Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
NR1H3
Белок NR1H3 PDB 1uhl.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1UHL , 3IPQ , 3IPS , 3IPU , 5AVI , 5AVL , 5HJS

Идентификаторы
ПсевдонимыNR1H3 , LXR-a, LXRA, RLD-1, X рецептор печени альфа, ядерный рецептор подсемейства 1, группа H, член 3
Внешние идентификаторыOMIM: 602423 MGI: 1352462 HomoloGene: 21165 Генные карты : NR1H3
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человека) [1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение NR1H3
Геномное расположение NR1H3
Группа11p11.2Начинать47 248 300 п.н. [1]
Конец47 269 032 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 2 (мышь)
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Хромосома 2 (мышь)
Геномное расположение NR1H3
Геномное расположение NR1H3
Группа2 E1 | 2 50,52 смНачинать91 184 061 п.н. [2]
Конец91 202 834 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• холестерина связывания
• GO: 0001948 связывание белка
• иона цинка связывания
• GO: 0038050, GO: 0004886, ГО: 0038051 активности ядерного рецептора
• связывание элемента ответа стерин
• стероидной активности рецептора гормона
• связывания ДНК
• связывания ДНК - последовательности конкретного
• ион металла связывание
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции
• Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции
• Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II
• Связывание фактора транскрипции
• лиганд-зависимая активность коактиватора транскрипции ядерного рецептора
• активность сигнального рецептора
Сотовый компонент• ядерный хроматин
• рецепторный комплекс
• нуклеоплазма
• комплекс факторов транскрипции РНК-полимераза II
• ядро клетки
• цитоплазма
Биологический процесс• позитивная регуляция сигнального пути толл-подобного рецептора 4
• гомеостаз стеролов
• негативная регуляция секреции панкреатического сока
• негативная регуляция воспалительного ответа
• клеточный ответ на липополисахарид
• негативная регуляция транспорта липидов
• позитивная регуляция активности липопротеинлипазы
• липидный гомеостаз
• триглицерид гомеостаз
• негативная регуляция активации макрофагов
• негативная регуляция дифференцировки пенистых клеток, происходящих из макрофагов
• позитивная регуляция транспорта холестерина
• отрицательная регуляция накопления холестерина
• регуляция транскрипции по шаблону ДНК
• позитивная регуляция процесса биосинтеза триглицеридов
• позитивная регуляция оттока холестерина
• позитивная регуляция процесса метаболизма клеточных белков
• негативная регуляция сигнального пути, опосредованного интерфероном гамма
• регуляция циркадного ритма
• транскрипция, ДНК-шаблон
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• ответ на прогестерон
• сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами
• клиренс апоптотических клеток
• положительная регуляция процесса биосинтеза жирных кислот
• инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• негативная регуляция секреции лизосомальных ферментов
• негативная регуляция пиноцитоза
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• внутриклеточный рецептор сигнальный путь
• гомеостаз холестерина
• регуляция активности коактиватора транскрипции лиганд-зависимых ядерных рецепторов
• липидный обмен
• развитие многоклеточного организма
• дифференцировка клеток
• отрицательная регуляция термогенеза, вызванного холодом
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

10062

22259

Ансамбль

ENSG00000025434

ENSMUSG00000002108

UniProt

Q13133

Q9Z0Y9

RefSeq (мРНК)

NM_001130101
NM_001130102
NM_001251934
NM_001251935
NM_005693

NM_001177730
NM_013839
NM_001355279

RefSeq (белок)
NP_001123573
NP_001123574
NP_001238863
NP_001238864
NP_005684

NP_001350524
NP_005684.2

NP_001171201
NP_038867
NP_001342208

Расположение (UCSC)Chr 11: 47,25 - 47,27 МбChr 2: 91,18 - 91,2 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Печень Х - рецептора альфа ( LXR-альфа ) представляет собой ядерный рецептор белка , который в организме человека кодируется NR1H3 гена (ядерный рецептор подсемейства 1, группа H, элемент 3). [5] [6]

Выражение [ править ]

miRNA hsa-miR-613 ауторегулирует ген LXRα человека путем нацеливания на эндогенный LXRα через его специфический ответный элемент miRNA (613MRE) в 3'-нетранслируемой области LXRα. LXRα саморегулирует свое собственное подавление посредством индукции SREBP1c, который активирует miRNA has-miR-613. [7]

Функция [ править ]

