Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с NUP43 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
NUP43
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4I79 , 5A9Q

Идентификаторы
ПсевдонимыNUP43 , bA350J20.1, p42, нуклеопорин 43 кДа, нуклеопорин 43
Внешние идентификаторыOMIM : 608141 MGI : 1917162 HomoloGene : 11639 GeneCards : NUP43
Расположение гена ( человек )
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человека) [1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение NUP43
Геномное расположение NUP43
Группа6q25.1Начинать149 724 315 п.н. [1]
Конец149 749 665 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 10 (мышь)
Chr.Хромосома 10 (мышь) [2]
Хромосома 10 (мышь)
Геномное расположение NUP43
Геномное расположение NUP43
Группа10 | 10 A1Начинать7 667 503 п.н. [2]
Конец7 678 881 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE NUP43 219007 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с белком GO: 0001948
Сотовый компонент• конденсированная кинетохора хромосомы
• цитозоль
• ядерная оболочка
• ядерная пора
• хромосома
• хромосома, центромерная область
• ядро клетки
• кинетохора
• внешнее кольцо ядерной поры
• клетка-хозяин
Биологический процесс• транспорт мРНК
• сегрегация хромосом
• деление клетки
• транспорт белков
• клеточный цикл
• вирусный процесс GO: 0022415
• экспорт мРНК из ядра
• регуляция гликолитического процесса
• экспорт тРНК из ядра
• сумоилирование белка
• вирусная транскрипция
• регуляция сайленсинга генов с помощью миРНК
• GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса
• регуляция клеточного ответа на тепло
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

348995

69912

Ансамбль

ENSG00000120253

ENSMUSG00000040034

UniProt

Q8NFH3

P59235

RefSeq (мРНК)

NM_024647
NM_198887

NM_145706

RefSeq (белок)

NP_942590

NP_663752

Расположение (UCSC)Chr 6: 149,72 - 149,75 МбChr 10: 7.67 - 7.68 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 43 ( Nup43 ) представляет собой белок , который у человека кодируется NUP43 гена . [5] [6]

Двунаправленный транспорт макромолекул между цитоплазмой и ядром происходит через комплексы ядерных пор (NPC), встроенные в ядерную оболочку. NPCs состоят из субкомплексов, и NUP43 является частью одного из таких субкомплексов, Nup107-160 (Loiodice et al., 2004) [предоставлено OMIM] [6] вместе с другими нуклеопоринами.

Структура [ править ]

Он складывается в канонический повторяющийся домен WD40 . [7] [8]

Ассоциация болезней [ править ]

Высокая экспрессия NUP43 при раке груди связана с плохой общей выживаемостью . [9] При хроническом миелолейкозе (ХМЛ) уменьшение miRNA-409-5p увеличивает экспрессию NUP43, что, в свою очередь, увеличивает пролиферативный потенциал, прогрессирование клеточного цикла и устойчивость к иматинибу . [10]

Некоторые варианты Nup43 были охарактеризованы как причины возникновения сердечно-сосудистых заболеваний (ССЗ) [11], в то время как экспрессия Nup43 была связана с синдромом дефицита внимания с гиперактивностью . [12]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000120253 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040034 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Cronshaw JM, Крутчинский А.Н., Zhang W, Хаит BT, Matunis MJ (сентябрь 2002). «Протеомный анализ комплекса ядерных пор млекопитающих» . J Cell Biol . 158 (5): 915–27. DOI : 10,1083 / jcb.200206106 . PMC 2173148 . PMID 12196509 .  
  6. ^ a b «Ген Энтреза: NUP43 нуклеопорин 43 кДа» .
  7. ^ Loïodice я, Алвес А, Rabut G, Ван Overbeek М, Элленберга Дж, Sibarita JB, Doye В (июль 2004 г.). «Весь комплекс Nup107-160, включая три новых члена, нацелен как единое целое на кинетохоры в митозе» . Молекулярная биология клетки . 15 (7): 3333–44. DOI : 10.1091 / mbc.e03-12-0878 . PMC 452587 . PMID 15146057 .  
  8. ^ Xu C, He H и др. (2015). «Кристаллическая структура компонента комплекса ядерных пор человека NUP43». FEBS Lett . 589 (21): 3247–3253. DOI : 10.1016 / j.febslet.2015.09.008 . PMID 26391640 . S2CID 8089347 .  
  9. ↑ Tian C, Zhou S, Yi C (июнь 2018). «Высокая экспрессия NUP43 может независимо предсказывать плохую общую выживаемость при раке молочной железы A и HER2 +». Будущая онкология . Лондон, Англия. 14 (15): 1431–1442. DOI : 10,2217 / фон-2017-0690 . PMID 29402145 . 
  10. ^ Лю YY, Jiao WY, Li T, Bao YY (октябрь 2019 г.). «Нарушение регуляции MiRNA-409-5p способствует устойчивости к иматинибу и прогрессированию заболевания у детей с хроническим миелоидным лейкозом». Европейский обзор медицинских и фармакологических наук . 23 (19): 8468–8475. DOI : 10,26355 / eurrev_201910_19159 . PMID 31646577 . 
  11. ^ Haskell GT, Jensen BC, Samsa LA, Marchuk D, Huang W, Skrzynia C, Tilley C, Seifert BA, Rivera-Muñoz EA, Koller B, Wilhelmsen KC, Liu J, Alhosaini H, Weck KE, Evans JP, Berg JS (Июнь 2017 г.). «Секвенирование всего экзома выявляет варианты усечения в генах ядерной оболочки у пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями» . Тираж: сердечно-сосудистая генетика . 10 (3). DOI : 10,1161 / CIRCGENETICS.116.001443 . PMC 5497793 . PMID 28611029 .  
  12. ^ Fahira A, Li Z, Лю N, Shi Y (май 2019). «Прогнозирование причинных генов и анализ экспрессии генов синдрома дефицита внимания с гиперактивностью в различных областях мозга, комплексный интегративный анализ СДВГ». Поведенческие исследования мозга . 364 : 183–192. DOI : 10.1016 / j.bbr.2019.02.010 . PMID 30738099 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Genome Res . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC  310948 . PMID  11076863 .
  • Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Genome Res . 11 (3): 422–35. DOI : 10.1101 / гр . GR1547R . PMC  311072 . PMID  11230166 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Genome Res . 14 (10B): 2136–44. DOI : 10.1101 / gr.2576704 . PMC  528930 . PMID  15489336 .
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Nucleic Acids Res . 34 (Выпуск базы данных): D415–8. DOI : 10.1093 / NAR / gkj139 . PMC  1347501 . PMID  16381901 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q8NFH3 (человеческий нуклеопорин Nup43) в PDBe-KB .


  • v
  • т
  • е