Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с NUP214 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
NUP214
Белок NUP214 PDB 2oit.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2OIT , 3FHC , 3FMO , 3FMP , 5DIS

Идентификаторы
ПсевдонимыNUP214 , CAIN , CAN, D9S46E, N214, p250, нуклеопорин 214 кДа, нуклеопорин 214, IIAE9
Внешние идентификаторыOMIM : 114350 MGI : 1095411 HomoloGene : 38008 GeneCards : Nup214
Расположение гена ( человек )
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек) [1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное расположение NUP214
Геномное расположение NUP214
Группа9q34.13Начинать131 125 586 п.н. [1]
Конец131 234 663 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 2 (мышь)
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Хромосома 2 (мышь)
Геномное расположение NUP214
Геномное расположение NUP214
Группа2 B | 2 21.97 смНачинать31 974 436 п.н. [2]
Конец32 053 975 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК


Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• активность рецептора ядерного экспортного сигнала
• связывание с белком GO: 0001948
• связывание с последовательностью ядерной локализации
• структурный компонент ядерной поры GO: 0005487
Сотовый компонент• цитозоль
• внутриклеточная мембранный ограниченные органеллы
• фокальная адгезия
• нуклеоплазма
• ядро клетки
• цитоплазматического сторона ядерной поры
• ядерных пор ядерная корзина
• пор центральный транспортный канал ядерного
• ядерных пор
• ядерной оболочки
• клетка - хозяин
Биологический процесс• транспорт мРНК
• регуляция стабильности мРНК
• регуляция клеточного цикла
• экспорт белка из ядра
• транспорт белка
• вирусный процесс GO: 0022415
• импорт белка в ядро
• экспорт РНК из ядра
• экспорт мРНК из ядра
• регуляция ядерно-цитоплазматического транспорта
• GO: 0007067 митотический клеточный цикл
• регуляция гликолитического процесса
• экспорт тРНК из ядра
• сумоилирование белка
• вирусная транскрипция
• регуляция сайленсинга генов с помощью миРНК
• GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса
• регуляция клеточного ответа на тепло
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

8021

227720

Ансамбль

ENSG00000126883

ENSMUSG00000001855

UniProt

P35658

Q80U93

RefSeq (мРНК)

NM_005085
NM_001318324
NM_001318325

NM_172268

RefSeq (белок)

NP_001305253
NP_001305254
NP_005076

NP_758472

Расположение (UCSC)Chr 9: 131,13 - 131,23 МбChr 2: 31.97 - 32.05 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 214 ( Nup2014 ) представляет собой белок , который у человека кодируется Nup214 гена . [5] [6] [7]

Функция [ править ]

Комплекс ядерных пор представляет собой массивную структуру, которая простирается через ядерную оболочку, образуя ворота, которые регулируют поток макромолекул между ядром и цитоплазмой . Нуклеопорины являются основными компонентами комплекса ядерных пор в эукариотических клетках. Этот ген является членом нуклеопоринов, содержащих FG-повтор. Белок, кодируемый этим геном, локализован на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор, где он необходим для правильного развития клеточного цикла и ядерно-цитоплазматического транспорта. 3'-часть этого гена образует гибридный ген с геном DEK на хромосоме 6 при транслокации at (6,9).ассоциированный с острым миелолейкозом и миелодиспластическим синдромом . [7]

Структура [ править ]

Структура N-концевого домена Nup214 обнаруживает семилепестковую бета-пропеллерную складку, за которой следует 30 -концевой удлиненный пептидный сегмент (CTE) из 30 остатков . CTE складывается обратно на бета-винт и прикрепляется к его нижней поверхности. [8]Структура NTD Nup214, связанного с геликазой Ddx19 в ее ADP-связанном состоянии, раскрывает молекулярную основу взаимодействия между двумя белками. Показано, что консервативный остаток Ddx19 имеет решающее значение для образования комплексов in vitro и in vivo. Поразительно, что поверхности взаимодействия демонстрируют сильно противоположные поверхностные потенциалы, при этом поверхность геликазы заряжена положительно, а поверхность Nup214 - отрицательно. Показано, что Ddx19 связывает РНК только в своем АТФ-связанном состоянии, а связывание РНК и NTD Nup214 является взаимоисключающим. [9]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что NUP214 взаимодействует с:

  • DDX19 , [9]
  • CRM1
  • NXF1 , [10] [11] и
  • NXF2 , [10] и
  • ZFP36 . [12]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000126883 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001855 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Кремер D, Возняк RW, Блобель G, Radu A (февраль 1994). «Белок CAN человека, предполагаемый продукт онкогена, связанный с миелоидным лейкемогенезом, представляет собой комплексный белок ядерных пор, обращенный к цитоплазме» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (4): 1519–23. DOI : 10.1073 / pnas.91.4.1519 . PMC 43191 . PMID 8108440 .  
  6. ^ фон Линдерн М, Поустка А, Лерах Х, Гросвельд G (август 1990). «Транслокация (6; 9) хромосомы, связанная со специфическим подтипом острого нелимфоцитарного лейкоза, приводит к аберрантной транскрипции целевого гена на 9q34» . Молекулярная и клеточная биология . 10 (8): 4016–26. DOI : 10.1128 / mcb.10.8.4016 . PMC 360912 . PMID 2370860 .  
  7. ^ a b «Ген Энтреза: нуклеопорин NUP214 214 кДа» .
  8. ^ Napetschnig Дж, Блобель G, Hoelz А (2007). «Кристаллическая структура N-концевого домена протоонкогена человека Nup214 / CAN» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 104 (6): 1783–8. DOI : 10.1073 / pnas.0610828104 . PMC 1794303 . PMID 17264208 .  
  9. ^ a b Napetschnig J, Kassube SA, Debler EW, Wong RW, Blobel G, Hoelz A (2009). «Структурный и функциональный анализ взаимодействия нуклеопорина Nup214 с DEAD-бокс-геликазой Ddx19» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 106 (9): 3089–94. DOI : 10.1073 / pnas.0813267106 . PMC 2651337 . PMID 19208808 .  
  10. ^ a b Херольд А., Суяма М., Родригес Дж. П., Браун И. К., Кутай Ю., Кармо-Фонсека М., Борк П., Изаурральде Е. (декабрь 2000 г.). «TAP (NXF1) принадлежит к мультигенному семейству предполагаемых факторов экспорта РНК с консервативной модульной архитектурой» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (23): 8996–9008. DOI : 10.1128 / mcb.20.23.8996-9008.2000 . PMC 86553 . PMID 11073998 .  
  11. Перейти ↑ Schmitt I, Gerace L (ноябрь 2001 г.). «In vitro анализ ядерного транспорта, опосредованного C-концевым челночным доменом Tap» . Журнал биологической химии . 276 (45): 42355–63. DOI : 10.1074 / jbc.M103916200 . PMID 11551912 . 
  12. ^ Carman JA, Недлер SG (март 2004). «Прямая ассоциация тристетрапролина с нуклеопорином CAN / Nup214». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 315 (2): 445–9. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2004.01.080 . PMID 14766228 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Стоффлер Д., Фаренкрог Б., Эби Ю. (июнь 1999 г.). «Ядерный поровый комплекс: от молекулярной архитектуры к функциональной динамике». Текущее мнение в клеточной биологии . 11 (3): 391–401. DOI : 10.1016 / S0955-0674 (99) 80055-6 . PMID  10395558 .
  • фон Линдерн М., Форнерод М., ван Баал С., Йегле М., де Вит Т., Буйс А., Гросвельд Г. (апрель 1992 г.). «Транслокация (6; 9), связанная с конкретным подтипом острого миелоидного лейкоза, приводит к слиянию двух генов, dek и can, и к экспрессии химерной, специфичной для лейкемии мРНК dek-can» . Молекулярная и клеточная биология . 12 (4): 1687–97. DOI : 10.1128 / mcb.12.4.1687 . PMC  369612 . PMID  1549122 .
  • Номура Н., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Каварабаяси Ю., Сато С., Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Табата С. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. I. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0001-KIAA0040), выведенные путем анализа случайно отобранных клонов кДНК из незрелых миелоидных клеток человека линии KG-1» . Исследования ДНК . 1 (1): 27–35. DOI : 10.1093 / dnares / 1.1.27 . PMID  7584026 .
  • Номура Н., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Каварабаяси И., Сато С., Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Табата С. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. I. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0001-KIAA0040), выведенные путем анализа случайно выбранных клонов кДНК из незрелых миелоидных клеток человека линии KG-1 (дополнение)» . Исследования ДНК . 1 (1): 47–56. DOI : 10.1093 / dnares / 1.1.47 . PMID  7584028 .
  • Пилз А., Вудворд К., Пови С., Эбботт С. (январь 1995 г.). «Сравнительное картирование 50 локусов хромосомы 9 человека у лабораторных мышей». Геномика . 25 (1): 139–49. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80119-7 . PMID  7774911 .
  • Штутц Ф., Изаурральде Э., Маттай И. В., Росбаш М. (декабрь 1996 г.). «Роль доменов повторов FG нуклеопорина в экспорте белка Rev вируса иммунодефицита человека 1 типа и РНК из ядра» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (12): 7144–50. DOI : 10.1128 / mcb.16.12.7144 . PMC  231718 . PMID  8943370 .
  • Форнерод М., ван Дерсен Дж., Ван Баал С., Рейнольдс А., Дэвис Д., Мурти К. Г., Франсен Дж., Гросвельд Г. (февраль 1997 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого CRM1 находится в динамическом подкомплексе с CAN / Nup214 и новым компонентом ядерных пор Nup88» . Журнал EMBO . 16 (4): 807–16. DOI : 10.1093 / emboj / 16.4.807 . PMC  1169681 . PMID  9049309 .
  • Ясин Н.Р., Блобель Г. (апрель 1997 г.). «Клонирование и характеристика человеческого кариоферина бета3» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (9): 4451–6. DOI : 10.1073 / pnas.94.9.4451 . PMC  20743 . PMID  9114010 .
  • Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (май 1997 г.). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (10): 5055–60. DOI : 10.1073 / pnas.94.10.5055 . PMC  24630 . PMID  9144189 .
  • Бастос Р., Рибас де Пуплана Л., Энарсон М., Бодур К., Берк Б. (июнь 1997 г.). «Nup84, новый нуклеопорин, который связан с CAN / Nup214 на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор» . Журнал клеточной биологии . 137 (5): 989–1000. DOI : 10,1083 / jcb.137.5.989 . PMC  2136229 . PMID  9166401 .
  • Бур Дж., Бонтен-Сюртель Дж., Гросвельд Дж. (Март 1998 г.). «Сверхэкспрессия нуклеопорина CAN / NUP214 вызывает остановку роста, дефекты ядерно-цитоплазматического транспорта и апоптоз» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (3): 1236–47. DOI : 10.1128 / mcb.18.3.1236 . PMC  108836 . PMID  9488438 .
  • Богерд HP, Эчарри А., Росс TM, Каллен Б.Р. (ноябрь 1998 г.). «Ингибирование функции вируса иммунодефицита человека Rev и вируса Т-клеточного лейкоза человека Rex, но не активности конститутивного транспортного элемента вируса обезьяны Mason-Pfizer с помощью мутантного человеческого нуклеопорина, нацеленного на Crm1» . Журнал вирусологии . 72 (11): 8627–35. DOI : 10,1128 / JVI.72.11.8627-8635.1998 . PMC  110274 . PMID  9765402 .
  • Золотухин А.С., Фельбер Б.К. (январь 1999 г.). «Нуклеопорины nup98 и nup214 участвуют в ядерном экспорте вируса иммунодефицита человека типа 1 Rev» . Журнал вирусологии . 73 (1): 120–7. DOI : 10,1128 / JVI.73.1.120-127.1999 . PMC  103815 . PMID  9847314 .
  • Schmitt C, von Kobbe C, Bachi A, Panté N, Rodrigues JP, Boscheron C, Rigaut G, Wilm M, Séraphin B, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (август 1999). «Dbp5, белок DEAD-бокса, необходимый для экспорта мРНК, рекрутируется в цитоплазматические фибриллы комплекса ядерных пор посредством консервативного взаимодействия с CAN / Nup159p» . Журнал EMBO . 18 (15): 4332–47. DOI : 10.1093 / emboj / 18.15.4332 . PMC  1171509 . PMID  10428971 .
  • Бачи А., Браун И. К., Родригес Дж. П., Панте Н., Риббек К., фон Коббе С., Кутай Ю., Вильм М., Герлих Д., Кармо-Фонсека М., Изаурральде Е. (январь 2000 г.). «С-концевой домен TAP взаимодействует с комплексом ядерных пор и способствует экспорту специфических CTE-несущих РНК-субстратов» . РНК . 6 (1): 136–58. DOI : 10.1017 / S1355838200991994 . PMC  1369901 . PMID  10668806 .
  • Герольд А., Суяма М., Родригес Дж. П., Браун И. К., Кутай Ю., Кармо-Фонсека М., Борк П., Изаурральде Е. (декабрь 2000 г.). «TAP (NXF1) принадлежит к мультигенному семейству предполагаемых факторов экспорта РНК с консервативной модульной архитектурой» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (23): 8996–9008. DOI : 10.1128 / MCB.20.23.8996-9008.2000 . PMC  86553 . PMID  11073998 .
  • Hofmann W, Reichart B, Ewald A, Müller E, Schmitt I, Stauber RH, Lottspeich F, Jockusch BM, Scheer U, Hauber J, Dabauvalle MC (март 2001 г.). «Требования кофактора для ядерного экспорта Rev response element (RRE) - и конститутивного транспортного элемента (CTE) -содержащих ретровирусных РНК. Неожиданная роль актина» . Журнал клеточной биологии . 152 (5): 895–910. DOI : 10,1083 / jcb.152.5.895 . PMC  2198816 . PMID  11238447 .