В печени X - рецепторы , LXRα (этот белок) и LXRβ , образуют подсемейство ядерного рецептора суперсемейства и являются ключевыми регуляторами макрофагальной функции, контролирующие транскрипцию программ , участвующих в липидном гомеостазе и воспаление. Кроме того, они играют важную роль в локальной активации гормонов щитовидной железы через дейодиназы . [8] Индуцибельный LXRα высоко экспрессируется в печени, надпочечниках, кишечнике, жировой ткани, макрофагах, легких и почках, тогда как LXRβ экспрессируется повсеместно. Активированные лигандом LXR образуют облигатные гетеродимеры с ретиноидными X-рецепторами (RXR) и регулируют экспрессию генов-мишеней, содержащих LXR.элементы ответа . [9] [10] Восстановление экспрессии / функции LXR-альфа в псориатическом поражении может помочь переключить переход от псориатической к бессимптомной коже. [11]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что альфа рецептор Х печени взаимодействует с EDF1 [12] и малым гетеродимерным партнером . [13] LXRα активирует фактор транскрипции SREBP-1c , что приводит к липогенезу . [14]

Ссылка на рассеянный склероз [ править ]

В 2016 году исследование показало, что у 70% людей в двух семьях с редкой формой быстро прогрессирующего рассеянного склероза была мутация в NR1H3. [15] Однако анализ, проведенный Международным консорциумом по генетике рассеянного склероза с использованием выборки в 13 раз большего размера, не смог найти никаких доказательств того, что рассматриваемая мутация (p.Arg415Gln) связана с рассеянным склерозом, что опровергает эти выводы. [16]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000025434 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002108 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Мият К.С., Макий С.Е., Пател HV, Rachubinski Р.А., Capone JP (апрель 1996 г.). «Рецептор орфанного ядерного гормона LXR альфа взаимодействует с рецептором, активируемым пролифератором пероксисом, и ингибирует передачу сигналов пролифератора пероксисом» . Журнал биологической химии . 271 (16): 9189–92. DOI : 10.1074 / jbc.271.16.9189 . PMID 8621574 . 
  6. ^ Вилли PJ, Umesono K, Ong ES, Evans RM, RA Хейман, Mangelsdorf DJ (май 1995). «LXR, ядерный рецептор, определяющий отдельный путь ретиноидного ответа» . Гены и развитие . 9 (9): 1033–45. DOI : 10,1101 / gad.9.9.1033 . PMID 7744246 . 
  7. ^ http://mend.endojournals.org/content/25/4/584.abstract
  8. ^ Christoffolete MA, Doleschall M, Egri P, Liposits Z, Zavacki AM, Bianco AC, Gereben B (2010). «Регулирование активации гормона щитовидной железы через путь Х-рецептора / ретиноида Х-рецептора печени» . Журнал эндокринологии . 205 (2): 179–86. DOI : 10.1677 / JOE-09-0448 . PMC 3133926 . PMID 20176747 .  
  9. ↑ Korf H, Vander Beken S, Romano M, Steffensen KR, Stijlemans B, Gustafsson JA, Grooten J, Huygen K (июнь 2009 г.). «Х-рецепторы печени способствуют защитному иммунному ответу против Mycobacterium tuberculosis у мышей» . Журнал клинических исследований . 119 (6): 1626–37. DOI : 10.1172 / JCI35288 . PMC 2689129 . PMID 19436111 .  
  10. ^ «Энтрез Ген: подсемейство ядерных рецепторов 1» .
  11. Перейти ↑ Gupta DS, Kaul D, Kanwar AJ, Parsad D (январь 2010). «Псориаз: решающая роль LXR-альфа RNomics» . Гены и иммунитет . 11 (1): 37–44. DOI : 10.1038 / gene.2009.63 . PMID 19798078 . 
  12. Перейти ↑ Brendel C, Gelman L, Auwerx J (июнь 2002 г.). «Мультибелковый мостиковый фактор-1 (MBF-1) является кофактором ядерных рецепторов, регулирующих липидный обмен» . Молекулярная эндокринология . 16 (6): 1367–77. DOI : 10.1210 / mend.16.6.0843 . PMID 12040021 . 
