Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
LIF
LIF Crystal Structure.rsh.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1ЭМР , 1ПВХ , 2К7Н

Идентификаторы
ПсевдонимыLIF , CDF, DIA, HILDA, MLPLI, фактор ингибирования лейкемии, цитокин семейства интерлейкинов 6, цитокин семейства интерлейкинов 6 LIF
Внешние идентификаторыOMIM : 159540 MGI : 96787 HomoloGene : 1734 GeneCards : LIF
Расположение гена ( человек )
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человека) [1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное расположение LIF
Геномное расположение LIF
Группа22q12.2Начинать30 240 453 п.н. [1]
Конец30 246 759 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 11 (мышь)
Chr.Хромосома 11 (мышь) [2]
Хромосома 11 (мышь)
Геномное расположение LIF
Геномное расположение LIF
Группа11 A1 | 11 2,94 смНачинать4 257 557 п.н. [2]
Конец4 272 514 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE LIF 205266 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание рецептора
• активность фактора роста
• активность цитокинов
• ГО: 0001948 связывание белка
• связывание рецептора лейкоз фактор ингибирования
Сотовый компонент• внеклеточная область
• внеклеточная
• цитозоль
Биологический процесс• негативная регуляция пролиферации клеток
• дифференцировка стволовых клеток
• позитивная регуляция пептидил-серинового фосфорилирования белка STAT
• позитивная регуляция каскада MAPK
• позитивная регуляция фосфорилирования пептидил-серина
• дифференцировка спонгиотрофобластов
• развитие легких
• позитивная регуляция ацетилирования гистона H3-K27
• развитие многоклеточного организма
• мочка легких морфогенезы
• формообразование мышцы органа
• материнского процесс вовлекается в женской беременности
• негативной регуляции секреции гормонов
• сигнальный путь фактора ингибирования лейкемии
• регуляция дифференцировки эпителиальных клеток метанефрических канальцев нефрона
• регуляция дифференцировки клеток
• позитивная регуляция экспрессии генов
• поддержание популяции стволовых клеток
• позитивная регуляция фосфорилирования пептидил-тирозина
• регуляция ДНК, специфичной для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II связывание
• позитивная регуляция дифференцировки астроцитов
• негативная регуляция каскада ERK1 и ERK2
• развитие нейронов
• децидуализация
• положительная регуляция перехода от мезенхимы к эпителию, участвующая в морфогенезе метанефроса
• развитие альвеол легких
• позитивная регуляция дифференцировки макрофагов
• ремоделирование кровеносных сосудов
• дифференцировка гигантских клеток трофобласта
• развитие сосудистой сети легких
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• позитивная регуляция локализации белка в ядро
• имплантация эмбриона
• негативная регуляция мейотического деления ядра
• иммунный ответ
• позитивная регуляция пролиферации клеток
• положительная регуляция фосфорилирования тирозина белка STAT
• фосфорилирование тирозина белка STAT
• регулирование активности рецептора
• цитокин-опосредованный сигнальный путь
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3976

16878

Ансамбль

ENSG00000128342

ENSMUSG00000034394

UniProt

P15018

P09056

RefSeq (мРНК)

NM_001257135
NM_002309

NM_001039537
NM_008501

RefSeq (белок)

NP_001244064
NP_002300

NP_001034626
NP_032527

Расположение (UCSC)Chr 22: 30.24 - 30.25 МбChr 11: 4.26 - 4.27 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор ингибирования лейкемии , или LIF , представляет собой цитокин класса интерлейкина 6, который влияет на рост клеток путем ингибирования дифференцировки. Когда уровни LIF падают, клетки дифференцируются.

