Транспортина-1 (или Importin-β 2 ) представляет собой белок , который у человека кодируется TNPO1 гена . [5] [6] [7]
TNPO1 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | TNPO1 , IPO2, KPNB2, MIP, MIP1, TRN, Transportin 1 | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 602901 MGI : 2681523 HomoloGene : 5358 GeneCards : TNPO1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 5: 72,82 - 72,92 Мб | Chr 13: 98,84 - 98,93 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Функция
Этот белок представляет собой кариоферин, который взаимодействует с последовательностью ядерной локализации для нацеливания ядерных белков на ядро. Классический рецепторный комплекс кариоферина, такой как комплекс, в котором используется Импортин-β1 (кодируемый геном KPNB1 ), представляет собой гетеродимер альфа-субъединицы, которая распознает сигнал ядерной локализации, и бета-субъединицы, которая присоединяет комплекс к нуклеопоринам. Однако Transportin-1 может напрямую связываться с белками-грузами, и для этого может не потребоваться альфа-субъединица импортина. [8]
Предполагается, что Transportin-1 использует тот же основной механизм для осуществления ядерного транспорта, что и другие импортины. Он опосредует стыковку с комплексом ядерных пор посредством связывания с нуклеопорином и впоследствии перемещается через поры с помощью механизма, требующего энергии. Затем в ядре Ran связывается с Transportin-1, он отделяется от груза, и Transportin-1 реэкспортируется из ядра в цитоплазму, где гидролиз GTP высвобождает Ran. Тогда Transportin-1 может привязать новый груз.
Кроме того, Transportin-1 участвует в транспортировке белка в первичные реснички . [9] Считается, что в этом случае функция Transportin-1 аналогична переносу белков в ядро через ядерную пору. Transportin-1 связывает груз, а затем помогает ему пройти через пору в основании реснички. В этом механизме также участвуют Ran и нуклеопорины. [10]
Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскрипта, кодирующим разные белки. [7]
Цели
Транспортин 1 (TRN1) является частью неклассического ядерного пути импорта. В сочетании с каскадом гидролиза RanGTP TRN1 действует, чтобы импортировать выбранные белки в ядро клеток. Эти мишени обычно содержат мотив PY, иначе известный как сигнал ядерной локализации M9. Хорошо описанные примеры включают hnRNP A1 . [11]
Тип белков-грузов, которые Транспортин 1 может переносить в ядро, включает РНК-связывающие белки (такие как hnRNP A1 и hnRNP F), а также рибосомные белки. [12]
Клиническое значение
TRN1 участвует в патогенезе двух нейродегенеративных заболеваний, а именно бокового амиотрофического склероза и лобно-височной деменции . [13]
Взаимодействия
Транспортин 1 взаимодействует с:
- RGPD5 [14] и
- Ран (биология) . [15] [16]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000083312 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009470 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Поллард В.М., Майкл В.М., Накельни С., Сиоми М.С., Ван Ф., Дрейфус Дж. (Декабрь 1996 г.). «Новый рецептор-опосредованный путь импорта ядерного белка». Cell . 86 (6): 985–94. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80173-7 . PMID 8808633 . S2CID 15666255 .
- ^ Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (июнь 1997 г.). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (10): 5055–60. DOI : 10.1073 / pnas.94.10.5055 . PMC 24630 . PMID 9144189 .
- ^ а б "Entrez Gene: TNPO1 transportin 1" .
- ^ RA Fridell (1997). Ядерный импорт hnRNP A1 опосредуется новым клеточным кофактором, связанным с кариоферином-бета . Journal of Cell Science 1997 110: 1325-1331;
- ^ Тоби В. Херд (2011). Локализация пигментного ретинита 2 в ресничках регулируется Importin β2 . J Cell Sci 2011 124: 718-726; DOI: 10.1242 / jcs.070839
- ^ Kee HL (2012). Барьер проницаемости для исключения размера и нуклеопорины характеризуют комплекс пор ресничек, который регулирует транспорт в реснички. . Nat. Cell Biol. 2012 4 марта; 14 (4): 431-7. DOI: 10,1038 / NCB2450.
- ^ Dormann D, Rodde R, Edbauer D, Bentmann E, Fischer I, Hruscha A, Than ME, Mackenzie IR, Capell A, Schmid B, Neumann M, Haass C (август 2010). «Мутации, связанные с БАС, слитые в саркоме (FUS), нарушают ядерный импорт, опосредованный транспортином» . EMBO J . 29 (16): 2841–57. DOI : 10.1038 / emboj.2010.143 . PMC 2924641 . PMID 20606625 .
- ^ Анн-Кристин Str (2001). Импортин-бета-подобные рецепторы ядерного транспорта . Genome Biol. 2001; 2 (6): обзоры3008.1 – обзоры3008.9.
- ^ Брелстафф Дж., Лэшли Т., Холтон Дж. Л., Лис А. Дж., Россор М. Н., Бандопадхай Р., Ревес Т. (ноябрь 2011 г.). «Транспортин1: маркер FTLD-FUS». Acta Neuropathol . 122 (5): 591–600. DOI : 10.1007 / s00401-011-0863-6 . PMID 21847626 . S2CID 5913873 .
- ^ Цай И, Мяо С.Ю., Ван Л.Ф. (октябрь 2001 г.). «[Определение сайта связывания семенников-специфического нуклеопорина BS-63 с транспортином (кароферин бета 2) и доказательство их комбинации in vitro]». Чжунго И Сюэ Кэ Сюэ Юань Сюэ Бао (на китайском языке). 23 (5): 462–6. PMID 12905863 .
- ^ Чук Ю.М., Блобель Г. (май 1999 г.). «Структура ядерного транспортного комплекса кариоферин-бета2-Ran x GppNHp». Природа . 399 (6733): 230–7. DOI : 10.1038 / 20375 . PMID 10353245 . S2CID 4413233 .
- ^ Шамшер М.К., Плоски Дж., Раду А. (октябрь 2002 г.). «Кариоферин бета 2В участвует в экспорте мРНК из ядра» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (22): 14195–9. DOI : 10.1073 / pnas.212518199 . PMC 137860 . PMID 12384575 .
дальнейшее чтение
- Букринский М.И., Хаффар О.К. (1997). «Ядерный импорт ВИЧ-1: в поисках лидера». Фронт. Biosci . 2 (4): d578-87. DOI : 10.2741 / A213 . PMID 9366553 .
- Букринский М.И., Хаффар О.К. (1998). «Ядерный импорт ВИЧ-1: матричный белок снова в центре внимания, на этот раз вместе с Vpr» . Мол. Med . 4 (3): 138–43. DOI : 10.1007 / BF03401911 . PMC 2230352 . PMID 9562972 .
- Букринский М.И., Шарова Н., Демпси М.П., Стэнвик Т.Л., Букринская А.Г., Хаггерти С., Стивенсон М. (1992). «Активный ядерный импорт преинтеграционных комплексов вируса иммунодефицита человека 1 типа» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 89 (14): 6580–4. DOI : 10.1073 / pnas.89.14.6580 . PMC 49545 . PMID 1631159 .
- Морояну Дж., Хиджиката М., Блобель Дж., Раду А. (1995). «Гетеродимеры кариоферина альфа 1 бета и альфа 2 бета млекопитающих: субъединица альфа 1 или альфа 2 связывает сигнал ядерной локализации, а субъединица бета взаимодействует с нуклеопоринами, содержащими пептидные повторы» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (14): 6532–6. DOI : 10.1073 / pnas.92.14.6532 . PMC 41552 . PMID 7604027 .
- Букринский М.И., Хаггерти С., Демпси М.П., Шарова Н., Аджубель А., Шпиц Л., Льюис П., Гольдфарб Д., Эмерман М., Стивенсон М. (1993). «Сигнал ядерной локализации в матричном белке ВИЧ-1, который управляет инфекцией неделящихся клеток». Природа . 365 (6447): 666–9. DOI : 10.1038 / 365666a0 . PMID 8105392 . S2CID 25678 .
- Майкл В.М., Чой М., Дрейфус Г. (1995). «Сигнал ядерного экспорта в hnRNP A1: опосредованный сигналом, зависимый от температуры путь экспорта ядерного белка». Cell . 83 (3): 415–22. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90119-1 . PMID 8521471 . S2CID 615927 .
- Nakielny S, Siomi MC, Siomi H, Майкл WM, Поллард V, Дрейфус G (1996). «Транспортин: ядерный транспортный рецептор нового пути импорта ядерного белка». Exp. Cell Res . 229 (2): 261–6. DOI : 10.1006 / excr.1996.0369 . PMID 8986607 .
- Фриделл Р.А., Труант Р., Торн Л., Бенсон Р. Э., Каллен Б. Р. (1997). «Ядерный импорт hnRNP A1 опосредуется новым клеточным кофактором, связанным с кариоферином-бета». J. Cell Sci . 110 (11): 1325–31. PMID 9202393 .
- Галлай П., Надежда Т., Чин Д., Троно Д. (1997). «ВИЧ-1 инфекция неделящихся клеток через распознавание интегразы путем импорта / кариоферина» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (18): 9825–30. DOI : 10.1073 / pnas.94.18.9825 . PMC 23276 . PMID 9275210 .
- Сиоми М.К., Эдер П.С., Катаока Н., Ван Л., Лю К., Дрейфус Г. (1997). «Опосредованный транспортином ядерный импорт гетерогенных ядерных белков РНП» . J. Cell Biol . 138 (6): 1181–92. DOI : 10,1083 / jcb.138.6.1181 . PMC 2132560 . PMID 9298975 .
- Хендерсон Б.Р., Percipalle P (1997). «Взаимодействие между ВИЧ Rev и ядерными факторами импорта и экспорта: сигнал ядерной локализации Rev опосредует специфическое связывание с человеческим импортином-бета». J. Mol. Биол . 274 (5): 693–707. DOI : 10.1006 / jmbi.1997.1420 . PMID 9405152 .
- Efthymiadis A, Briggs LJ, Jans DA (1998). «Последовательность ядерной локализации Tat ВИЧ-1 придает новые свойства ядерного импорта» . J. Biol. Chem . 273 (3): 1623–8. DOI : 10.1074 / jbc.273.3.1623 . PMID 9430704 .
- Водичка М.А., Кепп Д.М., Сильвер П.А., Эмерман М. (1998). «ВИЧ-1 Vpr взаимодействует с ядерным транспортом, способствуя заражению макрофагами» . Genes Dev . 12 (2): 175–85. DOI : 10,1101 / gad.12.2.175 . PMC 316441 . PMID 9436978 .
- Попов С., Рексач М., Зибарт Г., Рейлинг Н., Ли М.А., Ратнер Л., Лейн С.М., Мур М.С., Блобель Г., Букринский М. (1998). «Вирусный белок R регулирует ядерный импорт преинтеграционного комплекса ВИЧ-1» . EMBO J . 17 (4): 909–17. Doi : 10.1093 emboj / / 17.4.909 . PMC 1170440 . PMID 9463369 .
- Попов С, Рексач М, Ратнер Л, Блобель Г, Букринский М (1998). «Вирусный белок R регулирует стыковку прединтеграционного комплекса ВИЧ-1 с комплексом ядерных пор» . J. Biol. Chem . 273 (21): 13347–52. DOI : 10.1074 / jbc.273.21.13347 . PMID 9582382 .
- Фушье Р.А., Мейер Б.Е., Саймон Дж. Х., Фишер У., Олбрайт А. В., Гонсалес-Скарано Ф, Малим М. Х. (1998). «Взаимодействие белка Vpr вируса иммунодефицита человека 1 типа с комплексом ядерных пор» . J. Virol . 72 (7): 6004–13. DOI : 10,1128 / JVI.72.7.6004-6013.1998 . PMC 110405 . PMID 9621063 .