Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Не путать с ядерным фактором (эритроидный 2) -подобный 1 или NFE2L1 .
NRF1
Идентификаторы
ПсевдонимыNRF1 , ALPHA-PAL, ядерный респираторный фактор 1
Внешние идентификаторыOMIM: 600879 MGI: 1332235 HomoloGene: 3674 Генные карты : NRF1
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек) [1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение NRF1
Геномное расположение NRF1
Группа7q32.2Начинать129 611 720 п.н. [1]
Конец129 757 082 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 6 (мышь)
Chr.Хромосома 6 (мышь) [2]
Хромосома 6 (мышь)
Геномное расположение NRF1
Геномное расположение NRF1
Группа6 A3.3 | 6 12,47 смНачинать30 047 988 п.н. [2]
Конец30 153 458 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE NRF1 204652 s в формате fs.png

PBB GE NRF1 204651 в формате fs.png

PBB GE NRF1 211279 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывания ДНК
• гомодимеризации активность белка
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающий активатор активности транскрипции, РНК - полимеразы II-специфического
• ГО: 0000980 РНК - полимеразы II цис-регуляторную область Связывание ДНК, специфичное для последовательности
• Связывание с белком GO: 0001948
• Связывание ДНК, специфичное для последовательности корового промотора
• Связывание ДНК с последовательностью корового промотора РНК-полимеразы II
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Транскрипция связывания ДНК факторная активность
Сотовый компонент• внеклеточная экзосома
• нуклеоплазма
• цитозоль
• ядро клетки
Биологический процесс• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• митохондриальная организация
• генерация метаболитов и энергии-предшественников
• транскрипция, ДНК-шаблон
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4899

18181

Ансамбль

ENSG00000106459

ENSMUSG00000058440

UniProt

Q16656

Q9WU00

RefSeq (мРНК)

NM_005011
NM_001040110
NM_001293163
NM_001293164

NM_001164226
NM_001164227
NM_001164228
NM_001164229
NM_001164230

NM_010938
NM_001361692
NM_001361693
NM_001361694
NM_001361695

RefSeq (белок)

NP_001035199
NP_001280092
NP_001280093
NP_005002

NP_001157698
NP_001157699
NP_001157700
NP_001157701
NP_001157702

NP_035068
NP_001348621
NP_001348622
NP_001348623
NP_001348624

Расположение (UCSC)Chr 7: 129.61 - 129.76 МбChr 6: 30.05 - 30.15 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ядерный респираторный фактор 1 , также известный как Nrf1 , Nrf-1 , NRF1 и NRF-1 , кодирует белок, который гомодимеризуется и функционирует как фактор транскрипции, который активирует экспрессию некоторых ключевых метаболических генов, регулирующих рост клеток, и ядерных генов, необходимых для дыхания, биосинтез гема , транскрипция и репликация митохондриальной ДНК . Белок также был связан с регуляцией роста нейритов. Альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, которые кодируют один и тот же белок, были охарактеризованы. Были описаны дополнительные варианты, кодирующие различные изоформы белков , но они не были полностью охарактеризованы. В библиографических базах данных возникла путаница из-за общего символа NRF1 для этого гена и для «ядерного фактора (эритроидный 2) -подобный 1», который имеет официальный символ NFE2L1 . [ необходима цитата ]

Функция [ править ]

Nrf1 функционирует как фактор транскрипции, который активирует экспрессию некоторых ключевых метаболических генов, регулирующих рост клеток, и ядерных генов, необходимых для митохондриального дыхания, а также транскрипции и репликации митохондриальной ДНК . Nrf1 вместе с Nrf2 опосредует биогеномную координацию между ядерным и митохондриальным геномами, напрямую регулируя экспрессию нескольких ядерно-кодируемых белков ETC и косвенно регулируя три гена субъединиц ЦОГ, кодируемых митохондриями, путем активации mtTFA , mtTFB1 и mtTFB2 .

Nrf1 связан с регуляцией роста нейритов. [5]

Были охарактеризованы альтернативные варианты сплайсинга транскрипции, которые кодируют один и тот же белок. Были описаны дополнительные варианты, кодирующие различные изоформы белков, но они не были полностью охарактеризованы. [6]

Циклин D1-зависимая киназа посредством фосфорилирования NRF-1 по S47 координирует синтез ядерной ДНК и функцию митохондрий. [7]

Взаимодействия [ править ]

NRF1, как было показано, взаимодействует с DYNLL1 , [8] PPARGC1A , [9] и PPRC1 . [10]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000106459 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058440 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Chang WT, Chen HI, Цю RJ, Chen CY, Huang AM (август 2005). «Новая функция фактора транскрипции альфа-Pal / NRF-1: увеличение роста нейритов». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 334 (1): 199–206. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2005.06.079 . PMID 15992771 . 
  6. ^ «Энтрез Ген: ядерный респираторный фактор 1 NRF1» .
  7. ↑ Ван Ц, Ли З, Лу И, Ду Р, Катияр С., Ян Дж, Фу М., Лидер Дж. Э., Куонг А., Новикофф П. М., Пестелл Р. Г. (2006). «Репрессия циклином D1 ядерного респираторного фактора 1 объединяет синтез ядерной ДНК и функцию митохондрий» . Труды Национальной академии наук . 103 (31): 11567–72. Bibcode : 2006PNAS..10311567W . DOI : 10.1073 / pnas.0603363103 . JSTOR 30051572 . PMC 1518800 . PMID 16864783 .   
  8. ^ Herzig RP, Andersson U, Scarpulla RC (декабрь 2000). «Легкая цепь динеина взаимодействует с NRF-1 и EWG, структурно и функционально родственными факторами транскрипции человека и дрозофилы». J. Cell Sci . 113 (23): 4263–73. PMID 11069771 . 
  9. ^ Wu Z, Puigserver P, Andersson U, Zhang C, Adelmant G, Mootha V, Troy A, Cinti S, Lowell B, Scarpulla RC, Spiegelman BM (июль 1999 г.). «Механизмы управления митохондриальным биогенезом и дыханием через термогенный коактиватор PGC-1». Cell . 98 (1): 115–24. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80611-X . PMID 10412986 . S2CID 16143809 .  
  10. ^ Andersson U, Scarpulla RC (май 2001). «Коактиватор, связанный с PGC-1, новый, индуцируемый сывороткой коактиватор транскрипции, зависимой от ядерного респираторного фактора 1, в клетках млекопитающих» . Мол. Клетка. Биол . 21 (11): 3738–49. DOI : 10.1128 / MCB.21.11.3738-3749.2001 . PMC 87014 . PMID 11340167 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Тиранти В., Росси Е., Рокки М., ДиДонато С., Дзуффарди О., Зевиани М. (1995). «Ген (NFE2L1) человеческого NRF-1, активатор, участвующий в ядерно-митохондриальных взаимодействиях, соответствует 7q32». Геномика . 27 (3): 555–7. DOI : 10.1006 / geno.1995.1094 . PMID  7558044 .
  • Гопалакришнан Л., Скарпулла Р.С. (1995). «Структура, экспрессия и хромосомная принадлежность гена человека, кодирующего ядерный респираторный фактор 1» . J. Biol. Chem . 270 (30): 18019–25. DOI : 10.1074 / jbc.270.30.18019 . PMID  7629110 .
  • Эфиок Б.Дж., Кьорини Д.А., Сэфер Б. (1994). «Ключевой фактор транскрипции для фактора инициации эукариот-2 альфа сильно гомологичен факторам транскрипции развития и может связывать метаболические гены с ростом и развитием клеток». J. Biol. Chem . 269 (29): 18921–30. PMID  8034649 .
  • Вирбазиус СП, Скарпулла Р.С. (1994). «Активация гена фактора транскрипции митохондрий человека А ядерными респираторными факторами: потенциальная регуляторная связь между экспрессией ядерных и митохондриальных генов в биогенезе органелл» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (4): 1309–13. Bibcode : 1994PNAS ... 91.1309V . DOI : 10.1073 / pnas.91.4.1309 . PMC  43147 . PMID  8108407 .
  • Вирбазиус CA, Вирбазиус СП, Скарпулла RC (1994). «NRF-1, активатор, участвующий в ядерно-митохондриальных взаимодействиях, использует новый ДНК-связывающий домен, законсервированный в семействе регуляторов развития» . Genes Dev . 7 (12A): 2431–45. DOI : 10.1101 / gad.7.12a.2431 . PMID  8253388 .
  • Спелбринк Дж., Ван ден Богерт С (1996). «Пре-мРНК ядерного респираторного фактора 1, регулятора митохондриального биогенеза, альтернативно сплайсируется в тканях и клеточных линиях человека». Гм. Мол. Genet . 4 (9): 1591–6. DOI : 10.1093 / HMG / 4.9.1591 . PMID  8541844 .
  • Johnsen O, Skammelsrud N, Luna L, Nishizawa M, Prydz H, Kolstø AB (1996). «Малые белки Maf взаимодействуют с человеческим фактором транскрипции TCF11 / Nrf1 / LCR-F1» . Nucleic Acids Res . 24 (21): 4289–97. DOI : 10.1093 / NAR / 24.21.4289 . PMC  146217 . PMID  8932385 .
  • Венугопал Р., Джайсвал А.К. (1997). «Nrf1 и Nrf2 положительно и c-Fos и Fra1 отрицательно регулируют опосредованную элементом антиоксидантного ответа экспрессию гена NAD (P) H: хиноноксидоредуктазы1 человека» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (25): 14960–5. Bibcode : 1996PNAS ... 9314960V . DOI : 10.1073 / pnas.93.25.14960 . PMC  26245 . PMID  8962164 .
  • Чен С., Надь П.Л., Залкин Х. (1997). «Роль NRF-1 в двунаправленной транскрипции локуса биосинтеза пуринов человека GPAT-AIRC» . Nucleic Acids Res . 25 (9): 1809–16. DOI : 10.1093 / NAR / 25.9.1809 . PMC  146651 . PMID  9108165 .
  • Токи Т., Ито Дж., Китадзава Дж., Араи К., Хатакеяма К., Акасака Дж., Игараси К., Номура Н., Йокояма М., Ямамото М., Ито Э. (1997). «Человеческие малые белки Maf образуют гетеродимеры с факторами транскрипции семейства CNC и распознают мотив NF-E2» . Онкоген . 14 (16): 1901–10. DOI : 10.1038 / sj.onc.1201024 . PMID  9150357 .
  • Марини М.Г., Чан К., Казула Л., Кан Ю.В., Цао А., Мой П. (1997). «hMAF, небольшой фактор транскрипции человека, который специфически гетеродимеризуется с Nrf1 и Nrf2» . J. Biol. Chem . 272 (26): 16490–7. DOI : 10.1074 / jbc.272.26.16490 . PMID  9195958 .
  • Gugneja S, Scarpulla RC (1997). «Фосфорилирование серина в кратком амино-концевом домене в ядерном респираторном факторе 1 усиливает связывание ДНК» . J. Biol. Chem . 272 (30): 18732–9. DOI : 10.1074 / jbc.272.30.18732 . PMID  9228045 .
  • Йонсен О., Мерфи П., Прюдз Х, Колсто А.Б. (1998). «Взаимодействие фактора CNC-bZIP TCF11 / LCR-F1 / Nrf1 с MafG: выбор сайта связывания и регуляция транскрипции» . Nucleic Acids Res . 26 (2): 512–20. DOI : 10.1093 / NAR / 26.2.512 . PMC  147270 . PMID  9421508 .
  • Au HC, Scheffler IE (1998). «Анализ промотора гена железо-протеина сукцинатдегидрогеназы человека - требуются оба ядерных респираторных фактора NRF-1 и NRF-2». Евро. J. Biochem . 251 (1–2): 164–74. DOI : 10.1046 / j.1432-1327.1998.2510164.x . PMID  9492280 .
  • Миранда С., Фонсеа Р., Герреро Дж., Лейтон Ф. (1999). «Окислительный стресс и активация генов митохондриального биогенеза в митохондриальных ДНК-истощенных клетках HeLa». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 258 (1): 44–9. DOI : 10.1006 / bbrc.1999.0580 . PMID  10222232 .
  • Ли Б., Холлоши Ю.О., Семенкович С.Ф. (1999). «Респираторное разобщение индуцирует экспрессию дельта-аминолевулинатсинтазы через ядерный респираторный фактор-1-зависимый механизм в клетках HeLa» . J. Biol. Chem . 274 (25): 17534–40. DOI : 10.1074 / jbc.274.25.17534 . PMID  10364186 .
  • Wu Z, Puigserver P, Andersson U, Zhang C, Adelmant G, Mootha V, Troy A, Cinti S, Lowell B, Scarpulla RC, Spiegelman BM (1999). «Механизмы управления митохондриальным биогенезом и дыханием через термогенный коактиватор PGC-1». Cell . 98 (1): 115–24. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80611-X . PMID  10412986 . S2CID  16143809 .
  • Солецки Д., Бернхардт Г., Липп М., Виммер Э. (2000). «Идентификация сайта связывания ядерного респираторного фактора-1 внутри основного промотора гена рецептора вируса полиомиелита человека / CD155» . J. Biol. Chem . 275 (17): 12453–62. DOI : 10.1074 / jbc.275.17.12453 . PMID  10777530 .
  • Кумари Д., Усдин К. (2001). «Взаимодействие факторов транскрипции USF1, USF2 и альфа -Pal / Nrf-1 с промотором FMR1. Последствия для синдрома умственной отсталости Fragile X» . J. Biol. Chem . 276 (6): 4357–64. DOI : 10.1074 / jbc.M009629200 . PMID  11058604 .

Внешние ссылки [ править ]

  • NRF1 + белок, + человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • FactorBook Nrf1

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .