Археи


Археи ( / ɑːr ˈ k ə / ( слушать ) ar - KEE ; единичные археи / ɑːr ˈ k ə n / ) составляют область одноклеточных организмов . Эти микроорганизмы лишены клеточных ядер и поэтому являются прокариотами . Первоначально археи были отнесены к бактериям , получив название архебактериицарстве архебактерий).), но этот термин вышел из употребления. [4]

Клетки архей обладают уникальными свойствами, отличающими их от двух других доменов , бактерий и эукариот . Археи далее делятся на несколько признанных типов . Классификация затруднена, потому что большинство из них не были выделены в лаборатории и были обнаружены только по их генным последовательностям в образцах окружающей среды.

Археи и бактерии, как правило, похожи по размеру и форме, хотя некоторые археи имеют очень разные формы, например, плоские квадратные клетки Haloquadratum walsbyi . [5] Несмотря на это морфологическое сходство с бактериями, археи обладают генами и несколькими метаболическими путями , которые более тесно связаны с путями эукариот, особенно для ферментов, участвующих в транскрипции и трансляции . Другие аспекты биохимии архей уникальны, например, их зависимость от эфирных липидов в их клеточных мембранах [6] , включая археолы .. Археи используют более разнообразные источники энергии, чем эукариоты, от органических соединений , таких как сахара, до аммиака , ионов металлов и даже газообразного водорода . Солеустойчивые галоархеи используют солнечный свет в качестве источника энергии, а другие виды архей фиксируют углерод , но, в отличие от растений и цианобактерий , ни один из известных видов архей не делает и того, и другого. Археи размножаются бесполым путем бинарным делением , фрагментацией или почкованием ; в отличие от бактерий, ни один из известных видов архей не образует эндоспоры . Первыми обнаруженными археями былиэкстремофилы , живущие в экстремальных условиях, таких как горячие источники и соленые озера , где нет других организмов. Усовершенствованные инструменты молекулярного обнаружения привели к открытию архей почти во всех средах обитания , включая почву, океаны и болота . Археи особенно многочисленны в океанах, и археи в планктоне могут быть одной из самых многочисленных групп организмов на планете.

Археи составляют основную часть жизни Земли . Они входят в состав микробиоты всех организмов. В микробиоме человека они важны для кишечника , рта и кожи. [7] Их морфологическое, метаболическое и географическое разнообразие позволяет им играть несколько экологических ролей: фиксация углерода; цикл азота ; оборот органических соединений; например, поддержание микробных симбиотических и синтрофных сообществ. [8]

Четкие примеры архейных патогенов или паразитов неизвестны. Вместо этого они часто являются мутуалистами или комменсалами , такими как метаногены (вырабатывающие метан штаммы), населяющие желудочно- кишечный тракт человека и жвачных животных , где их огромное количество облегчает пищеварение . Метаногены также используются в производстве биогаза и очистке сточных вод , а в биотехнологии используются ферменты экстремофильных архей, которые могут выдерживать высокие температуры и органические растворители .

На протяжении большей части 20-го века прокариоты рассматривались как единая группа организмов и классифицировались на основе их биохимии , морфологии и метаболизма . Микробиологи пытались классифицировать микроорганизмы на основе структуры их клеточных стенок , их формы и веществ, которые они потребляют. [9] В 1965 году Эмиль Цукеркандль и Линус Полинг [10] вместо этого предложили использовать последовательности генов разных прокариот, чтобы выяснить, как они связаны друг с другом. Этот филогенетический подход является основным методом, используемым сегодня. [11]


Археи были обнаружены в вулканических горячих источниках . На фото: Большой призматический источник Йеллоустонского национального парка .
ARMAN -- это группа архей , недавно обнаруженных в кислых дренажных шахтах .
EuryarchaeotaNanoarchaeotaThermoproteotaProtozoaAlgaePlantSlime moldsAnimalFungusGram-positive bacteriaChlamydiotaChloroflexotaActinomycetotaPlanctomycetotaSpirochaetotaFusobacteriotaCyanobacteriaThermophilesAcidobacteriotaPseudomonadota
Филогенетическое древо , показывающее связь между археями и другими областями жизни. Эукариоты окрашены в красный цвет, археи — в зеленый, а бактерии — в синий. Адаптировано из Ciccarelli et al. (2006) [73]
Мембранные конструкции. Вверху — фосфолипид архей: 1 — изопреновые цепи; 2 — эфирные связи; 3 ,  фрагмент L-глицерина ; 4 , фосфатная группа. Средний , бактериальный или эукариотический фосфолипид: 5 , цепи жирных кислот; 6 , сложноэфирные связи; 7 ,  фрагмент D-глицерина ; 8 , фосфатная группа. Внизу : 9 — липидный бислой бактерий и эукариот; 10 , липидный монослой некоторых архей.
Бактериородопсин из Halobacterium salinarum . Кофактор ретинола и остатки, участвующие в переносе протона, показаны в виде шарико-палочных моделей . [135]
Сульфолобус инфицирован ДНК-вирусом STSV1 . [148] Бар равен 1  микрометру .
Археи, которые растут в горячей воде горячего источника Morning Glory в Йеллоустонском национальном парке , производят яркий цвет.
Метаногенные археи образуют симбиоз с термитами .