Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
NF2
Белок NF2 PDB 1h4r.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4ZRJ , 1H4R , 3U8Z , 4ZRI

Идентификаторы
ПсевдонимыNF2 , ACN, BANF, SCH, нейрофибромин 2 (мерлин), нейрофибромин 2
Внешние идентификаторыOMIM : 607379 MGI : 97307 HomoloGene : 2180 GeneCards : NF2
Расположение гена ( человек )
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человека) [1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное расположение NF2
Геномное расположение NF2
Группа22q12.2Начинать29 603 556 п.н. [1]
Конец29 698 598 б.п. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 11 (мышь)
Chr.Хромосома 11 (мышь) [2]
Хромосома 11 (мышь)
Геномное расположение NF2
Геномное расположение NF2
Группа11 A1 | 11 3,0 смНачинать4 765 845 п.н. [2]
Конец4 849 536 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE NF2 204991 s в формате fs.png

PBB GE NF2 210767 в формате fs.png

PBB GE NF2 211017 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• цитоскелета связывание белка
• GO: связывание белка 0001948
• актина связывание
Сотовый компонент• цитоплазма
• тело клетки
• проекция клетки
• мембрана
• филоподий
• волнистость
• соединение сращений
• клеточная мембрана
• апикальная часть клетки
• волнистая мембрана
• ранняя эндосома
• ядрышко
• кортикальный актиновый цитоскелет
• перинуклеарная область цитоплазмы
• проекция нейрона
• борозда дробления
• цитоскелет
• ядро клетки
• ламеллиподиум
• мембрана филоподия
• цитозоль
Биологический процесс• негативная регуляция каскада JAK-STAT
• регуляция глиогенеза
• организация межклеточного соединения
• регуляция стабильности белка
• негативная регуляция межклеточной адгезии
• негативная регуляция активности протеинкиназы
• образование мезодермы
• развитие эктодермы
• негативная регуляция репликации ДНК
• пролиферация шванновских клеток
• регуляция пролиферации нервных клеток-предшественников
• регуляция локализации белка в ядре
• негативная регуляция адгезии клеточного матрикса
• одонтогенез дентинсодержащего зуба
• развитие мозга
• негативная регуляция миграции клеток
• дифференцировка клеток хрусталика
• регуляция пролиферации клеток
• позитивная регуляция дифференцировки клеток
• негативная регуляция каскада MAPK
• регуляция передачи сигналов гиппопотама
• развитие гиппокампа
• регуляция стволовых клеток пролиферация
• регуляция нейрогенеза
• организация актинового цитоскелета
• позитивная регуляция сборки стрессовых волокон
• негативная регуляция пролиферации клеток
• отрицательная регуляция фосфорилирования тирозина белка STAT
• регуляция апоптотического процесса
• регуляция клеточного цикла
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4771

18016

Ансамбль

ENSG00000186575

ENSMUSG00000009073

UniProt

P35240

P46662

RefSeq (мРНК)
NM_181835
NM_000268
NM_016418
NM_181825
NM_181826

NM_181827
NM_181828
NM_181829
NM_181830
NM_181831
NM_181832
NM_181833
NM_181834

NM_001252250
NM_001252251
NM_001252252
NM_001252253
NM_010898

NM_001361675
NM_001361676
NM_001361677

RefSeq (белок)
NP_000259
NP_057502
NP_861546
NP_861966
NP_861967

NP_861968
NP_861969
NP_861970
NP_861971

NP_001239179
NP_001239180
NP_001239181
NP_001239182
NP_035028

NP_001348604
NP_001348605
NP_001348606

Расположение (UCSC)Chr 22: 29,6 - 29,7 МбChr 11: 4.77 - 4.85 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Мерлин (также называемый нейрофибромином 2 или шванномином ) - это белок цитоскелета . У людей это белок-супрессор опухолей, участвующий в нейрофиброматозе II типа . [5] [6] Данные последовательности показывают его сходство с семейством белков ERM .

Название «мерлин» является аббревиатурой от « Моэсин - Эзрин - Радиксин - Подобный белку».

Джин [ править ]

Человеческий мерлин кодируется геном NF2 в хромосоме 22 . Ген мерлина мыши расположен на хромосоме 11 [7], а ген мерлина крысы - на хромосоме 17. Ген мерлина плодовой мушки (символ Mer ) расположен на хромосоме 1 и имеет 58% сходства со своим гомологом человека . Другие подобные мерлину гены известны у широкого круга животных, и считается, что происхождение мерлина произошло от ранних многоклеточных животных . Мерлин является членом семейства белков ERM, включая эзрин, моэзин и радиксин, которые входят в суперсемейство белков 4.1 . Мерлин также известен как шванномин, название, производное от наиболее распространенного типа опухоли в фенотипе пациента NF2, шванномы .

