Ламинин субъединица альфа-4 представляет собой белок , который у человека кодируется LAMA4 гена . [5] [6]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 Джин
3 ссылки
4 Дальнейшее чтение
Функция [ править ]
Ламинины , семейство гликопротеинов внеклеточного матрикса , являются основным неколлагеновым компонентом базальных мембран . Они вовлечены в широкий спектр биологических процессов, включая клеточную адгезию , дифференциацию, миграцию, передачу сигналов, рост нейритов и метастазирование .
Ламинины состоят из 3-х неидентичных цепей: ламинина альфа, бета и гамма (ранее A, B1 и B2, соответственно), и они образуют крестообразную структуру, состоящую из 3 коротких ветвей, каждое из которых образовано отдельной цепью, и длинной ветви всех 3 цепей. Каждая цепь ламинина представляет собой мультидоменный белок, кодируемый отдельным геном. Описано несколько изоформ каждой цепи. Различные изомеры альфа-, бета- и гамма-цепей в сочетании дают разные гетеротримерные соединения.изоформы ламинина, которые обозначены арабскими цифрами в порядке их открытия, то есть гетеротримером альфа1бета1 гамма1 является ламинин 1. Биологические функции различных цепей и молекул тримеров в значительной степени неизвестны, но было показано, что некоторые цепи различаются в зависимости от их тканевое распределение, предположительно отражающее различные функции in vivo .
Этот ген кодирует изоформу альфа-цепи ламинин, альфа 4. Доменная структура альфа 4 аналогична структуре домена альфа 3, оба из которых напоминают усеченные версии альфа 1 и альфа 2, в том, что примерно 1200 остатков на N-конце ( домены IV, V и VI) были потеряны. Ламинин, альфа 4, содержит C-концевой домен G, который отличает все альфа-цепи от бета- и гамма-цепей. Анализ РНК из тканей взрослого и плода выявил регуляцию экспрессии в процессе развития, однако точная функция ламинина, альфа 4, неизвестна. [6]
Джин [ править ]
В литературе описано тканеспецифическое использование альтернативного полиА-сигнала. Также отмечен альтернативный сплайсинг с участием первого интрона в 5 'UTR и изоформ, подобных ламинину альфа 4, однако полноразмерная природа этих продуктов не известна. [6]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000112769 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019846 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ричардс AJ, аль-Imara L, Картер Н.П., Ллойд JC, Leversha MA, папа FM (июль 1994). «Локализация гена (LAMA4) на хромосоме 6q21 и выделение частичной кДНК, кодирующей вариант цепи ламинина А». Геномика . 22 (1): 237–9. DOI : 10.1006 / geno.1994.1372 . PMID 7959779 .
^ a b c «Ген Энтреса: ламинин LAMA4, альфа 4» .
Дальнейшее чтение [ править ]
Любимова Ю.Ю., Фуджита М, Хазензон Н.М., Любимов А.В., Черный К.Л. (2006). «Изменения изоформ ламинина, связанные с инвазией опухоли головного мозга и ангиогенезом» . Границы биологических наук . 11 (1): 81–8. DOI : 10,2741 / 1781 . PMC 3506377 . PMID 16146715 .
Иванайнен А., Сайнио К., Сариола Х., Трюггвасон К. (май 1995 г.). «Первичная структура и экспрессия новой цепи альфа-4 ламинина человека» . Письма FEBS . 365 (2–3): 183–8. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (95) 00462-I . PMID 7781776 . S2CID 83904114 .
Burgeson RE, Chiquet M, Deutzmann R, Ekblom P, Engel J, Kleinman H, Martin GR, Meneguzzi G, Paulsson M, Sanes J (апрель 1994). «Новая номенклатура ламининов». Матричная биология . 14 (3): 209–11. DOI : 10.1016 / 0945-053X (94) 90184-8 . PMID 7921537 .
Райан М.С., Тизард Р., ВанДевантер Д.Р., Картер В.Г. (сентябрь 1994 г.). «Клонирование гена LamA3, кодирующего альфа-3 цепь адгезивного лиганда эпилигрина. Экспрессия при заживлении ран». Журнал биологической химии . 269 (36): 22779–87. PMID 8077230 .
Ричардс А., Аль-Имара Л., Папа Ф.М. (июнь 1996 г.). «Полная последовательность кДНК ламинина альфа 4 и ее связь с другими цепями ламинина альфа человека» . Европейский журнал биохимии / FEBS . 238 (3): 813–21. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1996.0813w.x . PMID 8706685 .
