Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с NUP54 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
NUP54
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4JNU , 4JNV , 4JO7 , 4JO9 , 5IJO , 5IJN

Идентификаторы
ПсевдонимыNUP54 , нуклеопорин 54
Внешние идентификаторыOMIM : 607607 MGI : 1920460 HomoloGene : 41169 GeneCards : NUP54
Расположение гена ( человек )
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек) [1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное местоположение для NUP54
Геномное местоположение для NUP54
Группа4q21.1Начинать76 114 659 п.н. [1]
Конец76 148 444 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 5 (мышь)
Chr.Хромосома 5 (мышь) [2]
Хромосома 5 (мышь)
Геномное местоположение для NUP54
Геномное местоположение для NUP54
Группа5 | 5 E2Начинать92 415 540 п.н. [2]
Конец92 435 219 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE NUP54 218256 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• GO: 0001948 связывание белка
• GO: 0005487 структурной составляющей ядерной поры
Сотовый компонент• ядерная мембрана
• ядерная оболочка
• мембрана
• ядерная пора
• центральный транспортный канал ядерной поры
• ядро
• белковый комплекс
• клетка-хозяин
Биологический процесс• нацеливание на белок
• транспорт мРНК
• гетеротетрамеризация белка
• локализация белка на внутренней мембране ядра • гетероолигомеризация белка
• ядерно-цитоплазматический транспорт • регуляция импорта белка в ядро • транспорт белка • вирусный процесс GO: 0022415 • гомоолигомеризация белка • организация ядерных пор • белок, несущий NLS импорт в ядро • экспорт мРНК из ядра • гетеротримеризация белка • регуляция гликолитического процесса •










Экспорт тРНК из ядра
• сумоилирование белка
• вирусная транскрипция
• регуляция сайленсинга генов с помощью миРНК
• GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса
• регуляция клеточного ответа на тепло
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

53371

269113

Ансамбль

ENSG00000138750

ENSMUSG00000034826

UniProt

Q7Z3B4

Q8BTS4

RefSeq (мРНК)

NM_001278603
NM_017426

NM_183392
NM_001359995

RefSeq (белок)

NP_001265532
NP_059122

NP_899248
NP_001346924

Расположение (UCSC)Chr 4: 76.11 - 76.15 МбChr 5: 92,42 - 92,44 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 54 ( Nup54 ) представляет собой белок , который у человека кодируется NUP54 гена . [5] [6]

Функция [ править ]

Ядерная оболочка создает отдельные ядерные и цитоплазматические компартменты в эукариотических клетках. Он состоит из двух концентрических мембран, перфорированных ядерными порами, крупных белковых комплексов, которые образуют водные каналы для регулирования потока макромолекул между ядром и цитоплазмой. Эти комплексы состоят по крайней мере из 100 различных полипептидных субъединиц, многие из которых принадлежат к семейству нуклеопоринов. Этот ген кодирует член субнабора нуклеопоринов, содержащих повтор phe-gly (FG). [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000138750 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034826 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Hu T, Guan T, Gerace L (сентябрь 1996 г.). «Молекулярная и функциональная характеристика комплекса p62, сборки гликопротеинов комплекса ядерных пор» . J Cell Biol . 134 (3): 589–601. DOI : 10,1083 / jcb.134.3.589 . PMC 2120945 . PMID 8707840 .  
  6. ^ a b «Ген Энтреза: NUP54 нуклеопорин 54 кДа» . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Стоффлер Д., Фаренкрог Б., Эби Ю. (1999). «Ядерно-поровый комплекс: от молекулярной архитектуры к функциональной динамике». Curr. Opin. Cell Biol . 11 (3): 391–401. DOI : 10.1016 / S0955-0674 (99) 80055-6 . PMID  10395558 .
  • Бодур К., Шейх С., Энарсон П., Чоудхури С., Салина Д., Рахарджо У.Х., Берк Б. (1999). «Функция и сборка сложных белков ядерной поры». Биохим. Cell Biol . 77 (4): 321–329. DOI : 10,1139 / BCB-77-4-321 . PMID  10546895 .
  • Finlay DR, Meier E, Bradley P, Horecka J, Forbes DJ (1991). «Комплекс белков ядерных пор, необходимых для функционирования пор» . J. Cell Biol . 114 (1): 169–183. DOI : 10,1083 / jcb.114.1.169 . PMC  2289063 . PMID  2050741 .
  • Бусс Ф, Стюарт М (1995). «Макромолекулярные взаимодействия в комплексе нуклеопорина p62 ядерных пор крысы: связывание нуклеопорина p54 с стержневым доменом p62» . J. Cell Biol . 128 (3): 251–261. DOI : 10,1083 / jcb.128.3.251 . PMC  2120351 . PMID  7531196 .
  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–174. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Гуан Т., Мюллер С., Клир Г., Панте Н., Блевитт Дж. М., Ханер М., Паскаль Б., Эби Ю., Джерас Л. (1996). «Структурный анализ комплекса p62, сборки O-связанных гликопротеинов, который располагается рядом с центральным закрытым каналом комплекса ядерных пор» . Мол. Биол. Cell . 6 (11): 1591–1603. DOI : 10.1091 / mbc.6.11.1591 . PMC  301313 . PMID  8589458 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–156. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Попов С, Рексач М, Ратнер Л, Блобель Г, Букринский М (1998). «Вирусный белок R регулирует стыковку прединтеграционного комплекса ВИЧ-1 с комплексом ядерных пор» . J. Biol. Chem . 273 (21): 13347–13352. DOI : 10.1074 / jbc.273.21.13347 . PMID  9582382 .
  • Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R , Е М., Чжоу Дж., Сюй Ш., Гу Дж., Ши Дж. Х, Джин В. Р., Чжан СК, Ву TM, Хуан Г. Ю., Чен З, Чен М. Д., Чен Дж. Л. (2000). «Профили экспрессии генов в человеческой оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники и клонирование полноразмерной кДНК» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (17): 9543–9548. DOI : 10.1073 / pnas.160270997 . PMC  16901 . PMID  10931946 .

Внешние ссылки [ править ]

  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого нуклеопорина p54.



  • v
  • т
  • е