В митохондриальной генетике человека , гаплогруппа Е является человеческой митохондриальной ДНК (мтДНК) Гаплогруппы характерно для Малайского архипелага . Это подгруппа гаплогруппы M9 .
Гаплогруппа E | |
---|---|
Возможное время происхождения | От 35 000 [1] до 8 000 [2] YBP |
Возможное место происхождения | восточный Сундаленд [1] или побережье Фуцзянь [2] |
Предок | M9 |
Потомки | E1, E2 |
Определение мутаций | 3027, 3705, 7598, 13626, 16390 [3] |
Источник
Было сделано два противоположных предложения относительно местоположения и времени происхождения гаплогруппы E. Согласно одной из точек зрения, клада образовалась более 30 000 лет назад, примерно во время последнего ледникового максимума , на северо-восточном побережье Сундаленда (недалеко от современного Борнео). ). В этой модели гаплогруппа была рассеяна повышением уровня моря во время позднего ледникового периода. [1] [4]
В 2014 году было обнаружено, что митохондриальная ДНК 8000-летнего скелета, обнаруженного на острове Лян , одном из островов Мацу у юго-восточного побережья Китая, принадлежит к гаплогруппе E с двумя из четырех мутаций, характерных для подгруппы E1. Исходя из этого, Ко и его коллеги утверждают, что гаплогруппа E возникла от 8000 до 11000 лет назад недалеко от северного побережья Фуцзянь , отправилась на Тайвань с неолитическими поселенцами 6000 лет назад, а оттуда распространилась в Приморскую Юго-Восточную Азию с распространением австронезийского языка . [2] Соарес и др. Предостерегают от чрезмерного акцента на одном образце и утверждают, что постоянные молекулярные часы предполагают более раннюю дату (и более южное происхождение), что остается более вероятным. [5]
Распределение
Гаплогруппа E встречается по всей Приморской Юго-Восточной Азии . [4] Он почти отсутствует на материковой части Восточной Азии, где распространена его сестринская группа M9a (также найденная в Японии). [4] [6] В частности, он встречается среди носителей австронезийских языков и редко встречается даже в Юго-Восточной Азии среди членов других языковых семей. Он был обнаружен в популяциях Тайване , на Филиппинах , Индонезии , Малайзии ( в том числе Сабах на острове Борнео , но не орангасли полуостровной Малайзии), прибрежные Папуа - Новой Гвинеи , и особенно в чаморро из Марианских островов . [4] [7] [8] [9] [10] [11]
Из четырех основных субкладов E1b и E2a находятся в основном в Приморской Юго-Восточной Азии, в то время как только E1a и E2b также находятся на Тайване. [12] E2b имеет низкое разнообразие на Тайване, что позволяет предположить, что он прибыл туда около 5000 лет назад. [12] Самый распространенный субклад E, E1a1a, имеет наибольшее разнообразие на Тайване, за которым следуют Филиппины и Сулавеси. Более того, другие ответвления E1a1 в основном ограничены Тайванем. [13]
Население | Частота | Считать | Источник | Подтипы |
---|---|---|---|---|
Чаморро (85 Гуам , 14 Сайпан и 6 Рота ) | 0,924 | 105 | Вилар и др., 2013 г. | E2a = 68, E1a2 = 29 |
Восточно-индонезийский ( Сулавеси , включая 89 Манадо , 64 Тораджа , 46 Уджунг Паданг и 38 Палу ) | 0,266 | 237 | Хилл и др. 2007 | E1a = 42, E1b = 9, E2 = 7, E1 (xE1a, E1b) = 5 |
Филиппинский ( Минданао ) | 0,214 | 70 | Таббада и др., 2010 г. , стр. 24 | E1a1a = 10, E2 (xE2b) = 4, E1b = 1 |
Филиппинский ( Висайские острова ) | 0,214 | 112 | Таббада и др., 2010 г. , стр. 24 | E1a1a = 18, E2 (xE2b) = 5, E1 (xE1a1a, E1a2, E1b) = 1 |
Восточно-индонезийский ( Амбон ) | 0,163 | 43 год | Хилл и др. 2007 | E1 (xE1a, E1b) = 3, E1a = 2, E2 = 2 |
