Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
KLF5
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2EBT

Идентификаторы
ПсевдонимыKLF5 , BTEB2, CKLF, IKLF, Kruppel-подобный фактор 5 (кишечник), Kruppel-подобный фактор 5
Внешние идентификаторыOMIM: 602903 MGI: 1338056 HomoloGene: 37520 Генные карты : KLF5
Расположение гена (человек)
Хромосома 13 (человек)
Chr.Хромосома 13 (человека) [1]
Хромосома 13 (человек)
Геномное расположение KLF5
Геномное расположение KLF5
Группа13q22.1Начинать73 054 976 п.н. [1]
Конец73 077 541 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE KLF5 209212 s в формате fs.png

PBB GE KLF5 209211 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание ДНК
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающий активатор транскрипции активность, РНК-полимераза II-специфическая
• Связывание с ионом металла
• GO: 0000980 Цис-регуляторная область РНК-полимеразы II Связывание ДНК, специфичное для последовательности
• Связывание с белком GO: 0001948
• Связывание с нуклеиновой кислотой
• Связывание с последовательностью специфической ДНК
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II
• связывание с фактором транскрипции
• связывание MRF
Сотовый компонент• Аппарат Гольджи
• внутриклеточная мембраносвязанная органелла
• нуклеоплазма
• ядро клетки
• комплекс регуляторов транскрипции
Биологический процесс• регулирование микроворсинок сборки
• микроворсинок сборки
• регуляция транскрипции ДНК-шаблонный
• кишечные эпителиальные развитие клеток
• регуляция транскрипции с РНК - полимеразы II , промотор
• негативной регуляции транскрипции с РНК - полимеразы II промотора
• транскрипции от РНК - полимеразы II промотор
• транскрипции, ДНК-шаблон
• положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• ангиогенез
• дифференцировка клеток скелетных мышц
• позитивная регуляция дифференцировки жировых клеток
• положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• клеточный ответ на органическое циклическое соединение
• позитивная регуляция клеточной пролиферации
• клеточный ответ на пептид
• клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии
• межклеточная передача сигналов через экзосомы
• позитивная регуляция транскрипции pri-miRNA из РНК - полимераза II , промотор
• регуляции экспрессии генов
• скелетных мышцы спутниковой дифференцировки клеток
• активации сателлитных клеток , участвующая в регенерации скелетных мышц
• myotube дифференцировка участвует в скелетной мышечной регенерации
• регенерация ткани скелетных мышц
• положительная регуляция транскрипции за счет локализации фактора транскрипции
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

688

12224

Ансамбль

ENSG00000102554

ENSMUSG00000005148

UniProt

Q13887

Q9Z0Z7

RefSeq (мРНК)

NM_001730
NM_001286818

NM_009769

RefSeq (белок)

NP_001273747
NP_001721

NP_033899

Расположение (UCSC)Chr 13: 73.05 - 73.08 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Krueppel-подобный фактор 5 является белком , который в организме человека кодируется KLF5 гена . [4] [5]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует член подсемейства Kruppel-подобных факторов белков цинкового пальца. Поскольку белок локализуется в ядре и связывает элемент ответа эпидермального фактора роста, считается, что он является фактором транскрипции . [5]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что KLF5 взаимодействует с Protein SET . [6]

См. Также [ править ]

  • Факторы типа Круппеля

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000102554 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ Sogawa К, Imataka Н, Ямасаки Y, Kusume Н, Эйб Н, Фуджи-Курияма Y (апрель 1993 г.). «Клонирование кДНК и транскрипционные свойства нового связывающего GC-бокса белка, BTEB2» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (7): 1527–32. DOI : 10.1093 / NAR / 21.7.1527 . PMC 309358 . PMID 8479902 .  
  5. ^ a b «Ген Энтреза: KLF5 Kruppel-подобный фактор 5 (кишечник)» .
  6. ↑ Миямото С., Сузуки Т., Муто С., Аидзава К., Кимура А., Мизуно Ю., Нагино Т., Имаи Ю., Адачи Н., Хорикоши М., Нагай Р. (декабрь 2003 г.). «Положительная и отрицательная регуляция фактора транскрипции сердечно-сосудистой системы KLF5 с помощью p300 и онкогенного регулятора SET посредством взаимодействия и ацетилирования на ДНК-связывающем домене» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (23): 8528–41. DOI : 10.1128 / MCB.23.23.8528-8541.2003 . PMC 262669 . PMID 14612398 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Галеб А.М., Нандан М.О., Чанчевалап С., Далтон В.Б., Хисамуддин И.М., Ян В.В. (февраль 2005 г.). «Крюппель-подобные факторы 4 и 5: регуляторы инь и янь клеточной пролиферации» . Клеточные исследования . 15 (2): 92–6. DOI : 10.1038 / sj.cr.7290271 . PMC  1317089 . PMID  15740636 .
  • Нагай Р., Сузуки Т., Айзава К., Шиндо Т., Манабэ И. (август 2005 г.). «Значение фактора транскрипции KLF5 в ремоделировании сердечно-сосудистой системы» . Журнал тромбоза и гемостаза . 3 (8): 1569–76. DOI : 10.1111 / j.1538-7836.2005.01366.x . PMID  16102021 .
  • Макконнелл ББ, Галеб А.М., Нандан МО, Ян В.В. (июнь 2007 г.). «Разнообразные функции Krüppel-подобных факторов 4 и 5 в эпителиальной биологии и патобиологии» . BioEssays . 29 (6): 549–57. DOI : 10.1002 / bies.20581 . PMC  2211634 . PMID  17508399 .
  • Кодзима С., Кобаяси А., Гото О, Окума Ю., Фудзи-Курияма Ю., Согава К. (февраль 1997 г.). «Транскрипционный домен активации BTEB2 человека, фактор связывания GC бокса». Журнал биохимии . 121 (2): 389–96. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021600 . PMID  9089417 .
  • Conkright MD, Wani MA, Anderson KP, Lingrel JB (март 1999 г.). «Ген, кодирующий обогащенный кишечником член семейства факторов Крюппеля, экспрессируемый в эпителиальных клетках кишечника» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (5): 1263–70. DOI : 10.1093 / NAR / 27.5.1263 . PMC  148310 . PMID  9973612 .
  • Ши Х, Чжан З., Ван Х, Лю С., Дэн К. Т. (декабрь 1999 г.). «Выделение и характеристика гена, кодирующего человеческий фактор Kruppel-подобный 5 (IKLF): связывание с CAAT / GT боксом промотора гена лактоферрина мыши» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (24): 4807–15. DOI : 10.1093 / NAR / 27.24.4807 . PMC  148782 . PMID  10572182 .
  • Хосино Ю., Курабаяси М., Канда Т., Хасэгава А., Сакамото Х., Окамото Е., Ковасе К., Ватанабе Н., Манабе И., Сузуки Т., Накано А., Такасе С., Уилкокс Дж. Н., Нагаи Р. (ноябрь 2000 г.). «Регулируемая экспрессия фактора транскрипции BTEB2 в клетках гладкой мускулатуры сосудов: анализ профилей онтогенетической и патологической экспрессии показывает значение фактора, прогнозирующего рестеноз» . Тираж . 102 (20): 2528–34. DOI : 10.1161 / 01.cir.102.20.2528 . PMID  11076828 .
  • Sun R, Chen X, Yang VW (март 2001 г.). «Обогащенный кишечником Крюппель-подобный фактор (Крюппель-подобный фактор 5) является положительным регулятором клеточной пролиферации» . Журнал биологической химии . 276 (10): 6897–900. DOI : 10.1074 / jbc.C000870200 . PMC  2268089 . PMID  11152667 .
  • Dang DT, Zhao W., Mahatan CS, Geiman DE, Yang VW (июль 2002 г.). «Противодействующие эффекты Krüppel-подобного фактора 4 (обогащенного кишечника Krüppel-подобного фактора) и Krüppel-подобного фактора 5 (кишечного обогащенного Krüppel-подобного фактора) на промотор гена Krüppel-подобного фактора 4» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (13): 2736–41. DOI : 10.1093 / NAR / gkf400 . PMC  117055 . PMID  12087155 .
  • Синдо Т., Манабэ I, Фукусима Ю., Тобе К., Айзава К., Миямото С., Кавай-Ковасе К., Морияма Н., Имаи Ю., Каваками Х., Нисимацу Х., Ишикава Т., Судзуки Т., Морита Х, Маэмура К., Сата М, Хирата Ю., Комукай М., Кагечика Х., Кадоваки Т., Курабаяши М., Нагай Р. (август 2002 г.). «Krüppel-подобный фактор транскрипции цинкового пальца KLF5 / BTEB2 является мишенью для передачи сигналов ангиотензина II и важным регулятором ремоделирования сердечно-сосудистой системы». Природная медицина . 8 (8): 856–63. DOI : 10.1038 / nm738 . PMID  12101409 . S2CID  34181151 .
  • Sur I, Undén AB, Toftgård R (июнь 2002 г.). «Человеческий Krüppel-подобный фактор5 / KLF5: синергизм с факторами NF-kappaB / Rel и экспрессия в коже человека и волосяных фолликулах». Европейский журнал клеточной биологии . 81 (6): 323–34. DOI : 10.1078 / 0171-9335-00257 . PMID  12113473 .
  • Chen C, Bhalala HV, Qiao H, Dong JT (сентябрь 2002 г.). «Возможная роль фактора транскрипции KLF5 в опухолевом супрессоре при раке груди человека» . Онкоген . 21 (43): 6567–72. DOI : 10.1038 / sj.onc.1205817 . PMID  12242654 .
  • Ян XO, Doty RT, Hicks JS, Willerford DM (июнь 2003 г.). «Регулирование промотора Т-клеточного рецептора D beta 1 с помощью KLF5 через повторяющиеся GC-богатые мотивы» . Кровь . 101 (11): 4492–9. DOI : 10,1182 / кровь 2002-08-2579 . PMID  12576331 .
  • Чен С., Бхалала Х.В., Веселла Р.Л., Донг Дж.Т. (май 2003 г.). «KLF5 часто удаляется и подавляется, но редко мутирует при раке простаты». Простата . 55 (2): 81–8. DOI : 10.1002 / pros.10205 . PMID  12661032 .
  • Zhang Z, Teng CT (апрель 2003 г.). «Фосфорилирование Kruppel-подобного фактора 5 (KLF5 / IKLF) в области взаимодействия CBP усиливает его функцию трансактивации» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (8): 2196–208. DOI : 10.1093 / NAR / gkg310 . PMC  153738 . PMID  12682370 .
  • Охниши С., Охнами С., Лауб Ф., Аоки К., Судзуки К., Канаи И., Хага К., Асака М., Рамирес Ф., Йошида Т. (август 2003 г.). «Подавление и ингибирующий рост эффект Krüppel-подобного эпителиального транскрипционного фактора KLF4, но не KLF5, при раке мочевого пузыря». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 308 (2): 251–6. DOI : 10.1016 / S0006-291X (03) 01356-1 . PMID  12901861 .
  • Айзава К., Сузуки Т., Када Н., Исихара А., Кавай-Ковасе К., Мацумура Т., Сасаки К., Мунемаса И., Манабе И., Курабаяси М., Коллинз Т., Нагай Р. (январь 2004 г.). «Регулирование цепи фактора роста тромбоцитов-A с помощью Krüppel-подобного фактора 5: новый путь кооперативной активации с ядерным фактором-kappaB» . Журнал биологической химии . 279 (1): 70–6. DOI : 10.1074 / jbc.M306621200 . PMID  14573617 .
  • Сато Т., Канда Т., Иида Т., Такахаши Т., Киши С., Хосино Ю. (2004). «Иммуногистохимическое исследование хирургически вырезанных хориоидальных неоваскулярных мембран». Журнал международных медицинских исследований . 31 (5): 402–6. DOI : 10.1177 / 147323000303100507 . PMID  14587307 . S2CID  33670045 .

Внешние ссылки [ править ]

  • KLF5 + белок, + человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .