Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
IRF7
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2O61

Идентификаторы
ПсевдонимыIRF7 , IRF-7H, IRF7A, IRF7B, IRF7C, IRF7H, IMD39, фактор регуляции интерферона 7, IRF-7
Внешние идентификаторыOMIM : 605047 MGI : 1859212 HomoloGene : 128624 GeneCards : irf7
Расположение гена ( человек )
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человека) [1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение IRF7
Геномное расположение IRF7
Группа11p15.5Начинать612 553 п.н. [1]
Конец615 983 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 7 (мышь)
Chr.Хромосома 7 (мышь) [2]
Хромосома 7 (мышь)
Геномное расположение IRF7
Геномное расположение IRF7
Группа7 | 7 F5Начинать141 262 706 п.н. [2]
Конец141 266 481 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE IRF7 208436 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с ДНК
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• Связывание с белком GO: 0001948
• Связывание ДНК с последовательностью основного промотора РНК-полимеразы II
• Активность фактора транскрипции, РНК-полимераза II Связывание, специфичное для последовательности проксимальной области основного промотора
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201, ДНК-связывающий фактор транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II
• GO: 0000980 Связывание ДНК с цис-регуляторной областью РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности
• GO : 0001158 Связывание ДНК проксимальной области корового промотора, специфичное для последовательности
Сотовый компонент• нуклеоплазма
• мембрана эндосомы
• ядро клетки
• цитоплазма
• цитозоль
Биологический процесс• позитивная регуляция опосредованного интерфероном сигнального пути I типа
• регуляция транскрипции по шаблону ДНК
• позитивная регуляция продукции интерферона-альфа
• сигнальный путь MDA-5
• сигнальный путь, опосредованный интерфероном гамма
• процесс иммунной системы
• регуляция адаптивного иммунитета ответ
• ответ на вирус
• отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция, ДНК-шаблонная
• регуляция продукции интерферона I типа
• клеточный ответ на стимул повреждения ДНК
• TRIF-зависимый сигнальный путь толл-подобных рецепторов
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• негативная регуляция процесса апоптоза макрофагов
• сигнальный путь интерферона типа I
• иммуноглобулин-опосредованный иммунный ответ
• установление вирусной латентности
• регуляция иммунного ответа
• Вирусный процесс GO: 0022415
• регуляция дифференцировки моноцитов
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• позитивная регуляция продукции интерферона-бета
• продукция интерферона-бета
• регуляция MyD88-независимого сигнального пути толл-подобного рецептора
• позитивная регуляция продукции интерферона типа I
• врожденная иммунная система
• регуляция MyD88-зависимого сигнального пути толл-подобного рецептора
• продукция интерферона-альфа
• защитный ответ на вирус
• регуляция экспрессии генов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3665

54123

Ансамбль

ENSG00000276561
ENSG00000185507

ENSMUSG00000025498

UniProt

Q92985

P70434

RefSeq (мРНК)

NM_001572
NM_004029
NM_004030
NM_004031

NM_001252600
NM_001252601
NM_016850

RefSeq (белок)

НП_001563
НП_004020
НП_004022

NP_001239529
NP_001239530
NP_058546

Расположение (UCSC)Chr 11: 0,61 - 0,62 МбChr 7: 141.26 - 141.27 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор регуляции интерферона 7 , также известный как IRF7 , является членом семейства факторов регуляции интерферона факторов транскрипции .

Функция [ править ]

IRF7 кодирует фактор регуляции 7 интерферона, член семейства факторов регуляции транскрипции интерферона (IRF). Было показано, что IRF7 играет роль в активации транскрипции индуцируемых вирусами клеточных генов , включая гены интерферона I типа . В частности, IRF7 регулирует многие гены интерферона-альфа . [5] Конститутивная экспрессия IRF7 в значительной степени ограничена лимфоидной тканью , в основном плазмацитоидными дендритными клетками, тогда как IRF7 индуцируется во многих тканях. Было идентифицировано множество вариантов транскрипта IRF7, хотя их функциональные последствия еще не установлены. [6]

Было показано, что путь IRF7 подавляется в некоторых линиях клеток метастатического рака молочной железы, что может помочь клеткам избежать иммунного ответа хозяина. [7] Восстановление IRF7 в этих клеточных линиях уменьшило метастазы и увеличило время выживания хозяина в моделях на животных.

Было показано, что ген и продукт IRF7 являются дефектными у пациента с тяжелой восприимчивостью к гриппу H1N1 , в то время как чувствительность к другим вирусным заболеваниям, таким как CMV, RSV и парагрипп, не изменилась. [8]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что IRF7 взаимодействует с IRF3 . [9] Также было показано, что IRF7 взаимодействует с белком, взаимодействующим с арилуглеводородным рецептором (AIP) , который является негативным регулятором противовирусного пути. [10]

См. Также [ править ]

  • Факторы регуляции интерферона

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c ENSG00000185507 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000276561, ENSG00000185507 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025498 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Marié I, Дурбин JE, Леви DE (ноябрь 1998). «Дифференциальная вирусная индукция различных генов интерферона-альфа посредством положительной обратной связи через фактор регуляции интерферона-7» . Журнал EMBO . 17 (22): 6660–9. DOI : 10.1093 / emboj / 17.22.6660 . PMC 1171011 . PMID 9822609 .  
  6. ^ «Энтрез Ген: фактор 7 регуляции интерферона IRF7» .
  7. ^ Bidwell (2012). «Замалчивание путей Irf7 в клетках рака груди способствует метастазированию в кости за счет ускользания иммунной системы». Природная медицина . 18 (8): 1224–1231. DOI : 10.1038 / nm.2830 . PMID 22820642 . S2CID 6727932 .  
  8. ^ Ciancanelli МДж, Хуанг SX, Luthra Р, Гарнер Н, Итан Y, Вольпи S, Лафай FG, Trouillet С, Schmolke М, Альбрехт Р.А., Исраелссон Е, Лим HK, Casadio М, Хермеш Т, Лоренцо л, Leung ЛМ, Pedergnana V, Boisson B, Okada S, Picard C, Ringuier B, Troussier F, Chaussabel D, Abel L, Pellier I, Notarangelo LD, García-Sastre A, Basler CF, Geissmann F, Zhang SY, Snoeck HW, Casanova JL (апрель 2015). «Инфекционное заболевание. Опасный для жизни грипп и нарушение амплификации интерферона при дефиците IRF7 человека» . Наука . 348 (6233): 448–53. DOI : 10.1126 / science.aaa1578 . PMC 4431581 . PMID 25814066 .  
  9. ^ Au WC, Yeow WS, Pitha PM (февраль 2001). «Анализ функциональных доменов фактора регуляции интерферона 7 и его связь с IRF-3». Вирусология . 280 (2): 273–82. DOI : 10.1006 / viro.2000.0782 . PMID 11162841 . 
  10. ^ Чжоу Q, LaVorgna А, Bowman М, Hiscott Дж, Harhaj EW (июнь 2015). «Белок, взаимодействующий с арилуглеводородным рецептором, нацелен на IRF7 для подавления передачи противовирусных сигналов и индукции интерферона I типа» . Журнал биологической химии . 290 (23): 14729–39. DOI : 10.1074 / jbc.M114.633065 . PMC 4505538 . PMID 25911105 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Нинг С., Пагано Дж. С., Парикмахер Г. Н. (сентябрь 2011 г.). «IRF7: активация, регулировка, модификация и функция» . Гены и иммунитет . 12 (6): 399–414. DOI : 10.1038 / gene.2011.21 . PMC  4437765 . PMID  21490621 .
  • Pitha PM, Au WC, Lowther W, Juang YT, Schafer SL, Burysek L, Hiscott J, Moore PA (1999). «Роль факторов регуляции интерферона (IRF) в вирусной передаче сигналов и регуляции роста клеток». Биохимия . 80 (8–9): 651–8. DOI : 10.1016 / S0300-9084 (99) 80018-2 . PMID  9865487 .
  • Чжан Л., Pagano JS (январь 2002 г.). «Устройство и функции ИРФ-7». Журнал исследований интерферона и цитокинов . 22 (1): 95–101. DOI : 10,1089 / 107999002753452700 . PMID  11846980 .
  • Чжан Л., Пагано Дж.С. (октябрь 1997 г.). «IRF-7, новый фактор регуляции интерферона, связанный с латентным периодом вируса Эпштейна-Барра» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (10): 5748–57. DOI : 10,1128 / MCB.17.10.5748 . PMC  232423 . PMID  9315633 .
  • Wathelet MG, Lin CH, Parekh BS, Ronco LV, Howley PM, Maniatis T (март 1998 г.). «Вирусная инфекция индуцирует сборку скоординированно активированных факторов транскрипции на энхансере IFN-бета in vivo». Молекулярная клетка . 1 (4): 507–18. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80051-9 . PMID  9660935 .
  • Au WC, Мур PA, LaFleur DW, Tombal B, Pitha PM (октябрь 1998 г.). «Характеристика регуляторного фактора интерферона-7 и его потенциальной роли в активации транскрипции генов интерферона А» . Журнал биологической химии . 273 (44): 29210–7. DOI : 10.1074 / jbc.273.44.29210 . PMID  9786932 .
