Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
«Фактор транскрипции Икароса» перенаправляется сюда. Для использования в других целях, см Икар (значения) .
IKZF1
Идентификаторы
ПсевдонимыIKZF1 , Hs.54452, IK1, IKAROS, LYF1, LyF-1, PPP1R92, PRO0758, ZNFN1A1, CVID13, цинковый палец семейства IKAROS 1
Внешние идентификаторыOMIM : 603023 MGI : 1342540 HomoloGene : 55948 GeneCards : ikzf1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек) [1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение IKZF1
Геномное расположение IKZF1
Группа7п12.2Начинать50 304 068 п.н. [1]
Конец50 405 101 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 11 (мышь)
Chr.Хромосома 11 (мышь) [2]
Хромосома 11 (мышь)
Геномное расположение IKZF1
Геномное расположение IKZF1
Группа11 A1 | 11 7,02 смНачинать11 685 003 п.н. [2]
Конец11 772 926 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE IKZF1 216901 s в формате fs.png

PBB GE IKZF1 205039 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• Связывание ДНК
• Связывание с белком GO: 0001948
• связывание с ионом металла
• связывание нуклеиновой кислоты
• специфическое связывание с доменом белка
• GO: 0001200, GO : 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент• цитоплазма
• ядро клетки
• ядерный перицентрический гетерохроматин
• нуклеоплазма
• макромолекулярный комплекс
Биологический процесс• дифференцировка эритроцитов
• клеточный цикл
• развитие многоклеточных организмов
• развитие мезодермы
• негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• транскрипция, ДНК-шаблон
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• дифференцировка лимфоцитов
• гетероолигомеризация белков
• организация хроматина
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

10320

22778

Ансамбль

ENSG00000185811

ENSMUSG00000018654

UniProt

Q13422

Q03267

RefSeq (мРНК)
NM_001220765
NM_001220766
NM_001220767
NM_001220768
NM_001220769

NM_001220770
NM_001220771
NM_001220772
NM_001220773
NM_001220774
NM_001220775
NM_001220776
NM_001291837
NM_001291838
NM_001291839
NM_001291840
NM_001291841
NM_001291842
NM_001291843
NM_001291844
NM_001291845
NM_001291846
NM_001291847
NM_006060

NM_001025597
NM_001301863
NM_001301865
NM_001301866
NM_001301868

NM_009578

RefSeq (белок)
NP_001207694
NP_001207696
NP_001207697
NP_001207699
NP_001207700

NP_001278766
NP_001278767
NP_001278768
NP_001278769
NP_001278770
NP_001278771
NP_001278772
NP_001278773
NP_001278774
NP_001278775
NP_001278776
NP_006051

н / д

Расположение (UCSC)Chr 7: 50,3 - 50,41 МбChr 11: 11.69 - 11.77 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ДНК-связывающий белок Икарос также известный как Ikaros семьи цинковый палец белка 1 представляет собой белок , который у человека кодируется ikzf1 гена . [5] [6] [7]

Икарос - фактор транскрипции [ править ]

Икарос представляет собой фактор транскрипции, который кодируется генами IKZF из группы цинковых пальцев семейства Икарос . Цинковый палец - это небольшой структурный мотив белка, который позволяет белку связываться с молекулой ДНК или РНК, которая характеризуется координацией одного или нескольких ионов цинка (Zn 2+ ) для стабилизации складки.

Икарос выполняет важные функции в кроветворной системе и является известным регулятором развития иммунных клеток , в основном ранних B-клеток , CD4 + T-клеток . Его дисфункция была связана с развитием хронического лимфолейкоза. [8] [9] В частности, в последние годы было обнаружено, что Икарос является основным супрессором опухолей, участвующим в В-клеточной острой лимфобластной лейкемии [8], и что он также участвует в дифференцировке и функции отдельных Т-хелперов. клетки. [10]

Ikaros также играет роль на более поздних стадиях развития B-клеток во время рекомбинации VDJ в переключении класса изотипов антител и экспрессии рецептора B-клеток. [11]

У мышей с нокаутом Ikaros Т-клетки, но не В-клетки, образуются на поздних стадиях развития мышей из-за поздней компенсаторной экспрессии родственного гена Aiolos (IKZF3). [12] Мыши с точечными мутантами Ikaros являются эмбриональными летальными из-за анемии; у них есть серьезные дефекты дифференцировки терминальных эритроцитов и гранулоцитов и чрезмерное образование макрофагов. [13] ОНП, расположенные около 3 'области IKZF1 у людей, были связаны с предрасположенностью к детскому острому лимфобластному лейкозу (ОЛЛ) [14], а также к диабету 1 типа . [15] Эти два эффекта , как представляется, в противоположных направлениях, с аллелем маркировки восприимчивость к ALL защиты от СД1наоборот. [15]

Гены группы Ikaros Zinc Finger Family [ править ]

Семейство факторов транскрипции Ikaros Zinc Finger (IkZF) - известные регуляторы развития гемопоэтических клеток и многих иммунных клеток, включая клетки CD4 + T.

