Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с NUP50 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
NUP50
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2EC1 , 3TJ3

Идентификаторы
ПсевдонимыNUP50 , NPAP60, NPAP60L, нуклеопорин 50 кДа, нуклеопорин 50
Внешние идентификаторыOMIM : 604646 MGI : 1351502 HomoloGene : 5190 GeneCards : NUP50
Расположение гена ( человек )
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человека) [1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное местоположение для NUP50
Геномное местоположение для NUP50
Группа22q13.31Начинать45 163 925 п.н. [1]
Конец45 188 017 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 15 (мышь)
Chr.Хромосома 15 (мышь) [2]
Хромосома 15 (мышь)
Геномное местоположение для NUP50
Геномное местоположение для NUP50
Группа15 E2 | 15 40,25 смНачинать84 923 411 п.н. [2]
Конец84 942 963 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE NUP50 213682 в формате fs.png

PBB GE NUP50 218294 s в формате fs.png

PBB GE NUP50 218293 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с белками GO: 0001948
• Связывание с Ran GTPase
• GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase
Сотовый компонент• ядерная мембрана
• мембрана
• нуклеоплазма
• ядро клетки
• органелла, связанная с внутриклеточной мембраной
• ядерная пора
• цитоплазма
• центросома
• клетка-хозяин
Биологический процесс• транспорт мРНК
• внутриклеточный транспорт
• транспорт белка
• вирусный процесс GO: 0022415
• импорт белка в ядро
• экспорт мРНК из ядра
• GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase
• регуляция гликолитического процесса
• экспорт тРНК из ядра
• сумоилирование белков
• вирусная транскрипция
• регуляция сайленсинга генов с помощью миРНК
• GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса
• регуляция клеточного ответа на тепло
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

10762

18141

Ансамбль

ENSG00000093000

ENSMUSG00000016619

UniProt

Q9UKX7

Q9JIH2

RefSeq (мРНК)

NM_007172
NM_153645

NM_016714

RefSeq (белок)

NP_009103
NP_705931

NP_057923

Расположение (UCSC)Chr 22: 45.16 - 45.19 МбChr 15: 84.92 - 84.94 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 50 ( Nup50 ) представляет собой белок , который у человека кодируется NUP50 гена . [5] [6]

Комплекс ядерных пор представляет собой массивную структуру, которая простирается через ядерную оболочку, образуя ворота, которые регулируют поток макромолекул между ядром и цитоплазмой. Нуклеопорины являются основными компонентами комплекса ядерных пор в эукариотических клетках. Белок, кодируемый этим геном, является членом нуклеопоринов, содержащих FG-повтор, который функционирует как растворимый кофактор в импортин-альфа: бета-опосредованном импорте ядерного белка. Псевдогены этого гена находятся на хромосомах 5, 6 и 14. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. [6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что NUP50 взаимодействует с KPNB1 [7] и CDKN1B . [8]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000093000 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000016619 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. Перейти ↑ Trichet V, Shkolny D, Dunham I, Beare D, McDermid HE (октябрь 1999 г.). «Картирование и сложная картина экспрессии гена нуклеопорина NPAP60L человека». Cytogenet Cell Genet . 85 (3–4): 221–6. DOI : 10.1159 / 000015297 . PMID 10449902 . 
  6. ^ a b «Ген Энтреза: NUP50 нуклеопорин 50 кДа» .
  7. ^ Линдси, Марк E; Плафкер Кендра; Смит Алисия Э; Клерман Брюс Э; Макара Ян Джи (август 2002 г.). «Npap60 / Nup50 - это тристабильный переключатель, который стимулирует импорт ядерного белка, опосредованного импортин-альфа: бета». Cell . 110 (3): 349–60. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (02) 00836-X . ISSN 0092-8674 . PMID 12176322 .  
  8. ^ Смитерман, М; Лук-порей; Swanger J; Капур Р; Clurman BE (август 2000 г.). «Характеристика и целенаправленное разрушение мышиного Nup50, p27Kip1-взаимодействующего компонента ядерного порового комплекса» . Мол. Клетка. Биол . 20 (15): 5631–42. DOI : 10.1128 / MCB.20.15.5631-5642.2000 . ISSN 0270-7306 . PMC 86029 . PMID 10891500 .   

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983 .
  • Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. DOI : 10,1038 / NBT1240 . PMID  16964243 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта кДНК полной длины NIH: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А. и др. (2005). «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека» . Genome Biol . 5 (10): R84. DOI : 10.1186 / GB-2004-5-10-R84 . PMC  545604 . PMID  15461802 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Сваминатан С., Мельхиор Ф (2002). «Нуклеоцитоплазматический транспорт: больше, чем обычные подозреваемые». Dev. Cell . 3 (3): 304–6. DOI : 10.1016 / S1534-5807 (02) 00262-9 . PMID  12361592 .
  • Линдси М.Э., Плафкер К., Смит А.Е. и др. (2002). «Npap60 / Nup50 - это тристабильный переключатель, который стимулирует импорт ядерного белка, опосредованного импортин-альфа: бета». Cell . 110 (3): 349–60. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (02) 00836-X . PMID  12176322 .
  • Смитерман М., Ли К., Свангер Дж. И др. (2000). «Характеристика и целенаправленное разрушение мышиного Nup50, p27Kip1-взаимодействующего компонента ядерного порового комплекса» . Мол. Клетка. Биол . 20 (15): 5631–42. DOI : 10.1128 / MCB.20.15.5631-5642.2000 . PMC  86029 . PMID  10891500 .
  • Guan T, Kehlenbach RH, Schirmer EC, et al. (2000). «Nup50, нуклеоплазматически ориентированный нуклеопорин с ролью в экспорте ядерного белка» . Мол. Клетка. Биол . 20 (15): 5619–30. DOI : 10.1128 / MCB.20.15.5619-5630.2000 . PMC  86026 . PMID  10891499 .
  • Данэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Bibcode : 1999Natur.402..489D . DOI : 10.1038 / 990031 . PMID  10591208 .
  • v
  • т
  • е