  • Лу Р., Ау В.С., Йео В.С., Хагеман Н., Пита П.М. (октябрь 2000 г.). «Регулирование активности промотора гена фактора-7, регулирующего интерферон. Активация интерфероном и подавление его гиперметилированием» . Журнал биологической химии . 275 (41): 31805–12. DOI : 10.1074 / jbc.M005288200 . PMID  10924517 .
  • Пэрис М.Дж., Уильямс Б.Р. (октябрь 2000 г.). «Характеристика контига размером 500 т.п.н., охватывающего область между c-Ha-Ras и MUC2 на хромосоме 11p15.5». Геномика . 69 (2): 196–202. DOI : 10.1006 / geno.2000.6339 . PMID  11031102 .
  • Марие I, Смит Э., Пракаш А., Леви Д.Е. (декабрь 2000 г.). «Индуцированная фосфорилированием димеризация фактора регуляции интерферона 7 разоблачает связывание ДНК и домен двусторонней трансактивации» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (23): 8803–14. DOI : 10.1128 / MCB.20.23.8803-8814.2000 . PMC  86519 . PMID  11073981 .
  • Смит Э.Дж., Мари I, Пракаш А., Гарсия-Састре А., Леви Д.Е. (март 2001 г.). «Фосфорилирование IRF3 и IRF7 в инфицированных вирусом клетках не требует двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы R или Ikappa B киназы, но блокируется белком E3L вируса осповакцины» . Журнал биологической химии . 276 (12): 8951–7. DOI : 10.1074 / jbc.M008717200 . PMID  11124948 .
  • Au WC, Yeow WS, Pitha PM (февраль 2001 г.). «Анализ функциональных доменов фактора регуляции интерферона 7 и его связь с IRF-3». Вирусология . 280 (2): 273–82. DOI : 10.1006 / viro.2000.0782 . PMID  11162841 .
  • Лу Р, Мур PA, Pitha PM (май 2002 г.). «Стимуляция экспрессии гена IRF-7 альфа-фактором некроза опухоли: потребность в факторе транскрипции NFkappa B и доступность гена» . Журнал биологической химии . 277 (19): 16592–8. DOI : 10.1074 / jbc.M111440200 . PMID  11877397 .
  • Морин П., Браганса Дж., Банду М.Т., Лин Р., Хискотт Дж., Доли Дж., Сивас А. (март 2002 г.). «Предпочтительные сайты связывания для факторов регуляции интерферона 3 и 7, участвующих в транскрипции гена интерферона-А». Журнал молекулярной биологии . 316 (5): 1009–22. DOI : 10.1006 / jmbi.2001.5401 . PMID  11884139 .
  • Кайо А., Пракаш А., Смит Э., Масуми А., Ованесян А.Г., Леви Д.Е., Мари I (декабрь 2002 г.). «Ацетилирование фактора-7, регулирующего интерферон, с помощью фактора, ассоциированного с p300 / CREB-связывающим белком (CBP) (PCAF), нарушает его связывание с ДНК» . Журнал биологической химии . 277 (51): 49417–21. DOI : 10.1074 / jbc.M207484200 . PMID  12374802 .
  • Измайлова Е., Бертли Ф.М., Хуанг К., Макори Н., Миллер С.Дж., Янг Р.А., Альдовини А. (февраль 2003 г.). «ВИЧ-1 Tat перепрограммирует незрелые дендритные клетки для экспрессии хемоаттрактантов для активированных Т-клеток и макрофагов». Природная медицина . 9 (2): 191–7. DOI : 10.1038 / nm822 . PMID  12539042 . S2CID  26145639 .
  • Ян Х., Лин Ч., Ма Г, Баффи МО, Уотелет М.Г. (май 2003 г.). «Фактор-7, регулирующий интерферон, взаимодействует с другими факторами транскрипции за счет множественных взаимодействий с коактиваторами p300 / CBP» . Журнал биологической химии . 278 (18): 15495–504. DOI : 10.1074 / jbc.M212940200 . PMID  12604599 .
  • Нинг С., Хан А.М., Хуйе Л.Э., Пагано Дж.С. (сентябрь 2003 г.). «Интерфероновый регуляторный фактор 7 регулирует экспрессию латентного мембранного белка 1 вируса Эпштейна-Барра: регуляторный контур» . Журнал вирусологии . 77 (17): 9359–68. DOI : 10,1128 / JVI.77.17.9359-9368.2003 . PMC  187426 . PMID  12915551 .
  • Фицджеральд К.А., Роу, округ Колумбия, Барнс Б.Дж., Кэффри Д.Р., Визинтин А., Латц Е., Монах Б., Пита П.М., Голенбок Д.Т. (октябрь 2003 г.). «Передача сигналов LPS-TLR4 к IRF-3/7 и NF-kappaB включает в себя адаптеры платы за проезд TRAM и TRIF» . Журнал экспериментальной медицины . 198 (7): 1043–55. DOI : 10,1084 / jem.20031023 . PMC  2194210 . PMID  14517278 .
  • Лин Р., Нойс Р.С., Коллинз С.Е., Эверетт Р.Д., Моссман К.Л. (февраль 2004 г.). «Палец-домен ICP0 RING вируса простого герпеса ингибирует IRF3- и IRF7-опосредованную активацию генов, стимулированных интерфероном» . Журнал вирусологии . 78 (4): 1675–84. DOI : 10,1128 / JVI.78.4.1675-1684.2004 . PMC  369457 . PMID  14747533 .

Внешние ссылки [ править ]

  • СМИ, связанные с регуляторным фактором-7 интерферона на Викискладе?
  • IRF7 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .