Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
HLA-DOA
Доступные конструкции
PDBПоиск человеческого UniProt: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4I0P

Идентификаторы
ПсевдонимыHLA-DOA , HLA-ДНК, HLA-DZA, HLADZ, главный комплекс гистосовместимости, класс II, DO альфа
Внешние идентификаторыOMIM : 142930 MGI : 95924 HomoloGene : 1601 GeneCards : HLA-DOA
Расположение гена ( человек )
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человека) [1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение HLA-DOA
Геномное расположение HLA-DOA
Группа6п21.32Начинать33 004 182 п.н. [1]
Конец33 009 591 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 17 (мышь)
Chr.Хромосома 17 (мышь) [2]
Хромосома 17 (мышь)
Геномное расположение HLA-DOA
Геномное расположение HLA-DOA
Группа17 B1 | 17 17,98 смНачинать34 092 340 п.н. [2]
Конец34 095 234 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE HLA-DOA 211142 x at fs.png

PBB GE HLA-DOA 206313 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Активность рецептора MHC класса II
• Связывание с белком GO: 0001948
• Связывание с белковым комплексом MHC класса II
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент мембраны
• лизосомальная мембрана
• эндосома
• клеточная мембрана
• лизосома
• белковый комплекс MHC класса II
• мембрана эндосомы
• мембрана
Биологический процесс• процессинг антигена и презентация пептидного или полисахаридного антигена через MHC класса II
• процессинг и презентация антигена
• процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II
• иммунный ответ
• негативная регуляция процессинга антигена и презентация пептидного антигена через MHC класса II
• регуляция дифференцировки Т-клеток
• процесс иммунной системы
• передача сигнала
• адаптивный иммунный ответ
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3111

15001

Ансамбль
ENSG00000204252
ENSG00000230141
ENSG00000232962
ENSG00000235744
ENSG00000231558

ENSG00000206292
ENSG00000232957

ENSMUSG00000024334

UniProt

P06340

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_002119

NM_008206

RefSeq (белок)

NP_002110

н / д

Расположение (UCSC)Chr 6: 33 - 33,01 МбChr 17: 34.09 - 34,1 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

HLA класса II , антиген гистосовместимости, DO альфа - цепь представляет собой белок , который у человека кодируется HLA-DOA гена . [5] [6]