Сяо С., Люкс М.Л., Ривз Р., Хадсон Т.Дж., Флетчер Дж.А. (март 1997 г.). «Активация HMGI (Y) перестройками хромосомы 6p21 в мезенхимальных клетках с несколькими линиями из гамартомы легких» . Американский журнал патологии . 150 (3): 901–10. PMC 1857887 . PMID 9060828 .
Дуркин М.Э., Лоечел Ф., Маттей М.Г., Гилпин Б.Дж., Альбрехтсен Р., Вевер УМ (июль 1997 г.). «Тканеспецифическая экспрессия альфа5-цепи ламинина человека и картирование гена на хромосоме 20q13.2-13.3 человека и на дистальной хромосоме 2 мыши рядом с локусом мутации рваной (Ra)» . Письма FEBS . 411 (2–3): 296–300. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (97) 00686-8 . PMID 9271224 . S2CID 45286880 .
Ричардс А., Луккарини С., Папа Ф.М. (август 1997 г.). «Структурная организация LAMA4, гена, кодирующего ламинин альфа4». Европейский журнал биохимии / FEBS . 248 (1): 15–23. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1997.t01-1-00015.x . PMID 9310354 .
Mrowiec T, Melchar C, Górski A (1998). «Опосредованные белком ВИЧ изменения во взаимодействиях Т-клеток с белками внеклеточного матрикса и эндотелием». Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis . 45 (2–3): 255–9. PMID 9597096 .
Тальтс Дж. Ф., Сасаки Т., Миосге Н., Геринг В., Манн К., Мейн Р., Тимпл Р. (ноябрь 2000 г.). «Структурный и функциональный анализ рекомбинантного G-домена цепи ламинина альфа4 и его протеолитический процессинг в тканях» . Журнал биологической химии . 275 (45): 35192–9. DOI : 10.1074 / jbc.M003261200 . PMID 10934193 .
Флейшмайер Р., Курода К., Утани А., Дуглас Макдональд Е., Перлиш Дж. С., Арикава-Хирасава Е., Секигучи К., Сандзен Н., Тимпл Р., Ямада Ю. (декабрь 2000 г.). «Дифференциальная экспрессия альфа-цепей ламинина на стадиях пролиферации и дифференцировки в модели морфогенеза кожи». Матричная биология . 19 (7): 637–47. DOI : 10.1016 / S0945-053X (00) 00092-5 . PMID 11102753 .
McArthur CP, Wang Y, Heruth D, Gustafson S (июнь 2001 г.). «Амплификация внеклеточного матрикса и онкогенов в трансфицированных tat линиях клеток слюнных желез человека с экспрессией ламинина, фибронектина, коллагенов I, III, IV, c-myc и p53». Архивы оральной биологии . 46 (6): 545–55. DOI : 10.1016 / S0003-9969 (01) 00014-0 . PMID 11311202 .
Петяниеми Н., Корхонен М., Кортесмаа Дж., Трюггвасон К., Секигучи К., Фудзивара Х., Сорокин Л., Торнелл Л. Е., Вондиму З., Ассефа Д., Патарройо М., Виртанен И. (август 2002 г.). «Локализация альфа4-цепи ламинина в тканях развивающегося и взрослого человека» . Журнал гистохимии и цитохимии . 50 (8): 1113–30. DOI : 10.1177 / 002215540205000813 . PMID 12133914 .
Хаяси Ю., Ким К. Х., Фудзивара Х, Шимоно К., Ямасита М., Сандзен Н., Футаки С., Секигучи К. (декабрь 2002 г.). «Идентификация и рекомбинантное производство вариантов сплайсинга субъединицы ламинина альфа4 человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 299 (3): 498–504. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 02642-6 . PMID 12445830 .
Гонсалес А.М., Гонсалес М., Херрон Г.С., Нагаварапу Ю., Хопкинсон С.Б., Цурута Д., Джонс Дж. К. (декабрь 2002 г.). «Сложные взаимодействия между субъединицей ламинина альфа 4 и интегринами регулируют поведение эндотелиальных клеток in vitro и ангиогенез in vivo» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (25): 16075–80. DOI : 10.1073 / pnas.252649399 . PMC 138567 . PMID 12454288 .
ДеХан К.С., Гонсалес М., Гонсалес А.М., Хопкинсон С.Б., Чандель Н.С., Брунель Дж. К., Джонс Дж. С. (март 2004 г.). «Субъединица альфа4 ламинина регулирует выживаемость эндотелиальных клеток». Экспериментальные исследования клеток . 294 (1): 281–9. DOI : 10.1016 / j.yexcr.2003.11.006 . PMID 14980521 .