Восточно-индонезийский ( Waingapu , Sumba ) | 0,160 | 50 | Хилл и др. 2007 | E1b = 6, E1a = 1, E2 = 1 |
Индонезийский ( Bangka ) | 0,147 | 34 | Хилл и др., 2006 г. | E = 5 |
Борнео (89 Банджармасин и 68 Кота-Кинабалу ) | 0,146 | 157 | Хилл и др. 2007 | E1a = 14, E2 = 5, E1b = 3, E1 (xE1a, E1b) = 1 |
Филиппинский | 0,125 | 64 | Таббада и др., 2010 г. , стр. 24 | E1a1a = 5, E2 (xE2b) = 2, E1a2 = 1 |
Филиппинский ( Лусон ) | 0,124 | 177 | Таббада и др., 2010 г. , стр. 24 | E1a1a = 14, E1b = 5, E2 (xE2b) = 2, E2b = 1 |
Тайвань (абориген) | 0,120 | 640 | Пэн и др., 2011 г. | E = 77 |
Восточно-индонезийский ( Алор ) | 0,111 | 45 | Хилл и др. 2007 | E1a = 3, E1b = 2 |
Восточно-индонезийский ( Матарам , Ломбок ) | 0,091 | 44 год | Хилл и др. 2007 | E1b = 3, E1a = 1 |
Индонезийский ( Паданг , Суматра ) | 0,083 | 24 | Хилл и др., 2006 г. | E = 2 |
Индонезийский ( Медан , Суматра ) | 0,071 | 42 | Хилл и др., 2006 г. | E = 3 |
Индонезийский ( Пеканбару , Медан , Бангка , Палембанг и Паданг ) | 0,067 | 180 | Хилл и др. 2007 | E1a = 6, E1b = 4, E1 (xE1a, E1b) = 1, E2 = 1 |
Индонезийский ( Бали ) | 0,061 | 82 | Хилл и др. 2007 | E1a = 3, E1b = 1, E1 (xE1a, E1b) = 1 |
Филиппинский ( Палаван ) | 0,050 | 20 | Скоулз и др., 2011 г. | E1a = 1 |
Индонезийский ( Палембанг , Суматра ) | 0,036 | 28 год | Хилл и др., 2006 г. | E = 1 |
Туцзя ( округ Яньхэ , Гуйчжоу ) | 0,034 | 29 | Ли и др., 2007 г. | E = 1 |
Гелао (округ Даочжэнь, Гуйчжоу) | 0,032 | 31 год | Ли и др., 2007 г. | E = 1 |
Индонезийский ( Ява , в т.ч. 36 из Тенгерского языка ) | 0,022 | 46 | Хилл и др. 2007 | E1b = 1 |
Индонезийский ( Пеканбару , Суматра ) | 0,019 | 52 | Хилл и др., 2006 г. | E = 1 |
Чам ( Bình Thuận , Вьетнам ) | 0,012 | 168 | Peng et al 2010 | E1a1a = 1, E2a = 1 |
Каролинский ( Сайпан ) | 0,000 | 17 | Вилар и др., 2013 г. | - |
И ( уезд Хэчжан , Гуйчжоу ) | 0,000 | 20 | Ли и др., 2007 г. | - |
Дун ( уезд Тяньчжу, Гуйчжоу ) | 0,000 | 28 год | Ли и др., 2007 г. | - |
Батек ( Малайзия ) | 0,000 | 29 | Хилл и др., 2006 г. | - |
Цунь ( Хайнань ) | 0,000 | 30 | Пэн и др., 2011 г. | - |
Батак ( Палаван ) | 0,000 | 31 год | Скоулз и др., 2011 г. | - |
Лингао ( Хайнань ) | 0,000 | 31 год | Пэн и др., 2011 г. | - |
Мендрик ( Малайзия ) | 0,000 | 32 | Хилл и др., 2006 г. | - |
Темуан ( Малайзия ) | 0,000 | 33 | Хилл и др., 2006 г. | - |
Данга ( Хайнань ) | 0,000 | 40 | Пэн и др., 2011 г. | - |
Джахаи ( Малайзия ) | 0,000 | 51 | Хилл и др., 2006 г. | - |
Сеной ( Малайзия ) | 0,000 | 52 | Хилл и др., 2006 г. | - |
Семелаи ( Малайзия ) | 0,000 | 61 | Хилл и др., 2006 г. | - |
Гелао (округ Даочжэнь, Гуйчжоу) | 0,000 | 102 | Лю и др. 2011 г. | - |
Ли ( Хайнань ) | 0,000 | 346 | Пэн и др., 2011 г. | - |
Субклады
Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы E основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека [3] и последующих опубликованных исследований.
- E
- E1
- E1a
- E1a1
- E1a1a
- E1a1a1
- E1a1a
- E1a2
- E1a1
- E1b
- E1b1
- E1a
- E2
- E2a
- E2b
- E2b1
- E2b2
- E1
Смотрите также
- Генеалогический ДНК-тест
- Генетическая генеалогия
- Митохондриальная генетика человека
- Популяционная генетика
- Гаплогруппы митохондриальной ДНК человека
Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Митохондриальная Ева ( L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | грамм | Q | О | А | S | р | я | W | Икс | Y | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | pre-JT | п | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HV | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ЧАС | V | J | Т |
Рекомендации
- ^ a b c Соарес и др., 2008 г. , стр. 1215.
- ^ а б в Ко и др., 2014 .
- ^ а б ван Овен и Кайзер 2008 .
- ^ а б в г Хилл и др. 2007 .
- ^ Соарес и др., 2016 .
- ^ Trejaut и др 2005 .
- ^ Tabbada и др 2010 , стр. 24, 28.
- Перейти ↑ Peng et al 2010 .
- ^ Хилл и др. 2006 .
- ^ Вилар и др., 2013 .
- Перейти ↑ Peng et al, 2011 .
- ^ а б Соарес и др., 2008 г. , стр. 1213.
- ^ Tabbada и др 2010 , стр. 29.
- Хилл, Кэтрин; Соарес, Педро; Мормина, Мару; Маколей, Винсент; Михан, Уильям; Блэкберн, Джеймс; Кларк, Дуглас; Раджа, Джозеф Марипа; Исмаил, Патима; Бульбек, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Ричардс, Мартин (2006). «Филогеография и этногенез аборигенов Юго-Восточной Азии» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (12): 2480–2491. DOI : 10.1093 / molbev / msl124 . PMID 16982817 .
- Хилл, Кэтрин; Соарес, Педро; Мормина, Мару; Маколей, Винсент; Кларк, Дуги; Блюмбах, Петя Б .; Визуете-Форстер, Матье; Форстер, Питер; Бульбек, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Ричардс, Мартин (2007). «Митохондриальная стратиграфия островов Юго-Восточной Азии» . Американский журнал генетики человека . 80 (1): 29–43. DOI : 10.1086 / 510412 . PMC 1876738 . PMID 17160892 .
- Ко, Альберт Мин-Шан; Чен, Чун-Ю; Фу, Цяомэй; Дельфин, Фредерик; Ли, Минкун; Чиу, Хун-Линь; Стоункинг, Марк; Ко, Инь-Чин (2014). «Ранние австронезийцы: на Тайвань и из Тайваня» . Американский журнал генетики человека . 94 (3): 426–436. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2014.02.003 . PMC 3951936 . PMID 24607387 .
- Ли, Бинбин; Чжун, Фугуан; Йи Хуншэн; Ван, Сяньрань; Ли, Лянфан; Ван, Лилан; Ци, Сяолань; Ву, Лифу (2007). «Генетический полиморфизм митохондриальной ДНК в этнических популяциях донг, гелао, туцзя и йи из Гуйчжоу, Китай». Журнал генетики и геномики . 34 (9): 800–811. DOI : 10.1016 / S1673-8527 (07) 60091-5 . PMID 17884690 .
- Лю, Чанг; Ван, Ша-Ян; Чжао, Миан; Сюй, Чжи-Юн; Ху, Ю-Хуа; Чен, Фэн; Чжан, Жуань-Чжан; Гао, Го-Фэн; Юй Юэ-Шэн; Конг, Цин-Пэн (2011). «Полиморфизмы митохондриальной ДНК в этнической группе Гелао, проживающей в Юго-Западном Китае». Международная судебная медицина: генетика . 5 (1): PE4 – E10. DOI : 10.1016 / j.fsigen.2010.04.007 . PMID 20494640 .
- Пэн, Мин-Шэн; Куанг, Хай Хо; Данг, Кхоа Фам; Trieu, An Vu; Ван, Хуа-Вэй; Яо, Юн-Ган; Конг, Цин-Пэн; Чжан, Я-Пин (2010). «Прослеживание австронезийского следа в материковой части Юго-Восточной Азии: взгляд на митохондриальную ДНК» . Молекулярная биология и эволюция . 27 (10): 2417–2430. DOI : 10.1093 / molbev / msq131 . PMID 20513740 .
- Пэн, Мин-Шэн; Он, Джун-Донг; Лю, Хай-Синь; Чжан, Я-Пин (2011). «Прослеживание наследия первых жителей острова Хайнань - взгляд на митохондриальную ДНК» . BMC Evolutionary Biology . 11 (46): 46. DOI : 10.1186 / 1471-2148-11-46 . PMC 3048540 . PMID 21324107 .
- Скоулз, Кларисса; Сиддл, Кэтрин; Дюкурно, Аксель; Кривелларо, Федерика; Ярве, Мари; Рутси, Сиири; Беллатти, Мэгги; Таббада, Кристина; Мормина, Мару; Рейдла, Маэре; Виллемс, Ричард; Кивисилд, Тоомас; Лар, Марта Миразон; Мильяно, Андреа Бамберг (2011). «Генетическое разнообразие и данные о примеси популяции в Batak Negritos из Палавана». Американский журнал физической антропологии . 146 (1): 62–72. DOI : 10.1002 / ajpa.21544 . PMID 21796613 .
