Ламинин субъединица альфа-5 представляет собой белок , который у человека кодируется LAMA5 гена . [5] [6]
LAMA5 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | LAMA5 , ламинин, альфа 5, субъединица ламинина альфа 5 | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 601033 MGI : 105382 HomoloGene : 4060 GeneCards : LAMA5 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 20: 62.31 - 62.37 Мб | Chr 2: 180.18 - 180.23 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Функция
Компоненты внеклеточного матрикса оказывают огромное влияние на ткани по всему телу. В частности, ламинины, семейство гетеротримерных внеклеточных гликопротеинов, влияют на развитие и целостность тканей в таких различных органах, как почки, легкие, кожа и нервная система. Считается, что ламинины опосредуют прикрепление, миграцию и организацию клеток в тканях во время эмбрионального развития, взаимодействуя с другими компонентами внеклеточного матрикса. Ламинины функционируют как гетеротримерные комплексы альфа-, бета- и гамма-цепей, причем каждый тип цепи представляет отдельное подсемейство белков. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к альфа-подсемейству цепей ламинина и является основным компонентом базальных мембран. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы, но полноразмерная природа одного из них не установлена. [6]
Взаимодействия
Ламинин альфа 5 взаимодействует с BCAM . [7] [8]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000130702 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015647 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Дуркин М.Э., Лоечел Ф., Маттей М.Г., Гилпин Б.Дж., Альбрехтсен Р., Вевер УМ (июль 1997 г.). «Тканеспецифическая экспрессия альфа5-цепи ламинина человека и картирование гена на хромосоме 20q13.2-13.3 человека и на дистальной хромосоме 2 мыши рядом с локусом мутации рваной (Ra)» . Письма FEBS . 411 (2–3): 296–300. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (97) 00686-8 . PMID 9271224 . S2CID 45286880 .
- ^ а б «Энтрез Ген: ламин LAMA5, альфа 5» .
- ^ Парсонс С.Ф., Ли Дж., Спринг Ф.А., Уиллиг Т.Н., Питерс Л.Л., Гимм Дж. А., Таннер М.Дж., Мохандас Н., Энсти Д.Дж., Часис Д.А. (январь 2001 г.). «Лютеранский гликопротеин группы крови и его недавно охарактеризованный мышиный гомолог специфически связывают ламинин человека, содержащий альфа5-цепь, с высокой аффинностью». Кровь . 97 (1): 312–20. DOI : 10.1182 / blood.V97.1.312 . PMID 11133776 .
- ^ Киккава Ю., Моулсон К.Л., Виртанен И., Майнер Дж. Х. (ноябрь 2002 г.). «Идентификация сайта связывания гликопротеина лютеранской группы крови на ламинине альфа 5 посредством экспрессии цепей химерного ламинина in vivo» . Журнал биологической химии . 277 (47): 44864–9. DOI : 10.1074 / jbc.M208731200 . PMID 12244066 .
дальнейшее чтение
- Утани А., Номидзу М., Ямада Ю. (январь 1997 г.). «Фибулин-2 связывается с короткими плечами ламинина-5 и ламинина-1 через консервативные аминокислотные последовательности» . Журнал биологической химии . 272 (5): 2814–20. DOI : 10.1074 / jbc.272.5.2814 . PMID 9006922 .
- Rousselle P, Keene DR, Ruggiero F, Champliaud MF, Rest M, Burgeson RE (август 1997). «Ламинин 5 связывает домен NC-1 коллагена VII типа» . Журнал клеточной биологии . 138 (3): 719–28. DOI : 10,1083 / jcb.138.3.719 . PMC 2141627 . PMID 9245798 .
- Tiger CF, Champliaud MF, Pedrosa-Domellof F, Thornell LE, Ekblom P, Gullberg D (ноябрь 1997 г.). «Присутствие цепи ламинина альфа5 и отсутствие цепи ламинина альфа1 во время развития мышц человека и при мышечных дистрофиях» . Журнал биологической химии . 272 (45): 28590–5. DOI : 10.1074 / jbc.272.45.28590 . PMID 9353324 .
- Mrowiec T, Melchar C, Górski A (1998). «Опосредованные белком ВИЧ изменения во взаимодействии Т-клеток с белками внеклеточного матрикса и эндотелием». Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis . 45 (2–3): 255–9. PMID 9597096 .
- Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . Исследования ДНК . 5 (1): 31–9. DOI : 10.1093 / dnares / 5.1.31 . PMID 9628581 .
- Симидзу Х., Хосокава Х., Ниномия Х., Шахтер Дж. Х., Масаки Т. (апрель 1999 г.). «Адгезия культивируемых эндотелиальных клеток аорты крупного рогатого скота к ламинину-1, опосредованная дистрогликаном» . Журнал биологической химии . 274 (17): 11995–2000. DOI : 10.1074 / jbc.274.17.11995 . PMID 10207021 .
- Сын Ю.Дж., Скрэнтон Т.В., Сандерленд В.Дж., Бэк С.Дж., Майнер Дж.Х., Санес-младший, Карлсон СС (январь 2000 г.). «Белок синаптических везикул SV2 образует комплекс с альфа5-содержащим ламинином на поверхности нервного окончания» . Журнал биологической химии . 275 (1): 451–60. DOI : 10.1074 / jbc.275.1.451 . PMID 10617638 .
- Кёлер Д., Крузе М., Стёкер В., Стерчи Е.Е. (январь 2000 г.). «Гетерологически сверхэкспрессированный, аффинно очищенный человеческий меприн альфа является функционально активным и расщепляет компоненты базальной мембраны in vitro» . Письма FEBS . 465 (1): 2–7. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (99) 01712-3 . PMID 10620696 . S2CID 22895580 .
- Киккава Ю., Сандзен Н., Фудзивара Х, Сонненберг А., Секигучи К. (март 2000 г.). «Специфичность связывания интегрина ламинина-10/11: ламинин-10/11 распознается интегринами альфа 3 бета 1, альфа 6 бета 1 и альфа 6 бета 4». Журнал клеточной науки . 113 (Pt 5) (5): 869–76. PMID 10671376 .
- Champliaud MF, Virtanen I, Tiger CF, Korhonen M, Burgeson R, Gullberg D (сентябрь 2000 г.). «Посттрансляционные модификации и ассоциации бета / гамма цепей человеческого ламинина альфа1 и ламинина альфа5 цепей: очистка ламинина-3 из плаценты». Экспериментальные исследования клеток . 259 (2): 326–35. DOI : 10.1006 / excr.2000.4980 . PMID 10964500 .
- Libby RT, Champliaud MF, Claudepierre T., Xu Y, Gibbons EP, Koch M, Burgeson RE, Hunter DD, Brunken WJ (сентябрь 2000 г.). «Экспрессия ламинина во взрослых и развивающихся сетчатках: свидетельство двух новых ламининов ЦНС» . Журнал неврологии . 20 (17): 6517–28. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.20-17-06517.2000 . PMC 2924637 . PMID 10964957 .
- Пирс Р.А., Гриффин Г.Л., Майнер Дж. Х., старший RM (декабрь 2000 г.). «Паттерны экспрессии ламинина альфа1 и альфа5 в легких человека во время развития». Американский журнал респираторной клетки и молекулярной биологии . 23 (6): 742–7. DOI : 10,1165 / ajrcmb.23.6.4202 , PMID 11104726 .
- Парсонс С.Ф., Ли Дж., Спринг Ф.А., Уиллиг Т.Н., Питерс Л.Л., Гимм Дж. А., Таннер М.Дж., Мохандас Н., Энсти Д.Дж., Часис Д.А. (январь 2001 г.). «Лютеранский гликопротеин группы крови и его недавно охарактеризованный мышиный гомолог специфически связывают ламинин человека, содержащий альфа5-цепь, с высокой аффинностью». Кровь . 97 (1): 312–20. DOI : 10.1182 / blood.V97.1.312 . PMID 11133776 .
- Сагизаде М., Браун Д. Д., Кастельон Р., Чва М., Хуанг Г. Х., Любимова Ю. Ю., Розенберг С., Спирин К. С., Столитенко Р. Б., Адачи В., Киношита С., Мерфи Г., Виндзор Л. Дж., Кенни М. С., Любимов А. В. (февраль 2001 г.). «Сверхэкспрессия матриксной металлопротеиназы-10 и матриксной металлопротеиназы-3 в диабетической роговице человека: возможный механизм изменений базальной мембраны и интегрина» . Американский журнал патологии . 158 (2): 723–34. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 64015-1 . PMC 1850323 . PMID 11159210 .
- McArthur CP, Wang Y, Heruth D, Gustafson S (июнь 2001 г.). «Амплификация внеклеточного матрикса и онкогенов в трансфицированных tat линиях клеток слюнных желез человека с экспрессией ламинина, фибронектина, коллагенов I, III, IV, c-myc и p53». Архивы оральной биологии . 46 (6): 545–55. DOI : 10.1016 / S0003-9969 (01) 00014-0 . PMID 11311202 .
- Gagnoux-Palacios L, Allegra M, Spirito F, Pommeret O, Romero C, Ortonne JP, Meneguzzi G (май 2001 г.). «Короткое плечо цепи ламинина гамма2 играет ключевую роль во включении ламинина 5 во внеклеточный матрикс и в клеточной адгезии» . Журнал клеточной биологии . 153 (4): 835–50. DOI : 10.1083 / jcb.153.4.835 . PMC 2192378 . PMID 11352943 .
- Нагасе Т., Кикуно Р., Охара О. (август 2001 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XXI. Полные последовательности 60 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки» . Исследования ДНК . 8 (4): 179–87. DOI : 10.1093 / dnares / 8.4.179 . PMID 11572484 .
- Дои М., Тиболл Дж., Кортесмаа Дж., Янссон К., Иванайнен А., Парварде М., Тимпл Р., Хедин Ю., Сведенборг Дж., Трюггвасон К. (апрель 2002 г.). «Рекомбинантный человеческий ламинин-10 (alpha5beta1gamma1). Продукция, очистка и активность, способствующая миграции на эндотелиальных клетках сосудов» . Журнал биологической химии . 277 (15): 12741–8. DOI : 10.1074 / jbc.M111228200 . PMID 11821406 .