-предшественников. [20] Передача сигналов Notch также происходит в клетках крипт кишечника . Гиперактивированный Notch вызывает уменьшение количества типов секреторных клеток (т. Е. Бокаловидных клеток , энтероэндокринных клеток и клеток Панета ). Удаление пути Notch путем удаления контроллера экспрессии Notch, Rbpsuh , вызывает продукцию почти только бокаловидных клеток. [21]
Пищеварительная система [ править ]
Было показано, что HES1 влияет на решение дифференцировки клеток желудочно-кишечного тракта. В клетках-предшественниках поджелудочной железы экспрессия HES1 подавляет экспрессию Ptf1a , который контролирует дифференцировку экзокринных клеток, и Ngn3 , который управляет дифференцировкой типов эндокринных клеток, которые будут формировать островки Лангерганса . [7] Отсутствие Hes1 в развивающемся кишечнике мышей способствует увеличению Math1 (белка, необходимого для производства кишечных секреторных клеток), что приводит к увеличению бокаловидных, энтероэндокринных и клеток Панета. Когда Hes1удаляется у мышей и рыбок данио, образуются избыточные бокаловидные клетки и энтероэндокринные клетки, в то время как образуется мало энтероцитов. [7] , [21] Клетки-предшественники печени дифференцируются на два разных типа клеток: гепатоциты и билиарные эпителиальные клетки . Когда экспрессия Hes1 низкая, гепатоциты формируются нормально, но желчные протоки полностью отсутствуют. [22] Этот фенотип напоминает синдром Алажиля , отличительной чертой которого являются мутации в Jagged1 . Следовательно, взаимодействия Hes-Notch также играют роль в развитии органов пищеварения.
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000114315 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022528 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Федер JN, Ли L, Ян LY, Ян YN (июль 1994). «Геномное клонирование и хромосомная локализация HRY, человеческого гомолога гена сегментации дрозофилы, волосатый». Геномика . 20 (1): 56–61. DOI : 10.1006 / geno.1994.1126 . PMID 8020957 .
^ a b «Ген Entrez: волосатый HES1 и усилитель расщепления 1, (Drosophila)» .
^ Б с д е е г Кагеяма R, T, Ohtsuka Kobayashi T (2007). «Семейство генов Hes: репрессоры и осцилляторы, которые организуют эмбриогенез» . Развитие . 134 (7): 1243–1251. DOI : 10.1242 / dev.000786 . PMID 17329370 .
^ Хирата Н, Yoshiura S, Оцука Т, Bessho У, Т Харада, Ёшикава К, Р Кагеяма (октябрь 2002 г.). «Колебательная экспрессия фактора bHLH Hes1, регулируемая петлей отрицательной обратной связи». Наука . 298 (5594): 840–843. Bibcode : 2002Sci ... 298..840H . DOI : 10.1126 / science.1074560 . PMID 12399594 . S2CID 30725650 .
^ Тельман В, Ван Wayenbergh R, Solter М, Пишон В, Pieler Т, Кристоф Д, Bellefroid Е.Ю. (2004). «Последовательности, расположенные ниже домена bHLH фактора транскрипции-1 Xenopus hairy-related, действуют как расширенный домен димеризации, который способствует отбору партнеров» . Биология развития . 276 (1): 47–63. DOI : 10.1016 / j.ydbio.2004.08.019 . PMID 15531363 .
^ Кан С.А., Seol JH, Ким J (2005). «Консервативный мотив WRPW Hes6 опосредует протеасомную деградацию». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 332 (1): 33–36. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2005.04.089 . PMID 15896295 .
^ Paroush Z, Финли RL, Кидд Т, Тележник С.М., Ингам PW, Brent R, Иш-Horowicz D (1994). «Граучо необходим для нейрогенеза, сегментации и определения пола дрозофилы и напрямую взаимодействует с белками bHLH, связанными с шерстью». Cell . 79 (5): 805–815. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90070-1 . PMID 8001118 . S2CID 14574755 .
^ Grbavec D, Lo R, Liu Y, Stifani S (декабрь 1998). «Трансдуцин-подобный энхансер split 2, гомолог Drosophila Groucho у млекопитающих, действует как репрессор транскрипции, взаимодействует с волосатым / энхансером расщепленных белков и экспрессируется во время развития нейронов» . Евро. J. Biochem . 258 (2): 339–49. DOI : 10.1046 / j.1432-1327.1998.2580339.x . PMID 9874198 .
^ Takata T, Ishikawa F (январь 2003). «Человеческий Sir2-родственный белок SIRT1 ассоциируется с репрессорами bHLH HES1 и HEY2 и участвует в HES1- и HEY2-опосредованной репрессии транскрипции». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 301 (1): 250–7. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 03020-6 . PMID 12535671 .
^ Хатакэяма Дж, Bessho Y, Като К, Ookawara S, Фудзиока М, Guillemot Ж, Кагеяма R (2004). «Гены Hes регулируют размер, форму и гистогенез нервной системы, контролируя время дифференцировки нервных стволовых клеток» . Развитие . 131 (22): 5539–5550. DOI : 10.1242 / dev.01436 . PMID 15496443 .
^ a b c Кагеяма Р., Оцука Т., Кобаяши Т. (2008). «Роль генов Hes в развитии нервной системы» . Развитие, рост и дифференциация . 50 : S97–103. DOI : 10.1111 / j.1440-169X.2008.00993.x . PMID 18430159 . S2CID 25283902 .
^ СУГИМОРИ M, Нагао M, N Bertrand, Parras CM, Guillemot F, Nakafuku M (2007). «Комбинаторные действия факторов формирования паттерна и транскрипции HLH в пространственно-временном контроле нейрогенеза и глиогенеза в развивающемся спинном мозге» . Развитие . 134 (8): 1617–1629. DOI : 10.1242 / dev.001255 . PMID 17344230 .
^ а б Кобаяси Т., Мидзуно Х, Имаёши I, Фурусава С., Сирахиге К., Кагеяма Р. (2009). «Циклический ген Hes1 способствует разнообразным ответам на дифференцировку эмбриональных стволовых клеток» . Гены и развитие . 23 (16): 1870–1875. DOI : 10,1101 / gad.1823109 . PMC 2725939 . PMID 19684110 .
^ Shimojo Н, Оцука Т, Кагеяма R (2008). «Колебания в передаче сигналов Notch регулируют поддержание нейронных предшественников». Нейрон . 58 (1): 52–64. DOI : 10.1016 / j.neuron.2008.02.014 . hdl : 2433/135871 . PMID 18400163 . S2CID 870946 .
^ Кагеяма Р, Т Оцука (1999). «Путь Notch-Hes в нервном развитии млекопитающих». Клеточные исследования . 9 (3): 179–188. DOI : 10.1038 / sj.cr.7290016 . PMID 10520600 . S2CID 12570403 .
^ Lowell S, Benchoua A, B Heavey, Smith AG (2006). «Notch способствует проникновению в нейронную линию с помощью плюрипотентных эмбриональных стволовых клеток» . PLOS Биология . 4 (5): e121. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0040121 . PMC 1431581 . PMID 16594731 .
^ a b Crosnier C, Stamataki D, Lewis J (2006). «Организация обновления клеток в кишечнике: стволовые клетки, сигналы и комбинаторный контроль». Природа Обзоры Генетики . 7 (5): 349–359. DOI : 10.1038 / nrg1840 . PMID 16619050 . S2CID 37382174 .
Перейти ↑ Kodama Y, Hijikata M, Kageyama R, Shimotohno K, Chiba T (2004). «Роль передачи сигналов notch в развитии внутрипеченочных желчных протоков». Гастроэнтерология . 127 (6): 1775–1786. DOI : 10,1053 / j.gastro.2004.09.004 . hdl : 2433/144718 . PMID 15578515 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Такебаяши К., Сасай Й, Сакаи Й, Ватанабе Т., Наканиши С., Кагеяма Р. (1994). «Анализ структуры, хромосомного локуса и промотора гена, кодирующего фактор спирали-петли-спирали мыши HES-1. Отрицательная ауторегуляция через несколько элементов N-бокса». J. Biol. Chem . 269 (7): 5150–6. PMID 7906273 .
Грбавец Д., Стифани С. (1996). «Молекулярное взаимодействие между TLE1 и карбоксиконцевым доменом HES-1, содержащим мотив WRPW». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 223 (3): 701–5. DOI : 10.1006 / bbrc.1996.0959 . PMID 8687460 .
Стрем А., Кастелла П., Роквуд Дж., Вагнер Дж., Кауди М. (1998). «Посредничество передачи сигналов NGF путем посттрансляционного ингибирования HES-1, основного репрессора спираль-петля-спираль нейрональной дифференцировки» . Genes Dev . 11 (23): 3168–81. DOI : 10,1101 / gad.11.23.3168 . PMC 316755 . PMID 9389649 .
Вотруба М., Пейн А., Мур А.Т., Бхаттачарья С.С. (1998). «Доминирующая атрофия зрительного нерва: исключение и точное генетическое картирование гена-кандидата, HRY». Мамм. Геном . 9 (10): 784–7. DOI : 10.1007 / s003359900867 . PMID 9745030 . S2CID 25575546 .
Бэ С., Бесшо Ю., Ходзё М., Кагеяма Р. (2000). «Ген bHLH Hes6, ингибитор Hes1, способствует дифференцировке нейронов». Развитие . 127 (13): 2933–43. PMID 10851137 .
Яо Дж, Лай Э, Стифани С. (2001). «Белковый фактор мозга 1 с крылатой спиралью взаимодействует с белками граучо и hes, подавляя транскрипцию» . Мол. Клетка. Биол . 21 (6): 1962–72. DOI : 10.1128 / MCB.21.6.1962-1972.2001 . PMC 86788 . PMID 11238932 .
Исо Т., Сарторелли В., Поизат С., Иеззи С., Ву Х.Й., Чунг Г., Кедес Л., Хамамори Ю. (2001). «HERP, новый гетеродимерный партнер HES / E (spl) в передаче сигналов Notch» . Мол. Клетка. Биол . 21 (17): 6080–9. DOI : 10.1128 / MCB.21.17.6080-6089.2001 . PMC 87325 . PMID 11486045 .
Dintilhac A, Bernués J (2002). «HMGB1 взаимодействует со многими очевидно неродственными белками, распознавая короткие аминокислотные последовательности» . J. Biol. Chem . 277 (9): 7021–8. DOI : 10.1074 / jbc.M108417200 . PMID 11748221 .
Йоги А., Перссон П., Гринфельд А., Полман С., Аксельсон Х (2002). «Модуляция образования основного комплекса транскрипции спираль-петля-спираль белками Id во время дифференцировки нейронов» . J. Biol. Chem . 277 (11): 9118–26. DOI : 10.1074 / jbc.M107713200 . PMID 11756408 .
Кунисато А., Чиба С., Накагами-Ямагути Е., Кумано К., Сайто Т., Масуда С., Ямагути Т., Осава М., Кагеяма Р., Накаучи Н., Нисикава М., Хираи Н. (2003). «HES-1 сохраняет очищенные гемопоэтические стволовые клетки ex vivo и накапливает клетки побочной популяции in vivo» . Кровь . 101 (5): 1777–83. DOI : 10,1182 / кровь 2002-07-2051 . PMID 12406868 . S2CID 40234452 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T. , Макс С.И., Ван Дж., Се Ф., Дьяченко Л., Марусина К., Фармер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес МБ, Боналдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Э., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С. P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS,Кшивинский М.И., Скальска Ю., Смаилус Д.Е., Шнерч А., Шейн Дж. Э., Джонс С.Дж., Марра М.А. (2003).«Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Таката Т., Исикава Ф (2003). «Человеческий Sir2-родственный белок SIRT1 ассоциируется с репрессорами bHLH HES1 и HEY2 и участвует в HES1- и HEY2-опосредованной репрессии транскрипции». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 301 (1): 250–7. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 03020-6 . PMID 12535671 .
Граттон МО, Торбан Э., Жасмин С.Б., Терио FM, Немецкий MS, Stifani S (2003). «Hes6 способствует кортикальному нейрогенезу и подавляет активность репрессии транскрипции Hes1 с помощью множества механизмов» . Мол. Клетка. Биол . 23 (19): 6922–35. DOI : 10.1128 / MCB.23.19.6922-6935.2003 . PMC 193938 . PMID 12972610 .
Томсен Дж. С., Киц С., Стрем А., Густафссон Дж. А. (2004). «HES-1, новый ген-мишень для арилуглеводородного рецептора» . Мол. Pharmacol . 65 (1): 165–71. DOI : 10,1124 / mol.65.1.165 . PMID 14722248 . S2CID 22942120 .
Камакура С., Оиси К., Йошимацу Т., Накафуку М., Масуяма Н., Гото Ю. (2004). «Связывание Hes со STAT3 опосредует перекрестные помехи между передачей сигналов Notch и JAK-STAT». Nat. Cell Biol . 6 (6): 547–54. DOI : 10.1038 / ncb1138 . PMID 15156153 . S2CID 36887899 .
Persson P, Stockhausen MT, Påhlman S, Axelson H (2005). «Убиквилин-1 представляет собой новый комплексообразующий белок HASH-1, который регулирует уровни нейрональных факторов транскрипции bHLH в клетках нейробластомы человека». Int. J. Oncol . 25 (5): 1213–21. DOI : 10.3892 / ijo.25.5.1213 . PMID 15492808 .
Агилера К., Хойя-Ариас Р., Хэгеман Г., Эспиноза Л., Бигас А. (2004). «Привлечение IkappaBalpha к промотору hes1 связано с репрессией транскрипции» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 101 (47): 16537–42. Bibcode : 2004PNAS..10116537A . DOI : 10.1073 / pnas.0404429101 . PMC 534509 . PMID 15536134 .
Фрайер С.Дж., Уайт Дж.Б., Джонс К.А. (2005). «Mastermind рекрутирует CycC: CDK8 для фосфорилирования Notch ICD и координирует активацию с оборотом». Мол. Cell . 16 (4): 509–20. DOI : 10.1016 / j.molcel.2004.10.014 . PMID 15546612 .
Внешние ссылки [ править ]
HES1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также дефицит фактора транскрипции / корегулятора