Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с NUP85 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
NUP85
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

5A9Q

Идентификаторы
ПсевдонимыNUP85 , Nup75, FROUNT, нуклеопорин 85, NPHS17
Внешние идентификаторыOMIM : 170285 MGI : 3046173 HomoloGene : 11755 GeneCards : NUP85
Расположение гена ( человек )
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человека) [1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение NUP85
Геномное расположение NUP85
Группа17q25.1Начинать75 205 659 п.н. [1]
Конец75 235 758 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 11 (мышь)
Chr.Хромосома 11 (мышь) [2]
Хромосома 11 (мышь)
Геномное расположение NUP85
Геномное расположение NUP85
Группа11 | 11 E2Начинать115 564 434 п.н. [2]
Конец115 583 985 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE NUP85 218014 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• GO: 0005487 структурный компонент ядерной поры
• связывание белка GO: 0001948
Сотовый компонент• цитоплазма
• конденсированная хромосомная кинетохора
• не мембрана
• мембрана
• ядерная оболочка
• веретено
• ядерная пора
• хромосома
• внешнее кольцо ядерной поры
• хромосома, центромерная область
• цитоскелет
• кинетохора
• ядро клетки
• цитозоль
• клетка-хозяин
Биологический процесс• транспорт мРНК
• импорт белка в ядро
• вирусная транскрипция
• сумоилирование белка
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• хемотаксис
• разборка митотической ядерной оболочки
• хемотаксис макрофагов
• регуляция клеточного ответа на тепло
• транспорт белка
• вирусный процесс GO: 0022415
• сборка ламеллиподиума
• GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса
• экспорт мРНК из ядра
• экспорт тРНК из ядра
• сцепление сестринских хроматид
• регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA
• регуляция гликолитического процесса
• транспорт
• развитие нефронов
• ядерно-цитоплазматический транспорт
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

79902

445007

Ансамбль

ENSG00000125450

ENSMUSG00000020739

UniProt

Q9BW27

Q8R480

RefSeq (мРНК)

NM_001303276
NM_024844
NM_001330472

NM_001002929

RefSeq (белок)

NP_001290205
NP_001317401
NP_079120

NP_001002929

Расположение (UCSC)Chr 17: 75.21 - 75.24 МбChr 11: 115,56 - 115,58 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 85 ( Nup85 ) представляет собой белок , который у человека кодируется NUP85 гена . [5] [6]

Функция [ править ]

Двунаправленный транспорт макромолекул между цитоплазмой и ядром происходит через комплексы ядерных пор (NPC), встроенные в ядерную оболочку. NPC состоят из подкомплексов, и NUP85 является частью одного из таких подкомплексов, Nup107-160. [6]

Модельные организмы [ править ]

Модельные организмы были использованы в исследовании функции NUP85. Линия условно нокаутированных мышей под названием Nup85 tm1a (KOMP) Wtsi была создана в Wellcome Trust Sanger Institute . [7] Самцы и самки животных прошли стандартизированный фенотипический скрининг [8] для определения эффектов делеции. [9] [10] [11] [12] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование [13]

Фенотип мышей с нокаутом Nup85
ХарактеристикаФенотип
Все данные доступны на сайте. [8] [13]ИнсулинНормальный
Гомозиготная жизнеспособность на P14Аномальный
Рецессивное летальное исследованиеАномальный
Масса телаНормальный
Неврологический осмотрНормальный
Сила захватаНормальный
ДисморфологияНормальный
Косвенная калориметрияНормальный
Тест толерантности к глюкозеНормальный
Слуховой ответ ствола мозгаНормальный
DEXAНормальный
РентгенографияНормальный
Морфология глазаНормальный
Клиническая химияНормальный
Гематология 16 недельНормальный
Лейкоциты периферической крови 16 недельНормальный
Вес сердцаНормальный
Сальмонеллезная инфекцияНормальный
Функция цитотоксических Т-клетокНормальный
Анализ антиядерных антителНормальный
Состав эпидермального иммунитетаНормальный
Проблема гриппаНормальный

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000125450 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020739 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Doxsey SJ, Штейн Р, Эванс л, Calarco PD, Киршнер М (февраль 1994 г.). «Перицентрин, высококонсервативный белок центросомы, участвующий в организации микротрубочек». Cell . 76 (4): 639–50. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90504-5 . PMID 8124707 . S2CID 20503793 .  
  6. ^ a b «Ген Энтреза: нуклеопорин NUP85 85 кДа» .
  7. ^ Гердин AK (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica . 88 : 925–7. DOI : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 . 
  8. ^ a b «Международный консорциум по фенотипированию мышей» .
  9. ^ Skarnes туалет, Розен В, Уэст А.П., Koutsourakis М, Бушелл Вт, Ийер В, Мухика А.О., Томас М, борона Дж, Кокс Т, Джексон D, Северин Дж, Биггс Р, фу Дж, Нефедов М, де - Jong PJ, Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши» . Природа . 474 (7351): 337–42. DOI : 10,1038 / природа10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .  
  10. ^ Долгин E (июнь 2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут" . Природа . 474 (7351): 262–3. DOI : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 . 
  11. ↑ Collins FS, Rossant J, Wurst W (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Cell . 128 (1): 9–13. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 . S2CID 18872015 .  
  12. ^ Белый Ю.К., Gerdin А.К., Карп Н.А., Райдера Е, Булян М, Bussell Ю.Н., Salisbury Дж, Clare S, Ингам штат Нью - Джерси, Podrini С, Houghton R, Estabel J, Боттомли JR, Мелвин Д.Г., Сунтер D, Адамс Северная Каролина, Таннахилл D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов» . Cell . 154 (2): 452–64. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.06.022 . PMC 3717207 . PMID 23870131 .  
  13. ^ a b «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Капеллер Р., Токер А., Cantley LC, Carpenter CL (октябрь 1995 г.). «Фосфоинозитид-3-киназа конститутивно связывается с альфа / бета-тубулином и связывается с гамма-тубулином в ответ на инсулин» . Журнал биологической химии . 270 (43): 25985–91. DOI : 10.1074 / jbc.270.43.25985 . PMID  7592789 .
  • Тайнан С.Х., Пурохит А., Докси С.Дж., Валле РБ (октябрь 2000 г.). «Легкая промежуточная цепь 1 определяет функциональную субфракцию цитоплазматического динеина, которая связывается с перицентрином» . Журнал биологической химии . 275 (42): 32763–8. DOI : 10.1074 / jbc.M001536200 . PMID  10893222 .
  • Кроншоу Дж. М., Крутчинский А. Н., Чжан В., Чайт Б. Т., Матунис М. Дж. (Сентябрь 2002 г.). «Протеомный анализ комплекса ядерных пор млекопитающих» . Журнал клеточной биологии . 158 (5): 915–27. DOI : 10,1083 / jcb.200206106 . PMC  2173148 . PMID  12196509 .
  • Mulari MT, Patrikainen L, Kaisto T, Metsikkö K, Salo JJ, Väänänen HK (май 2003 г.). «Архитектура микротрубочковой сети и ориентация Гольджи в остеокластах - основные различия между видами птиц и млекопитающих». Экспериментальные исследования клеток . 285 (2): 221–35. DOI : 10.1016 / S0014-4827 (03) 00033-8 . PMID  12706117 .
  • Чанг Ф., Ре Ф., Себастьян С., Сазер С., Любан Дж. (Апрель 2004 г.). «Vpr ВИЧ-1 вызывает дефекты митоза, цитокинеза, ядерной структуры и центросом» . Молекулярная биология клетки . 15 (4): 1793–801. DOI : 10,1091 / mbc.E03-09-0691 . PMC  379276 . PMID  14767062 .
  • Loïodice I, Alves A, Rabut G, Van Overbeek M, Ellenberg J, Sibarita JB, Doye V (июль 2004 г.). «Весь комплекс Nup107-160, включая три новых члена, нацелен как единое целое на кинетохоры в митозе» . Молекулярная биология клетки . 15 (7): 3333–44. DOI : 10,1091 / mbc.E03-12-0878 . PMC  452587 . PMID  15146057 .
  • Терашима Ю., Онаи Н., Мурай М., Эномото М., Пунпирия В., Хамада Т., Мотомура К., Сува М., Эзаки Т., Хага Т., Канегасаки С., Мацусима К. (август 2005 г.). «Основная функция цитоплазматического белка FROUNT в CCR2-опосредованном хемотаксисе моноцитов». Иммунология природы . 6 (8): 827–35. DOI : 10.1038 / ni1222 . PMID  15995708 . S2CID  23496938 .
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY , Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
  • Сато М., Акацу Т., Ишкава Ю., Минами Ю., Накамура М. (март 2007 г.). «Новый активатор CC-хемокина, FROUNT, экспрессируется с CC-хемокиновым рецептором 2 и его лигандом при сердечной недостаточности человека». Журнал сердечной недостаточности . 13 (2): 114–9. DOI : 10.1016 / j.cardfail.2006.11.003 . PMID  17395051 .