• Связывание ДНК • Якорь белковой мембраны • Связывание иона металла • Связывание с белком GO: 0001948 • Идентичное связывание с белком • Связывание с последовательностью ядерной локализации • GO: 0005487 структурный компонент ядерной поры
Сотовый компонент
• не мембрана • периферия ядра • мембрана • ядерная пора • нуклеоплазма • ядрышко • ядерное тело включения • ядерная корзина ядерной поры • ядро клетки • центральный транспортный канал ядерной поры • цитозоль • клетка-хозяин
Биологический процесс
• транспорт мРНК • сборка комплекса ядерных пор • проникновение вируса в ядро хозяина • транспорт белка • проникновение вируса • вирусный процесс GO: 0022415 • негативная регуляция экспорта РНК из ядра • экспорт мРНК из ядра • импорт белка в ядро • регуляция гликолитического процесса • Экспорт тРНК из ядра • сумоилирование белка • вирусная транскрипция • регуляция сайленсинга генов с помощью миРНК • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • регуляция клеточного ответа на тепло
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
9972
218210
Ансамбль
ENSG00000124789
ENSMUSG00000021374
UniProt
P49790
н / д
RefSeq (мРНК)
NM_001278209 NM_001278210 NM_005124
NM_175749
RefSeq (белок)
NP_001265138 NP_001265139 NP_005115
н / д
Расположение (UCSC)
Chr 6: 17,62 - 17,71 Мб
Chr 13: 46.68 - 46.73 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Нуклеопорин 153 ( Nup153 ) представляет собой белок, который у человека кодируется геном NUP153 . Это важный компонент корзины ядерных поровых комплексов (NPC) у позвоночных, и он необходим для закрепления NPC. Он также действует как стыковочный узел для импортируемого кариоферина. [5] На цитоплазматической стороне NPC, Nup358 выполняет аналогичную роль.
Содержание
1 Предпосылки
2 Структура
3 взаимодействия
4 ссылки
5 Дальнейшее чтение
Фон [ править ]
Основная статья: Ядерная пора
Комплексы ядерных пор представляют собой чрезвычайно сложные структуры, которые обеспечивают регулируемое движение макромолекул между ядром и цитоплазмой. Эти комплексы состоят по крайней мере из 100 различных полипептидных субъединиц, многие из которых принадлежат к семейству нуклеопоринов. Нуклеопорины представляют собой гликопротеины, специфичные для поровых комплексов, характеризующиеся цитоплазматически ориентированными О-связанными остатками N-ацетилглюкозамина и многочисленными повторами пентапептидной последовательности XFXFG.
Структура [ править ]
Нуклеопорин 153 имеет массу 153 кДа (отсюда и его название). Он нитевидный и содержит три отдельных домена: N-концевую область, в которой был идентифицирован домен, нацеленный на поры, центральную область, содержащую несколько мотивов цинковых пальцев , и C-концевую область, содержащую несколько повторов XFXFG. [6]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что NUP153 взаимодействует с SENP2 [7] [8] и KPNB1 . [9] [10] [11]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000124789 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021374 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Мороян Дж, Блобля G, Рада А (1997). «Опосредованный RanGTP ядерный экспорт кариоферина альфа включает его взаимодействие с нуклеопорином Nup153» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (18): 9699–704. Bibcode : 1997PNAS ... 94.9699M . DOI : 10.1073 / pnas.94.18.9699 . PMC 23253 . PMID 9275187 .
^ "Энтрез Ген: NUP153 нуклеопорин 153 кДа" .
^ Hang, июнь; Дассо Мэри (май 2002 г.). «Связь человеческой протеазы SUMO-1 SENP2 с ядерной порой» . J. Biol. Chem . 277 (22): 19961–6. DOI : 10.1074 / jbc.M201799200 . ISSN 0021-9258 . PMID 11896061 .
^ Чжан, Хун; Сайто Хисато; Матунис Майкл Дж (сентябрь 2002 г.). «Ферменты пути модификации SUMO локализуются в филаментах комплекса ядерных пор» . Мол. Клетка. Биол . 22 (18): 6498–508. DOI : 10.1128 / MCB.22.18.6498-6508.2002 . ISSN 0270-7306 . PMC 135644 . PMID 12192048 .
^ Накельный, S; Shaikh S; Берк Б; Дрейфус Дж. (Апрель 1999 г.). «Nup153 представляет собой M9-содержащий мобильный нуклеопорин с новым Ran-связывающим доменом» . EMBO J . 18 (7): 1982–95. DOI : 10.1093 / emboj / 18.7.1982 . ISSN 0261-4189 . PMC 1171283 . PMID 10202161 .
^ Kehlenbach, RH; Джерас Л. (июнь 2000 г.). «Фосфорилирование ядерного транспортного механизма подавляет импорт ядерного белка in vitro» . J. Biol. Chem . 275 (23): 17848–56. DOI : 10.1074 / jbc.M001455200 . ISSN 0021-9258 . PMID 10749866 .
↑ Бен-Эфраим, я; Джерас Л. (январь 2001 г.). «Градиент увеличения сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта» . J. Cell Biol . 152 (2): 411–7. DOI : 10,1083 / jcb.152.2.411 . ISSN 0021-9525 . PMC 2199621 . PMID 11266456 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Морояну Дж. (2000). «Пути импорта и экспорта ядерной энергии». J. Cell. Biochem . Дополнение 32–33: 76–83. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-4644 (1999) 75: 32+ <76 :: AID-JCB10> 3.0.CO; 2-Q . PMID 10629106 .
МакМорроу I, Бастос Р., Хортон Х, Берк Б. (1994). «Анализ последовательности кДНК, кодирующей белок комплекса ядерных пор человека, hnup153». Биохим. Биофиз. Acta . 1217 (2): 219–23. DOI : 10.1016 / 0167-4781 (94) 90040-X . PMID 8110839 .
Ясин Н.Р., Блобель Г. (1997). «Клонирование и характеристика человеческого кариоферина бета3» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (9): 4451–6. Bibcode : 1997PNAS ... 94.4451Y . DOI : 10.1073 / pnas.94.9.4451 . PMC 20743 . PMID 9114010 .
Золотухин А.С., Фельбер Б.К. (1999). «Нуклеопорины nup98 и nup214 участвуют в ядерном экспорте вируса иммунодефицита человека типа 1 Rev» . J. Virol . 73 (1): 120–7. DOI : 10,1128 / JVI.73.1.120-127.1999 . PMC 103815 . PMID 9847314 .
Ульман К.С., Шах С., Пауэрс М.А., Forbes DJ (1999). «Нуклеопорин nup153 играет важную роль во многих типах ядерного экспорта» . Мол. Биол. Cell . 10 (3): 649–64. DOI : 10.1091 / mbc.10.3.649 . PMC 25193 . PMID 10069809 .
Накельный С., Шейх С., Берк Б., Дрейфус Г. (1999). «Nup153 представляет собой M9-содержащий мобильный нуклеопорин с новым Ran-связывающим доменом» . EMBO J . 18 (7): 1982–95. DOI : 10.1093 / emboj / 18.7.1982 . PMC 1171283 . PMID 10202161 .
Бачи А., Браун И.С., Родригес Дж. П. и др. (2000). «C-концевой домен TAP взаимодействует с комплексом ядерных пор и способствует экспорту специфических CTE-несущих РНК-субстратов» . РНК . 6 (1): 136–58. DOI : 10.1017 / S1355838200991994 . PMC 1369901 . PMID 10668806 .
Келенбах Р.Х., Джерас Л. (2000). «Фосфорилирование ядерного транспортного механизма подавляет импорт ядерного белка in vitro» . J. Biol. Chem . 275 (23): 17848–56. DOI : 10.1074 / jbc.M001455200 . PMID 10749866 .
Кутай У., Хартманн Э., Трейхель Н и др. (2001). «Идентификация двух новых RanGTP-связывающих белков, принадлежащих к суперсемейству importin beta» . J. Biol. Chem . 275 (51): 40163–8. DOI : 10.1074 / jbc.M006242200 . PMID 11024021 .
Герольд А., Суяма М., Родригес Дж. П. и др. (2000). «TAP (NXF1) принадлежит к мультигенному семейству предполагаемых факторов экспорта РНК с консервативной модульной архитектурой» . Мол. Клетка. Биол . 20 (23): 8996–9008. DOI : 10.1128 / MCB.20.23.8996-9008.2000 . PMC 86553 . PMID 11073998 .
Хофманн В., Райхарт Б., Эвальд А. и др. (2001). «Требования кофактора для ядерного экспорта Rev response element (RRE) - и конститутивного транспортного элемента (CTE) -содержащих ретровирусных РНК. Неожиданная роль для актина» . J. Cell Biol . 152 (5): 895–910. DOI : 10,1083 / jcb.152.5.895 . PMC 2198816 . PMID 11238447 .
Бен-Эфраим I, Джерас Л. (2001). «Градиент увеличения сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта» . J. Cell Biol . 152 (2): 411–7. DOI : 10,1083 / jcb.152.2.411 . PMC 2199621 . PMID 11266456 .
Димаано К., Болл-младший, Прунуске А.Дж., Ульман К.С. (2002). «РНК-ассоциация определяет функционально консервативный домен в белке ядерных пор Nup153» . J. Biol. Chem . 276 (48): 45349–57. DOI : 10.1074 / jbc.M102592200 . PMID 11567018 .
Вальтер Т.С., Форнерод М., Пикерсгилл Х. и др. (2001). «Нуклеопорин Nup153 необходим для образования корзины ядерных пор, заякоривания комплексов ядерных пор и импорта субнабора ядерных белков» . EMBO J . 20 (20): 5703–14. DOI : 10.1093 / emboj / 20.20.5703 . PMC 125666 . PMID 11598013 .
