Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
IRF5
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3ДШ

Идентификаторы
ПсевдонимыIrf5 , SLEB10, интерферон регуляторного фактора 5
Внешние идентификаторыOMIM : 607218 MGI : 1350924 HomoloGene : 8088 GeneCards : irf5
Расположение гена ( человек )
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек) [1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение IRF5
Геномное расположение IRF5
Группа7q32.1Начинать128 937 457 п.н. [1]
Конец128 950 038 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 6 (мышь)
Chr.Хромосома 6 (мышь) [2]
Хромосома 6 (мышь)
Геномное расположение IRF5
Геномное расположение IRF5
Группа6 A3.3 | 6 12,36 смНачинать29 526 625 п.н. [2]
Конец29 541 871 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE IRF5 205468 s в формате fs.png

PBB GE IRF5 205469 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание ДНК
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• Связывание с белками GO: 0001948
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфическая
для РНК-полимеразы II • Последовательно-специфическое связывание с ДНК
• идентичное связывание с белками
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфическая для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент• цитоплазма
• цитозоль
• ядро клетки
Биологический процесс• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• позитивная регуляция продукции интерлейкина-12
• сигнальный путь, опосредованный гамма-интерфероном
• процесс иммунной системы
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• позитивная регуляция продукции интерферона-альфа
• ответ на мурамилдипептид
• транскрипция, ДНК-шаблон
• защитный ответ на вирус
• сигнальный путь интерферона типа I
• ответ на пептидогликан
• позитивная регуляция апоптотического процесса
• врожденная иммунная система
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• позитивная регуляция продукции интерферона-бета
• сигнальный путь, опосредованный цитокинами
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3663

27056

Ансамбль

ENSG00000128604

ENSMUSG00000029771

UniProt

Q13568

P56477

RefSeq (мРНК)
NM_001098627
NM_001098629
NM_001098630
NM_001242452
NM_032643

NM_001347928
NM_001364314

NM_001252382
NM_012057
NM_001311083

RefSeq (белок)
NP_001092097
NP_001092099
NP_001092100
NP_001229381
NP_116032

NP_001334857
NP_001351243
NP_001092099.1

NP_001239311
NP_001298012
NP_036187

Расположение (UCSC)Chr 7: 128.94 - 128.95 МбChr 6: 29,53 - 29,54 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Интерферон регуляторного фактора 5 представляет собой белок , который у человека кодируется irf5 гена . [5]

Функция [ править ]

IRF5 является членом семейства факторов регуляции интерферона (IRF), группы факторов транскрипции с различными ролями, включая вирус-опосредованную активацию интерферона и модуляцию роста, дифференцировки, апоптоза и активности иммунной системы клеток. Члены семейства IRF характеризуются консервативным N-концевым ДНК-связывающим доменом, содержащим повторы триптофана (W). Существуют альтернативные варианты сплайсинга, кодирующие разные изоформы. [5]

Исследование 2020 года показало, что адаптерный белок, названный TASL, играет важную регуляторную роль в активации IRF5, фосфорилируясь по мотиву pLxIS [6], проводя аналогию с путем активации IRF3 через адаптерные белки MAVS, STING и TRIF. [7]

Клиническое значение [ править ]

IRF5 действует как молекулярный переключатель, который контролирует, будут ли макрофаги способствовать или подавлять воспаление. Блокирование выработки IRF5 в макрофагах может помочь в лечении широкого спектра аутоиммунных заболеваний, и что повышение уровня IRF5 может помочь в лечении людей, чья иммунная система ослаблена, ослаблена или повреждена. IRF5, по-видимому, работает «либо за счет прямого взаимодействия с ДНК, либо за счет взаимодействия с другими белками, которые сами контролируют, какие гены включены». [8]

См. Также [ править ]

  • Факторы регуляции интерферона

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000128604 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029771 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Entrez: фактор регуляции интерферона IRF5 5» .
  6. ^ Хайнц, Леонард X .; Ли, Чан Ын; Капур, Уткарш; Картниг, Феликс; Седляров, Виталий; Папакостас, Константинос; Сезар-Разкин, Адриан; Эсслецбихлер, Патрик; Гольдманн, Ульрих; Стефанович, Адрияна; Bigenzahn, Johannes W .; Скорцони, Стефания; Pizzagalli, Mattia D .; Бенсимон, Ариэль; Мюллер, Андре С .; Кинг, Ф. Джеймс; Ли, Цзюнь; Жирарди, Энрико; Мбоу, М. Ламин; Уайтхерст, Чарльз Э .; Ребсамен, Мануэле; Суперти-Фурга, Джулио (13 мая 2020 г.). «TASL - это связанный с SLC15A4 адаптер для активации IRF5 с помощью TLR7–9». Природа . 581 (7808): 316–322. Bibcode : 2020Natur.581..316H . DOI : 10.1038 / s41586-020-2282-0 . PMID 32433612 . S2CID  218625265 .
  7. ↑ Лю С., Цай X, Ву Дж, Конг Q, Чен Х, Ли Т, Ду Ф, Рен Дж, Ву И, Гришин Н. и Чен З. Дж. (13 марта 2015 г.). «Фосфорилирование адаптерных белков врожденного иммунитета MAVS, STING и TRIF вызывает активацию IRF3» . Наука . 347 (6227): ааа2630. DOI : 10.1126 / science.aaa2630 . PMID 25636800 . 
  8. ^ Krausgruber Т, Блазек К, Т Smallie, Alzabin S, Lockstone Н, Сахгал Н, Hussell Т, Фельдман М, Удалова И.А. (январь 2011). «IRF5 способствует поляризации воспалительных макрофагов и ответов T (H) 1-T (H) 17». Nat Immunol . 12 (3): 231–238. DOI : 10.1038 / ni.1990 . PMID 21240265 . S2CID 13730047 . Краткое содержание - MedScape .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Pitha PM, Au WC, Lowther W. и др. (1999). «Роль факторов регуляции интерферона (IRF) в вирусной передаче сигналов и регуляции роста клеток». Биохимия . 80 (8–9): 651–8. DOI : 10.1016 / S0300-9084 (99) 80018-2 . PMID  9865487 .
  • Барнс Б., Лубьева Б., Питха П.М. (2002). «О роли IRF в защите хозяев». J. Interferon Cytokine Res . 22 (1): 59–71. DOI : 10,1089 / 107999002753452665 . PMID  11846976 .
  • Барнс Б.Дж., Мур PA, Pitha PM (2001). «Вирус-специфическая активация нового фактора регуляции интерферона, IRF-5, приводит к индукции различных генов интерферона альфа» . J. Biol. Chem . 276 (26): 23382–90. DOI : 10.1074 / jbc.M101216200 . PMID  11303025 .
  • Nehyba J, Hrdlicková R, Burnside J, Bose HR (2002). «Новый фактор регуляции интерферона (IRF), IRF-10, играет уникальную роль в иммунной защите и индуцируется онкобелком v-Rel» . Мол. Клетка. Биол . 22 (11): 3942–57. DOI : 10.1128 / MCB.22.11.3942-3957.2002 . PMC  133824 . PMID  11997525 .
  • Барнс Б.Дж., Келлум М.Дж., Field AE, Pitha PM (2002). «Множественные регуляторные домены IRF-5 контролируют активацию, клеточную локализацию и индукцию хемокинов, которые опосредуют рекрутирование Т-лимфоцитов» . Мол. Клетка. Биол . 22 (16): 5721–40. DOI : 10.1128 / MCB.22.16.5721-5740.2002 . PMC  133975 . PMID  12138184 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Барнс Б.Дж., Филд А.Е., Питха-Роу PM (2003). «Вирус-индуцированное образование гетеродимера между IRF-5 и IRF-7 модулирует сборку энхансомов IFNA in vivo и транскрипционную активность генов IFNA» . J. Biol. Chem . 278 (19): 16630–41. DOI : 10.1074 / jbc.M212609200 . PMID  12600985 .
  • Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR и др. (2003). «Хромосома человека 7: последовательность ДНК и биология» . Наука . 300 (5620): 767–72. Bibcode : 2003Sci ... 300..767S . DOI : 10.1126 / science.1083423 . PMC  2882961 . PMID  12690205 .
  • Барнс Б.Дж., Келлум М.Дж., Пиндер К.Э. и др. (2003). «Интерферон регулирующий фактор 5, новый медиатор остановки клеточного цикла и гибели клеток». Cancer Res . 63 (19): 6424–31. PMID  14559832 .
  • Барнс Б.Дж., Ричардс Дж., Мэнкл М. и др. (2004). «Глобальные и отдельные мишени IRF-5 и IRF-7 во время врожденного ответа на вирусную инфекцию» . J. Biol. Chem . 279 (43): 45194–207. DOI : 10.1074 / jbc.M400726200 . PMID  15308637 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Лин Р., Ян Л., Аргуэлло М. и др. (2005). «CRM1-зависимый путь ядерного экспорта участвует в регуляции субклеточной локализации IRF-5» . J. Biol. Chem . 280 (4): 3088–95. DOI : 10.1074 / jbc.M408452200 . PMID  15556946 .
  • Сигурдссон С., Нордмарк Г., Геринг Х. Х. и др. (2005). «Полиморфизм генов тирозинкиназы 2 и фактора регуляции интерферона 5 связан с системной красной волчанкой» . Являюсь. J. Hum. Genet . 76 (3): 528–37. DOI : 10.1086 / 428480 . PMC  1196404 . PMID  15657875 .
  • Такаока А., Янаи Х., Кондо С. и др. (2005). «Интегральная роль IRF-5 в программе индукции генов, активируемых Toll-подобными рецепторами». Природа . 434 (7030): 243–9. Bibcode : 2005Natur.434..243T . DOI : 10,1038 / природа03308 . PMID  15665823 . S2CID  667829 .
  • Schoenemeyer A, Barnes BJ, Mancl ME, et al. (2005). «Фактор регуляции интерферона, IRF5, является центральным медиатором передачи сигналов toll-подобного рецептора 7» . J. Biol. Chem . 280 (17): 17005–12. DOI : 10.1074 / jbc.M412584200 . PMID  15695821 .
  • Mancl ME, Hu G, Sangster-Guity N, Olshalsky SL, Hoops K, Fitzgerald-Bocarsly P, Pitha PM, Pinder K, Barnes BJ (июнь 2005 г.). «Два дискретных промотора регулируют альтернативно сплайсированные изоформы регуляторного фактора 5 человеческого интерферона. Множественные изоформы с различными типами клеток экспрессией, локализацией, регуляцией и функцией» . J. Biol. Chem . 280 (22): 21078–90. DOI : 10.1074 / jbc.M500543200 . PMID  15805103 .
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
  • Грэм Р.Р., Козырев С.В., Baechler EC и др. (2006). «Общий гаплотип фактора регуляции интерферона 5 (IRF5) регулирует сплайсинг и экспрессию и связан с повышенным риском системной красной волчанки». Nat. Genet . 38 (5): 550–5. DOI : 10,1038 / нг1782 . PMID  16642019 . S2CID  21426281 .

Внешние ссылки [ править ]

  • IRF5 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q13568 (фактор регулирования интерферона 5) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , которая находится в свободном доступе .