  13. ^ Брендел С, Schoonjans К, Botrugno О.А., Treuter Е, Auwerx J (сентябрь 2002). «Маленький гетеродимерный партнер взаимодействует с альфа-рецептором Х печени и подавляет его транскрипционную активность» . Молекулярная эндокринология . 16 (9): 2065–76. DOI : 10.1210 / me.2001-0194 . PMID 12198243 . 
  14. ↑ Wang MY, Chen L, Clark GO, Lee Y, Stevens RD, Ilkayeva OR, Wenner BR, Bain JR, Charron MJ, Newgard CB, Unger RH (2010). «Лептиновая терапия при инсулино-дефицитном диабете I типа» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (11): 4813–9. DOI : 10.1073 / pnas.0909422107 . PMC 2841945 . PMID 20194735 .  
  15. ↑ Wang Z, Sadovnick AD, Traboulsee AL, Ross JP, Bernales CQ, Encarnacion M, Yee IM, de Lemos M, Greenwood T, Lee JD, Wright G, Ross CJ, Zhang S, Song W, Vilariño-Güell C (2016 ). «Ядерный рецептор NR1H3 в семейном рассеянном склерозе» . Нейрон . 90 (5): 948–54. DOI : 10.1016 / j.neuron.2016.04.039 . PMC 5092154 . PMID 27253448 .  
  16. ^ Антел Дж, Пан М, Baranzini S, Барселлос л, Barizzone Н, Бичем А, и др. (Международный консорциум по генетике рассеянного склероза) (октябрь 2016 г.). «NR1H3 p.Arg415Gln не связан с риском рассеянного склероза» . Нейрон . 92 (2): 333–335. DOI : 10.1016 / j.neuron.2016.09.052 . PMC 5641967 . PMID 27764667 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Леманн Дж. М., Кливер С. А., Мур Л. Б., Смит-Оливер Т. А., Оливер Б. Б., Су Дж. Л., Сундсет С. С., Вайнегар Д. А., Бланшар Д. Е., Спенсер Т. А., Уилсон TM (февраль 1997 г.). «Активация ядерного рецептора LXR оксистерином определяет новый путь гормонального ответа» . Журнал биологической химии . 272 (6): 3137–40. DOI : 10.1074 / jbc.272.6.3137 . PMID  9013544 .
  • Обо Д., Рюссе Дж., Фахас Л., Валлье П., Фреринг В., Рио Дж. П., Стэлс Б., Оверкс Дж., Лавиль М., Видаль Х. (август 1997 г.). «Распределение в тканях и количественная оценка экспрессии мРНК рецепторов, активируемых пролифератором пероксисом, и рецептора Х-альфа печени у людей: отсутствие изменений в жировой ткани у пациентов с ожирением и NIDDM». Диабет . 46 (8): 1319–27. DOI : 10.2337 / diabetes.46.8.1319 . PMID  9231657 .
  • Пит DJ, Терли С.Д., Ма В., Яновски Б.А., Лобаккаро Дж. М., Хаммер Р. Э., Мангельсдорф Д. Д. (май 1998 г.). «Метаболизм холестерина и желчных кислот нарушен у мышей, лишенных ядерного рецептора оксистерина LXR альфа». Cell . 93 (5): 693–704. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81432-4 . PMID  9630215 . S2CID  5856580 .
  • Miyata KS, McCaw SE, Meertens LM, Patel HV, Rachubinski RA, Capone JP (ноябрь 1998 г.). «Белок 140, взаимодействующий с рецептором, взаимодействует и ингибирует трансактивацию рецептором альфа, активируемым пролифератором пероксисом, и рецептором Х-печени альфа». Молекулярная и клеточная эндокринология . 146 (1–2): 69–76. DOI : 10.1016 / S0303-7207 (98) 00196-8 . PMID  10022764 . S2CID  53253694 .
  • Венкатесваран А., Лаффитт Б.А., Джозеф С.Б., Мак ПА, Вильпитц, округ Колумбия, Эдвардс, Пенсильвания, Тонтоноз П. (октябрь 2000 г.). «Контроль оттока клеточного холестерина ядерным рецептором оксистерина LXR альфа» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (22): 12097–102. Bibcode : 2000PNAS ... 9712097V . DOI : 10.1073 / pnas.200367697 . PMC  17300 . PMID  11035776 .
  • Chinetti G, Lestavel S, Bocher V, Remaley AT, Neve B, Torra IP, Teissier E, Minnich A, Jaye M, Duverger N, Brewer HB, Fruchart JC, Clavey V, Staels B (январь 2001 г.). «Активаторы PPAR-альфа и PPAR-гамма вызывают удаление холестерина из пенистых клеток макрофагов человека посредством стимуляции пути ABCA1». Природная медицина . 7 (1): 53–8. DOI : 10.1038 / 83348 . PMID  11135616 . S2CID  20558311 .
  • Laffitte BA, Repa JJ, Joseph SB, Wilpitz DC, Kast HR, Mangelsdorf DJ, Tontonoz P (январь 2001 г.). «LXR контролируют индуцируемую липидами экспрессию гена аполипопротеина Е в макрофагах и адипоцитах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (2): 507–12. DOI : 10.1073 / pnas.021488798 . PMC  14617 . PMID  11149950 .
  • Li Y, Bolten C, Bhat BG, Woodring-Dietz J, Li S, Prayaga SK, Xia C, Lala DS (март 2002 г.). «Индукция экспрессии альфа-гена рецептора X печени человека через механизм ауторегуляторной петли». Молекулярная эндокринология . 16 (3): 506–14. DOI : 10,1210 / me.16.3.506 . PMID  11875109 .
  • Mak PA, Laffitte BA, Desrumaux C, Joseph SB, Curtiss LK, Mangelsdorf DJ, Tontonoz P, Edwards PA (август 2002 г.). «Регулируемая экспрессия кластера генов аполипопротеина E / CI / C-IV / C-II в мышиных и человеческих макрофагах. Критическая роль ядерных Х-рецепторов альфа и бета» . Журнал биологической химии . 277 (35): 31900–8. DOI : 10.1074 / jbc.M202993200 . PMID  12032151 .
  • Брендель С., Гельман Л., Ауверкс Дж. (Июнь 2002 г.). «Мультибелковый мостиковый фактор-1 (MBF-1) является кофактором ядерных рецепторов, регулирующих липидный обмен» . Молекулярная эндокринология . 16 (6): 1367–77. DOI : 10.1210 / mend.16.6.0843 . PMID  12040021 .
  • Стеффенсен К.Р., Шустер Г.У., Парини П., Холтер Э., Садек С.М., Кассель Т., Эскильд В., Густафссон Дж. А. (май 2002 г.). «Различная регуляция активности промотора LXRalpha изоформами CCAAT / белков, связывающих энхансер». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 293 (5): 1333–40. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 00390-X . PMID  12054659 .
  • Gbaguidi GF, Agellon LB (июль 2002 г.). «Атипичное взаимодействие альфа-рецептора, активируемого пролифератором пероксисом, с альфа-рецептором Х печени противодействует стимулирующему эффекту их соответствующих лигандов на промотор гена холестерин-7альфа-гидроксилазы мыши». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов . 1583 (2): 229–36. DOI : 10.1016 / s1388-1981 (02) 00217-2 . PMID  12117567 .
  • Pawar A, Xu J, Jerks E, Mangelsdorf DJ, Jump DB (октябрь 2002 г.). «Жирнокислотная регуляция рецепторов Х печени (LXR) и рецептора, активируемого пролифератором пероксисом альфа (PPARalpha) в клетках HEK293» . Журнал биологической химии . 277 (42): 39243–50. DOI : 10.1074 / jbc.M206170200 . PMID  12161442 .
  • Брендель К., Скунджанс К., Ботругно О.А., Тройтер Е., Ауверкс Дж. (Сентябрь 2002 г.). «Малый гетеродимерный партнер взаимодействует с альфа-рецептором Х печени и подавляет его транскрипционную активность» . Молекулярная эндокринология . 16 (9): 2065–76. DOI : 10.1210 / me.2001-0194 . PMID  12198243 .
  • Оберкофлер Х., Шрамл Э., Кремплер Ф., Патч В. (апрель 2003 г.). «Усиление транскрипционной активности рецептора Х печени с помощью соактиватора гамма-рецептора, активируемого пероксисомами-пролифератором 1 альфа» . Биохимический журнал . 371 (Pt 1): 89–96. DOI : 10.1042 / BJ20021665 . PMC  1223253 . PMID  12470296 .
  • Ван М., Томас Дж., Беррис Т.П., Шкерянц Дж., Майкл Л.Ф. (ноябрь 2003 г.). «Молекулярные детерминанты агонизма LXRalpha». Журнал молекулярной графики и моделирования . 22 (2): 173–81. DOI : 10.1016 / S1093-3263 (03) 00159-1 . PMID  12932788 .
  • Фукути Дж., Сонг Си, Ко А.Л., Ляо С. (сентябрь 2003 г.). «Транскрипционная регуляция фарнезилпирофосфатсинтазы с помощью Х-рецепторов печени». Стероиды . 68 (7–8): 685–91. DOI : 10.1016 / S0039-128X (03) 00100-4 . PMID  12957674 . S2CID  6023862 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Расположение человеческого гена NR1H3 в браузере генома UCSC .
  • Подробная информация о человеческом гене NR1H3 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .