Нейрогенный локус режекторный гомолог белка 2 также известный как паз 2 представляет собой белок , который у человека кодируется Notch2 гена . [5]
NOTCH2 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | NOTCH2 , AGS2, HJCYS, hN2, Notch-2, notch 2, notch рецептор 2 | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 600275 MGI : 97364 HomoloGene : 7865 GeneCards : Notch2 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 1: 119.91 - 120.1 Мб | Chr 3: 98.01 - 98.15 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
NOTCH2 связан с синдромом Алажиля [6] и синдромом Хайду – Чейни . [7]
Функция
Паз 2 является членом надреза семьи. Члены этого семейства трансмембранных белков типа 1 имеют общие структурные характеристики, включая внеклеточный домен, состоящий из множества повторов, подобных эпидермальному фактору роста ( EGF ), и внутриклеточный домен, состоящий из множества разных типов доменов. Члены семейства Notch играют роль во множестве процессов развития, контролируя решения о судьбе клеток. Сеть передачи сигналов Notch представляет собой эволюционно консервативный межклеточный путь передачи сигналов, который регулирует взаимодействия между физически соседними клетками. При дрозофилии взаимодействие notch с его клеточно-связанными лигандами (дельта, зазубрины) устанавливает межклеточный сигнальный путь, который играет ключевую роль в развитии. Гомологи notch-лигандов также были идентифицированы у человека, но точные взаимодействия между этими лигандами и человеческими гомологами notch еще предстоит определить. Этот белок расщепляется в сети транс-Гольджи и представлен на поверхности клетки в виде гетеродимера. Этот белок функционирует как рецептор для мембраносвязанных лигандов и может играть роль в развитии сосудов, почек и печени. [8]
Было показано, что мутации в последнем кодирующем экзоне Notch2, которые удаляют домен PEST и избегают нонсенс-опосредованного распада мРНК , являются основной причиной синдрома Хайду-Чейни . [9] [10] [11]
Взаимодействия
NOTCH2 взаимодействует с:
- Дельта-подобный 1 [12] [13] [14]
- GSK3B , [15]
- JAG1 , [12] [13] [16] и
- JAG2 . [13]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000134250 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027878 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Ларссон С, Ларделли М, Уайт I, Лендаль У. (май 1995 г.). «Гены NOTCH1, 2 и 3 человека расположены в положениях хромосом 9q34, 1p13-p11 и 19p13.2-p13.1 в областях транслокации, связанной с неоплазией». Геномика . 24 (2): 253–8. DOI : 10.1006 / geno.1994.1613 . PMID 7698746 .
- ^ Самедзима Х, Тории С., Косаки Р., Куросава К., Ёсихаши Х., Муроя К., Окамото Н., Ватанабе И., Кошо Т., Кубота М., Мацуда О, Гото М., Изуми К., Такахаши Т., Косаки К. (2007). «Скрининг мутаций синдрома Алажиля в генах JAG1 и NOTCH2 с использованием денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии». Genet. Тест . 11 (3): 216–27. DOI : 10,1089 / gte.2006.0519 . PMID 17949281 .
- ^ Симпсон М.А., Ирвинг М.Д., Асилмаз Э., Грей М.Дж., Дафу Д., Элмсли Ф.В., Мансур С., Холдер С.Е., Мозг CE, Бертон Б.К., Ким К.Х., Паули Р.М., Афтимос С., Стюарт Х., Ким К.А., Холдер-Эспинасс М., Робертсон SP, Дрейк WM, Trembath RC (2011-03-06). «Мутации в NOTCH2 вызывают синдром Хайду-Чейни, нарушение тяжелой и прогрессирующей потери костной массы». Генетика природы . 43 (4): 303–5. DOI : 10.1038 / ng.779 . PMID 21378985 . S2CID 205357391 .
- ^ «Ген Entrez: NOTCH2, гомолог Notch 2 (Drosophila)» .
- ^ Симпсон М.А., Ирвинг М.Д., Асилмаз Е., Грей М.Дж., Дафу Д., Элмсли Ф.В., Мансур С., Холдер С.Э. и др. (2011). «Мутации в NOTCH2 вызывают синдром Хайду-Чейни, нарушение тяжелой и прогрессирующей потери костной массы». Генетика природы . 43 (4): 303–305. DOI : 10.1038 / ng.779 . PMID 21378985 . S2CID 205357391 .
- ^ Исидор Б., Линденбаум П., Пишон О., Безье С., Дина С., Жакмонт С., Мартин-Куаньяр Д., Товен-Робине С., Ле Меррер М., Мандель Дж. Л., Давид А., Фэвр Л., Кормье-Дэр В., Редон Р., Ле Caignec C (2011). «Усекающие мутации в последнем экзоне NOTCH2 вызывают редкое заболевание скелета с остеопорозом». Генетика природы . 43 (4): 306–8. DOI : 10.1038 / ng.778 . PMID 21378989 . S2CID 205357384 .
