Лин-28 гомолога является белком , который в организме человека кодируется Lin28 геном . [5] [6]
LIN28A | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | LIN28A , CSDD1, LIN-28, LIN28, ZCCHC1, lin-28A, гомолог lin-28 A, Lin28a, LIN28A (ген), гомолог Lin-28 A | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 611043 MGI : 1890546 HomoloGene : 32592 GeneCards : LIN28A | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 1: 26.41 - 26.43 Мб | Chr 4: 134 - 134,02 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
LIN28 кодирует РНК- связывающий белок [7], который связывается и усиливает трансляцию мРНК IGF-2 (инсулиноподобный фактор роста 2) . [8] Lin28 связывается с пре- микроРНК let-7 и блокирует выработку зрелой микроРНК let-7 в эмбриональных стволовых клетках мыши . [9] [10] В клетках плюрипотентной эмбриональной карциномы LIN28 локализован в рибосомах , Р-тельцах и стрессовых гранулах . [11]
Функция
Экспрессия стволовых клеток
Считается, что LIN28 регулирует самообновление стволовых клеток . У Caenorhabditis elegans экспрессируется только один ген Lin28, а у позвоночных присутствуют два паралога, Lin28a и Lin28b . У нематод гомолог LIN28 lin-28 представляет собой гетерохронный ген, который определяет начало ранних личиночных стадий развития у C. elegans , регулируя самообновление стволовых клеток нематод в коже (называемых клетками шва) и вульве ( называемые VPC) во время разработки. [12] У мышей LIN28 высоко экспрессируется в эмбриональных стволовых клетках мыши и во время раннего эмбриогенеза . [13]
LIN28 высоко экспрессируется в эмбриональных стволовых клетках человека [14] и может повышать эффективность образования индуцированных плюрипотентных стволовых ( iPS ) клеток из человеческих фибробластов . [15]
Полового созревания
Сверхэкспрессия LIN28 у мышей может вызывать гигантизм и задержку наступления полового созревания , что согласуется с исследованиями ассоциации всего генома человека, предполагающими, что полиморфизмы в гене LIN28B человека связаны с ростом человека и временем полового созревания . [16] Мутации в LIN28B связаны с преждевременным половым созреванием . [17]
LIN28 может регулировать гомеостаз глюкозы у млекопитающих за счет увеличения передачи сигналов инсулина - PI3K - mTOR и чувствительности к инсулину, тем самым способствуя устойчивости к ожирению, вызванному диетой с высоким содержанием жиров, и диабету 2 типа . [18] Было замечено, что аберрантная экспрессия LIN28 регулирует аэробный гликолиз, способствуя пролиферации рака.
Регенерация тканей
У мышей, генетически измененных для выработки LIN28 в течение своей жизни, наблюдался улучшенный рост волос . [19] и регенерация здоровых тканей на добавленных колотых ранах [19] на более поздних этапах жизни. [19] Хотя мыши могли регенерировать конечности, они не могли восстанавливать поврежденную ткань сердца. Соответствующие препараты воспроизводили регенерацию у неизмененных мышей, используя те же метаболические пути. Лекарства увеличивали скорость метаболизма субъектов, очевидно, заставляя тело быстрее заживать. Эффекты активации Lin28a со временем исчезли. [19] [20]
Состав
Модели комплексов Lin28 / let-7, полученные с помощью рентгеновской кристаллографии и ЯМР, показывают, что два свернутых домена Lin28 распознают две отдельные области РНК . [21] [22] Доменов достаточно для ингибирования let-7 in vivo . [10] [23]
Приложения
LIN28 является маркером недифференцированных эмбриональных стволовых клеток человека [14] и используется для повышения эффективности образования iPS-клеток из человеческих фибробластов . [15]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000131914 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000050966 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Мосс Э.Г., Тан Л. (июнь 2003 г.). «Сохранение гетерохронного регулятора Lin-28, его экспрессия в процессе развития и комплементарные сайты микроРНК». Биология развития . 258 (2): 432–42. DOI : 10.1016 / S0012-1606 (03) 00126-X . PMID 12798299 .
- ^ «Ген Entrez: гомолог lin-28 LIN28 (C. elegans)» .
- ^ Циаликас Дж., Ромер-Зайберт Дж. (Июль 2015 г.). «LIN28: роли и регулирование в развитии и за его пределами» . Развитие . 142 (14): 2397–404. DOI : 10.1242 / dev.117580 . PMID 26199409 .
- ^ Полесская А., Кювелье С., Нагибнева И., Дюке А., Мосс Э. Г., Харель-Беллан А. (май 2007 г.). «Lin-28 связывает мРНК IGF-2 и участвует в миогенезе скелета, повышая эффективность трансляции» . Гены и развитие . 21 (9): 1125–38. DOI : 10,1101 / gad.415007 . PMC 1855237 . PMID 17473174 .
- ^ Вишванатан С.Р., Дейли Г.К., Грегори Р.И. (апрель 2008 г.). «Избирательная блокада процессинга микроРНК Lin28» . Наука . 320 (5872): 97–100. Bibcode : 2008Sci ... 320 ... 97V . DOI : 10.1126 / science.1154040 . PMC 3368499 . PMID 18292307 .
- ^ а б Али PS, Ghoshdastider U, Hoffmann J, Brutschy B, Filipek S (ноябрь 2012 г.). «Распознавание предшественника let-7g miRNA человеческим Lin28B». Письма FEBS . 586 (22): 3986–90. DOI : 10.1016 / j.febslet.2012.09.034 . PMID 23063642 . S2CID 28899778 .
- ^ Бальцер Э., Мосс Э. Г. (2007). «Локализация регулятора времени развития Lin28 в комплексах мРНП, Р-тельцах и стрессовых гранулах» . Биология РНК . 4 (1): 16–25. DOI : 10,4161 / rna.4.1.4364 . PMID 17617744 .
- ^ Moss EG, Lee RC, Ambros V (март 1997 г.). «Белок домена холодового шока LIN-28 контролирует время развития C. elegans и регулируется РНК lin-4». Cell . 88 (5): 637–46. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (00) 81906-6 . PMID 9054503 . S2CID 13248841 .
- ^ Ян Д.Х., Мосс Э.Г. (декабрь 2003 г.). «Регулируемая во времени экспрессия Lin-28 в различных тканях развивающейся мыши». Паттерны экспрессии генов . 3 (6): 719–26. DOI : 10.1016 / s1567-133x (03) 00140-6 . PMID 14643679 .
- ^ а б Ричардс М., Тан С.П., Тан Дж.Х., Чан В.К., Бонгсо А. (2004). «Профиль транскриптома эмбриональных стволовых клеток человека, определенный SAGE» . Стволовые клетки . 22 (1): 51–64. DOI : 10.1634 / стволовые клетки.22-1-51 . PMID 14688391 .
- ^ а б Ю. Дж., Водяник М. А., Смуга-Отто К., Антосевич-Бурже Дж., Френ Дж. Л., Тиан С., Ни Дж., Джонсдоттир Г. А., Руотти В., Стюарт Р., Слуквин И. И., Томсон Дж. А. (декабрь 2007 г.). «Индуцированные линии плюрипотентных стволовых клеток, полученные из соматических клеток человека». Наука . 318 (5858): 1917–20. Bibcode : 2007Sci ... 318.1917Y . DOI : 10.1126 / science.1151526 . PMID 18029452 . S2CID 86129154 .
- ^ Чжу Х., Шах С., Ших-Чанг Н., Шинода Г., Эйнхорн В. С., Вишванатан С. Р., Такеучи А., Грасеманн К., Ринн Д. Л., Лопес М. Ф., Хиршхорн Д. Н., Палмерт М. Р., Дейли Г. К. (июль 2010 г.). «Трансгенные мыши Lin28a проявляют фенотипы размера и полового созревания, идентифицированные в исследованиях генетических ассоциаций человека» . Генетика природы . 42 (7): 626–30. DOI : 10.1038 / ng.593 . PMC 3069638 . PMID 20512147 .
- ^ Park SW, Lee ST, Sohn YB, Cho SY, Kim SH, Kim SJ, Kim CH, Ko AR, Paik KH, Kim JW, Jin DK (октябрь 2012 г.). «Полиморфизм LIN28B связан с центральным преждевременным половым созреванием и ранним половым созреванием у девочек» . Корейский педиатрический журнал . 55 (10): 388–92. DOI : 10.3345 / kjp.2012.55.10.388 . PMC 3488615 . PMID 23133486 .
- ^ Чжу Х., Ших-Чанг Н., Сегре А.В., Шинода Дж., Шах С.П., Эйнхорн В.С., Такеучи А., Энгрейц Дж. М., Хаган Дж. П., Харас М. Г., Урбах А., Торнтон Д. Е., Трибулет Р., Грегори Р. И., Альтшулер Д., Дейли Г. К. ( Сентябрь 2011 г.). «Ось Lin28 / let-7 регулирует метаболизм глюкозы» . Cell . 147 (1): 81–94. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.08.033 . PMC 3353524 . PMID 21962509 .
- ^ а б в г Shyh-Chang N, Zhu H, Yvanka de Soysa T., Shinoda G, Seligson MT, Tsanov KM, Nguyen L, Asara JM, Cantley LC, Daley GQ (ноябрь 2013 г.). «Lin28 усиливает восстановление тканей путем перепрограммирования клеточного метаболизма» . Cell . 155 (4): 778–792. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.09.059 . PMC 3917449 . PMID 24209617 . Краткое содержание - Scientific American .
- ^ Shyh-Chang N, Daley GQ (апрель 2013 г.). «Lin28: основной регулятор роста и метаболизма стволовых клеток» . Стволовая клетка . 12 (4): 395–406. DOI : 10.1016 / j.stem.2013.03.005 . PMC 3652335 . PMID 23561442 .
- ^ Нам, Юнсун; Чен, Касандра; Грегори, Ричард I .; Чоу, Джеймс Дж .; Слиз, Петр (ноябрь 2011). «Молекулярные основы взаимодействия let-7 MicroRNAs с Lin28» . Cell . 147 (5): 1080–1091. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.10.020 . PMC 3277843 . PMID 22078496 .
- ^ Loughlin, Fionna E; Геберт, Лука FR; Тобин, Гарри; Бруншвейгер, Андреас; Холл, Джонатан; Аллен, Фредерик Х.Т. (11 декабря 2011 г.). «Структурная основа распознавания пре-let-7 miRNA цинковыми костяшками пальцев фактора плюрипотентности Lin28». Структурная и молекулярная биология природы . 19 (1): 84–89. DOI : 10.1038 / nsmb.2202 . PMID 22157959 . S2CID 2201304 .
- ^ PDB : 3TS2 ; Нам Й., Чен С., Грегори Р.И., Чжоу Дж.Дж., Слиз П. (ноябрь 2011 г.). «Молекулярная основа взаимодействия микроРНК let-7 с Lin28» . Cell . 147 (5): 1080–91. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.10.020 . PMC 3277843 . PMID 22078496 .
дальнейшее чтение
- Ричардс М., Тан С.П., Тан Дж.Х., Чан В.К., Бонгсо А. (2004). «Профиль транскриптома эмбриональных стволовых клеток человека, определенный SAGE» . Стволовые клетки . 22 (1): 51–64. DOI : 10.1634 / стволовые клетки.22-1-51 . PMID 14688391 .
- Sempere LF, Freemantle S, Pitha-Rowe I, Moss E, Дмитровский E, Амброс V (2004). «Профилирование экспрессии микроРНК млекопитающих раскрывает подмножество экспрессируемых мозгом микроРНК с возможной ролью в дифференцировке нейронов мышей и человека» . Геномная биология . 5 (3): R13. DOI : 10.1186 / GB-2004-5-3-R13 . PMC 395763 . PMID 15003116 .
- Герехт-Нир С., Дазард Дж. Э., Голан-Машиах М., Осенберг С., Ботвинник А., Амариглио Н., Домани Е., Рехави Г., Гивол Д., Ицковиц-Элдор Дж. (Февраль 2005 г.). «Экспрессия сосудистых генов и фенотипическая корреляция при дифференцировке эмбриональных стволовых клеток человека». Динамика развития . 232 (2): 487–97. DOI : 10.1002 / dvdy.20247 . PMID 15614775 . S2CID 3006762 .
- Ли Й.С., Ким Х. К., Чанг С., Ким К. С., Датта А. (апрель 2005 г.). «Истощение человеческой микро-РНК miR-125b показывает, что она критична для пролиферации дифференцированных клеток, но не для подавления предполагаемых мишеней во время дифференцировки» . Журнал биологической химии . 280 (17): 16635–41. DOI : 10.1074 / jbc.M412247200 . PMID 15722555 .
- Ву Л., Беласко Дж. Г. (ноябрь 2005 г.). «Регуляция микро-РНК гена lin-28 млекопитающих во время нейрональной дифференцировки клеток эмбриональной карциномы» . Молекулярная и клеточная биология . 25 (21): 9198–208. DOI : 10.1128 / MCB.25.21.9198-9208.2005 . PMC 1265813 . PMID 16227573 .
Внешние ссылки
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9H9Z2 (белок lin-28 гомолог A) в PDBe-KB .