Кариоферин альфа 1

KPNA1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
2JDQ , 3TJ3 , 4B18

Идентификаторы

Псевдонимы

KPNA1 , IPOA5, NPI-1, RCH2, SRP1, Импортин, Кариоферин альфа 1, субъединица кариоферина альфа 1

Внешние идентификаторы

OMIM : 600686 MGI : 103560 HomoloGene : 55642 GeneCard : KPNA1

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 3 (человек) ^[1]

Группа	3q21.1	Начинать	122 421 902 п.н. ^[1]
Группа	3q21.1	Конец	122 514 945 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 16 (мышь) ^[2]

Группа	16 \| 16 B3	Начинать	35 978 750 п.н. ^[2]
Группа	16 \| 16 B3	Конец	36 037 131 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание с белком GO: 0001948 • Связывание с последовательностью ядерной локализации • Активность рецептора ядерного сигнала импорта
Сотовый компонент	• ядерная пора • нуклеоплазма • дендрит • ядро клетки • цитоплазма • цитозоль • клетка-хозяин • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • глутаматергический синапс
Биологический процесс	• регуляция рекомбинации ДНК • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • апоптотическая фрагментация ДНК • импорт белка в ядро • транспорт белка • модуляция вирусом процесса хозяина • импорт белка, несущего NLS, в ядро • вирусный процесс GO: 0022415 • постсинапс в ядро сигнальный путь
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


3836


16646

Ансамбль


ENSG00000114030


ENSMUSG00000022905

UniProt


P52294


Q60960

RefSeq (мРНК)


NM_002264


NM_008465

RefSeq (белок)


NP_002255


NP_032491

Расположение (UCSC)

Chr 3: 122,42 - 122,51 Мб

Chr 16: 35.98 - 36.04 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Importin субъединица альфа-1 представляет собой белок , который у человека кодируется KPNA1 гена . ^[5]

Взаимодействия [ править ]

Кариоферин альфа 1 взаимодействует с KPNB1 ^[6]^[7] и UBR5 . ^[8]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000114030 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022905 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ Cortes P, Ye ZS, Baltimore D (сентябрь 1994). «RAG-1 взаимодействует с повторяющимся аминокислотным мотивом человеческого гомолога дрожжевого белка SRP1» . Proc Natl Acad Sci USA . 91 (16): 7633–7. Bibcode : 1994PNAS ... 91.7633C . DOI : 10.1073 / pnas.91.16.7633 . PMC 44456 . PMID 8052633 .
^ Köhler, M; Speck C; Christiansen M; Bischoff FR; Prehn S; Haller H; Görlich D; Хартманн Э. (ноябрь 1999 г.). «Доказательства различных субстратных специфичностей членов семейства importin альфа в импорте ядерного белка» . Мол. Клетка. Биол . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 19 (11): 7782–91. DOI : 10.1128 / mcb.19.11.7782 . ISSN 0270-7306 . PMC 84838 . PMID 10523667 .
^ Percipalle, P; Кларксон WD; Kent HM; Родос D; Стюарт М. (март 1997 г.). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа / бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Биол . АНГЛИЯ. 266 (4): 722–32. DOI : 10.1006 / jmbi.1996.0801 . ISSN 0022-2836 . PMID 9102465 .
^ Хендерсон, Мишель Дж; Рассел Аманда Дж; Хирд Саманта; Муньос Марсия; Клэнси Дженнифер Л; Lehrbach Gillian M; Calanni Sophina T; Янс Дэвид А; Сазерленд Роберт Л; Уоттс Колин К.В. (июль 2002 г.). «EDD, белок гиперпластических дисков человека, играет роль в коактивации рецептора прогестерона и потенциальном участии в ответе на повреждение ДНК» . J. Biol. Chem . Соединенные Штаты. 277 (29): 26468–78. DOI : 10.1074 / jbc.M203527200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12011095 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Букринский М.И., Хаффар О.К. (2004). «Ядерный импорт ВИЧ-1: в поисках лидера». Фронт. Biosci . 2 (4): d578–87. DOI : 10.2741 / A213 . PMID 9366553 .
Букринский М.И., Хаффар О.К. (1998). «Ядерный импорт ВИЧ-1: матричный белок снова в центре внимания, на этот раз вместе с Vpr» . Мол. Med . 4 (3): 138–43. DOI : 10.1007 / BF03401911 . PMC 2230352 . PMID 9562972 .
Кино Т, Павлакис Г.Н. (2004). «Молекулы-партнеры вспомогательного белка Vpr вируса иммунодефицита человека 1 типа» . ДНК Cell Biol . 23 (4): 193–205. DOI : 10,1089 / 104454904773819789 . PMID 15142377 .
Букринский М.И., Шарова Н., Демпси М.П. и др. (1992). «Активный ядерный импорт преинтеграционных комплексов вируса иммунодефицита человека 1 типа» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 89 (14): 6580–4. Bibcode : 1992PNAS ... 89.6580B . DOI : 10.1073 / pnas.89.14.6580 . PMC 49545 . PMID 1631159 .
Шарова Н, Букринская А (1991). «p17 и p17-содержащие предшественники gag входящего вируса иммунодефицита человека транспортируются в ядра инфицированных клеток». AIDS Res. Гм. Ретровирусы . 7 (3): 303–6. DOI : 10,1089 / aid.1991.7.303 . PMID 2064827 .
Ди Марцио П., Чхве С., Эбрайт М. и др. (1996). «Мутационный анализ остановки клеточного цикла, ядерной локализации и упаковки вирионов вируса иммунодефицита человека типа 1 Vpr» . J. Virol . 69 (12): 7909–16. DOI : 10,1128 / JVI.69.12.7909-7916.1995 . PMC 189735 . PMID 7494303 .
Галлай П., Свинглер С., Сонг Дж. И др. (1995). «Ядерный импорт ВИЧ регулируется фосфотирозин-опосредованным связыванием матрикса с основным доменом интегразы». Cell . 83 (4): 569–76. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90097-7 . PMID 7585960 . S2CID 15536328 .
Морояну Дж., Хиджиката М., Блобель Дж., Раду А. (1995). «Гетеродимеры кариоферина альфа 1 бета и альфа 2 бета млекопитающих: субъединица альфа 1 или альфа 2 связывает сигнал ядерной локализации, а субъединица бета взаимодействует с нуклеопоринами, содержащими пептидные повторы» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (14): 6532–6. Bibcode : 1995PNAS ... 92.6532M . DOI : 10.1073 / pnas.92.14.6532 . PMC 41552 . PMID 7604027 .
Фрид Е.О., Энглунд Г., Мартин М.А. (1995). «Роль основного домена матрицы вируса иммунодефицита человека 1 типа в макрофагальной инфекции» . J. Virol . 69 (6): 3949–54. DOI : 10,1128 / JVI.69.6.3949-3954.1995 . PMC 189124 . PMID 7745752 .
Вайс К., Маттай И.В., Ламонд А.И. (1995). «Идентификация hSRP1 альфа как функционального рецептора для последовательностей ядерной локализации». Наука . 268 (5213): 1049–53. Bibcode : 1995Sci ... 268.1049W . DOI : 10.1126 / science.7754385 . PMID 7754385 .
О'Нил Р. Е., Палезе П. (1995). «NPI-1, человеческий гомолог SRP-1, взаимодействует с нуклеопротеином вируса гриппа». Вирусология . 206 (1): 116–25. DOI : 10.1016 / S0042-6822 (95) 80026-3 . PMID 7831767 .
Галлай П., Свинглер С., Эйкен С., Троно Д. (1995). «ВИЧ-1 инфекция неделящихся клеток: С-концевое фосфорилирование тирозина вирусного матричного белка является ключевым регулятором». Cell . 80 (3): 379–88. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90488-3 . PMID 7859280 . S2CID 15064293 .
Морояну Дж., Блобель Дж., Раду А. (1995). «Ранее идентифицированный белок с неопределенной функцией - это кариоферин альфа и вместе с кариоферином бета доки импортируют субстрат в комплексы ядерных пор» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (6): 2008–11. Bibcode : 1995PNAS ... 92.2008M . DOI : 10.1073 / pnas.92.6.2008 . PMC 42412 . PMID 7892216 .
фон Шведлер U, Корнблут RS, Trono D (1994). «Сигнал ядерной локализации матричного белка вируса иммунодефицита человека типа 1 позволяет установить инфекцию в макрофагах и покоящихся Т-лимфоцитах» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (15): 6992–6. Bibcode : 1994PNAS ... 91.6992V . DOI : 10.1073 / pnas.91.15.6992 . PMC 44324 . PMID 8041734 .
Хайнцингер Н.К., Букинский М.И., Хаггерти С.А. и др. (1994). «Белок Vpr вируса иммунодефицита человека 1 типа влияет на ядерную локализацию вирусных нуклеиновых кислот в неделящихся клетках-хозяевах» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (15): 7311–5. Bibcode : 1994PNAS ... 91.7311H . DOI : 10.1073 / pnas.91.15.7311 . PMC 44389 . PMID 8041786 .
Букринский М.И., Хаггерти С., Демпси М.П. и др. (1993). «Сигнал ядерной локализации в матричном белке ВИЧ-1, который управляет инфекцией неделящихся клеток». Природа . 365 (6447): 666–9. Bibcode : 1993Natur.365..666B . DOI : 10.1038 / 365666a0 . PMID 8105392 . S2CID 25678 .
Дубровский Л., Ульрих П., Нуово Г. Дж. И др. (1996). «Сигнал ядерной локализации ВИЧ-1 как новая мишень для терапевтического вмешательства» . Мол. Med . 1 (2): 217–30. DOI : 10.1007 / BF03401569 . PMC 2229944 . PMID 8529100 .
Галлай П., Ститт В., Манди С. и др. (1996). «Роль кариоферинового пути в ядерном импорте вируса иммунодефицита человека 1 типа» . J. Virol . 70 (2): 1027–32. DOI : 10,1128 / JVI.70.2.1027-1032.1996 . PMC 189908 . PMID 8551560 .
Букринская А.Г., Горпаде А., Хайнцингер Н.К. и др. (1996). «Зависимая от фосфорилирования инфекция вируса иммунодефицита человека типа 1 и ядерное нацеливание вирусной ДНК» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (1): 367–71. Bibcode : 1996PNAS ... 93..367B . DOI : 10.1073 / pnas.93.1.367 . PMC 40239 . PMID 8552640 .

Эта статья о гене в хромосоме 3 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000114030 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022905 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8052633-5] Cortes P, Ye ZS, Baltimore D (сентябрь 1994). «RAG-1 взаимодействует с повторяющимся аминокислотным мотивом человеческого гомолога дрожжевого белка SRP1» . Proc Natl Acad Sci USA . 91 (16): 7633–7. Bibcode : 1994PNAS ... 91.7633C . DOI : 10.1073 / pnas.91.16.7633 . PMC 44456 . PMID 8052633 .

[pmid10523667-6] Köhler, M; Speck C; Christiansen M; Bischoff FR; Prehn S; Haller H; Görlich D; Хартманн Э. (ноябрь 1999 г.). «Доказательства различных субстратных специфичностей членов семейства importin альфа в импорте ядерного белка» . Мол. Клетка. Биол . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 19 (11): 7782–91. DOI : 10.1128 / mcb.19.11.7782 . ISSN 0270-7306 . PMC 84838 . PMID 10523667 .

[pmid9102465-7] Percipalle, P; Кларксон WD; Kent HM; Родос D; Стюарт М. (март 1997 г.). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа / бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Биол . АНГЛИЯ. 266 (4): 722–32. DOI : 10.1006 / jmbi.1996.0801 . ISSN 0022-2836 . PMID 9102465 .

[pmid12011095-8] Хендерсон, Мишель Дж; Рассел Аманда Дж; Хирд Саманта; Муньос Марсия; Клэнси Дженнифер Л; Lehrbach Gillian M; Calanni Sophina T; Янс Дэвид А; Сазерленд Роберт Л; Уоттс Колин К.В. (июль 2002 г.). «EDD, белок гиперпластических дисков человека, играет роль в коактивации рецептора прогестерона и потенциальном участии в ответе на повреждение ДНК» . J. Biol. Chem . Соединенные Штаты. 277 (29): 26468–78. DOI : 10.1074 / jbc.M203527200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12011095 .

[1]