Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
KLF3
Белок KLF3 PDB 1p7a.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1П7А , 1У85 , 1У86

Идентификаторы
ПсевдонимыKLF3 , BKLF, фактор Круппеля 3 (базовый), фактор Круппеля 3
Внешние идентификаторыOMIM: 609392 MGI: 1342773 ГомолоГен: 7396 Генные карты : KLF3
Расположение гена (человек)
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человека) [1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение KLF3
Геномное расположение KLF3
Группа4п14Начинать38 664 197 п.н. [1]
Конец38 701 517 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 5 (мышь)
Chr.Хромосома 5 (мышь) [2]
Хромосома 5 (мышь)
Геномное расположение KLF3
Геномное расположение KLF3
Группа5 | 5 C3.1Начинать64 803 388 п.н. [2]
Конец64 832 901 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE KLF3 219657 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• Связывание с ДНК
• Связывание с белком GO: 0001948
• Связывание с ионом металла
• Связывание нуклеиновой кислоты
• Связывание с ДНК в регуляторной области РНК-полимеразы II
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II
Сотовый компонент• ядро клетки
• нуклеоплазма
Биологический процесс• развитие многоклеточного организма
• клеточный ответ на пептид
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• транскрипция, ДНК-шаблон
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

51274

16599

Ансамбль

ENSG00000109787

ENSMUSG00000029178

UniProt

P57682

Q60980

RefSeq (мРНК)

NM_016531

NM_008453

RefSeq (белок)

NP_057615

NP_032479

Расположение (UCSC)Chr 4: 38,66 - 38,7 МбChr 5: 64,8 - 64,83 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Kruppel-подобный фактор 3 представляет собой белок , который у человека кодируется KLF3 гена .

Структура [ править ]

KLF3, первоначально называемый Basic Kruppel-подобный фактор (BKLF), был третий член Kruppel-подобный фактор семейства цинковых пальцев факторов транскрипции , чтобы быть обнаружены. [5] Факторы транскрипции в этом семействе связывают ДНК посредством трех характерных трех цинковых пальцев C 2 H 2 на их С-концах . Поскольку их ДНК-связывающие домены в семействе высококонсервативны, все белки KLF распознают боксы CACCC или CGCCC общей формы NCR CRC CCN (где N - любое основание, а R - пурин ).

Функция [ править ]

В то время как C-концы сходны в разных KLF, N-концы различаются, и, соответственно, разные KLF могут либо активировать, либо репрессировать транскрипцию, либо и то, и другое. KLF3, по-видимому, функционирует преимущественно как репрессор транскрипции. Это выключает гены. Он делает это путем привлечения корепрессоров C-концевого связывающего белка CTBP1 и CTBP2 . [6] [7] CtBP стыкуется с коротким мотивом (остатки 61-65) на N-конце KLF3 общей формы пролин - изолейцин - аспартат - лейцин - серин (мотив PIDLS). [6] [7] CtBP, в свою очередь, привлекает ферменты, модифицирующие гистоны, для изменения хроматина и подавления экспрессии генов.

KLF3 высоко экспрессируется в эритроцитах или эритроидном клоне. Здесь он управляется другим KLF, Erythroid KLF или KLF1 , и его экспрессия увеличивается по мере созревания эритроидных клеток. Исследования на мышах с нокаутом выявляют легкую анемию в отсутствие функционального KLF3 и де-репрессию нескольких генов-мишеней, которые содержат CACCC-боксы в своих регуляторных областях. [8] Многие из этих генов активируются KLF1, следовательно, похоже, что KLF3 действует в петле отрицательной обратной связи, чтобы уравновесить активирующий потенциал KLF1. KLF3 также регулирует другой репрессивный KLF, KLF8 . [9]Таким образом, KLF1, KLF3 и KLF8 работают в жесткой регулирующей сети. KLF3 и KLF8 могут иметь избыточные функции, поскольку у мышей, лишенных как KLF3, так и KLF8, обнаруживаются более серьезные дефекты, чем при любом одиночном нокауте. Они умирают в утробе матери примерно на 14 день беременности. [10]

Помимо экспрессии в эритроидных клетках, KLF3 присутствует и в других типах клеток, и анализ мышей с нокаутом выявил дефекты, влияющие на жировую ткань [11] и В-клетки . [12] У мышей с дефицитом KLF3 меньше жировой ткани и признаки метаболического здоровья, что может быть связано с депрессией гена адипокинового гормона адиполина . [13] Роль KLF3 в B-лимфоцитах сложна, но, по-видимому, он действует в сети с KLF2 и KLF4, чтобы влиять на переключение между маргинальной зоной селезенки и фолликулярными B-клетками . [14]

Взаимодействия [ править ]

KLF3 взаимодействует с:

