Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из Каламавиралеса )
Перейти к навигации Перейти к поиску

Tectiviridae
1gw7.jpg
КриоЭМ- модель капсида PRD1 фага энтеробактерий. Запись PDB 1gw7 [1]
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Вариднавирия
Королевство:Bamfordvirae
Тип:Преплазмивирикота
Учебный класс:Tectiliviricetes
Заказ:Kalamavirales
Семья:Tectiviridae
Типовой вид
Фаг энтеробактерий PRD1
Роды

Alpatectivirus
Betatectivirus
Gammatectivirus
Deltatectivirus

Tectiviridae - это семейство вирусов, состоящее изсеми видов и трех родов. Бактерии служат естественными хозяевами. [2] [3] Теквирусы не имеют структуры "голова-хвост", но способны образовывать хвостообразные трубки размером ~ 60 × 10 нм при адсорбции или послеобработки хлороформом . Название происходит от латинского tectus (что означает «покрытый»). [4]

Вирусология [ править ]

В вирионы видов Tectiviridae не являются окутано, икосаэдрическими и отображать псевдо T = 25 симметрии. [2] капсид имеет два слоя. Внешний слой представляет собой белковую структуру из 240 тримеров капсидных белков, а внутренний - белковую липидную мембрану, которая окружает геном вируса . Апикальные шипы, простирающиеся примерно на 20  нанометров (нм), выступают из вершин икосаэдров.

Геном представляет собой одиночную молекулу линейной двухцепочечной ДНК длиной 15 кило оснований и имеет 30 открытых рамок считывания. [2] Он образует плотно упакованную спираль и кодирует несколько структурных белков. Он кодирует около 30 белков, которые транскрибируются в оперонах. В вироне присутствует не менее 9 структурных белков. Геном имеет вес около 66 мегадальтон и составляет 14-15% от веса вириона. Липиды составляют еще 15 мас.%. Углеводов нет.

Жизненный цикл [ править ]

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается путем адсорбции в хозяйской клетке. [2] После адсорбции на поверхности клетки-хозяина вирион вытесняет структуру хвостовой трубки через вершину для доставки генома в хозяина. Репликация следует модели смещения цепи ДНК. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. [2] Капсидные белки полимеризуются вокруг липопротеиновой везикулы, перемещаемой в цитоплазму факторами сборки вириона.

Зрелые вироны высвобождаются путем лизиса, который в случае PRD1 достигается с помощью кодируемого вирусом механизма лизиса, состоящего из четырех белков: P15 ( эндолизин ), [5] P35 (холин), [6] P36 и P37. (гомологи белков Rz / Rz1 фага лямбда). [7]

Таксономия [ править ]

Теквирусы были разделены на три основные группы: (1) фаги, которые инфицируют грамотрицательные бактерии (которые лизируют клетку-хозяин, не образуя профаги) (2) те, которые инфицируют грамположительные бактерии (образующие профаги) и (3) вирус который заражает Gluconobacter cerinus . Группы теквирусов имеют схожий размер генома и организацию, но у них нет обнаруживаемого сходства последовательностей на уровне нуклеотидов. [8]

В этом семействе были идентифицированы три рода: Alphatectivirus - инфицирующие Enterobactericeae; Бетатективирус - заражение грамположительными бактериями; и Gammatectivirus .

Примеры [3]

  • Фаг Bacillus AP50
  • Bacillus фаг Bam35
  • Фаг энтеробактерий PRD1

Два дополнительных рода - Deltatectivirus и Epsilontectivirus - были созданы для ряда фагов и ожидают ратификации ICTV (Forthebois, WheeHeim и Rhodococcus phage Toil), заражающих хозяев Actinobacteria . [9]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Сан-Мартин, C; Huiskonen, JT; Bamford, JK; Мясник, SJ; Фуллер, SD; Bamford, DH; Бернетт, Р.М. (2002). «Второстепенные белки, мобильные рукава и взаимодействия мембрана-капсид в капсиде бактериофага PRD1». Структурная биология природы . 9 (10): 756–63. DOI : 10.1038 / nsb837 . PMID  12219080 .
  2. ^ a b c d e «Вирусная зона» . ExPASy . Дата обращения 15 июня 2015 .
  3. ^ а б ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.» . Дата обращения 15 июня 2015 .
  4. ^ "Девятый отчет ICTV; Выпуск таксономии 2009: Tectiviridae " . ICTV . ICTV . Дата обращения 18 сентября 2020 .
  5. ^ Caldentey Дж, Ханнинен А.Л., Бэмфорд DH (1994). «Ген XV бактериофага PRD1 кодирует литический фермент с мурамидазной активностью» . Eur J Biochem . 225 (1): 341–346. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1994.00341.x . PMID 7925454 . 
  6. ^ Rydman PS, Бэмфорд DH (2003). «Идентификация и мутационный анализ холинового белка P35 бактериофага PRD1» . J Bacteriol . 185 (13): 3795–3803. DOI : 10.1128 / JB.185.13.3795-3803.2003 . PMC 161566 . PMID 12813073 .  
  7. ^ Krupovic М, Cvirkaite-Krupovic В, Бэмфорд DH (2008). «Идентификация и функциональный анализ Rz / Rz1-подобных дополнительных генов лизиса в мембранном бактериофаге PRD1» . Mol Microbiol . 68 (2): 492–503. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.2008.06165.x . PMID 18366440 . 
  8. ^ Сарен, Ари-Матти; Ravantti, Janne J .; Бенсон, Стейси Д .; Burnett, Roger M .; Паулин, Ларс; Bamford, Dennis H .; Бэмфорд, Яана К.Х. (15 июля 2005 г.). «Снимок вирусной эволюции из анализа генома семейства Tectiviridae». Журнал молекулярной биологии . 350 (3): 427–440. DOI : 10.1016 / j.jmb.2005.04.059 . PMID 15946683 . 
  9. ^ Caruso SM, deCarvalho TN, Huynh A, Morcos G, Kuo N, Parsa S, Erill I (2019) Новый род Actinobacterial Tectiviridae. Вирусы 11 (12) | DOI: 10.3390 / v11121134. PMID 31817897

Дальнейшее чтение [ править ]

  • ICTVdB - Управление универсальной базой данных вирусов ICTVdB (2006 г.). 00.068. Tectiviridae. В: ICTVdB - Универсальная база данных вирусов, версия 3. Бюхен-Осмонд, К. (Эд), Колумбийский университет, Нью-Йорк, США.
  • Таксономия вирусов : восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов HV Van Regenmortel, DHL Bishop, MH Van Regenmortel, Claude M. Fauquet (ред.)
  • 68.0.1. Теквирус

Внешние ссылки [ править ]

  • Viralzone : Tectivirus
  • ICTV