HLA-DOA относится к паралогам альфа-цепей HLA класса II. HLA-DOA образует гетеродимер с HLA-DOB. Гетеродимер, HLA-DO, обнаружен в лизосомах В-клеток и регулирует опосредованную HLA-DM пептидную нагрузку на молекулы MHC класса II. По сравнению с классическими молекулами HLA класса II, этот ген демонстрирует очень небольшое изменение последовательности, особенно на уровне белка. [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Б с ENSG00000230141, ENSG00000232962, ENSG00000235744, ENSG00000231558, ENSG00000206292, ENSG00000232957 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000204252, ENSG00000230141, ENSG00000232962, ENSG00000235744, ENSG00000231558, ENSG00000206292, ENSG00000232957 - Ensembl , май 2017
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024334 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Young JA, Trowsdale J (август 1990). «Ген HLA-ДНК (DZA) правильно экспрессируется в виде транскрипта зрелой мРНК размером 1,1 т.п.н.». Иммуногенетика . 31 (5–6): 386–8. DOI : 10.1007 / BF02115015 . PMID 2370084 . S2CID 31652916 .  
  6. ^ a b «Ген Энтреса: главный комплекс гистосовместимости HLA-DOA, класс II, DO альфа» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Пьятье-Тонно Д., Гастинель Л.Н., Амблар Ф. и др. (1991). «Взаимодействие CD4 с антигенами HLA класса II и gp120 ВИЧ». Иммуногенетика . 34 (2): 121–8. DOI : 10.1007 / BF00211424 . PMID  1869305 . S2CID  10116507 .
  • Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). «ВИЧ-gp120 может блокировать адгезию, опосредованную МНС CD4-класса II». J. Immunol . 144 (2): 526–31. PMID  1967269 .
  • Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). «Идентификация и структурный анализ остатков в области V1 CD4, участвующих во взаимодействии с гликопротеином оболочки вируса иммунодефицита человека gp120 и молекулами главного комплекса гистосовместимости класса II» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 87 (22): 9052–6. DOI : 10.1073 / pnas.87.22.9052 . PMC  55099 . PMID  1978941 .
  • Розен-Бронсон С., Лонг Е.О. (1991). «Необычная форма альтернативного сплайсинга в гене HLA-ДНК». Иммуногенетика . 33 (2): 124–31. DOI : 10.1007 / BF00210826 . PMID  1999352 . S2CID  23451770 .
  • Йонссон А.К., Раск Л. (1989). «Человеческие гены ДНК класса II и DOB демонстрируют низкую вариабельность последовательностей». Иммуногенетика . 29 (6): 411–3. DOI : 10.1007 / BF00375872 . PMID  2499532 . S2CID  5481750 .
  • Клейтон Л.К., Сие М., Благочестивый Д.А., Рейнхерц Е.Л. (1989). «Идентификация остатков CD4 человека, влияющих на MHC класса II по сравнению с связыванием gp120 ВИЧ-1». Природа . 339 (6225): 548–51. Bibcode : 1989Natur.339..548C . DOI : 10.1038 / 339548a0 . PMID  2543930 . S2CID  4246781 .
  • Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T. и др. (1988). «Ингибирование функции CD4 + Т-клеток белком оболочки ВИЧ, gp120». J. Immunol . 141 (11): 3715–7. PMID  2846691 .
  • Иноко Х, Андо А, Кимура М, Цудзи К. (1985). «Выделение и характеристика клона кДНК и геномных клонов тяжелой цепи нового антигена HLA класса II, DO альфа». J. Immunol . 135 (3): 2156–9. PMID  2991382 .
  • Троусдейл Дж, Келли А (1986). «Ген альфа-цепи DZ альфа-цепи человеческого HLA класса II отличается от генов в подобластях DP, DQ и DR» . EMBO J . 4 (9): 2231–7. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1985.tb03919.x . PMC  554490 . PMID  3000765 .
  • Андрие Дж. М., Эвен П., Венет А. (1986). «СПИД и родственные синдромы как вирусное аутоиммунное заболевание иммунной системы: нарушение анти-MHC II. Терапевтические последствия». Исследования СПИДа . 2 (3): 163–74. DOI : 10,1089 / aid.1.1986.2.163 . PMID  3489470 .
  • Ульгатте Р., Скармато П., Эль Мархоми С. и др. (1994). «Антигены HLA класса II и гликопротеин оболочки ВИЧ gp120 связываются с одной и той же стороной CD4». J. Immunol . 152 (9): 4475–88. PMID  7512597 .
  • Чирмул Н., Макклоски Т.В., Ху Р. и др. (1995). «ВИЧ gp120 ингибирует активацию Т-клеток, препятствуя экспрессии костимулирующих молекул лиганда CD40 и CD80 (B71)». J. Immunol . 155 (2): 917–24. PMID  7541827 .
  • Роуэлл Дж. Ф., Стэнхоуп П. Е., Силичиано РФ (1995). «Эндоцитоз эндогенно синтезированного белка оболочки ВИЧ-1. Механизм и роль в процессинге для ассоциации с MHC класса II». J. Immunol . 155 (1): 473–88. PMID  7602119 .
  • Чен Ю.Х., Бёк Г., Форнхаген Р. и др. (1994). «Связывающие белки gp41 ВИЧ-1 и антитела к gp41 могут ингибировать усиление экспрессии MHC класса I и II в клетках Raji человека с помощью gp41». Мол. Иммунол . 31 (13): 977–82. DOI : 10.1016 / 0161-5890 (94) 90092-2 . PMID  8084338 .
  • Chirmule N, Wang XP, Hu R и др. (1994). «Гликопротеины оболочки ВИЧ-1 мешают Т-клеточно-зависимой дифференцировке В-клеток: роль взаимодействия CD4-МНС класса II в эффекторной фазе помощи Т-лимфоцитов». Клетка. Иммунол . 155 (1): 169–82. DOI : 10,1006 / cimm.1994.1110 . PMID  8168144 .
  • Каллахан К.М., Роуэлл Дж. Ф., Солоски М. Дж. И др. (1993). «Белок оболочки ВИЧ-1 экспрессируется на поверхности инфицированных клеток перед его обработкой и представлением Т-лимфоцитам, ограниченным классом II». J. Immunol . 151 (6): 2928–42. PMID  8376762 .
  • Liljedahl M, Kuwana T., Fung-Leung WP и др. (1996). «HLA-DO является резидентом лизосомы, который требует ассоциации с HLA-DM для эффективного внутриклеточного транспорта» . EMBO J . 15 (18): 4817–24. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00862.x . PMC  452218 . PMID  8890155 .
  • Ruff AL, Guarnieri FG, Staveley-O'Carroll K и др. (1997). «Усиленный иммунный ответ на продукт химерного гена gp160 / LAMP ВИЧ, нацеленный на путь транспортировки белков лизосомной мембраны» . J. Biol. Chem . 272 (13): 8671–8. DOI : 10.1074 / jbc.272.13.8671 . PMID  9079699 .
  • Douek DC, Altmann DM (1997). «HLA-DO - это внутриклеточная молекула класса II с характерной экспрессией в тимусе». Int. Иммунол . 9 (3): 355–64. DOI : 10.1093 / intimm / 9.3.355 . PMID  9088974 .