- Соарес, Педро; Трежо, Жан Ален; Лоо, Цзюнь-Хун; Хилл, Кэтрин; Мормина, Мару; Ли, Цзянь-Лян; Чен, Яо-Мин; Худжашов, Георгий; Форстер, Питер; Маколей, Винсент; Бульбек, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Лин, Мари; Ричардс, Мартин Б. (2008). «Изменение климата и расселение людей после ледникового периода в Юго-Восточной Азии» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (6): 1209–1218. DOI : 10.1093 / molbev / msn068 . PMID 18359946 .
- Соарес, Педро А .; Trejaut, Жан А .; Рито, Тереза; Кавадас, Бруно; Хилл, Кэтрин; Энг, Кен Хонг; Мормина, Мару; Брандао, Андрей; Фрейзер, Росс М .; Ван, Цзе-И; Лоо, Цзюнь-Хун; Снелл, Кристофер; Ко, Цанг-Мин; Аморим, Антониу; Пала, Мария; Маколей, Винсент; Бульбек, Дэвид; Уилсон, Джеймс Ф .; Гужман, Леонор; Перейра, Луиза; Оппенгеймер, Стивен; Лин, Мари; Ричардс, Мартин Б. (2016). «Разрешение происхождения населения, говорящего на австронезийском языке» . Генетика человека . 135 (3): 309–326. DOI : 10.1007 / s00439-015-1620-z . PMC 4757630 . PMID 26781090 .
- Таббада, Кристина А .; Trejaut, Жан; Лоо, Цзюнь-Хун; Чен, Яо-Мин; Лин, Мари; Миразон-Лар, Марта; Кивисилд, Тоомас; Де Унгриа, Мария Коразон А. (2010). "Разнообразие митохондриальной ДНК Филиппин: густонаселенный виадук между Тайванем и Индонезией?" . Молекулярная биология и эволюция . 27 (1): 21–31. DOI : 10.1093 / molbev / msp215 . PMID 19755666 .
- Trejaut, Жан А .; Кивисилд, Тоомас; Лу, Джун Хун; Ли, Чиен Лян; Он, Чун Линь; Сюй, Чиа Юнг; Ли, Чжэн Юань; Лин, Мари (2005). «Следы архаичных митохондриальных линий сохраняются в австронезийских популяциях формозов» . PLOS Биология . 3 (8). e247. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0030247 . PMC 1166350 . PMID 15984912 .
- ван Овен, Маннис; Кайзер, Манфред (2008). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Человеческая мутация . 30 (2): E386 – E394. DOI : 10.1002 / humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 . Архивировано из оригинала 4 декабря 2012 года . Проверено 20 мая 2009 .
- Vilar, Miguel G .; Chan, Chim W .; Сантос, Дана Р .; Линч, Дэниел; Спатис, Рита; Гарруто, Ральф М .; Лам, Дж. Коджи (2013). «Происхождение и генетическая особенность чаморро Марианских островов: перспектива мтДНК» . Американский журнал биологии человека . 25 (1): 116–122. DOI : 10.1002 / ajhb.22349 . PMC 4335639 . PMID 23180676 .
Внешние ссылки
- Общий
- Сайт митохондриальной ДНК Яна Логана
- Филотрия Манниса ван Овена
- Гаплогруппа E
- Баллинджер, ЮАР; Schurr, TG; Torroni, A .; Ган, ГГ; Hodge, JA; Hassan, K .; Чен, KH; Уоллес, округ Колумбия (1992). «Анализ митохондриальной ДНК Юго-Восточной Азии показывает генетическую преемственность древних монголоидных миграций» . Генетика . 130 (1): 139–152. PMC 1204787 . PMID 1346259 .
- Herrnstadt, C .; Элсон, JL; Fahy, E .; и другие. (2002). «Анализ сокращенной медианной сети полных последовательностей кодирующей области митохондриальной ДНК для основных африканских, азиатских и европейских гаплогрупп» . Американский журнал генетики человека . 70 (5): 1152–1171. DOI : 10.1086 / 339933 . PMC 447592 . PMID 11938495 .
- Ингман, М .; Kaessmann, H .; Pääbo, S .; Гилленстен, У. (2000). «Вариации митохондриального генома и происхождение современного человека». Природа . 408 (6813): 708–713. Bibcode : 2000Natur.408..708I . DOI : 10.1038 / 35047064 . PMID 11130070 . S2CID 52850476 .
- Stoneking, M .; Jorde, LB; Bhatia, K .; Уилсон, AC (1990). «Географические изменения митохондриальной ДНК человека из Папуа-Новой Гвинеи» . Генетика . 124 (3): 717–733. PMC 1203963 . PMID 1968873 .