Функция [ править ]

LIF получил свое название от его способности индуцировать терминальной дифференцировки в миелоидных лейкозных клеток, таким образом , предотвращая их дальнейший рост. Другие свойства, приписываемые цитокину, включают: стимуляцию роста и дифференцировку клеток различных типов клеток-мишеней, влияние на метаболизм костей , кахексию , нервное развитие , эмбриогенез и воспаление . Было показано, что LIF, регулируемый p53, облегчает имплантацию на модели мышей и, возможно, людям. [5]Было высказано предположение, что рекомбинантный человеческий LIF может помочь улучшить частоту имплантации у женщин с необъяснимым бесплодием. [6]

Привязка / активация [ править ]

LIF связывается со специфическим рецептором LIF ( LIFR-α ), который образует гетеродимер со специфической субъединицей, общей для всех членов этого семейства рецепторов, субъединицей , передающей сигнал GP130. Это приводит к активации JAK / STAT (Janus киназы / преобразователь сигнала и активатор транскрипции ) и МАРК ( митоген активированный протеин киназа ) каскады . [ необходима цитата ]

Выражение [ править ]

LIF обычно экспрессируется в трофэктодерме развивающегося эмбриона, а его рецептор LIFR экспрессируется во внутренней клеточной массе . Поскольку эмбриональные стволовые клетки происходят из внутренней клеточной массы на стадии бластоцисты, их удаление из внутренней клеточной массы также удаляет их источник LIF. Рекомбинантный LIF был произведен InVitria на растениях.

Использование в культуре стволовых клеток [ править ]

LIF часто добавляют в среду для культивирования стволовых клеток в качестве альтернативы культуре питающих клеток из-за ограничения, которое присутствуют питающие клетки, продуцируя только LIF на своей клеточной поверхности. Фидерные клетки, лишенные гена LIF , не могут эффективно поддерживать стволовые клетки. [7] LIF способствует самообновлению за счет привлечения преобразователя сигнала и активатора транскрипции 3 ( Stat3 ). Stat3 рекрутируется на активированный рецептор LIF и фосфорилируется киназой Janus.. Следует отметить, что LIF и Stat3 недостаточны для подавления дифференцировки стволовых клеток, поскольку клетки будут дифференцироваться при удалении сыворотки. Во время фазы обратимости дифференцировки от наивной плюрипотентности можно вернуть клетки обратно к наивной плюрипотентности путем добавления LIF. [8] Удаление LIF подталкивает стволовые клетки к дифференцировке , однако генетические манипуляции с эмбриональными стволовыми клетками позволяют LIF независимый рост, особенно сверхэкспрессию гена Nanog .

LIF обычно добавляют в среду для культивирования стволовых клеток, чтобы уменьшить спонтанную дифференцировку. [9] [10]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000128342 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000034394 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Ху W, Z Feng, Teresky А.К., Levine AJ (ноябрь 2007). «p53 регулирует материнское воспроизводство через LIF». Природа . 450 (7170): 721–4. Bibcode : 2007Natur.450..721H . DOI : 10,1038 / природа05993 . PMID 18046411 . 
  6. ^ Aghajanova L (декабрь 2004). «Фактор ингибирования лейкемии и имплантация человеческого эмбриона». Летопись Нью-Йоркской академии наук . 1034 (1): 176–83. Bibcode : 2004NYASA1034..176A . DOI : 10.1196 / annals.1335.020 . PMID 15731310 . 
  7. ^ Стюарт CL, Каспар P, Брюне LJ, Бхатт H, Гади I, Köntgen F, Abbondanzo SJ (сентябрь 1992). «Имплантация бластоцисты зависит от материнской экспрессии фактора ингибирования лейкемии». Природа . 359 (6390): 76–9. Bibcode : 1992Natur.359 ... 76S . DOI : 10.1038 / 359076a0 . PMID 1522892 . 
  8. Перейти ↑ Martello G, Smith A (2014). «Природа эмбриональных стволовых клеток». Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития . 30 : 647–75. DOI : 10,1146 / annurev-cellbio-100913-013116 . PMID 25288119 . 
  9. ^ Кавахара Y, Манабэ Т, Мацумото М, Kajiume Т, Мацумото М, Yuge л (июль 2009 г.). Zwaka T (ред.). «Культура эмбриональных стволовых клеток без LIF в моделируемой микрогравитации» . PLOS ONE . 4 (7): e6343. Bibcode : 2009PLoSO ... 4.6343K . DOI : 10.1371 / journal.pone.0006343 . PMC 2710515 . PMID 19626124 .  
  10. ^ «CGS: PTO находит ожидаемый патент на стволовые клетки, очевидный в свете« важных ориентиров » » . Архивировано из оригинала на 2011-10-04.

