• Регулятор транскрипционный комплекс • белок-ДНК комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма
Биологический процесс
• клеточный ответ на ретиноевой кислоты • положительное регулирование myotube дифференциации • клеточной дифференцировки • myotube дифференциации • отрицательное регулирование гликолитического процесса • регуляции транскрипции ДНК-шаблонных • клеточный ответ на литий - ионный • оссификации • положительное регуляция дифференцировки мышечных клеток • ответа на мышечная активность, участвующая в регуляции мышечной адаптации • обязательство судьбы мышечных клеток • клеточный ответ на стимул фактора роста • клеточный ответ на стимул эстрадиола • положительная регуляция окислительного фосфорилирования • развитие мышечных органов • поперечно-полосатая мышечная атрофия • транскрипция мРНК с промотора РНК-полимеразы II • клеточный ответ на магнетизм • позитивная регуляция развития волокон скелетных мышц • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблонный • ответ на тяжесть • положительное регулирование миобластов синтеза • положительное регулирование мышечной атрофии • скелетной регенерации мышечной ткани • положительное регулирование миобластов дифференциации • Развитие скелетных мышечных волокон • реакция на электрических стимулов , участвующих в регуляции адаптации мышц • атрофии скелетных мышц • скелетной дифференцировки мышечных клеток • реакция на денервации , участвующих в регуляции адаптации мышц • клеточного цикла • регулирование миобластов слияния • миобластов дифференциация • регулирование пролиферации сателлитных клеток скелетных мышц • развитие скелета мышечной ткани • реакция на мышечную активность • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • негативная регуляция пролиферации клеток • позитивная регуляция остановки клеточного цикла • клеточный ответ на фактор некроза опухоли
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
4656
17928
Ансамбль
ENSG00000122180
ENSMUSG00000026459
UniProt
P15173
P12979
RefSeq (мРНК)
NM_002479
NM_031189
RefSeq (белок)
NP_002470
NP_112466
Расположение (UCSC)
Chr 1: 203.08 - 203.09 Мб
Chr 1: 134.29 - 134.29 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Миогенин ( миогенный фактор 4 ), также известный как MYOG , является геном . [5]
Миогенин - это специфический для мышц фактор транскрипции основной спирали, петли и спирали ( bHLH ), участвующий в координации развития скелетных мышц или миогенеза и восстановления. Myogenin является членом MyoD семейства факторов транскрипции , который также включает в себя MyoD , Myf5 и Mrf4 .
У мышей миогенин необходим для развития функциональных скелетных мышц. Миогенин необходим для правильной дифференциации большинства миогенных клеток-предшественников в процессе миогенеза . Когда ДНК, кодирующая миогенин, была выбита из генома мыши , наблюдались серьезные дефекты скелетных мышц. Мыши, лишенные обеих копий миогенина ( гомозиготный -null), страдают перинатальной летальностью из-за отсутствия зрелых вторичных волокон скелетных мышц по всему телу. [6] [7]
В культуре клеток миогенин может индуцировать миогенез в различных типах немышечных клеток.
СОДЕРЖАНИЕ
1 Взаимодействие
2 ссылки
3 Дальнейшее чтение
4 Внешние ссылки
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что миогенин взаимодействует с:
МДФИ , [8]
POLR2C , [9]
Фактор сывороточного ответа [10] [11]
Фактор транскрипции Sp1 , [10] и
TCF3 . [12] [13]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000122180 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026459 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
Перейти ↑ Hasty P, Bradley A, Morris JH, Edmondson DG, Venuti JM, Olson EN, Klein WH (август 1993). «Мышечная недостаточность и неонатальная смерть у мышей с целевой мутацией в гене миогенина». Природа . 364 (6437): 501–6. Bibcode : 1993Natur.364..501H . DOI : 10.1038 / 364501a0 . PMID 8393145 . S2CID 4372223 .
^ Набэсима Y, Ханаока K, M Hayasaka, Esumi E, Ли S, Nonaka I, Набэсима Y (август 1993). «Нарушение гена миогенина приводит к перинатальной летальности из-за тяжелого мышечного дефекта». Природа . 364 (6437): 532–5. Bibcode : 1993Natur.364..532N . DOI : 10.1038 / 364532a0 . PMID 8393146 . S2CID 4055548 .
^ Chen CM, Kraut N, M Groudine, Веинтроб H (сентябрь 1996). «I-mf, новый миогенный репрессор, взаимодействует с членами семьи MyoD». Cell . 86 (5): 731–41. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (00) 80148-8 . PMID 8797820 . S2CID 16252710 .