  • CTBP2 [6] [7] и
  • FHL3 . [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000109787 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029178 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. Перейти ↑ Crossley M (апрель 1996). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей BKLF / TEF-2, основной белок, связывающий CACCC-бокс в эритроидных клетках и некоторых других клетках» . Мол. Клетка. Биол . 16 (4): 1695–705. DOI : 10.1128 / mcb.16.4.1695 . PMC 231156 . PMID 8657145 .  
  6. ^ a b c d Тернер Дж, Николас Х, Епископ Д., Мэтьюз Дж. М., Кроссли М. (2003). «Белок LIM FHL3 связывает основной Krüppel-подобный фактор / Krüppel-подобный фактор 3 и его корепрессор C-концевой связывающий белок 2» . J. Biol. Chem . 278 (15): 12786–95. DOI : 10.1074 / jbc.M300587200 . PMID 12556451 . 
  7. ^ a b c Тернер Дж, Кроссли М (1998). «Клонирование и характеристика mCtBP2, корепрессора, который ассоциируется с основным Krüppel-подобным фактором и другими регуляторами транскрипции млекопитающих» . EMBO J . 17 (17): 5129–40. DOI : 10.1093 / emboj / 17.17.5129 . PMC 1170841 . PMID 9724649 .  
  8. ^ Funnell AP, Norton LJ, Mak KS, Burdach J, Artuz CM, Twine NA, Wilkins MR, Power CA, Hung TT, Perdomo J, Koh P, Bell-Anderson KS, Orkin SH, Fraser ST, Perkins AC, Pearson RC , Crossley M (август 2012). «CACCC-связывающий белок KLF3 / BKLF репрессирует подмножество генов-мишеней KLF1 / EKLF и необходим для правильного созревания эритроидов in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 32 (16): 3281–92. DOI : 10.1128 / MCB.00173-12 . PMC 3434552 . PMID 22711990 .  
  9. ^ Eaton SA, Funnell А.П., Сью N, Николас H, Pearson RC, Crossley M (август 2008). «Сеть Krüppel-подобных факторов (Klfs). Klf8 репрессируется Klf3 и активируется Klf1 in vivo» . J. Biol. Chem . 283 (40): 26937–47. DOI : 10.1074 / jbc.M804831200 . PMC 2556010 . PMID 18687676 .  
  10. ^ Funnell А.П., Mak К.С., шпагат Н.А., Pelka GJ, Нортон LJ, Radziewic T, мощность M, Уилкинс М.Р., Bell-Anderson KS, Fraser ST, Perkins AC, Tam PP, Pearson RC, Crossley M (август 2013). «Создание мышей, дефицитных по KLF3 / BKLF и KLF8, выявляет генетическое взаимодействие и роль этих факторов в подавлении эмбрионального гена глобина» . Мол. Клетка. Биол . 33 (15): 2976–87. DOI : 10.1128 / MCB.00074-13 . PMC 3719677 . PMID 23716600 .  
  11. ^ Сью Н, Джек Б.Х., Итон С.А., Пирсон Р.С., Фаннелл А.П., Тернер Дж., Чолидж Р., Дениер Г., Бао С., Молеро-Навахас Дж. К., Перкинс А., Фудзивара Ю., Оркин С. Г., Белл-Андерсон К., Кроссли М. ( Июн 2008 г.). «Целенаправленное нарушение основного гена Kruppel-подобного фактора (Klf3) показывает роль в адипогенезе» . Mol Cell Biol . 28 (12): 3967–78. DOI : 10.1128 / MCB.01942-07 . PMC 2423134 . PMID 18391014 .  
  12. ^ Vu TT, Gatto D, Turner V, Funnell AP, Mak KS, Norton LJ, Kaplan W, Cowley MJ, Agenès F, Kirberg J, Brink R, Pearson RC, Crossley M (ноябрь 2011 г.). «Нарушение развития В-клеток в отсутствие фактора Крюппеля 3» . J. Immunol . 187 (10): 5032–42. DOI : 10.4049 / jimmunol.1101450 . PMID 22003205 . 
  13. ^ Bell-Андерсон К., Funnell А.П., Williams H, Mat Jusoh H, Скалли T, Lim WF, Бурдах JG, Mak К.С., рыцари AJ, Hoy AJ, Николас HR, Sainsbury A, Turner N, Pearson RC, Crossley M (апрель 2013). «Потеря Kruppel-подобного фактора 3 (KLF3 / BKLF) приводит к усилению регуляции инсулино-сенсибилизирующего фактора адиполина (FAM132A / CTRP12 / C1qdc2)» . Диабет . 62 (8): 2728–37. DOI : 10,2337 / db12-1745 . PMC 3717849 . PMID 23633521 .  
  14. ^ Pearson RC, Funnell AP, Crossley M (февраль 2011). «Фактор транскрипции« цинковый палец »млекопитающих, подобный Krüppel фактор 3 (KLF3 / BKLF)» . IUBMB Life . 63 (2): 86–93. DOI : 10.1002 / iub.422 . PMID 21360637 . S2CID 38842040 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Тернер Дж, Кроссли М (2000). «Основные функции Крюппель-подобных факторов в сети взаимодействующих гематопоэтических транскрипционных факторов». Int. J. Biochem. Cell Biol . 31 (10): 1169–74. DOI : 10.1016 / S1357-2725 (99) 00067-9 . PMID  10582345 .
  • Ван MJ, Цюй XH, Ван LS, Чжай Y, Wu SL, He FC (2003). «Клонирование кДНК, субклеточная локализация и тканевая экспрессия нового человеческого фактора транскрипции Krüppel-подобного: человеческого основного Krüppel-подобного фактора (hBKLF)». И Чуань Сюэ Бао . 30 (1): 1–9. PMID  12812068 .
  • Пердомо Дж., Вергер А., Тернер Дж., Кроссли М. (2005). «Роль модификации SUMO в облегчении репрессии транскрипции с помощью BKLF» . Мол. Клетка. Биол . 25 (4): 1549–59. DOI : 10.1128 / MCB.25.4.1549-1559.2005 . PMC  548027 . PMID  15684403 .
  • Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Й, Ирие Р, Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Genome Res . 16 (1): 55–65. DOI : 10.1101 / gr.4039406 . PMC  1356129 . PMID  16344560 .
  • Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983 . S2CID  7827573 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Белок KLF3, человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)