Семейство IkZF состоит из пяти членов: Ikaros (кодируется геном Ikzf1 ), Helios ( Ikzf2 ), Aiolos ( Ikzf3 ), Eos ( Ikzf4 ) и Pegasus ( Ikzf5 ). Эти факторы содержат N-концевые домены цинковых пальцев (ZF), которые ответственны за опосредование прямых взаимодействий с ДНК, и C-концевые ZF, которые облегчают гомо- и гетеродимеризацию между членами семейства IkZF. [16]

IKZF1 активируется в гранулоцитах, В-клетках, CD4 и CD8 Т-клетках и NK-клетках и подавляется в эритробластах, мегакариоцитах и ​​моноцитах. [17]

Дефицит Икароса [ править ]

Мутация в гене IKZF1 может вызывать дисфункцию фактора транскрипции Ikaros. Дисфункция влияет на экспрессию в B-клетках, что может привести к нарушению регуляции передачи сигналов BCR во время развития B-клеток и связано с трансформацией B-клеток. Дерегуляция затем может привести к низкой скорости пролиферации и усилению апоптоза В-клеток. Нарушение регуляции может быть связано с лимфопролиферативными нарушениями и различными формами лейкемии . [18]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что IKZF1 взаимодействует с:

  • CTBP1 , [19]
  • HDAC1 , [20] [21]
  • HDAC7A , [21]
  • Гистоновая деацетилаза 5 , [21]
  • IKZF2 , [22]
  • IKZF3 , [23] [20] [24]
  • IKZF4 , [25] [26]
  • SIN3A , [20] [21] [27]
  • Цереблон
  • SIN3B . [20] [21]
  • GATA2 [28]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000185811 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018654 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Георгопулоса K, Мур Д., Derfler B (октябрь 1992). «Икарос, ранний лимфоид-специфический фактор транскрипции и предполагаемый медиатор для приверженности Т-лимфоцитам». Наука . 258 (5083): 808–12. DOI : 10.1126 / science.1439790 . PMID 1439790 . 
  6. ^ Хам К, Р Эрнст, Ло К, Ким Г.С., Turck С, Смэйл СТ (ноябрь 1994 года). «Фактор лимфоидной транскрипции LyF-1 кодируется специфическими, альтернативно сплайсированными мРНК, происходящими из гена Ikaros» . Молекулярная и клеточная биология . 14 (11): 7111–23. DOI : 10.1128 / mcb.14.11.7111 . PMC 359245 . PMID 7935426 .  
  7. ^ «Entrez Gene: IKZF1 IKAROS family цинковый палец 1 (Ikaros)» .
  8. ^ а б Кастнер П., Чан С. (июнь 2011 г.). «Роль Икароса в Т-клеточном остром лимфобластном лейкозе» . Всемирный журнал биологической химии . 2 (6): 108–14. DOI : 10,4331 / wjbc.v2.i6.108 . PMC 3135856 . PMID 21765975 .  
  9. ↑ Oliveira VC, Lacerda MP, Moraes BB, Gomes CP, Maricato JT, Souza OF, et al. (Июль 2019 г.). «Дерегуляция экспрессии Ikaros в клетках B-1: новые взгляды на злокачественную трансформацию в хронический лимфоцитарный лейкоз». Журнал биологии лейкоцитов . 106 (3): 581–594. DOI : 10.1002 / JLB.MA1118-454R . PMID 31299112 . S2CID 196350761 .  
  10. ^ Пауэлл MD, Read KA, Sreekumar BK, Oestreich KJ (2019). «+ Дифференциация Т-хелперных клеток» . Границы иммунологии . 10 : 1299. DOI : 10.3389 / fimmu.2019.01299 . PMC 6563078 . PMID 31244845 .  
  11. Перейти ↑ Sellars M, Kastner P, Chan S (июнь 2011 г.). «Икарос в развитии и функционировании В-клеток» . Всемирный журнал биологической химии . 2 (6): 132–9. DOI : 10,4331 / wjbc.v2.i6.132 . PMC 3135860 . PMID 21765979 .  
  12. ^ Георгопулоса К, Winandy S, Avitahl N (1997). «Роль гена Ikaros в развитии лимфоцитов и гомеостазе». Ежегодный обзор иммунологии . 15 : 155–76. DOI : 10.1146 / annurev.immunol.15.1.155 . PMID 9143685 . 
  13. ^ Папатанасиу П., Перкинс А.С., Кобб Б.С., Феррини Р., Шридхаран Р., Хойн Г.Ф. и др. (Июль 2003 г.). «Широко распространенная недостаточность дифференцировки гематолимфоидов, вызванная рецессивным аллелем заполнения ниши фактора транскрипции Ikaros». Иммунитет . 19 (1): 131–44. DOI : 10.1016 / s1074-7613 (03) 00168-7 . PMID 12871645 . 
  14. ^ Папаэммануил Э., Хоскинг Ф.Дж., Виджаякришнан Дж., Прайс А, Олвер Б., Шеридан Э и др. (Сентябрь 2009 г.). «Локусы на 7p12.2, 10q21.2 и 14q11.2 связаны с риском развития острого лимфобластного лейкоза у детей» . Генетика природы . 41 (9): 1006–10. DOI : 10.1038 / ng.430 . PMC 4915548 . PMID 19684604 .  
  15. ^ a b Swafford AD, Howson JM, Davison LJ, Wallace C, Smyth DJ, Schuilenburg H, et al. (Март 2011 г.). «Аллель IKZF1 (Ikaros), отвечающий за предрасположенность к детскому острому лимфобластному лейкозу, защищает от диабета 1 типа» . Диабет . 60 (3): 1041–4. DOI : 10,2337 / db10-0446 . PMC 3046822 . PMID 21270240 .  
  16. ^ Пауэлл, доктор медицины, Read KA, Sreekumar BK, Oestreich KJ (2019-06-06). «+ Дифференциация Т-хелперных клеток» . Границы иммунологии . 10 : 1299. DOI : 10.3389 / fimmu.2019.01299 . PMC 6563078 . PMID 31244845 .  
  17. ^ Уоткинс Н.А., Гуснанто А., де Боно Б., Де С, Миранда-Сааведра Д., Харди Д.Л. и др. (Май 2009 г.). «HaemAtlas: характеристика экспрессии генов в дифференцированных клетках крови человека» . Кровь . 113 (19): e1-9. DOI : 10.1182 / кровь-2008-06-162958 . PMC 2680378 . PMID 19228925 .  
  18. ↑ Oliveira VC, Lacerda MP, Moraes BB, Gomes CP, Maricato JT, Souza OF, et al. (Июль 2019 г.). «Дерегуляция экспрессии Ikaros в клетках B-1: новые взгляды на злокачественную трансформацию в хронический лимфоцитарный лейкоз». Журнал биологии лейкоцитов . 106 (3): 581–594. DOI : 10.1002 / JLB.MA1118-454R . PMID 31299112 . S2CID 196350761 .  
  19. ^ Koipally J, K Георгопулоса (июнь 2000). «Взаимодействия Ikaros с CtBP выявляют механизм репрессии, который не зависит от активности гистондеацетилазы» . Журнал биологической химии . 275 (26): 19594–602. DOI : 10.1074 / jbc.M000254200 . PMID 10766745 . 
  20. ^ a b c d Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия со стороны Ikaros и Aiolos опосредуется комплексами гистондеацетилазы» . Журнал EMBO . 18 (11): 3090–100. DOI : 10.1093 / emboj / 18.11.3090 . PMC 1171390 . PMID 10357820 .  
  21. ^ a b c d e Койпалли Дж., Георгопулос К. (август 2002 г.). «Молекулярное вскрытие репрессивной схемы Икароса» . Журнал биологической химии . 277 (31): 27697–705. DOI : 10.1074 / jbc.M201694200 . PMID 12015313 . 
  22. ^ Келли СМ, Икед Т, Koipally Дж, Avitahl Н, В л, Георгопулосо К, Морган Б.А. (апрель 1998 г.). «Гелиос, новый партнер по димеризации Икароса, экспрессирующийся в самых ранних гемопоэтических предшественниках». Текущая биология . 8 (9): 508–15. DOI : 10.1016 / s0960-9822 (98) 70202-7 . PMID 9560339 . S2CID 17835058 .  
  23. ^ Морган Б., Сан Л., Авитал Н., Андрикопулос К., Икеда Т., Гонсалес Е. и др. (Апрель 1997 г.). «Aiolos, фактор транскрипции, ограниченный лимфоидом, который взаимодействует с Ikaros, чтобы регулировать дифференцировку лимфоцитов» . Журнал EMBO . 16 (8): 2004–13. DOI : 10.1093 / emboj / 16.8.2004 . PMC 1169803 . PMID 9155026 .  
  24. ^ Ким Дж, Сиф С, Джонс Б., Джексон А., Койпалли Дж, Хеллер Е и др. (Март 1999 г.). «ДНК-связывающие белки Ikaros направляют образование комплексов ремоделирования хроматина в лимфоцитах». Иммунитет . 10 (3): 345–55. DOI : 10.1016 / s1074-7613 (00) 80034-5 . PMID 10204490 . 
  25. ^ Хонма Y, Киёсава Х, Мори Т, Огури А, Никайдо Т, Канадзава К. и др. (Март 1999 г.). «Эос: новый член семейства генов Икарос, экспрессирующийся преимущественно в развивающейся нервной системе» . Письма FEBS . 447 (1): 76–80. DOI : 10.1016 / s0014-5793 (99) 00265-3 . PMID 10218586 . S2CID 28898354 .  
  26. ^ Пердомо Дж, Холмс М, Чонг В, Кросли М (декабрь 2000). «Eos и pegasus, два члена семейства белков Ikaros с различными ДНК-связывающими активностями» . Журнал биологической химии . 275 (49): 38347–54. DOI : 10.1074 / jbc.M005457200 . PMID 10978333 . 
  27. ^ Koipally J, K Георгопулоса (июнь 2002). «Взаимодействия Ikaros-CtIP не требуют C-концевого связывающего белка и участвуют в деацетилазонезависимом режиме репрессии» . Журнал биологической химии . 277 (26): 23143–9. DOI : 10.1074 / jbc.M202079200 . PMID 11959865 . 
  28. ^ Katsumura KR, Bresnick EH (апрель 2017). «Революция фактора GATA в гематологии» . Кровь . 129 (15): 2092–2102. DOI : 10,1182 / кровь 2016-09-687871 . PMC 5391619 . PMID 28179282 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Тоннель С., Калмельс Б., Марок С., Габерт Дж., Шабаннон С. (январь 2002 г.). «Экспрессия гена Ikaros и лейкемия». Лейкемия и лимфома . 43 (1): 29–35. DOI : 10.1080 / 10428190210186 . PMID  11908734 . S2CID  23932398 .
  • Вестман Б.Дж., Маккей Дж. П., Гелл Д. (октябрь 2002 г.). «Икарос: ключевой регулятор кроветворения». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 34 (10): 1304–7. DOI : 10.1016 / S1357-2725 (02) 00070-5 . PMID  12127581 .
  • Мольнар А., Ву П., Ларгеспада Д.А., Форткамп А., Шерер С., Коупленд Н.Г. и др. (Январь 1996 г.). «Ген Ikaros кодирует семейство ограниченных лимфоцитами ДНК-связывающих белков цинкового пальца, высоко консервативных у человека и мыши». Журнал иммунологии . 156 (2): 585–92. PMID  8543809 .
  • Нитфельд В., Мейерханс А. (январь 1996 г.). «Клонирование и секвенирование hIk-1, кДНК, кодирующей человеческий гомолог мышиного Ikaros / LyF-1». Письма иммунологии . 49 (1–2): 139–41. DOI : 10.1016 / 0165-2478 (95) 02479-4 . PMID  8964602 .
  • Морган Б., Сан Л., Авитал Н., Андрикопулос К., Икеда Т., Гонсалес Е. и др. (Апрель 1997 г.). «Aiolos, фактор транскрипции, ограниченный лимфоидом, который взаимодействует с Ikaros, чтобы регулировать дифференцировку лимфоцитов» . Журнал EMBO . 16 (8): 2004–13. DOI : 10.1093 / emboj / 16.8.2004 . PMC  1169803 . PMID  9155026 .
  • Келли С.М., Икеда Т., Койпалли Дж., Авитал Н., Ву Л., Георгопулос К., Морган Б.А. (апрель 1998 г.). «Гелиос, новый партнер по димеризации Икароса, экспрессирующийся в самых ранних гемопоэтических предшественниках». Текущая биология . 8 (9): 508–15. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (98) 70202-7 . PMID  9560339 . S2CID  17835058 .
  • Сан Л., Херема Н., Кротти Л., Ву Х, Навара С., Василев А. и др. (Январь 1999 г.). «Экспрессия доминантно-отрицательных и мутантных изоформ фактора транскрипции против лейкемии Ikaros при остром лимфобластном лейкозе у младенцев» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (2): 680–5. DOI : 10.1073 / pnas.96.2.680 . PMC  15196 . PMID  9892693 .
  • Ким Дж., Сиф С., Джонс Б., Джексон А., Койпалли Дж., Хеллер Е. и др. (Март 1999 г.). «ДНК-связывающие белки Ikaros направляют образование комплексов ремоделирования хроматина в лимфоцитах». Иммунитет . 10 (3): 345–55. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (00) 80034-5 . PMID  10204490 .
  • Хонма Ю., Киёсава Х., Мори Т., Огури А., Никайдо Т., Канадзава К. и др. (Март 1999 г.). «Эос: новый член семейства генов Икарос, экспрессирующийся преимущественно в развивающейся нервной системе» . Письма FEBS . 447 (1): 76–80. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (99) 00265-3 . PMID  10218586 . S2CID  28898354 .
  • Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия со стороны Ikaros и Aiolos опосредуется комплексами гистондеацетилазы» . Журнал EMBO . 18 (11): 3090–100. DOI : 10.1093 / emboj / 18.11.3090 . PMC  1171390 . PMID  10357820 .
  • Сан Л., Гудман П.А., Вуд С.М., Кротти М.Л., Сенсель М., Сатер Х и др. (Декабрь 1999 г.). «Экспрессия аберрантно сплайсированных изоформ онкогенных икарос в детском остром лимфобластном лейкозе». Журнал клинической онкологии . 17 (12): 3753–66. DOI : 10.1200 / JCO.1999.17.12.3753 . PMID  10577847 .
  • Хосокава Ю., Маэда Ю., Итинохасама Р., Миура И., Таниваки М., Сето М. (апрель 2000 г.). «Ген Ikaros, центральный регулятор лимфоидной дифференцировки, сливается с геном BCL6 в результате транслокации t (3; 7) (q27; p12) у пациента с диффузной большой B-клеточной лимфомой». Кровь . 95 (8): 2719–21. DOI : 10.1182 / blood.V95.8.2719 . PMID  10753856 .
  • Койпалли Дж., Георгопулос К. (июнь 2000 г.). «Взаимодействия Ikaros с CtBP выявляют механизм репрессии, который не зависит от активности гистондеацетилазы» . Журнал биологической химии . 275 (26): 19594–602. DOI : 10.1074 / jbc.M000254200 . PMID  10766745 .
  • Пердомо Дж., Холмс М., Чонг Б., Кроссли М. (декабрь 2000 г.). «Eos и pegasus, два члена семейства белков Ikaros с различными ДНК-связывающими активностями» . Журнал биологической химии . 275 (49): 38347–54. DOI : 10.1074 / jbc.M005457200 . PMID  10978333 .
  • Пейн К.Дж., Николас Дж. Х., Чжу Дж. Ю., Барский Л. В., Крукс Г. М. (август 2001 г.). «Передний край: преобладающее выражение новой изоформы Ikaros в нормальном гемопоэзе человека» . Журнал иммунологии . 167 (4): 1867–70. DOI : 10.4049 / jimmunol.167.4.1867 . PMID  11489963 .
  • Койпалли Дж., Хеллер Э. Дж., Сивитт Дж. Р., Георгопулос К. (апрель 2002 г.). «Нетрадиционное усиление экспрессии генов с помощью Икароса» . Журнал биологической химии . 277 (15): 13007–15. DOI : 10.1074 / jbc.M111371200 . PMID  11799125 .
  • Dorsam G, Goetzl EJ (апрель 2002 г.). «Вазоактивный кишечный пептидный рецептор-1 (VPAC-1) представляет собой новую генную мишень гемолимфопоэтического фактора транскрипции Ikaros» . Журнал биологической химии . 277 (16): 13488–93. DOI : 10.1074 / jbc.M107922200 . PMID  11812772 .

Внешние ссылки [ править ]

  • IKZF1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Расположение человеческого гена IKZF1 в браузере генома UCSC .
  • Подробная информация о человеческом гене IKZF1 в браузере генома UCSC .