Структура [ править ]

Мерлин позвоночных - это белок массой 70  кДа . Известно 10 изоформ молекулы мерлина человека ( длина полной молекулы составляет 595 аминокислот ). Два наиболее распространенных из них также обнаруживаются у мышей и называются типом 1 и типом 2 , которые отличаются отсутствием или присутствием экзона 16 или 17 соответственно). Все известные разновидности имеют консервативную N-концевую часть, которая содержит домен FERM (домен, обнаруженный в большинстве белков, организующих цитоскелетные мембраны). За доменом FERM следует альфа-спиральный домен и гидрофильный хвост. [8] [9]Мерлин может димеризоваться сам с собой и гетеродимеризоваться с другими белками семейства ERM.

Функция [ править ]

Мерлин представляет собой белок-каркас мембраны- цитоскелета, т.е. связывающий актиновые филаменты с клеточной мембраной или мембранными гликопротеинами . [10] Человеческий мерлин преимущественно обнаруживается в нервной ткани , но также и в некоторых других тканях плода и в основном находится в сращениях . [11] Его опухолевые супрессивные свойства, вероятно, связаны с опосредованным контактом ингибированием роста . Drosophila merlin экспрессируется в эмбриональной задней кишке , слюнных железах и имагинальных дисках., и, по-видимому, играет несколько иную роль, чем у позвоночных. [12]

Фосфорилирование по серину 518 , как известно , чтобы изменить функциональное состояние Merlin. [13] Предполагается, что сигнальный путь мерлина включает несколько заметных молекул, контролирующих рост клеток, включая eIF3c, CD44 , протеинкиназу А и киназы, активируемые p21 .

Работа в Drosophila идентифицирована Merlin как выше по потоку регулятора Hippo супрессор опухоли пути , [14] функция , которая сохраняется у млекопитающих. [15] Путь Hippo - это хорошо законсервированный путь передачи сигналов, который координирует клеточную пролиферацию и апоптоз. [16]

Мутации гена NF2 вызывают у человека аутосомно-доминантное заболевание, называемое нейрофиброматозом 2 типа. Оно характеризуется развитием опухолей нервной системы, чаще всего двусторонних вестибулярных шванном (также называемых акустическими невриномами). NF2 принадлежит к группе генов- супрессоров опухолей. [17]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что мерлин (белок) взаимодействует с:

