NLGN1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
3B3Q

Идентификаторы

Псевдонимы

NLGN1 , NL1, нейролигин 1

Внешние идентификаторы

OMIM : 600568 MGI : 2179435 HomoloGene : 56690 GeneCards : NLGN1

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 3 (человек) ^[1]

Группа	3q26.31	Начинать	173 396 284 п.н. ^[1]
Группа	3q26.31	Конец	174 286 644 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 3 (мышь) ^[2]

Группа	3 \| 3 A3	Начинать	25 426 215 п.н. ^[2]
Группа	3 \| 3 A3	Конец	26 332 460 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание с доменом PDZ • Активность димеризации белков • Связывание молекул клеточной адгезии • Связывание с белками каркаса • Активность гидролазы сложного эфира карбоновой кислоты GO: 0004091 • Связывание с белками семейства нейрексинов • Связывание с бета-амилоидом • Активность сигнального рецептора
Сотовый компонент	• синапс • неотъемлемый компонент мембраны • селективный NMDA рецепторный комплекс глутамата • аппарат Гольджи • соединение клеток • дендритный стержень • кончик филоподия • дендритный шип • постсинаптическая мембрана • мембрана • дендрит • возбуждающий синапс • внешняя сторона плазматической мембраны • поверхность клетки • пресинапс • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент постсинаптической мембраны • интегральный компонент плазматической мембраны • охватывающий компонент мембраны • постсинапс • глутаматергический синапс • асимметричный, глутаматергический, возбуждающий синапс • неотъемлемый компонент мембраны постсинаптической специализации
Биологический процесс	• Кластеризация рецепторов глутамата NMDA • позитивная регуляция сборки складок • позитивная регуляция экзоцитоза синаптических везикул • регуляция активности рецептора AMPA • ритмический процесс • позитивная регуляция синаптической передачи, глутаматергия • гетерофильная межклеточная адгезия через молекулы адгезии клеток плазматической мембраны • позитивная регуляция циркадного цикла сна / бодрствования, бодрствования • регуляция дыхательного газообмена процессами неврологической системы • кальций-зависимая межклеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны • гетеротетрамеризация белков • транспорт синаптических везикул • организация терминальной кнопки • организация синапсов • положительная регуляция синаптической передачи, ГАМКергическая • кластеризация белков постсинаптической плотности • локализация рецептора в синапсе • локализация белка в синапсе • кластеризация нейрексинов, участвующих в сборке пресинаптической мембраны • положительная регуляция эндоцитоза синаптических везикул • нацеливание на синаптические везикулы • гомоолигомеризация белков • позитивная регуляция локализации белка в синапсе • развитие проекции нейронов • Белок ориентации • GO: 0010740 положительного регулирования внутриклеточной трансдукции сигнала • долгосрочная синаптическая потенциация • развитие нервной системы • АМРА глутаматных рецепторы кластеризация • нейронная сигнальная трансдукция • синаптические везикулы кластеризация • положительного регулирование синаптических везикул кластеризация • цитоскелет матричной организации в активной зоне • сборка синапсов • установление локализации белка • модуляция химической синаптической передачи • положительная регуляция сборки филоподий • клеточная адгезия • регуляция дифференцировки нейронов • адгезия нейронных клеток к клеткам • позитивная регуляция развития дендритных шипов • регуляция активности рецепторов NMDA • позитивная регуляция возбуждающего постсинаптического потенциала • негативная регуляция морфогенеза дендритных шипов • позитивная регуляция сборки синапсов • сборка возбуждающих синапсов • позитивная регуляция сборки пресинаптической активной зоны • ретроградная транс-синаптическая передача сигналов посредством транс-синаптического белкового комплекса • эндоцитоз синаптических везикул • сборка постсинаптической мембраны • сборка пресинаптической мембраны • клеточный ответ на ион кальция • сборка постсинаптической специализации • сборка пресинапса • регуляция организации пресинапса • адгезия синаптической мембраны • ветвление проекции нейронов
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


22871


192167

Ансамбль


ENSG00000169760


ENSMUSG00000063887

UniProt


Q8N2Q7


Q99K10

RefSeq (мРНК)

NM_014932 NM_001365923 NM_001365924 NM_001365925 NM_001365926
NM_001365927 NM_001365928 NM_001365929 NM_001365930 NM_001365931 NM_001365932 NM_001365933 NM_001365934 NM_001365935 NM_001365936


NM_001163387 NM_138666 NM_001357095 NM_001357096 NM_001357097

RefSeq (белок)

NP_055747 NP_001352852 NP_001352853 NP_001352854 NP_001352855
NP_001352856 NP_001352857 NP_001352858 NP_001352859 NP_001352860 NP_001352861 NP_001352862 NP_001352863 NP_001352864 NP_001352865


NP_001156859 NP_619607 NP_001344024 NP_001344025 NP_001344026

Расположение (UCSC)

Chr 3: 173,4 - 174,29 Мб

Chr 3: 25,43 - 26,33 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Нейролигины-1 представляет собой белок , который у человека кодируется NLGN1 гена . ^[5]^[6]^[7]

Этот ген кодирует член семейства нейролигинов поверхностных белков нейрональных клеток. Нейролигин-1 действует как лиганд, специфичный для сайта сплайсинга, для β-нейрексинов и, как было показано, локализуется в постсинаптическом компартменте возбуждающих синапсов и участвует в формировании и ремоделировании синапсов центральной нервной системы. ^[7]^[8]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что NLGN1 взаимодействует с NRXN1 ^[9]^[10] и DLG4 . ^[11]

См. Также [ править ]

Нейрексины : NRXN1 , NRXN2 , NRXN3

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000169760 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063887 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
Перейти ↑ Philibert RA, Winfield SL, Sandhu HK, Martin BM, Ginns EI (апрель 2000 г.). «Структура и экспрессия гена нейролигина-3 человека». Джин . 246 (1-2): 303-10. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (00) 00049-4 . PMID 10767552 .
^ Нагасе Т, Кику Р, Ишикав К, Hirosawa М, Охара О (апрель 2000 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследования ДНК . 7 (2): 143–50. DOI : 10.1093 / dnares / 7.2.143 . PMID 10819331 .
^ a b «Ген Энтреза: нейролигин 1 NLGN1» .
^ Scheiffele Р, Вентилятор J, J Choih, Цепка Р, Т Серафини (июнь 2000 г.). «Нейролигин, экспрессируемый в ненейрональных клетках, запускает пресинаптическое развитие в контактирующих аксонах». Cell . 101 (6): 657–69. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80877-6 . PMID 10892652 . S2CID 16095623 .
^ Комолетти Д., Флинн Р., Дженнингс Л.Л. и др. (Декабрь 2003 г.). «Характеристика взаимодействия рекомбинантного растворимого нейролигина-1 с нейрексином-1бета» . Журнал биологической химии . 278 (50): 50497–505. DOI : 10.1074 / jbc.M306803200 . PMID 14522992 .
^ Ichtchenko К, Т Нгуен, Südhof ТК (февраль 1996 г.). «Структуры, альтернативный сплайсинг и связывание нейрексинов нескольких нейролигинов» . Журнал биологической химии . 271 (5): 2676–82. DOI : 10.1074 / jbc.271.5.2676 . PMID 8576240 .
^ Irie M, Hata Y, Takeuchi M и др. (Сентябрь 1997 г.). «Связывание нейролигинов с PSD-95». Наука . 277 (5331): 1511–5. DOI : 10.1126 / science.277.5331.1511 . PMID 9278515 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Cantallops I, Cline HT (сентябрь 2000 г.). «Формирование синапсов: если он похож на утку и крякает, как утка». Текущая биология . 10 (17): R620–3. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 00663-1 . PMID 10996085 . S2CID 15851386 .
Ичченко К., Хата Ю., Нгуен Т. и др. (Май 1995 г.). «Нейролигин 1: сайт-специфичный лиганд сплайсинга для бета-нейрексинов». Cell . 81 (3): 435–43. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90396-8 . PMID 7736595 . S2CID 15638953 .
Ихченко К., Нгуен Т., Зюдхоф ТЦ (февраль 1996 г.). «Структуры, альтернативный сплайсинг и связывание нейрексинов нескольких нейролигинов» . Журнал биологической химии . 271 (5): 2676–82. DOI : 10.1074 / jbc.271.5.2676 . PMID 8576240 .
Ирие М., Хата Ю., Такеучи М. и др. (Сентябрь 1997 г.). «Связывание нейролигинов с PSD-95». Наука . 277 (5331): 1511–5. DOI : 10.1126 / science.277.5331.1511 . PMID 9278515 .
Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К. и др. (Июнь 1999 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследования ДНК . 6 (3): 197–205. DOI : 10.1093 / dnares / 6.3.197 . PMID 10470851 .
Шайффеле П., Фан Дж., Чой Дж., Феттер Р., Серафини Т. (июнь 2000 г.). «Нейролигин, экспрессируемый в ненейрональных клетках, запускает пресинаптическое развитие в контактирующих аксонах». Cell . 101 (6): 657–69. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80877-6 . PMID 10892652 . S2CID 16095623 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (Декабрь 2002 г.). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Комолетти Д., Флинн Р., Дженнингс Л.Л. и др. (Декабрь 2003 г.). «Характеристика взаимодействия рекомбинантного растворимого нейролигина-1 с нейрексином-1бета» . Журнал биологической химии . 278 (50): 50497–505. DOI : 10.1074 / jbc.M306803200 . PMID 14522992 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (Январь 2004 г.). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Генетика природы . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (Октябрь 2004 г.). «Статус, качество и расширение проекта кДНК полной длины NIH: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геномные исследования . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Чубыкин А.А., Лю X, Комолетти Д., Цигельный И., Тейлор П., Südhof TC (июнь 2005 г.). «Рассечение индукции синапсов нейролигинами: эффект мутации нейролигина, связанной с аутизмом» . Журнал биологической химии . 280 (23): 22365–74. DOI : 10.1074 / jbc.M410723200 . PMID 15797875 .
Музный Д.М., Шерер С.Е., Кауль Р. и др. (Апрель 2006 г.). «Последовательность ДНК, аннотация и анализ хромосомы 3 человека» . Природа . 440 (7088): 1194–8. DOI : 10,1038 / природа04728 . PMID 16641997 .
Ли Х, Чжан Дж., Цао З., Ву Дж., Ши И (сентябрь 2006 г.). «Структура раствора домена GOPC PDZ и его взаимодействие с С-концевым мотивом нейролигина» . Белковая наука . 15 (9): 2149–58. DOI : 10.1110 / ps.062087506 . PMC 2242614 . PMID 16882988 .

Эта статья о гене в хромосоме 3 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000169760 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063887 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10767552-5] Перейти ↑ Philibert RA, Winfield SL, Sandhu HK, Martin BM, Ginns EI (апрель 2000 г.). «Структура и экспрессия гена нейролигина-3 человека». Джин . 246 (1-2): 303-10. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (00) 00049-4 . PMID 10767552 .

[pmid10819331-6] Нагасе Т, Кику Р, Ишикав К, Hirosawa М, Охара О (апрель 2000 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследования ДНК . 7 (2): 143–50. DOI : 10.1093 / dnares / 7.2.143 . PMID 10819331 .

[entrez-7] «Ген Энтреза: нейролигин 1 NLGN1» .

[8] Scheiffele Р, Вентилятор J, J Choih, Цепка Р, Т Серафини (июнь 2000 г.). «Нейролигин, экспрессируемый в ненейрональных клетках, запускает пресинаптическое развитие в контактирующих аксонах». Cell . 101 (6): 657–69. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80877-6 . PMID 10892652 . S2CID 16095623 .

[pmid14522992-9] Комолетти Д., Флинн Р., Дженнингс Л.Л. и др. (Декабрь 2003 г.). «Характеристика взаимодействия рекомбинантного растворимого нейролигина-1 с нейрексином-1бета» . Журнал биологической химии . 278 (50): 50497–505. DOI : 10.1074 / jbc.M306803200 . PMID 14522992 .

[pmid8576240-10] Ichtchenko К, Т Нгуен, Südhof ТК (февраль 1996 г.). «Структуры, альтернативный сплайсинг и связывание нейрексинов нескольких нейролигинов» . Журнал биологической химии . 271 (5): 2676–82. DOI : 10.1074 / jbc.271.5.2676 . PMID 8576240 .

[pmid9278515-11] Irie M, Hata Y, Takeuchi M и др. (Сентябрь 1997 г.). «Связывание нейролигинов с PSD-95». Наука . 277 (5331): 1511–5. DOI : 10.1126 / science.277.5331.1511 . PMID 9278515 .

[1]