- ^ Маевски Дж., Шварцентрубер Дж. А., Какере А., Патри Л., Маркадье Дж., Фринс Дж. П., Бойкот К. М., Сте-Мари Л.Г., Маккирнан Ф. Е., Марик И., Ван Эш Х, Мишо Дж. Л., Сэмюэлс М. Э. (2011). «Мутации в NOTCH2 в семьях с синдромом Хайду-Чейни». Hum Mutat . 32 (10): 1114–7. DOI : 10.1002 / humu.21546 . PMID 21681853 . S2CID 39342783 .
- ^ а б Симидзу К., Чиба С., Сайто Т., Кумано К., Такахаши Т., Хираи Х. (июль 2001 г.). «Маниакальная бахрома и лунатическая бахрома модифицируют разные участки внеклеточной области Notch2, приводя к различной модуляции сигналов» . J. Biol. Chem . 276 (28): 25753–8. DOI : 10.1074 / jbc.M103473200 . PMID 11346656 .
- ^ а б в Симидзу К., Чиба С., Хосоя Н., Кумано К., Сайто Т., Курокава М., Канда Ю., Хамада И., Хираи Х (сентябрь 2000 г.). «Связывание Delta1, Jagged1 и Jagged2 с Notch2 быстро вызывает расщепление, ядерную транслокацию и гиперфосфорилирование Notch2» . Мол. Клетка. Биол . 20 (18): 6913–22. DOI : 10.1128 / mcb.20.18.6913-6922.2000 . PMC 88767 . PMID 10958687 .
- ^ Blaumueller CM, Qi H, Zagouras P, Artavanis-Tsakonas S (июль 1997 г.). «Внутриклеточное расщепление Notch приводит к гетеродимерному рецептору на плазматической мембране». Cell . 90 (2): 281–91. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (00) 80336-0 . PMID 9244302 . S2CID 16544864 .
- ^ Эспиноза Л., Инглес-Эстев Дж., Агилера С., Бигас А. (август 2003 г.). «Фосфорилирование киназой-3 бета гликогенсинтазы подавляет активность Notch, звена для путей Notch и Wnt» . J. Biol. Chem . 278 (34): 32227–35. DOI : 10.1074 / jbc.M304001200 . PMID 12794074 .
- ^ Симидзу К., Чиба С., Кумано К., Хосоя Н., Такахаши Т., Канда Ю., Хамада Ю., Язаки Ю., Хираи Н. (ноябрь 1999 г.). «Мышь jagged1 физически взаимодействует с notch2 и другими рецепторами notch. Оценка с помощью количественных методов» . J. Biol. Chem . 274 (46): 32961–9. DOI : 10.1074 / jbc.274.46.32961 . PMID 10551863 .
дальнейшее чтение
- Artavanis-Tsakonas S, Rand MD, Lake RJ (1999). «Передача сигналов Notch: контроль клеточной судьбы и интеграция сигналов в развитии» . Наука . 284 (5415): 770–6. Bibcode : 1999Sci ... 284..770A . DOI : 10.1126 / science.284.5415.770 . PMID 10221902 . S2CID 16790253 .
- Кодзика С., Гриффин Дж. Д. (2001). «Notch рецепторы и кроветворение». Exp. Гематол . 29 (9): 1041–52. DOI : 10.1016 / S0301-472X (01) 00676-2 . PMID 11532344 .
- Schwarzmeier JD, Hubmann R, Düchler M, Jäger U, Shehata M (2005). «Регулирование экспрессии CD23 с помощью Notch2 при В-клеточной хронической лимфоцитарной лейкемии». Лейк. Лимфома . 46 (2): 157–65. DOI : 10.1080 / 10428190400010742 . PMID 15621797 . S2CID 36863790 .
- Стифани С., Блаумюллер С.М., Рыжий Н.Дж., Хилл Р.Э., Артаванис-Цаконас С. (1993). «Человеческие гомологи Drosophila Enhancer продукта расщепленного гена определяют новое семейство ядерных белков». Nat. Genet . 2 (2): 119–27. DOI : 10.1038 / ng1092-119 . PMID 1303260 . S2CID 32142845 .
- Катсанис Н., Фитцгиббон Дж., Фишер Э.М. (1996). «Паралогическое картирование: идентификация области в человеческом MHC, тройной на хромосомах 1 и 9 человека, позволяет предсказывать и изолировать новые локусы PBX и NOTCH». Геномика . 35 (1): 101–8. DOI : 10.1006 / geno.1996.0328 . PMID 8661110 .
- Шей Дж.Дж., Нофцигер Д.Е., Вайнмастер Г., Хейворд С.Д. (1997). «Иммортализация вируса Эпштейна-Барра: Notch2 взаимодействует с CBF1 и блокирует дифференцировку» . J. Virol . 71 (3): 1938–45. DOI : 10,1128 / JVI.71.3.1938-1945.1997 . PMC 191274 . PMID 9032325 .
- Блаумюллер CM, Qi H, Zagouras P, Artavanis-Tsakonas S (1997). «Внутриклеточное расщепление Notch приводит к гетеродимерному рецептору на плазматической мембране». Cell . 90 (2): 281–91. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80336-0 . PMID 9244302 . S2CID 16544864 .
- Бигас А., Мартин Д.И., Милнер Л.А. (1998). «Notch1 и Notch2 ингибируют миелоидную дифференцировку в ответ на различные цитокины» . Мол. Клетка. Биол . 18 (4): 2324–33. DOI : 10.1128 / mcb.18.4.2324 . PMC 121486 . PMID 9528802 .
- Березовская О., Ся М.К., Хайман Б.Т. (1998). «Notch экспрессируется во взрослом мозге, коэкспрессируется с пресенилином-1 и изменяется при болезни Альцгеймера» . J. Neuropathol. Exp. Neurol . 57 (8): 738–45. DOI : 10.1097 / 00005072-199808000-00003 . PMID 9720489 .
- Грей Г.Е., Манн Р.С., Мициадис Э., Энрике Д., Каркангиу М.Л., Бэнкс А, Лейман Дж., Уорд Д., Иш-Горовиц Д., Артаванис-Цаконас С. (1999). «Человеческие лиганды рецептора Notch» . Являюсь. J. Pathol . 154 (3): 785–94. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 65325-4 . PMC 1866435 . PMID 10079256 .
- Симидзу К., Чиба С., Кумано К., Хосоя Н., Такахаши Т., Канда Ю., Хамада Ю., Язаки Ю., Хираи Н. (2000). «Мышь jagged1 физически взаимодействует с notch2 и другими рецепторами notch. Оценка с помощью количественных методов» . J. Biol. Chem . 274 (46): 32961–9. DOI : 10.1074 / jbc.274.46.32961 . PMID 10551863 .
- Симидзу К., Чиба С., Хосоя Н., Кумано К., Сайто Т., Курокава М., Канда Ю., Хамада И., Хираи Х (2000). «Связывание Delta1, Jagged1 и Jagged2 с Notch2 быстро вызывает расщепление, ядерную транслокацию и гиперфосфорилирование Notch2» . Мол. Клетка. Биол . 20 (18): 6913–22. DOI : 10.1128 / MCB.20.18.6913-6922.2000 . PMC 88767 . PMID 10958687 .
- Wu L, Aster JC, Blacklow SC, Lake R, Artavanis-Tsakonas S, Griffin JD (2001). «MAML1, человеческий гомолог главного разума дрозофилы, является коактиватором транскрипции для рецепторов NOTCH». Nat. Genet . 26 (4): 484–9. DOI : 10.1038 / 82644 . PMID 11101851 . S2CID 23335042 .
- Шриуранпонг В., Борхес М.В., Рави Р.К., Арнольд Д.Р., Нелкин Б.Д., Бейлин С.Б., Болл Д.В. (2001). «Передача сигналов Notch вызывает остановку клеточного цикла в клетках мелкоклеточного рака легких». Cancer Res . 61 (7): 3200–5. PMID 11306509 .
- Симидзу К., Чиба С., Сайто Т., Кумано К., Такахаши Т., Хираи Х (2001). «Маниакальная бахрома и лунатическая бахрома модифицируют разные участки внеклеточной области Notch2, приводя к различной модуляции сигналов» . J. Biol. Chem . 276 (28): 25753–8. DOI : 10.1074 / jbc.M103473200 . PMID 11346656 .
- Saxena MT, Schroeter EH, Mumm JS, Kopan R (2001). «Гомологи мышей notch (N1-4) подвергаются пресенилин-зависимому протеолизу» . J. Biol. Chem . 276 (43): 40268–73. DOI : 10.1074 / jbc.M107234200 . PMID 11518718 .
- Инглес-Эстев Дж., Эспиноза Л., Милнер Л.А., Кэллес С., Бигас А. (2002). «Фосфорилирование Ser2078 модулирует функцию Notch2 в дифференцировке 32D клеток» . J. Biol. Chem . 276 (48): 44873–80. DOI : 10.1074 / jbc.M104703200 . PMID 11577080 .
Внешние ссылки
- GeneReviews / NCBI / UW / NIH запись о синдроме Алажиля
- Записи OMIM о синдроме Алажиля
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q04721 (белок-гомолог 2 нейрогенного локуса) в PDBe-KB .