Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
KLF13
Идентификаторы
ПсевдонимыKLF13 , BTEB3, FKLF2, NSLP1, RFLAT-1, RFLAT1, фактор типа Круппеля 13, фактор типа Круппеля 13
Внешние идентификаторыOMIM: 605328 MGI: 1354948 HomoloGene: 32288 Генные карты : KLF13
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человека) [1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное расположение KLF13
Геномное расположение KLF13
Группа15q13.3Начинать31 326 835 п.н. [1]
Конец31 435 665 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 7 (мышь)
Chr.Хромосома 7 (мышь) [2]
Хромосома 7 (мышь)
Геномное расположение KLF13
Геномное расположение KLF13
Группа7 | 7 СНачинать63 886 351 п.н. [2]
Конец63 938 915 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE KLF13 219878 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• ГО: 0000980 РНК - полимеразы II цис-регуляторную область последовательности ДНК-специфический связывающий
• ДНК связывания
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающий активатор активности транскрипции РНК - полимеразы II - удельная
• ГО: связывание белка 0001948
• связывание иона металла
• нуклеиновой кислоты связывания
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающей активности фактора транскрипции, РНК - полимераза II-специфического
Сотовый компонент• ядро клетки
Биологический процесс• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• негативная регуляция пролиферации клеток
• негативная регуляция дифференцировки эритроцитов
• транскрипция, ДНК-шаблон
• регуляция транскрипции с РНК-полимеразы II промоутер
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

51621

50794

Ансамбль

ENSG00000169926
ENSG00000275746

ENSMUSG00000052040

UniProt

Q9Y2Y9

Q9JJZ6

RefSeq (мРНК)

NM_001302461
NM_015995

NM_021366

RefSeq (белок)

NP_001289390
NP_057079

NP_067341

Расположение (UCSC)Chr 15: 31.33 - 31.44 МбChr 7: 63,89 - 63,94 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Kruppel-подобный фактор 13 , также известный как KLF13 , является белком , который в организме человека кодируется KLF13 гена . [5] [6] [7]

Есть некоторые свидетельства того, что KLF13 играет роль в ожирении. Метилирования сайт, cg07814318, в пределах первого интрона из KLF13 был связан с ожирением и orexigenic процессов. [8] Уровни грелина также положительно коррелировали с уровнями метилирования cg07814318. [8] Более того, уровни экспрессии KLF13 были снижены и увеличены в мозге голодных и страдающих ожирением мышей соответственно. [8]

Функция [ править ]

KLF13 принадлежит к семейству факторов транскрипции, которые содержат 3 классических ДНК-связывающих домена с цинковыми пальцами, состоящих из атома цинка, тетраэдрически координированного 2 цистеинами и 2 гистидинами (мотив C2H2). Эти факторы транскрипции связываются с GC-богатыми последовательностями и родственными GT и CACCC-боксами. [5] [9]

KLF13 был впервые описан как фактор RANTES поздних активированных Т-лимфоцитов (RFLAT) -1. [7] Он регулирует экспрессию хемокина RANTES в Т-лимфоцитах. Он действует как стержень, вызывая большой энхансом. У мышей с нокаутом KLF13 обнаружен дефект в выживаемости лимфоцитов, поскольку KLF13 является регулятором экспрессии Bcl-xL . [7] [10] [11] [12] [13] [14] [15]

Взаимодействия [ править ]

KLF13 было показано, взаимодействует с CREB-связывающим белком , [16] белок теплового шока 47 [16] и PCAF . [16]

См. Также [ править ]

  • Факторы типа Круппеля

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c ENSG00000275746 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000169926, ENSG00000275746 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052040 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Энтрез Джин: KLF13 Kruppel-подобный фактор 13» .
  6. ^ Кук Т, Gebelein В, Р Уррутиа июнь (1999). «Sp1 и ему подобные: биохимические и функциональные прогнозы для растущего семейства факторов транскрипции цинкового пальца». Летопись Нью-Йоркской академии наук . 880 (1 ЯЧЕЙКА И МОЛЬ): 94–102. Bibcode : 1999NYASA.880 ... 94C . DOI : 10.1111 / j.1749-6632.1999.tb09513.x . PMID 10415854 . 
  7. ^ a b c Song A, Chen YF, Thamatrakoln K, Storm TA, Krensky AM (январь 1999 г.). «RFLAT-1: новый фактор транскрипции цинкового пальца, который активирует экспрессию гена RANTES в Т-лимфоцитах». Иммунитет . 10 (1): 93–103. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (00) 80010-2 . PMID 10023774 . 
  8. ^ a b c Wiemerslage L, Islam R, van der Kamp C, Cao H, Olivo G, Ence-Eriksson F, Castillo S, Larsen AL, Bandstein M, Dahlberg LS, Perland E, Gustavsson V, Nilsson J, Vogel H, Шюрманн А., Ларссон Э.М., Раск-Андерсен М., Бенедикт С., Шёт HB (14 февраля 2017 г.). «Сайт метилирования ДНК в гене KLF13 связан с орексигенными процессами, основанными на нейронных ответах и ​​уровнях грелина». Int J Obes (Лондон) . 43 (6): 990–994. DOI : 10.1038 / ijo.2017.43 . PMID 28194012 . S2CID 52835570 .  
  9. ^ Scohy S, Gabant Р, Ван Reeth Т, Hertveldt В, Dreze PL, Ван Vooren Р, Ривьер М, Szpirer Дж, Szpirer С (ноябрь 2000 г.). «Идентификация KLF13 и KLF14 (SP6), новых членов семейства факторов транскрипции SP / XKLF». Геномика . 70 (1): 93–101. DOI : 10.1006 / geno.2000.6362 . PMID 11087666 . 
  10. ^ Песня A, Nikolcheva T, Krensky AM (октябрь 2000). «Транскрипционная регуляция экспрессии RANTES в Т-лимфоцитах». Иммунологические обзоры . 177 (1): 236–45. DOI : 10.1034 / j.1600-065X.2000.17610.x . PMID 11138780 . 
  11. ^ Никольчева Т, Пироннет С, Чжоу С.Ю., Соненберг Н., Песня А, Клейбергер С, Кренский AM (июль 2002 г.). «Трансляционный реостат для RFLAT-1 регулирует экспрессию RANTES в Т-лимфоцитах» . Журнал клинических исследований . 110 (1): 119–26. DOI : 10.1172 / JCI15336 . PMC 151028 . PMID 12093895 .  
  12. ^ Песня A, Patel A, Thamatrakoln K, Лю C, D Feng, Clayberger C, Krensky AM (август 2002). «Функциональные домены и ДНК-связывающие последовательности RFLAT-1 / KLF13, Krüppel-подобного фактора транскрипции активированных Т-лимфоцитов» . Журнал биологической химии . 277 (33): 30055–65. DOI : 10.1074 / jbc.M204278200 . PMID 12050170 . 
  13. ↑ Zhou M, McPherson L, Feng D, Song A, Dong C, Lyu SC, Zhou L, Shi X, Ahn YT, Wang D, Clayberger C, Krensky AM (май 2007). «Kruppel-подобный фактор транскрипции 13 регулирует выживаемость Т-лимфоцитов in vivo» . Журнал иммунологии . 178 (9): 5496–504. DOI : 10.4049 / jimmunol.178.9.5496 . PMC 2664650 . PMID 17442931 .  
  14. ^ Хуанг В, Ahn УТ, МакФерсон л, Clayberger С, Krensky АМ (июнь 2007). «Взаимодействие PRP4 с Kruppel-подобным фактором 13 регулирует транскрипцию CCL5» . Журнал иммунологии . 178 (11): 7081–7. DOI : 10.4049 / jimmunol.178.11.7081 . PMC 2674583 . PMID 17513757 .  
  15. ^ Ahn YT, Huang B, McPherson L, C Clayberger, Krensky AM (январь 2007). «Динамическое взаимодействие транскрипционного аппарата и хроматина регулирует« позднюю »экспрессию хемокина RANTES в Т-лимфоцитах» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (1): 253–66. DOI : 10.1128 / MCB.01071-06 . PMC 1800668 . PMID 17074812 .  
  16. ^ a b c Song CZ, Keller K, Murata K, Asano H, Stamatoyannopoulos G (март 2002 г.). «Функциональное взаимодействие между коактиваторами CBP / p300, PCAF и фактором транскрипции FKLF2» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7029–36. DOI : 10.1074 / jbc.M108826200 . PMC 2808425 . PMID 11748222 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Кук Т., Гебелейн Б., Уррутия Р. (июнь 1999 г.). «Sp1 и ему подобные: биохимические и функциональные прогнозы для растущего семейства факторов транскрипции цинкового пальца». Летопись Нью-Йоркской академии наук . 880 (1 ЯЧЕЙКА И МОЛЬ): 94–102. Bibcode : 1999NYASA.880 ... 94C . DOI : 10.1111 / j.1749-6632.1999.tb09513.x . PMID  10415854 .
  • Сонг А, Чен Ю.Ф., Тхаматракольн К., Шторм Т.А., Кренский А.М. (январь 1999 г.). «RFLAT-1: новый фактор транскрипции цинкового пальца, который активирует экспрессию гена RANTES в Т-лимфоцитах». Иммунитет . 10 (1): 93–103. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (00) 80010-2 . PMID  10023774 .
  • Асано Х., Ли XS, Стаматояннопулос Г. (июнь 2000 г.). «FKLF-2: новый транскрипционный фактор, подобный Крюппелю, который активирует глобин и другие гены эритроидного происхождения». Кровь . 95 (11): 3578–84. DOI : 10.1182 / blood.V95.11.3578 . PMID  10828046 .
  • Scohy S, Gabant P, Van Reeth T., Hertveldt V, Drèze PL, Van Vooren P, Rivière M, Szpirer J, Szpirer C (ноябрь 2000 г.). «Идентификация KLF13 и KLF14 (SP6), новых членов семейства факторов транскрипции SP / XKLF». Геномика . 70 (1): 93–101. DOI : 10.1006 / geno.2000.6362 . PMID  11087666 .
  • Качиньски Дж., Чжан Дж. С., Элленридер В., Конли А., Дуэнес Т., Кестер Х., ван Дер Бург Б., Уррутия Р. (сентябрь 2001 г.). «Sp1-подобный белок BTEB3 ингибирует транскрипцию через блок основного элемента транскрипции, взаимодействуя с корепрессорами mSin3A и HDAC-1 и конкурируя с Sp1» . Журнал биологической химии . 276 (39): 36749–56. DOI : 10.1074 / jbc.M105831200 . PMID  11477107 .
  • Song CZ, Keller K, Murata K, Asano H, Stamatoyannopoulos G (март 2002 г.). «Функциональное взаимодействие между коактиваторами CBP / p300, PCAF и фактором транскрипции FKLF2» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7029–36. DOI : 10.1074 / jbc.M108826200 . PMC  2808425 . PMID  11748222 .
  • Качинский Дж. А., Конли А. А., Фернандес Сапико М., Дельгадо С. М., Чжан Дж. С., Уррутия Р. (сентябрь 2002 г.). «Функциональный анализ белка, связывающего основной элемент транскрипции (BTE) (BTEB) 3, и BTEB4, нового Sp1-подобного белка, выявляет подсемейство репрессоров транскрипции для сайта BTE промотора гена цитохрома P4501A1» . Биохимический журнал . 366 (Pt 3): 873–82. DOI : 10.1042 / BJ20020388 . PMC  1222816 . PMID  12036432 .
  • Песня А, Патель А., Тхаматракольн К., Лю С., Фэн Д., Клейбергер С., Кренски А.М. (август 2002 г.). «Функциональные домены и ДНК-связывающие последовательности RFLAT-1 / KLF13, Krüppel-подобного фактора транскрипции активированных Т-лимфоцитов» . Журнал биологической химии . 277 (33): 30055–65. DOI : 10.1074 / jbc.M204278200 . PMID  12050170 .
  • Никольчева Т., Пироннет С., Чжоу С.Ю., Соненберг Н., Сонг А, Клейбергер С., Кренский А.М. (июль 2002 г.). «Трансляционный реостат для RFLAT-1 регулирует экспрессию RANTES в Т-лимфоцитах» . Журнал клинических исследований . 110 (1): 119–26. DOI : 10.1172 / JCI15336 . PMC  151028 . PMID  12093895 .
  • Мицума А., Асано Х., Киношита Т., Мурате Т., Сайто Х., Стаматояннопулос Г., Наое Т. (февраль 2005 г.). «Регуляция транскрипции гена FKLF-2 (KLF13) в эритроидных клетках» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1727 (2): 125–33. DOI : 10.1016 / j.bbaexp.2004.12.007 . PMC  2808416 . PMID  15716005 .
  • Чжан П., Басу П., Редмонд Л.С., Моррис П.Е., Рупон Дж. У., Гиндер Г. Д., Ллойд Дж. А. (2006). «Функциональный скрининг на Krüppel-подобные факторы, которые регулируют ген гамма-глобина человека через элемент промотора CACCC». Клетки крови, молекулы и болезни . 35 (2): 227–35. DOI : 10.1016 / j.bcmd.2005.04.009 . PMID  16023392 .
  • Ан Ю.Т., Хуанг Б., Макферсон Л., Клейбергер С., Кренски А.М. (январь 2007 г.). «Динамическое взаимодействие транскрипционного аппарата и хроматина регулирует« позднюю »экспрессию хемокина RANTES в Т-лимфоцитах» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (1): 253–66. DOI : 10.1128 / MCB.01071-06 . PMC  1800668 . PMID  17074812 .
  • Хуанг Б., Ан Ю.Т., Макферсон Л., Клейбергер С., Кренски А.М. (июнь 2007 г.). «Взаимодействие PRP4 с Kruppel-подобным фактором 13 регулирует транскрипцию CCL5» . Журнал иммунологии . 178 (11): 7081–7. DOI : 10.4049 / jimmunol.178.11.7081 . PMC  2674583 . PMID  17513757 .

Внешние ссылки [ править ]

  • KLF13 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .