Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Стандартные идентификационные карты ISO / IEC 7810 см. В формате ID-2 .
ID2
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4AYA

Идентификаторы
ПсевдонимыID2 , GIG8, ID2A, ID2H, bHLHb26, ингибитор связывания ДНК 2, белок HLH, ингибитор связывания ДНК 2
Внешние идентификаторыOMIM: 600386 MGI: 96397 HomoloGene: 1632 GeneCards: ID2
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человека) [1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное местоположение для ID2
Геномное местоположение для ID2
Группа2п25.1Начинать8 678 845 п.н. [1]
Конец8 684 461 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 12 (мышь)
Chr.Хромосома 12 (мышь) [2]
Хромосома 12 (мышь)
Геномное местоположение для ID2
Геномное местоположение для ID2
Группа12 A1.3 | 12 8,57 смНачинать25 093 799 п.н. [2]
Конец25 097 140 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE ID2 201566 x at fs.png

PBB GE ID2 201565 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• белок димеризации активность
• ионный канал связывания
• GO: связывание 0001948 белок
• ГО: 0001200, ГО: 0001133, ГО: 0001201 ДНК-связывающий активность фактора транскрипции, РНК - полимеразы II-специфической
• РНК - полимеразы II транскрипции фактора связывания
• ГО: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• Связывание фактора транскрипции
Сотовый компонент• ядро клетки
• цитозоль
• цитоплазма
• макромолекулярный комплекс
Биологический процесс• регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла
• ритмический процесс
• отрицательная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• позитивная регуляция транскрипции, участвующая в переходе G1 / S митотического клеточного цикла
• развитие многоклеточных организмов
• негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• транскрипция, ДНК-шаблон
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• развитие метанефроса
• естественная дифференцировка клеток-киллеров
• тигмотаксис
• дифференцировка лейкоцитов
• морфогенез мембранной перегородки
• пучок развития His
• развитие сердца
• циркадный ритм
• двигательное поведение взрослого
• захват циркадных часов
• положительная регуляция экспрессии генов
• негативная регуляция экспрессии генов
• развитие олигодендроцитов
• регуляция липидного метаболического процесса
• обонятельный развитие луковицы
• циркадная регуляция экспрессии генов
• пролиферация эпителиальных клеток молочной железы
• регуляция циркадного ритма
• захват циркадных часов фотопериодом
• энуклеатная дифференцировка эритроцитов
• негативная регуляция связывания ДНК
• локомоторный ритм
• негативная регуляция дифференцировки B-клеток
• позитивная регуляция дифференцировки жировых клеток
• позитивная регуляция дифференцировки эритроцитов
• позитивная регуляция дифференцировки макрофагов
• негативная регуляция дифференцировка нейронов
• негативная регуляция дифференцировки остеобластов
• позитивная регуляция артериального давления
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• развитие клеток
• созревание клеток
• развитие пейеровских бляшек
• эмбриональный морфогенез пищеварительного тракта
• позитивная регуляция пролиферации гладкомышечных клеток
• обязательство судьбы нейронов
• клеточный морфогенез, участвующий в дифференцировке нейронов
• позитивная регуляция дифференцировки астроцитов
• негативная регуляция дифференцировки олигодендроцитов
• развитие жировой ткани
• развитие альвеол молочной железы
• дифференцировка эпителиальных клеток, участвующих в развитии альвеол молочной железы
• энтодермальный морфогенез пищеварительного тракта
• положительная регуляция остановки клеточного цикла
• клеточный ответ на ион лития
• клеточное старение
• негативная регуляция пролиферации нервных клеток-предшественников
• дифференцировка нейронов
• регуляция клеточного цикла
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3398

15902

Ансамбль

ENSG00000115738

ENSMUSG00000020644

UniProt

Q02363

P41136

RefSeq (мРНК)

NM_002166

NM_010496

RefSeq (белок)

NP_002157

NP_034626

Расположение (UCSC)Chr 2: 8.68 - 8.68 МбChr 12: 25.09 - 25,1 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ДНК-связывающий белок , ингибитор ID2 представляет собой белок , который у человека кодируется ID2 гена . [5]

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству ингибиторов связывания ДНК (ID), членами которого являются регуляторы транскрипции, которые содержат домен спираль-петля-спираль (HLH), но не основной домен. Члены семейства ID подавляют функции основных факторов транскрипции спираль-петля-спираль доминантно-негативным образом, подавляя своих партнеров по гетеродимеризации через домены HLH. Этот белок может играть роль в негативном регулировании дифференцировки клеток. Для этого гена был идентифицирован псевдоген. [6] В исследовании, опубликованном «Nature» в 01/2016 г. итальянскими исследователями Антонио Явароне и Анной Ласорелла из Колумбийского университета, говорится, что белок ID2 играет важную роль в развитии и устойчивости к терапии глиобластомы, наиболее агрессивной формы. рака мозга.[7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что ID2 взаимодействует с MyoD [8] и NEDD9 . [9]

См. Также [ править ]

  • Ингибитор ДНК-связывающего белка

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000115738 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020644 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Хара Е, Т Yamaguchi, Нодзима Н, Ида Т, Campisi Дж, Окаяма Н, ОДА К (февраль 1994). «Связанные с Id гены, кодирующие белки спираль-петля-спираль, необходимы для прогрессирования G1 и репрессируются в стареющих фибробластах человека». J Biol Chem . 269 (3): 2139–45. PMID 8294468 . 
  6. ^ «Энтрез Ген: ID2 ингибитор связывания ДНК 2, доминантный отрицательный белок спираль-петля-спираль» .
  7. ^ Ли, Санг Бэ; Фраттини, Вероника; Бансал, Мукеш; Castano, Angelica M .; Шерман, Дэн; Хатчинсон, Кейно; Брюс, Джеффри Н .; Калифано, Андреа; Лю, Гуанчжоу; Кардозо, Тимоти; Иавароне, Антонио; Ласорелла, Анна (2016). «ID2-зависимый механизм инактивации VHL при раке» . Природа . 529 (7585): 172–177. Bibcode : 2016Natur.529..172L . DOI : 10,1038 / природа16475 . PMC 5384647 . PMID 26735018 .  
  8. ^ Langlands K, Инь X, Ананд G, Prochownik EV (август 1997). «Дифференциальные взаимодействия белков Id с факторами транскрипции основной спирали, петли, спирали» . J. Biol. Chem . 272 (32): 19785–93. DOI : 10.1074 / jbc.272.32.19785 . PMID 9242638 . 
  9. ^ Закон SF, Чжан YZ, Fashena SJ, Toby G, J Estojak, Golemis EA (октябрь 1999). «Димеризация стыковочного / адаптерного белка HEF1 через карбокси-концевой домен спираль-петля-спираль». Exp. Cell Res . 252 (1): 224–35. DOI : 10.1006 / excr.1999.4609 . PMID 10502414 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Биггс Дж., Мерфи Э.В., Израиль Массачусетс (1992). «Человеческий Id-подобный белок спираль-петля-спираль, экспрессируемый на раннем этапе развития» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 89 (4): 1512–6. Полномочный код : 1992PNAS ... 89.1512B . DOI : 10.1073 / pnas.89.4.1512 . PMC  48481 . PMID  1741406 .
  • Iavarone A, Garg P, Lasorella A, Hsu J, Israel MA (1994). «Белок спираль-петля-спираль Id-2 усиливает пролиферацию клеток и связывается с белком ретинобластомы» . Genes Dev . 8 (11): 1270–84. DOI : 10,1101 / gad.8.11.1270 . PMID  7926730 .
  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Курабаяши М., Джеясилан Р., Кедес Л. (1993). «Две различные последовательности кДНК, кодирующие белок Id2 спираль-петля-спираль человека». Джин . 133 (2): 305–6. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (93) 90658-P . PMID  8224921 .
  • Мэтью С., Чен В., Мурти В.В., Бенезра Р., Чаганти Р.С. (1996). «Хромосомная принадлежность человеческих генов ID1 и ID2». Геномика . 30 (2): 385–7. DOI : 10.1006 / geno.1995.0037 . PMID  8586447 .
  • Lasorella A, Iavarone A, Israel MA (1996). «Id2 специфически изменяет регуляцию клеточного цикла белками-супрессорами опухоли» . Мол. Клетка. Биол . 16 (6): 2570–8. DOI : 10,1128 / MCB.16.6.2570 . PMC  231247 . PMID  8649364 .
  • Хара Е., Холл М., Петерс Г. (1997). «Cdk2-зависимое фосфорилирование Id2 модулирует активность факторов транскрипции, связанных с E2A» . EMBO J . 16 (2): 332–42. DOI : 10.1093 / emboj / 16.2.332 . PMC  1169639 . PMID  9029153 .
  • Langlands K, Yin X, Anand G, Prochownik EV (1997). «Дифференциальные взаимодействия белков Id с факторами транскрипции основной спирали, петли, спирали» . J. Biol. Chem . 272 (32): 19785–93. DOI : 10.1074 / jbc.272.32.19785 . PMID  9242638 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Yates PR, Atherton GT, Deed RW, Norton JD, Sharrocks AD (1999). «Белки Id спираль-петля-спираль ингибируют образование нуклеопротеиновых комплексов факторами транскрипции ETS-домена TCF» . EMBO J . 18 (4): 968–76. DOI : 10.1093 / emboj / 18.4.968 . PMC  1171189 . PMID  10022839 .
  • Йокота Ю., Мансури А., Мори С., Сугавара С., Адачи С., Нисикава С., Грусс П. (1999). «Развитие периферических лимфоидных органов и естественных клеток-киллеров зависит от ингибитора спираль-петля-спираль Id2». Природа . 397 (6721): 702–6. Bibcode : 1999Natur.397..702Y . DOI : 10.1038 / 17812 . PMID  10067894 . S2CID  4428856 .
  • Закон С.Ф., Чжан Ю.З., Фашена С.Дж., Тоби Г., Эстоджак Дж., Големис Е.А. (1999). «Димеризация стыковочного / адаптерного белка HEF1 через карбокси-концевой домен спираль-петля-спираль». Exp. Cell Res . 252 (1): 224–35. DOI : 10.1006 / excr.1999.4609 . PMID  10502414 .
  • Мольдес М, Бойзард М, Лиепвр XL, Фев Б, Дугайль I, Пайро Дж. (2000). «Функциональный антагонизм между ингибитором связывания ДНК (Id) и определением адипоцитов и транс-факторами фактора дифференцировки 1 / стерол-регуляторного элемента-связывающего белка-1c (ADD1 / SREBP-1c) для регуляции промотора синтазы жирных кислот в адипоцитах» . Biochem. Дж . 344 (3): 873–80. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3440873 . PMC  1220711 . PMID  10585876 .
  • Лю Дж, Ши В., Уорбертон Д. (2000). «Остаток цистеина в домене спираль-петля-спираль Id2 имеет решающее значение для гомодимеризации и функционирования». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 273 (3): 1042–7. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.3055 . PMID  10891368 .
  • Ласорелла А., Нозеда М., Бейна М., Йокота Ю., Иавароне А. (2000). «Id2 является белком-мишенью ретинобластомы и опосредует передачу сигналов онкобелками Myc». Природа . 407 (6804): 592–8. Bibcode : 2000Natur.407..592L . DOI : 10.1038 / 35036504 . PMID  11034201 . S2CID  4335368 .
  • Робертс Э.С., Дид RW, Иноуэ Т., Нортон Д.Д., Шаррокс А.Д. (2001). «Белки Id Helix-Loop-Helix противодействуют активности фактора транскрипции Pax путем ингибирования связывания ДНК» . Мол. Клетка. Биол . 21 (2): 524–33. DOI : 10.1128 / MCB.21.2.524-533.2001 . PMC  86614 . PMID  11134340 .
  • Ван С., Сдрулла А., Джонсон Дж. Э., Йокота Ю., Баррес Б. А. (2001). «Роль белка Id2 спирали-петли-спирали в контроле развития олигодендроцитов». Нейрон . 29 (3): 603–14. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (01) 00237-9 . PMID  11301021 . S2CID  7978661 .
  • Вонг Дж., Фунес-Дюран М., Альберг Дж., Раунд Дж., О'Коннелл Р., Миллер Р., Чен Е., Ричмонд, Пенсильвания, Вьерра, Калифорния (2001). «Характеристика основного белка спираль-петля-спираль, ABF-1: ядерная локализация, транскрипционные свойства и взаимодействие с Id-2». ДНК Cell Biol . 20 (8): 465–71. DOI : 10,1089 / 104454901316976091 . PMID  11560778 .
  • Сузуки Х, Фукуниси Й, Кагава И, Сайто Р., Ода Х, Эндо Т, Кондо С., Боно Х, Окадзаки Й, Хаяшизаки Й (2001). «Панель белок-белкового взаимодействия с использованием полноразмерных кДНК мыши» . Genome Res . 11 (10): 1758–65. DOI : 10.1101 / gr.180101 . PMC  311163 . PMID  11591653 .

Внешние ссылки [ править ]

  • ID2 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q02363 (ингибитор ДНК-связывающего белка ID-2) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .