Вирус гепатита С ( ВГС ) [3] представляет собой небольшой ( размером 55–65 нм ) оболочечный одноцепочечный РНК-вирус с положительным смыслом из семейства Flaviviridae . Вирус гепатита С является причиной гепатита С и некоторых видов рака, таких как рак печени ( гепатоцеллюлярная карцинома , сокращенно ГЦК) и лимфомы у людей. [4] [5]
Вирус гепатита С принадлежит к роду Hepacivirus , члену семейства Flaviviridae . До 2011 года он считался единственным представителем этого рода. Однако у собак был обнаружен представитель этого рода : собачий гепацивирус . [6] Существует также по крайней мере один вирус этого рода, поражающий лошадей. [7] Несколько дополнительных вирусов этого рода были описаны у летучих мышей и грызунов. [8] [9]
Частица вируса гепатита С состоит из липидной мембранной оболочки диаметром от 55 до 65 нм. [10] [11] Два гликопротеина вирусной оболочки , E1 и E2 , встроены в липидную оболочку. [12] Они принимают участие в прикреплении вируса и проникновении в клетку. [10] Внутри оболочки находится икосаэдрическое ядро диаметром от 33 до 40 нм. [11] Внутри ядра находится РНК-материал вируса. [10]
E1 и E2 соединяются ковалентно при внедрении в оболочку ВГС и стабилизируются дисульфидными связями . E2 имеет глобулярную форму и, судя по изображениям электронного микроскопа, кажется, выступает на 6 нм из оболочки оболочки. [11]
Эти гликопротеины играют важную роль во взаимодействии гепатита С с иммунной системой. Гипервариабельная область , гипервариабельная область 1 (HVR1), находится на гликопротеине E2. [10] HVR1 гибок и вполне доступен для окружающих молекул. [13] HVR1 помогает E2 защитить вирус от иммунной системы. Он предотвращает захват CD81 соответствующего рецептора вируса. [13] Кроме того, E2 может защищать E1 от иммунной системы. [13] Хотя аминокислотная последовательность HVR1 весьма вариабельна, эта область имеет схожие химические, физические и конформационные характеристики во многих гликопротеинах E2. [14]
Вирус гепатита С имеет геном с положительной смысловой одноцепочечной РНК . Геном состоит из одной открытой рамки считывания длиной 9600 нуклеотидных оснований. [15] Эта единственная открытая рамка считывания транслируется для получения одного белкового продукта, который затем подвергается дальнейшей обработке для производства более мелких активных белков. Вот почему в общедоступных базах данных, таких как Европейский институт биоинформатики , вирусный протеом состоит только из 2 белков. [ нужна ссылка ]