  • CUL4A , [18]
  • DDB1 , [18]
  • EZR , [19]
  • HGS , [20] [21]
  • MED28 , [22]
  • RIT1 , [18]
  • СДКБП , [23]
  • СПТБН1 , [24] и
  • ВПРБП . [18]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000186575 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009073 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Rouleau GA, Merel P, Lutchman M, Sanson M, Zucman J, Marineau C, Hoang-Xuan K, Demczuk S, Desmaze C, Plougastel B (1993). «Изменение нового гена, кодирующего предполагаемый мембранно-организующий белок, вызывает нейрофиброматоз 2 типа». Природа . 363 (6429): 515–21. Bibcode : 1993Natur.363..515R . DOI : 10.1038 / 363515a0 . PMID 8379998 . 
  6. ↑ Головнина К., Блинов А., Ахмаметьева Е.М., Омельянчук Л.В., Чанг Л.С. (2005). «Эволюция и происхождение мерлина, продукта гена-супрессора нейрофиброматоза 2 типа (NF2)» . BMC Evol. Биол . 5 : 69. DOI : 10.1186 / 1471-2148-5-69 . PMC 1315344 . PMID 16324214 .  
  7. ^ Хаас В.Х., Trofatter JA, MacCollin М, Tarttelin Е, Gusella ДФ, Рамеш В (1994). «Гомолог NF2 мыши кодирует высококонсервативный белок мерлин с альтернативными формами». Гм. Мол. Genet . 3 (3): 407–11. DOI : 10.1093 / HMG / 3.3.407 . PMID 8012352 . 
  8. ↑ Симидзу Т., Сето А., Маита Н., Хамада К., Цукита С., Цукита С., Хакосима Т. (2002). «Структурные основы нейрофиброматоза 2 типа. Кристаллическая структура домена мерлина FERM» . J. Biol. Chem . 277 (12): 10332–6. DOI : 10.1074 / jbc.M109979200 . PMID 11756419 . 
  9. ^ Али Хадже, J; Ju, JH; Атчиба, М. (2014). «Молекулярная конформация полноразмерного супрессора опухолей NF2 / Merlin - исследование малоуглового рассеяния нейтронов» . Журнал молекулярной биологии . 426 (15): 2755–68. DOI : 10.1016 / j.jmb.2014.05.011 . PMC 4407695 . PMID 24882693 .  
  10. ^ McClatchey А.И., Giovannini M (2005). «Мембранная организация и туморогенез - опухолевый супрессор NF2, Мерлин» . Genes Dev . 19 (19): 2265–77. DOI : 10,1101 / gad.1335605 . PMID 16204178 . 
  11. ^ ден Баккер MA, Vissers KJ, Molijn AC, Kros JM, Zwarthoff EC, van der Kwast TH (1999). «Экспрессия гена нейрофиброматоза 2 типа в тканях человека» . J. Histochem. Cytochem . 47 (11): 1471–80. DOI : 10.1177 / 002215549904701113 . PMID 10544220 . Архивировано из оригинала на 2008-05-18. 
  12. ^ Lajeunesse DR Маккартни BM, Fehon RG (1998). «Структурный анализ Drosophila Merlin выявляет функциональные домены, важные для контроля роста и субклеточной локализации» . J. Cell Biol . 141 (7): 1589–99. DOI : 10.1083 / jcb.141.7.1589 . PMC 2133006 . PMID 9647651 .  
  13. ^ Alfthan К, Heiska л, Гронхольм М, Renkema GH, CARPEN O (2004). «Циклическая АМФ-зависимая протеинкиназа фосфорилирует мерлин по серину 518 независимо от р21-активированной киназы и способствует гетеродимеризации мерлин-эзрина» . J. Biol. Chem . 279 (18): 18559–66. DOI : 10.1074 / jbc.M313916200 . PMID 14981079 . 
  14. ^ Hamaratoglu F, Willecke M, Канго-Сингх М., и др. (2006). «Гены-супрессоры опухолей NF2 / Merlin и Expanded действуют посредством передачи сигналов Hippo, регулируя пролиферацию клеток и апоптоз». Природа клеточной биологии . 8 (1): 27–36. DOI : 10.1038 / ncb1339 . PMID 16341207 . 
  15. ↑ Zhang N, Bai H, David KK, Dong J, Zheng Y, Cai J, Giovannini M, Liu P, Anders RA, Pan D. (2010). «Супрессор опухоли Merlin / NF2 действует через онкопротеин YAP, регулируя гомеостаз тканей у млекопитающих» . Клетка развития . 19 (1): 27–38. DOI : 10.1016 / j.devcel.2010.06.015 . PMC 2925178 . PMID 20643348 .  
  16. ↑ Pan D (октябрь 2010 г.). «Путь передачи сигналов бегемота в развитии и раке» . Клетка развития . 19 (4): 491–505. DOI : 10.1016 / j.devcel.2010.09.011 . PMC 3124840 . PMID 20951342 .  
  17. ^ Scoles DR, Ен WH, Цинь Y, Wawrowsky K, Pulst SM (2006). «Шванномин подавляет онкогенез за счет прямого взаимодействия с субъединицей с эукариотического фактора инициации (eIF3c)» . Гм. Мол. Genet . 15 (7): 1059–70. DOI : 10,1093 / HMG / ddl021 . PMID 16497727 . 
  18. ^ а б в г Хуанг Дж, Чен Дж (июль 2008 г.). «VprBP нацеливает Мерлин на лигазный комплекс Roc1-Cul4A-DDB1 E3 для деградации» . Онкоген . 27 (29): 4056–64. DOI : 10.1038 / onc.2008.44 . PMID 18332868 . 
  19. ^ Гронхольм M, Sainio M, Чжао F, Heiska L, Vaheri A, CARPEN O (март 1999). «Гомотипическое и гетеротипическое взаимодействие белка супрессора опухоли нейрофиброматоза 2 мерлина и белка ERM эзрина». J. Cell Sci . 112 (6): 895–904. PMID 10036239 . 
  20. ^ Гутман DH, Haipek CA, Берк SP, ВС CX, Scoles DR, Pulst SM (апрель 2001). «Интератор NF2, субстрат тирозинкиназы (HRS), регулируемый фактором роста гепатоцитов, связывается с мерлином в« открытой »конформации и подавляет рост и подвижность клеток» . Гм. Мол. Genet . 10 (8): 825–34. DOI : 10.1093 / HMG / 10.8.825 . PMID 11285248 . 
  21. ^ Scoles DR, DP Хюинь, Chen MS, Берк SP, Гутман DH, Pulst SM (июль 2000). «Белок-супрессор опухоли нейрофиброматоза 2 взаимодействует с субстратом тирозинкиназы, регулируемым фактором роста гепатоцитов» . Гм. Мол. Genet . 9 (11): 1567–74. DOI : 10.1093 / HMG / 9.11.1567 . PMID 10861283 . 
  22. ^ Wiederhold Т, Ли М.Ф., Джеймс М, Neujahr Р, Смит Н, Муртхи А, Хартвиг Дж, Gusella ДФ, Рамеш В (ноябрь 2004 г.). «Магицин, новый цитоскелетный белок, связывающийся с супрессором опухолей NF2 мерлином и Grb2» . Онкоген . 23 (54): 8815–25. DOI : 10.1038 / sj.onc.1208110 . PMID 15467741 . 
  23. ^ Jannatipour М, Дион Р, S Хан, Джиндал Н, Вентилятор Х, Laganière Дж, Чишти АГ, Rouleau Г.А. (август 2001 г.). «Изоформа-1 шванномина взаимодействует с синтенином через домены PDZ» . J. Biol. Chem . 276 (35): 33093–100. DOI : 10.1074 / jbc.M105792200 . PMID 11432873 . 
  24. ^ Neill GW, Кромптон MR (сентябрь 2001). «Связывание продукта мерлина-I гена-супрессора опухоли нейрофиброматоза 2-го типа с новым сайтом в бета-фодрине регулируется ассоциацией между доменами мерлина» . Биохим. Дж . 358 (Pt 3): 727–35. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3580727 . PMC 1222106 . PMID 11535133 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о нейрофиброматозе 2
  • Синопсис гена Mer с FlyBase