Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с NUP133 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
NUP133
Протеин NUP133 PDB 1xks.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1XKS , 3CQC , 3CQG , 3I4R , 5A9Q

Идентификаторы
ПсевдонимыNUP133 , гнуклеопорин 133 кДа, нуклеопорин 133, NPHS18, GAMOS8
Внешние идентификаторыOMIM : 607613 MGI : 2442620 HomoloGene : 32402 GeneCards : NUP133
Расположение гена ( человек )
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение NUP133
Геномное расположение NUP133
Группа1q42.13Начинать229 440 259 п.н. [1]
Конец229 508 341 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 8 (мышь)
Chr.Хромосома 8 (мышь) [2]
Хромосома 8 (мышь)
Геномное расположение NUP133
Геномное расположение NUP133
Группа8 | 8 E2Начинать123 897 123 п.н. [2]
Конец123 949 265 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE NUP133 202184 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• GO: 0001948 связывание белка
• GO: 0005487 структурной составляющей ядерной поры
Сотовый компонент• ядро клетки
• ядерная оболочка
• хромосома
• хромосома, центромерная область
• кинетохора
• мембрана
• цитозоль
• внешняя кинетохора конденсированной хромосомы
• не мембрана
• кинетохора конденсированной хромосомы
• ядерная пора
• внешнее кольцо ядерной поры
• клетка-хозяин
Биологический процесс• импорт белка в ядро
• транспорт белка
• вирусный процесс GO: 0022415
• нейрогенез
• развитие нервной трубки
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• вирусная транскрипция
• транспорт мРНК
• регуляция клеточного ответа на тепло
• развитие параксиальной мезодермы
• разборка митотической ядерной оболочки
• организация ядерных пор
• сумоилирование белка
• развитие сомитов
• GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса
• экспорт мРНК из ядра
• организация хроматина
• экспорт тРНК из ядра
• сцепление сестринских хроматид
• транскрипционно-зависимое связывание ДНК гена РНК-полимеразы II на периферии ядра
• регуляция сайленсинга генов с помощью миРНК
• регуляция гликолитического процесса
• транспорт
• развитие нефронов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

55746

234865

Ансамбль

ENSG00000069248

ENSMUSG00000039509

UniProt

Q8WUM0

Q8R0G9

RefSeq (мРНК)

NM_018230

NM_172288

RefSeq (белок)

NP_060700

NP_758492

Расположение (UCSC)Chr 1: 229,44 - 229,51 МбChr 8: 123.9 - 123.95 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 133 ( Nup133 ) представляет собой белок , который у человека кодируется NUP133 гена . [5] [6]

Функция [ править ]

Ядерная оболочка создает отдельные ядерные и цитоплазматические компартменты в эукариотических клетках. Он состоит из двух концентрических мембран, перфорированных ядерными порами, крупных белковых комплексов, которые образуют водные каналы для регулирования потока макромолекул между ядром и цитоплазмой. Эти комплексы состоят по крайней мере из 100 различных полипептидных субъединиц, многие из которых принадлежат к семейству нуклеопоринов. Белок нуклеопорин, кодируемый этим геном, демонстрирует эволюционно консервативные взаимодействия с другими нуклеопоринами. Этот белок, который локализуется с обеих сторон комплекса ядерных пор на интерфазе, остается связанным с комплексом во время митоза и нацелен на ранних стадиях реформирования ядерной оболочки. Этот белок также находится на кинетохорах митотических клеток. [6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что Nup133 взаимодействует с NUP107 . [7] [8]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000069248 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039509 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ВАСУ S, Shah S, Orjalo A, Парк М, Фишер WH, Forbes DJ (октябрь 2001). «Новые нуклеопорины позвоночных Nup133 и Nup160 играют роль в экспорте мРНК» . Журнал клеточной биологии . 155 (3): 339–54. DOI : 10.1083 / jcb.200108007 . PMC 2150853 . PMID 11684705 .  
  6. ^ a b «Ген Энтреза: NUP133 нуклеопорин 133 кДа» .
  7. ^ Loïodice я, Алвес А, Rabut G, Ван Overbeek М, Элленберга Дж, Sibarita JB, Doye В (июль 2004). «Весь комплекс Nup107-160, включая три новых члена, нацелен как единое целое на кинетохоры в митозе» . Молекулярная биология клетки . 15 (7): 3333–44. DOI : 10,1091 / mbc.E03-12-0878 . PMC 452587 . PMID 15146057 .  
  8. ^ Belgareh N, Rabut G, Bai SW, ван Овербек М, Beaudouin Дж, Дайгле Н, Зацепина О. В., Pasteau Р, Лабас В, Фромон-Расин М, Элленберга Дж, Doye В (сентябрь 2001). «Эволюционно консервативный субкомплекс NPC, который частично перераспределяется на кинетохоры в клетках млекопитающих» . Журнал клеточной биологии . 154 (6): 1147–60. DOI : 10.1083 / jcb.200101081 . PMC 2150808 . PMID 11564755 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Стоффлер Д., Фаренкрог Б., Эби Ю. (июнь 1999 г.). «Комплекс ядерных пор: от молекулярной архитектуры к функциональной динамике». Текущее мнение в клеточной биологии . 11 (3): 391–401. DOI : 10.1016 / S0955-0674 (99) 80055-6 . PMID  10395558 .
  • Бодур К., Шейх С., Энарсон П., Чоудхури С., Салина Д., Рахарджо У.Х., Берк Б. (1999). «Функция и сборка сложных белков ядерной поры». Биохимия и клеточная биология . 77 (4): 321–9. DOI : 10,1139 / BCB-77-4-321 . PMID  10546895 .
  • Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. DOI : 10.1006 / abio.1996.0138 . PMID  8619474 .
  • Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геномные исследования . 7 (4): 353–8. DOI : 10.1101 / gr.7.4.353 . PMC  139146 . PMID  9110174 .
  • Белгаре Н., Рабут Г., Бай С.В., ван Овербек М., Бодуэн Дж., Дайгл Н., Зацепина О.В., Пасто Ф., Лабас В., Фромонт-Расин М., Элленберг Дж., Дой В. (сентябрь 2001 г.). «Эволюционно консервативный субкомплекс NPC, который частично перераспределяется на кинетохоры в клетках млекопитающих» . Журнал клеточной биологии . 154 (6): 1147–60. DOI : 10.1083 / jcb.200101081 . PMC  2150808 . PMID  11564755 .
  • Walther TC, Alves A, Pickersgill H, Loïodice I, Hetzer M, Galy V, Hülsmann BB, Köcher T., Wilm M, Allen T., Mattaj IW, Doye V (апрель 2003 г.). «Консервированный комплекс Nup107-160 имеет решающее значение для сборки комплекса ядерных пор». Cell . 113 (2): 195–206. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (03) 00235-6 . PMID  12705868 . S2CID  16449133 .
  • Loïodice I, Alves A, Rabut G, Van Overbeek M, Ellenberg J, Sibarita JB, Doye V (июль 2004 г.). «Весь комплекс Nup107-160, включая три новых члена, нацелен как единое целое на кинетохоры в митозе» . Молекулярная биология клетки . 15 (7): 3333–44. DOI : 10,1091 / mbc.E03-12-0878 . PMC  452587 . PMID  15146057 .
  • Berke IC, Boehmer T, Blobel G, Schwartz TU (ноябрь 2004 г.). «Структурный и функциональный анализ доменов Nup133 выявляет модульные строительные блоки комплекса ядерных пор» . Журнал клеточной биологии . 167 (4): 591–7. DOI : 10.1083 / jcb.200408109 . PMC  2172596 . PMID  15557116 .
  • Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (апрель 2006 г.). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (14): 5391–6. Bibcode : 2006PNAS..103.5391N . DOI : 10.1073 / pnas.0507066103 . PMC  1459365 . PMID  16565220 .
  • Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природа Биотехнологии . 24 (10): 1285–92. DOI : 10,1038 / НБТ1240 . PMID  16964243 . S2CID  14294292 .
  • Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983 . S2CID  7827573 .
  • Бемер Т., Шварц Т.У. (сентябрь 2007 г.). "Очистка, кристаллизация и предварительный рентгеновский анализ гетеродимерного нуклеопоринового комплекса Nup107-Nup133" . Acta Crystallographica Раздел F . 63 (Pt 9): 816–8. DOI : 10.1107 / S1744309107040523 . PMC  2376328 . PMID  17768364 .