Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
KLF12
Идентификаторы
ПсевдонимыKLF12 , AP-2rep, AP2REP, HSPC122, Kruppel-подобный фактор 12, Kruppel-подобный фактор 12
Внешние идентификаторыOMIM: 607531 MGI: 1333796 HomoloGene: 21417 GeneCards: KLF12
Расположение гена (человек)
Хромосома 13 (человек)
Chr.Хромосома 13 (человека) [1]
Хромосома 13 (человек)
Геномное расположение KLF12
Геномное расположение KLF12
Группа13q22.1Начинать73 686 089 п.н. [1]
Конец73 995 056 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 14 (мышь)
Chr.Хромосома 14 (мышь) [2]
Хромосома 14 (мышь)
Геномное расположение KLF12
Геномное расположение KLF12
Группа14 E2.2-E2.3 | 14 50,9 смНачинать99 870 632 п.н. [2]
Конец100 284 679 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE KLF12 214276 в формате fs.png

PBB GE KLF12 206966 s в формате fs.png

PBB GE KLF12 206965 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывания ДНК
• GO: 0001948 связывание белка
• GO: 0001106 транскрипции корепрессор активность
• связывание иона металла
• нуклеиновой кислоты связывания
• ГО: 0001131, ГО: 0001151, ГО: 0001130, ГО: 0001204 ДНК-связывающий фактор транскрипции активность
• GO: 0001200 , GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающая активность фактора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая
• Связывание ДНК регуляторной области РНК-полимеразы II
• GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая
Сотовый компонент• ядро клетки
• нуклеоплазма
• цитозоль
Биологический процесс• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• транскрипция, ДНК-шаблон
• отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

11278

16597

Ансамбль

ENSG00000118922

ENSMUSG00000072294

UniProt

Q9Y4X4

O35738

RefSeq (мРНК)

NM_007249
NM_016285

NM_010636

RefSeq (белок)

NP_009180

NP_034766

Расположение (UCSC)Chr 13: 73.69 - 74 МбChr 14: 99,87 - 100,28 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Krueppel-подобный фактор 12 представляет собой белок , который у человека кодируется KLF12 гена . [5] [6]

Активаторный белок-2 альфа (AP-2 альфа) - это регулируемый в процессе развития фактор транскрипции и важный регулятор экспрессии генов во время развития позвоночных и канцерогенеза. Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков типа «цинковые пальцы» Kruppel и может подавлять экспрессию гена АР-2 альфа путем связывания со специфическим сайтом в промоторе гена АР-2 альфа. Репрессия кодируемым белком требует связывания с корепрессором CtBP1. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. [6]

См. Также [ править ]

  • Факторы типа Круппеля

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000118922 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000072294 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Рот С, Schuierer М, Гюнтер К, Р Бюттнер (июль 2000). «Геномная структура и ДНК-связывающие свойства репрессора транскрипции цинкового пальца человека AP-2rep (KLF12)». Геномика . 63 (3): 384–90. DOI : 10.1006 / geno.1999.6084 . PMID 10704285 . 
  6. ^ a b «Энтрез Ген: KLF12 Kruppel-подобный фактор 12» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Имхоф А., Шуерер М., Вернер О. и др. (1999). «Регуляция транскрипции промотора AP-2alpha с помощью BTEB-1 и AP-2rep, нового репрессора цинкового пальца, связанного с wt-1 / egr» . Мол. Клетка. Биол . 19 (1): 194–204. DOI : 10,1128 / MCB.19.1.194 . PMC  83878 . PMID  9858544 .
  • Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках» . Genome Res . 10 (10): 1546–60. DOI : 10.1101 / gr.140200 . PMC  310934 . PMID  11042152 .
  • Schuierer M, Hilger-Eversheim K, Dobner T. и др. (2001). «Индукция экспрессии AP-2alpha посредством аденовирусной инфекции включает инактивацию корепрессора транскрипции AP-2rep CtBP1» . J. Biol. Chem . 276 (30): 27944–9. DOI : 10.1074 / jbc.M100070200 . PMID  11373277 .
  • Zhu CH, Huang Y, Broman MT, Domann FE (2001). «Экспрессия AP-2 альфа в иммортализованных фибробластах легких человека SV40 связана с определенным паттерном метилирования цитозина в промоторе AP-2 альфа». Биохим. Биофиз. Acta . 1519 (1–2): 85–91. DOI : 10.1016 / s0167-4781 (01) 00227-5 . PMID  11406275 .
  • Chen C, Brabham WW, Stultz BG и др. (2001). «Определение общей области делеции 13q21 при раке человека». Гены Хромосомы Рак . 31 (4): 333–44. DOI : 10.1002 / gcc.1152 . PMID  11433524 .
  • Розенблюм Э., Вахтеристо П., Сандберг Т. и др. (2002). «Геномная карта области размером 6 Mb в 13q21-q22, вовлеченной в развитие рака: идентификация и характеристика генов-кандидатов» . Гм. Genet . 110 (2): 111–21. DOI : 10.1007 / s00439-001-0646-6 . PMID  11935316 . S2CID  21371347 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .
  • Данэм А., Мэтьюз Л.Х., Бертон Дж. И др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 13 человека» . Природа . 428 (6982): 522–8. Bibcode : 2004Natur.428..522D . DOI : 10,1038 / природа02379 . PMC  2665288 . PMID  15057823 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
  • Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Genome Res . 16 (1): 55–65. DOI : 10.1101 / gr.4039406 . PMC  1356129 . PMID  16344560 .
  • Суда С., Рай Т., Сохара Э. и др. (2006). «Постнатальная экспрессия KLF12 во внутренних мозговых собирательных протоках почек и его трансактивация промотора транспортера мочевины UT-A1». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 344 (1): 246–52. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2006.03.138 . PMID  16615998 .

Внешние ссылки [ править ]

  • KLF12 + белок, + человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .