Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
KLF9
Идентификаторы
ПсевдонимыKLF9 , BTEB, BTEB1, фактор типа Круппеля 9, фактор типа Круппеля 9
Внешние идентификаторыOMIM : 602902 MGI : 1333856 HomoloGene : 931 GeneCards : KLF9
Расположение гена ( человек )
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек) [1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное расположение KLF9
Геномное расположение KLF9
Группа9q21.12Начинать70 384 597 п.н. [1]
Конец70 414 624 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 19 (мышь)
Chr.Хромосома 19 (мышь) [2]
Хромосома 19 (мышь)
Геномное расположение KLF9
Геномное расположение KLF9
Группа19 | 19 млрдНачинать23 141 226 п.н. [2]
Конец23 168 134 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE KLF9 203542 s в формате fs.png

PBB GE KLF9 203541 s в формате fs.png

PBB GE KLF9 203543 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• Связывание ДНК
• Связывание с ионом металла
• Связывание нуклеиновой кислоты
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции активность, специфическая к РНК-полимеразе II
Сотовый компонент• клеточная мембрана
• ядро клетки
• нуклеоплазма
• цитозоль
Биологический процесс• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• клеточный ответ на стимул кортизола
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• циркадный ритм
• негативная регуляция пролиферации кератиноцитов
• транскрипция, ДНК-шаблон
• клеточный ответ на стимул тироидного гормона
• ритмический процесс
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

687

16601

Ансамбль

ENSG00000119138

ENSMUSG00000033863

UniProt

Q13886

O35739
Q8CEC4

RefSeq (мРНК)

NM_001206

NM_010638

RefSeq (белок)

NP_001197

NP_034768

Расположение (UCSC)Chr 9: 70,38 - 70,41 МбChr 19: 23.14 - 23.17 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Krueppel-подобный фактор 9 является белком , который в организме человека кодируется KLF9 гена . [5] [6] Ранее известный как белок 1, связывающий основной элемент транскрипции (белок 1 BTEB), Klf9 является частью семейства факторов транскрипции « цинковые пальцы» типа Sp1 C2H2 . Несколько предыдущих исследований показали, что Klf9-связанная регуляция развития животных, включая клеточную дифференцировку В-клеток , кератиноцитов и нейронов. [7] Klf9 также является ключевым регулятором транскрипции эндометрия матки.пролиферация, адгезия и дифференцировка клеток - все факторы, которые необходимы в процессе беременности и отключаются во время туморогенеза . [8]

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой фактор транскрипции, который связывается с элементами GC-бокса, расположенными в промоторе. Связывание кодируемого белка с одним GC-боксом ингибирует экспрессию мРНК, в то время как связывание с тандемно повторяющимися элементами GC-бокса активирует транскрипцию. [6]

Окислительный стресс увеличивает экспрессию Klf9, а сверхэкспрессия гена Klf9 сенсибилизирует клетку к окислительному стрессу и реактивным формам кислорода (АФК)]. ,

Использование короткой шпилечной РНК (shRNA) для подавления экспрессии Klf9 обеспечивает устойчивость клетки к окислительному стрессу и гибели клеток, связанной с АФК. Klf9 активируется ROS и способствует гибели клеток, связанных с ROS. [7]

Klf9 проявляет сходство с другими известными генами окислительного стресса, такими как NQO1 и HMOX1 . При воздействии одного и того же количества перекиси водорода как клетки эмбриона мыши, так и клетки человека продуцировали аналогичные количества Klf9 и NQO1 / HMOX. [7] Также имеет место обратный эффект; Сверхэкспрессия Klf9 внутри клетки приводит к увеличению внутриклеточных АФК. Конечным результатом увеличения внутриклеточных ROS и Klf9 является увеличение гибели клеток; со сверхэкспрессией гена Klf9 погибает больше клеток. Подобная гибель клеток была обнаружена in vivo, когда мыши дикого типа подвергались воздействию агента окислительного стресса параквата интраназально, что подтвердило зависимую от окислительного стресса экспрессию Klf9, обнаруженную только в клеточных линиях. [7]

Области примерно на 10 т.п.н. выше и на 1 т.п.н. ниже сайта начала транскрипции Klf9 содержат консервативные элементы антиоксидантного ответа (ARE), которые являются сайтами связывания для Nrf2. [7] Nrf2 является основным регулятором антиоксидантного ответа на АФК внутри клетки. Klf9 активируется Nrf2; при высоком окислительном стрессе и высокой концентрации внутриклеточных АФК Nrf2 связывается с промотором Klf9, что увеличивает количество внутриклеточных АФК, что приводит к гибели клеток. Когда окислительный стресс низкий, Nrf2 проходит свой нормальный путь, увеличивая количество антиоксидантов в клетке и уменьшая количество внутриклеточных АФК. [7]

Исследования на животных [ править ]

Дефицит Klf9 подавляет индуцированный блеомицином фиброз в легких мышей. Путем введения блеомицина в легочную ткань ткань будет производить ROS и развивать фиброзную легочную ткань для борьбы с повреждением, наносимым блеомицином. Когда у этих мышей был нокаутирован Klf9, образовалось меньше фиброзной легочной ткани. [7] Из-за этого открытия исследователи предположили, что манипуляции с уровнями Klf9 в организме могут быть действенным лечением и для других заболеваний, включая определенные типы рака. [7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что KLF9 взаимодействует с рецептором прогестерона . [9]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000119138 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033863 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Imataka Н, Sogawa К, Ясумото К, Кикучи Y, Sasano К, Кобаяши А, Hayami М, Фуджи-Курияма Y (ноябрь 1992). «Два регуляторных белка, которые связываются с основным элементом транскрипции (BTE), последовательностью GC-бокса в промоторной области гена P-4501A1 крысы» . EMBO J . 11 (10): 3663–71. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05451.x . PMC 556826 . PMID 1356762 .  
  6. ^ a b «Энтрез Джин: KLF9 Kruppel-подобный фактор 9» .
  7. ^ a b c d e f g h Цукер С. Н., Финк Э. Э., Багати А., Маннава С., Бьянки-Смираглия А., Богнер П. Н., Вавжиняк Д. А., Фоли С., Леонова К. И., Гримм М. Дж., Мопарти К., Ионов Ю., Ван Дж., Лю С., Секстон С., Кандел Е. С., Бакин А. В., Чжан Ю., Камински Н., Сегал Б. Х., Никифоров М. А. (2014). «Nrf2 усиливает окислительный стресс за счет индукции Klf9» . Мол. Cell . 53 (6): 916–28. DOI : 10.1016 / j.molcel.2014.01.033 . PMC 4049522 . PMID 24613345 .  
  8. ^ Simmen FA, Су Y, Xiao R, Цзэн Z, Simmen RC (2008). «Сеть Krüppel-подобного фактора 9 (KLF9) в клетках карциномы эндометрия HEC-1-A предполагает канцерогенный потенциал дисрегулируемой экспрессии KLF9» . Репродукция. Биол. Эндокринол . 6 : 41. DOI : 10,1186 / 1477-7827-6-41 . PMC 2542371 . PMID 18783612 .  
  9. ↑ Zhang XL, Zhang D, Michel FJ, Blum JL, Simmen FA, Simmen RC (июнь 2003 г.). «Селективные взаимодействия Kruppel-подобного фактора 9 / основного белка, связывающего элемент транскрипции с изоформами рецептора прогестерона A и B, определяют транскрипционную активность генов, чувствительных к прогестерону, в эпителиальных клетках эндометрия» . J. Biol. Chem . 278 (24): 21474–82. DOI : 10.1074 / jbc.M212098200 . PMID 12672823 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Кобаяси А., Согава К., Иматака Х., Фудзии-Курияма Й. (1995). «Анализ функциональных доменов GC box-связывающего белка, BTEB». J. Biochem . 117 (1): 91–5. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a124727 . PMID  7775404 .
  • Иматака Х., Накаяма К., Ясумото К., Мидзуно А., Фудзи-Курияма Й., Хаями М. (1994). «Клеточно-специфический трансляционный контроль экспрессии транскрипционного фактора BTEB. Роль вышестоящего AUG в 5'-нетранслируемой области». J. Biol. Chem . 269 (32): 20668–73. PMID  8051167 .
  • Иматака Х., Мидзуно А, Фудзи-Курияма Й., Хаями М. (1994). «Активация длинного концевого повтора вируса иммунодефицита человека типа 1 с помощью BTEB, фактора транскрипции, связывающего GC-бокс». AIDS Res. Гм. Ретровирусы . 9 (9): 825–31. DOI : 10,1089 / aid.1993.9.825 . PMID  8257632 .
  • Хашимото Х., Тойде К., Китамура Р., Фудзита М., Тагава С., Ито С., Каматаки Т. (декабрь 1993 г.). «Генная структура CYP3A4, взрослой специфической формы цитохрома P450 в печени человека и его транскрипционный контроль» . Евро. J. Biochem . 218 (2): 585–95. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18412.x . PMID  8269949 .
  • Охе Н., Ямасаки И., Согава К., Инадзава Дж., Арияма Т., Осимура М., Фуджи-Курияма И. (сентябрь 1993 г.). «Хромосомная локализация и последовательность кДНК человеческого BTEB, GC-бокс-связывающий белок». Сомат. Cell Mol. Genet . 19 (5): 499–503. DOI : 10.1007 / BF01233255 . PMID  8291025 . S2CID  45624023 .
  • Чжан XL, Чжан Д., Мишель Ф.Дж., Блюм Дж.Л., Симмен Ф.А., Симмен Р.С. (2003). «Селективные взаимодействия Kruppel-подобного фактора 9 / основного белка, связывающего элемент транскрипции с изоформами рецептора прогестерона A и B, определяют транскрипционную активность генов, чувствительных к прогестерону, в эпителиальных клетках эндометрия» . J. Biol. Chem . 278 (24): 21474–82. DOI : 10.1074 / jbc.M212098200 . PMID  12672823 .
  • Веларде М.С., Ирутаянатан М., Исон Р.Р., Чжан Д., Симмен Ф.А., Симмен Р.К. (апрель 2006 г.). «Трансактивация рецептора прогестерона гена секреторного лейкоцитарного ингибитора протеазы в эпителиальных клетках эндометрия Ishikawa включает привлечение Krüppel-подобного фактора 9 / основного белка-1, связывающего элемент транскрипции» . Эндокринология . 147 (4): 1969–78. DOI : 10.1210 / en.2005-1419 . PMID  16384861 .

Внешние ссылки [ править ]

  • KLF9 + белок, + человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .