Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
KLF17
Белок KIFC3 PDB 2h58.png
Идентификаторы
ПсевдонимыKLF17 , ZNF393, Zfp393, Kruppel-подобный фактор 17, Kruppel-подобный фактор 17, ZLF393
Внешние идентификаторыOMIM: 609602 MGI: 2181068 HomoloGene: 12621 Генные карты : KLF17
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение KLF17
Геномное расположение KLF17
Группа1п34.1Начинать44 118 821 п.н. [1]
Конец44 135 140 п.н. [1]
Генная онтология
Молекулярная функция• ДНК - связывающий
• GO: связывание 0001948 белок
• связывание иона металла
• нуклеиновой кислоты связывания
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции
• GO: 0001200, ГО: 0001133, ГО: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфическая к РНК-полимеразе II
• GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфическая к РНК-полимеразе II
Сотовый компонент• ядро клетки
Биологический процесс• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• транскрипция, ДНК-шаблон
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

128209

75753

Ансамбль

ENSG00000171872

ENSMUSG00000048626

UniProt

Q5JT82

Q8CFA7

RefSeq (мРНК)

NM_173484

NM_029416

RefSeq (белок)

NP_775755

NP_083692

Расположение (UCSC)Chr 1: 44.12 - 44.14 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Krueppel-подобный фактор 17 представляет собой белок , который у человека кодируется KLF17 гена . [4] [5]

Модельные организмы [ править ]

Модельные организмы использовались при изучении функции KLF17. Линия условно нокаутных мышей под названием Klf17 tm1b (KOMP) Wtsi была создана в Wellcome Trust Sanger Institute . [6] Самцы и самки животных прошли стандартизированный фенотипический скрининг [7] для определения эффектов делеции. [8] [9] [10] [11] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование [12]

Фенотип мышей с нокаутом Klf17
ХарактеристикаФенотип
Все данные доступны на сайте. [7] [12]
Лейкоциты периферической крови 6 недельНормальный
Гематология 6 недельНормальный
ИнсулинНормальный
Гомозиготная жизнеспособность на P14Нормальный
Гомозиготная фертильностьНормальный
Масса телаНормальный
Неврологический осмотрНормальный
Сила захватаНормальный
ДисморфологияНормальный
Косвенная калориметрияНормальный
Тест толерантности к глюкозеНормальный
Слуховой ответ ствола мозгаНормальный
DEXAНормальный
РентгенографияНормальный
Морфология глазаНормальный
Клиническая химияНормальный
Гематология 16 недельНормальный
Лейкоциты периферической крови 16 недельНормальный
Вес сердцаНормальный
Сальмонеллезная инфекцияНормальный
Функция цитотоксических Т-клетокНормальный
Состав эпидермального иммунитетаНормальный
Проблема гриппаНормальный

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000171872 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ Ван Влита J, Crofts LA, Вос KG, Czolij R, Perkins AC, Crossley M (апрель 2006). «Человеческий KLF17 - новый член семейства транскрипционных факторов Sp / KLF». Геномика . 87 (4): 474–82. DOI : 10.1016 / j.ygeno.2005.12.011 . PMID 16460907 . 
  5. ^ "Entrez Gene: KLF17 Kruppel-подобный фактор 17" .
  6. ^ Гердин AK (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica . 88 : 925–7. DOI : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 . 
  7. ^ a b «Международный консорциум по фенотипированию мышей» .
  8. ^ Skarnes туалет, Розен В, Уэст А.П., Koutsourakis М, Бушелл Вт, Ийер В, Мухика А.О., Томас М, борона Дж, Кокс Т, Джексон D, Северин Дж, Биггс Р, фу Дж, Нефедов М, де - Jong PJ, Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши» . Природа . 474 (7351): 337–42. DOI : 10,1038 / природа10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .  
  9. ^ Долгин E (июнь 2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут" . Природа . 474 (7351): 262–3. DOI : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 . 
  10. ↑ Collins FS, Rossant J, Wurst W (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Cell . 128 (1): 9–13. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 . S2CID 18872015 .  
  11. ^ Белый Ю.К., Gerdin А.К., Карп Н.А., Райдера Е, Булян М, Bussell Ю.Н., Salisbury Дж, Clare S, Ингам штат Нью - Джерси, Podrini С, Houghton R, Estabel J, Боттомли JR, Мелвин Д.Г., Сунтер D, Адамс Северная Каролина, Таннахилл D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов» . Cell . 154 (2): 452–64. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.06.022 . PMC 3717207 . PMID 23870131 .  
  12. ^ a b «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65. DOI : 10.1101 / gr.4039406 . PMC  1356129 . PMID  16344560 .
  • Ян В., Бернс К.Х., Ма Л., Мацук М.М. (октябрь 2002 г.). «Идентификация Zfp393, гена, специфичного для зародышевых клеток, кодирующего новый белок цинкового пальца». Механизмы развития . 118 (1–2): 233–9. DOI : 10.1016 / S0925-4773 (02) 00258-7 . PMID  12351194 . S2CID  16603729 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Белок KLF17, человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)