Металлосфера хаконенсис
Metallosphaera hakonensis — грамотрицательная термоацидофильная архея , обнаруженная в горячих источниках национального парка Хаконэ , Канагава, Япония . [1]
Metallosphaera hakonensis была выделена в 1996 году Takayanagi et al. из горячего источника в национальном парке Хаконэ в Канагаве, Япония. [1] Первоначально отнесенный к роду Sulfolobus , [1] Kurosawa et al. определили с помощью генетического тестирования, что организм принадлежит к роду Metallosphaera в 2003 г. [2] Takayanagi et al. определили 92% сходство с видами Sulfolobus ; однако Куросава и соавт. определили 98% сходство с видами Metallosphaera . [1] [2]Используя более точный метод высокоэффективной жидкостной хроматографии , Kurosawa et al. также определили новое содержание G+C (43,29%), характерное для видов Metallosphaera . [2]
Такаянаги и др . взяли пробу воды из горячего источника в национальном парке Хаконэ в Канагаве, Япония, с pH 1,5 и температурой 91,5 °C. [1] Разведение 1:10 мл образца и модифицированной среды Аллена, среды, которая, как известно, поддерживает виды Sulfolobus , было приготовлено и инкубировано при 70 °C в течение примерно одной недели. [1] Этот образец затем использовали для получения разбавления 1:9 мл со средой Аллена, а часть наносили штрихами на чашки с 1,0% гельтритом, содержащие среду Аллена, во время экспоненциального роста. [1] После инкубации при 70 °C изолированную колонию M. hakonensis использовали для инокуляции свежего бульона, инкубировали и высевали. [1]Эту процедуру проводили еще раз для выделения архей. [1]
M. hakonensis может расти при температуре от 50 ° C до 80 ° C и значениях pH от 1,0 до 4,0. [1] Оптимальные условия роста M. hakonensis : 70 °C и pH 3,0. [1] Некоторые виды Metallosphaera , такие как M. prunae , подвижны с помощью жгутика ; однако у M. hakonensis нет жгутика. [2] M. hakonensis является грамотрицательным и имеет сферические или неправильные многогранные клетки (лопастные клетки) диаметром от 0,9 до 1,1 мкм. [1]
Геном M. hakonensis имеет длину около 2,3 Мбит/с и содержание G+C 43,29%, определенное с помощью секвенирования Ion Torrent и собранное с использованием программного обеспечения Newbler v. 2.8 . [3] [4] Геном M. hakonensis содержит 3357 генов, кодирующих белки, и 57 генов РНК, определенных с использованием методов определения генов Объединенного института генома и конвейера аннотаций IMG [ 3] Ближайшие соседи включают Metallosphaera prunae, M. sedula и М. yellowstonensis. [2] M. hakonensis имеет 98% сходство в последовательности 16S рРНК с другими представителями рода. Металлосфера» . [2]
Секвенирование генома M. hakonensis выявило наличие генов, кодирующих фермент уреазу , с генами, присутствующими для субъединиц А и В. [3] Уреаза катализирует расщепление мочевины до аммиака и бикарбоната . [5] Последовательности также выявили наличие генов галоацетатдегалогеназы . [3] Галоацетатдегалогеназа катализирует превращение галоацетата в гликолят и галогенид -ион (например, фторид ). [3] M. hakonensis также содержит ген малеилацетатредуктазы., ключевой компонент в биологической деградации галогенированных ароматических органических соединений. [6] [3]