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Паттерсон PH (август 1994 г.). «Фактор ингибирования лейкемии, цитокин на стыке нейробиологии и иммунологии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (17): 7833–5. Bibcode : 1994PNAS ... 91.7833P . DOI : 10.1073 / pnas.91.17.7833 . PMC  44497 . PMID  8058719 .
  • Агаджанова Л. (декабрь 2004 г.). «Фактор ингибирования лейкемии и имплантация человеческого эмбриона». Летопись Нью-Йоркской академии наук . 1034 : 176–83. Bibcode : 2004NYASA1034..176A . DOI : 10.1196 / annals.1335.020 . PMID  15731310 .
  • Králícková M, Síma P, Rokyta Z (2005). «Роль мутаций гена фактора, ингибирующего лейкоз, у женщин с бесплодием: перекрестный обмен цитокинов эмбриона и эндометрия во время имплантации - хрупкое гомеостатическое равновесие». Folia Microbiologica . 50 (3): 179–86. DOI : 10.1007 / BF02931563 . PMID  16295654 .
  • Шталь Дж., Геринг Д.П., Уилсон Т.А., Браун М.А., Кинг Д.А., Гоф Н.М. (май 1990 г.). «Структурная организация генов фактора ингибирования лейкемии мышей и человека. Эволюционная консервация кодирующих и некодирующих областей». Журнал биологической химии . 265 (15): 8833–41. PMID  1692837 .
  • Базан Дж. Ф. (август 1991 г.). «Нейропоэтические цитокины кроветворной складки». Нейрон . 7 (2): 197–208. DOI : 10.1016 / 0896-6273 (91) 90258-2 . PMID  1714745 .
  • Лоу Д.Г., Нуньес В., Бомбара М., МакКейб С., Диапазоны Г.Е., Хензель В., Томида М., Ямамото-Ямагути Ю., Ходзуми М., Геддел Д.В. (июнь 1989 г.). «Геномное клонирование и гетерологичная экспрессия фактора, стимулирующего дифференцировку человека». ДНК . 8 (5): 351–9. DOI : 10.1089 / dna.1.1989.8.351 . PMID  2475312 .
  • Сазерленд Г.Р., Бейкер Э., Хайленд В.Дж., Каллен Д.Ф., Шталь Дж., Гоф Н.М. (январь 1989 г.). «Ген фактора ингибирования лейкемии человека (LIF) соответствует 22q12». Лейкоз . 3 (1): 9–13. PMID  2491897 .
  • Мори М., Ямагути К., Абе К. (май 1989 г.). «Очистка белка, ингибирующего липопротеинлипазу, продуцируемого линией клеток меланомы, ассоциированной с раковой кахексией». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 160 (3): 1085–92. DOI : 10.1016 / S0006-291X (89) 80114-7 . PMID  2730639 .
  • Gough NM, Gearing DP, King JA, Willson TA, Hilton DJ, Никола Н.А., Меткалф Д. (апрель 1988 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия человеческого гомолога мышиного гена, кодирующего фактор ингибирования миелоидной лейкемии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 85 (8): 2623–7. Bibcode : 1988PNAS ... 85.2623G . DOI : 10.1073 / pnas.85.8.2623 . PMC  280050 . PMID  3128791 .
  • Уильямс Р.Л., Хилтон Диджей, Пис С., Уилсон Т.А., Стюарт К.Л., Геринг Д.П., Вагнер Э.Ф., Меткалф Д., Никола Н.А., Гоф Н.М. (декабрь 1988 г.). «Фактор ингибирования миелоидного лейкоза поддерживает потенциал развития эмбриональных стволовых клеток». Природа . 336 (6200): 684–7. Bibcode : 1988Natur.336..684W . DOI : 10.1038 / 336684a0 . PMID  3143916 .
  • Моро Дж. Ф., Дональдсон Д. Д., Беннетт Ф., Витек-Джаннотти Дж., Кларк С. К., Вонг Г. Г. (декабрь 1988 г.). «Фактор ингибирования лейкемии идентичен человеческому интерлейкину миелоидного фактора роста для DA-клеток». Природа . 336 (6200): 690–2. Bibcode : 1988Natur.336..690M . DOI : 10.1038 / 336690a0 . PMID  3143918 .
  • Ямагути М., Мики Н., Оно М., Оцука С., Демура Х., Курачи Х., Иноуэ М., Эндо Х., Тага Т., Кисимото Т. (март 1995 г.). «Ингибирование выработки фактора высвобождения гормона роста в плаценте мыши цитокинами с использованием gp130 в качестве преобразователя сигнала». Эндокринология . 136 (3): 1072–8. DOI : 10.1210 / en.136.3.1072 . PMID  7867561 .
  • Schmelzer CH, Harris RJ, Butler D, Yedinak CM, Wagner KL, Burton LE (май 1993 г.). «Паттерн гликозилирования и дисульфидные отнесения рекомбинантного человеческого фактора, стимулирующего дифференцировку». Архивы биохимии и биофизики . 302 (2): 484–9. DOI : 10.1006 / abbi.1993.1243 . PMID  8489250 .
  • Айкава Дж., Икэда-Наики С., Огане Дж., Мин К.С., Имамура Т., Сасай К., Шиота К., Огава Т. (сентябрь 1997 г.). «Молекулярное клонирование гена альфа-цепи рецептора фактора ингибирования лейкемии крыс и его экспрессия во время беременности». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена . 1353 (3): 266–76. DOI : 10.1016 / s0167-4781 (97) 00079-1 . PMID  9349722 .
  • Хайндс М.Г., Маурер Т., Чжан Дж.Г., Никола Н.А., Нортон Р.С. (май 1998 г.). «Структура раствора фактора ингибирования лейкемии» . Журнал биологической химии . 273 (22): 13738–45. DOI : 10.1074 / jbc.273.22.13738 . PMID  9593715 .
  • Центр Сангера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, The (ноябрь 1998 г.). «К полной последовательности человеческого генома» . Геномные исследования . 8 (11): 1097–108. DOI : 10.1101 / gr.8.11.1097 . PMID  9847074 .
  • Танака М., Хара Т., Коупленд Н. Г., Гилберт Д. Д., Дженкинс Н. А., Миядзима А. (февраль 1999 г.). «Восстановление функционального мышиного рецептора онкостатина M (OSM): молекулярное клонирование бета-субъединицы мышиного рецептора OSM». Кровь . 93 (3): 804–15. DOI : 10.1182 / blood.V93.3.804 . PMID  9920829 .
  • Накашима К., Янагисава М., Аракава Н., Кимура Н., Хисацунэ Т., Кавабата М., Миядзоно К., Тага Т. (апрель 1999 г.). «Синергетическая передача сигналов в мозге плода с помощью комплекса STAT3-Smad1, соединенного мостиком p300». Наука . 284 (5413): 479–82. Bibcode : 1999Sci ... 284..479N . DOI : 10.1126 / science.284.5413.479 . PMID  10205054 .
  • Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бисли О., Берд С.П., Блейки С., Бриджман А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В.Д., О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Bibcode : 1999Natur.402..489D . DOI : 10.1038 / 990031 . PMID  10591208 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Лейкемия + ингибирующий + фактор в медицинских предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Источник рекомбинированного фактора ингибирования лейкемии ( http://www.invitria.com/cell-culture-products-services/leukemia-inhibitory-factor-culture-media.html )
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P15018 (фактор ингибирования лейкемии) в PDBe-KB .