^ Корби Н, Ди Падуя М, Де Анджелис Р, Т Бруно, Либри В, Iezzi S, Флориди А, Fanciulli М, Passananti С (октябрь 2002 г.). «Коровая субъединица 3 альфа-подобной РНК-полимеразы II (RPB3) участвует в тканеспецифической транскрипции и дифференцировке мышц через взаимодействие с миогенным фактором миогенином». Журнал FASEB . 16 (12): 1639–41. DOI : 10,1096 / fj.02-0123fje . PMID 12207009 . S2CID 30243193 .
^ a b Biesiada E, Hamamori Y, Kedes L, Sartorelli V (апрель 1999 г.). «Миогенные основные белки спираль-петля-спираль и Sp1 взаимодействуют как компоненты мультипротеинового транскрипционного комплекса, необходимого для активности промотора сердечного альфа-актина человека» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (4): 2577–84. DOI : 10,1128 / MCB.19.4.2577 . PMC 84050 . PMID 10082523 .
^ Гройсман R, Masutani Н, Лейбович МП, Робин Р, Soudant я, Trouche D, Харель-Беллан А (март 1996 года). «Физическое взаимодействие между митоген-чувствительным сывороточным фактором ответа и миогенными белками основной спирали, петли, спирали» . Журнал биологической химии . 271 (9): 5258–64. DOI : 10.1074 / jbc.271.9.5258 . PMID 8617811 .
^ Langlands K, Инь X, Ананд G, Prochownik EV (август 1997). «Дифференциальные взаимодействия белков Id с факторами транскрипции основной спирали, петли, спирали» . Журнал биологической химии . 272 (32): 19785–93. DOI : 10.1074 / jbc.272.32.19785 . PMID 9242638 .
Перейти ↑ Chakraborty T, Martin JF, Olson EN (сентябрь 1992 г.). «Анализ олигомеризации миогенина и продуктов E2A in vivo с использованием двухгибридной системы анализа» . Журнал биологической химии . 267 (25): 17498–501. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (19) 37069-3 . PMID 1325437 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Вайнтрауб Х, Дэвис Р., Тапскотт С., Тайер М., Краузе М., Бенезра Р., Блэквелл Т.К., Тернер Д., Рупп Р., Холленберг С. (февраль 1991 г.). «Семейство генов myoD: узловая точка во время спецификации клона мышечных клеток». Наука . 251 (4995): 761–6. Bibcode : 1991Sci ... 251..761W . DOI : 10.1126 / science.1846704 . PMID 1846704 .
Чакраборти Т., Мартин Дж. Ф., Олсон Э. Н. (сентябрь 1992 г.). «Анализ олигомеризации миогенина и продуктов E2A in vivo с использованием двухгибридной системы анализа» . Журнал биологической химии . 267 (25): 17498–501. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (19) 37069-3 . PMID 1325437 .
Funk WD, Wright WE (октябрь 1992 г.). «Циклическая амплификация и выбор мишеней для многокомпонентных комплексов: миогенин взаимодействует с факторами, распознающими сайты связывания для основной спирали-петли-спирали, ядерного фактора 1, специфичного для миоцитов фактора связывания энхансера 2 и фактора COMP1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (20): 9484–8. Bibcode : 1992PNAS ... 89.9484F . DOI : 10.1073 / pnas.89.20.9484 . PMC 50156 . PMID 1329097 .
Лассар А.Б., Дэвис Р.Л., Райт В.Е., Кадеш Т., Мюрр С., Воронова А., Балтимор Д., Вайнтрауб Г. (июль 1991 г.). «Функциональная активность миогенных белков HLH требует гетероолигомеризации с E12 / E47-подобными белками in vivo». Cell . 66 (2): 305–15. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (91) 90620-E . PMID 1649701 . S2CID 25957022 .
Салминен А., Браун Т., Бухбергер А., Юрс С., Винтер Б., Арнольд Х. Х. (ноябрь 1991 г.). «Транскрипция мышечного регуляторного гена Myf4 регулируется компонентами сыворотки, факторами роста пептидов и сигнальными путями с участием G-белков» . Журнал клеточной биологии . 115 (4): 905–17. DOI : 10,1083 / jcb.115.4.905 . PMC 2289955 . PMID 1659574 .
Пирсон-Уайт SH (март 1991 г.). «MyoD человека: кДНК и выведенная аминокислотная последовательность» . Исследования нуклеиновых кислот . 19 (5): 1148. DOI : 10,1093 / NAR / 19.5.1148 . PMC 333794 . PMID 1850513 .
Олсон Э., Эдмондсон Д., Райт В.Е., Лин В.К., Гуэнет Д.Л., Саймон-Шазотт Д., Томпсон Л.Х., Столлингс Р.Л., Шредер В.Т., Дувик М. (ноябрь 1990 г.). «Миогенин находится в эволюционно законсервированной группе сцепления на хромосоме 1q31-q41 человека и не связан с другими картированными генами факторов регуляции мышц». Геномика . 8 (3): 427–34. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (90) 90028-S . PMID 1962752 .
Бреннан Т.Дж., Олсон Э.Н. (апрель 1990 г.). «Миогенин находится в ядре и приобретает высокое сродство к консервативному энхансерному элементу при гетеродимеризации» . Гены и развитие . 4 (4): 582–95. DOI : 10,1101 / gad.4.4.582 . PMID 2163343 .
Браун Т., Бобер Е., Бушхаузен-Денкер Г., Кохц С., Гжещик К. Х., Арнольд Х. Х., Коц С. (декабрь 1989 г.). «Дифференциальная экспрессия генов миогенной детерминации в мышечных клетках: возможная аутоактивация продуктами гена Myf» . Журнал EMBO . 8 (12): 3617–25. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1989.tb08535.x . PMC 402043 . PMID 2583111 .
Гройсман Р., Масутани Х., Лейбович М.П., Робин П., Судан И., Труш Д., Харель-Беллан А. (март 1996 г.). «Физическое взаимодействие между митоген-чувствительным сывороточным фактором ответа и миогенными белками основной спирали, петли, спирали» . Журнал биологической химии . 271 (9): 5258–64. DOI : 10.1074 / jbc.271.9.5258 . PMID 8617811 .
Чен С.М., Краут Н., Гроудин М., Вайнтрауб Х. (сентябрь 1996 г.). «I-mf, новый миогенный репрессор, взаимодействует с членами семьи MyoD». Cell . 86 (5): 731–41. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80148-8 . PMID 8797820 . S2CID 16252710 .
Kong Y, Flick MJ, Kudla AJ, Konieczny SF (август 1997 г.). «Мышечный белок LIM способствует миогенезу за счет усиления активности MyoD» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (8): 4750–60. DOI : 10.1128 / mcb.17.8.4750 . PMC 232327 . PMID 9234731 .
Langlands K, Yin X, Anand G, Prochownik EV (август 1997 г.). «Дифференциальные взаимодействия белков Id с факторами транскрипции основной спирали, петли, спирали» . Журнал биологической химии . 272 (32): 19785–93. DOI : 10.1074 / jbc.272.32.19785 . PMID 9242638 .
Биесиада Э., Хамамори Ю., Кедес Л., Сарторелли В. (апрель 1999 г.). «Миогенные основные белки спираль-петля-спираль и Sp1 взаимодействуют как компоненты мультипротеинового транскрипционного комплекса, необходимого для активности промотора сердечного альфа-актина человека» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (4): 2577–84. DOI : 10,1128 / MCB.19.4.2577 . PMC 84050 . PMID 10082523 .
Tseng BS, Cavin ST, Hoffman EP, Iannaccone ST, Mancias P, Booth FW, Butler IJ (май 1999 г.). «Ген фактора транскрипции bHLH человека миогенин (MYOG): анализ геномной последовательности и отрицательных мутаций у пациентов с тяжелыми врожденными миопатиями». Геномика . 57 (3): 419–23. DOI : 10.1006 / geno.1998.5719 . PMID 10329008 .
Ноепфлер П.С., Бергстром Д.А., Уэцуки Т., Дак-Корытко И., Сан Ю.Х., Райт В.Е., Тапскотт С.Дж., Кампс М.П. «Консервативный мотив на N-конце ДНК-связывающих доменов миогенных факторов транскрипции bHLH опосредует кооперативное связывание ДНК с pbx-Meis1 / Prep1» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (18): 3752–61. DOI : 10.1093 / NAR / 27.18.3752 . PMC 148632 . PMID 10471746 .
Лук Дж., Германн С., Грундстрём Т. (апрель 2000 г.). «Новый тип взаимодействия кальмодулина в ингибировании основных факторов транскрипции спираль-петля-спираль». Биохимия . 39 (15): 4366–74. DOI : 10.1021 / bi992533u . PMID 10757985 .
Корби Н., Ди Падова М., Де Ангелис Р., Бруно Т., Либри В., Иеззи С., Флориди А., Фанчулли М., Пассанти С. (октябрь 2002 г.). «Коровая субъединица 3 альфа-подобной РНК-полимеразы II (RPB3) участвует в тканеспецифической транскрипции и дифференцировке мышц через взаимодействие с миогенным фактором миогенином». Журнал FASEB . 16 (12): 1639–41. DOI : 10,1096 / fj.02-0123fje . PMID 12207009 . S2CID 30243193 .
Внешние ссылки [ править ]
Миогенин в Национальной медицинской библиотеке США по предметным рубрикам по медицине (MeSH)
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
АВТОМОБИЛЬ
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другие
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
Т1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также дефицит фактора транскрипции / корегулятора