Нуклеопорин 88 ( Nup88 ) представляет собой белок , который у человека кодируется NUP88 гена . [5] [6]
NUP88 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | NUP88 , нуклеопорин 88, FADS4 | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 602552 MGI : 104900 HomoloGene : 1901 GeneCards : NUP88 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 17: 5,36 - 5,42 Мб | Chr 11: 70.94 - 70.97 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Функция
Комплекс ядерных пор представляет собой массивную структуру, которая простирается через ядерную оболочку, образуя ворота, которые регулируют поток макромолекул между ядром и цитоплазмой. Нуклеопорины, семейство от 50 до 100 белков, являются основными компонентами комплекса ядерных пор в эукариотических клетках. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству нуклеопоринов и связан с онкогенным нуклеопорином CAN / Nup214 в динамическом подкомплексе. Этот белок также сверхэкспрессируется в большом количестве злокачественных новообразований и предраковых дисплазий. [6]
Взаимодействия
Было показано, что NUP88 взаимодействует с NUP98 . [7]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000108559 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040667 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Форнерод М., ван Дерсен Дж., Ван Баал С., Рейнольдс А., Дэвис Д., Мурти К. Г., Франсен Дж., Гросвельд Г. (март 1997 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого CRM1 находится в динамическом субкомплексе с CAN / Nup214 и новым компонентом ядерных пор Nup88» . EMBO J . 16 (4): 807–16. DOI : 10.1093 / emboj / 16.4.807 . PMC 1169681 . PMID 9049309 .
- ^ а б «Ген Entrez: нуклеопорин NUP88 88 кДа» .
- ^ Гриффис ER, Сюй С., Пауэрс Массачусетс (февраль 2003 г.). «Nup98 локализуется как на ядерной, так и на цитоплазматической сторонах ядерной поры и связывается с двумя различными субкомплексами нуклеопоринов» . Мол. Биол. Cell . 14 (2): 600–10. DOI : 10.1091 / mbc.E02-09-0582 . PMC 149995 . PMID 12589057 .
дальнейшее чтение
- Стоффлер Д., Фаренкрог Б., Эби Ю. (1999). «Ядерно-поровый комплекс: от молекулярной архитектуры к функциональной динамике». Curr. Opin. Cell Biol . 11 (3): 391–401. DOI : 10.1016 / S0955-0674 (99) 80055-6 . PMID 10395558 .
- Худ Дж. К., Сильвер ПА (2000). «Разнообразные пути ядерного транспорта регулируют пролиферацию клеток и онкогенез». Биохим. Биофиз. Acta . 1471 (1): M31–41. DOI : 10.1016 / s0304-419x (00) 00018-4 . PMID 10967423 .
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
- Форнерод М., Ван Баал С., Валентин В., Шапиро Д. Н., Гросвельд Г. (1997). «Хромосомная локализация генов, кодирующих белки, взаимодействующие с CAN / Nup214 - CRM1 человека локализуется в 2p16, тогда как Nup88 локализуется в 17p13 и физически связан с SF2p32». Геномика . 42 (3): 538–40. DOI : 10.1006 / geno.1997.4767 . PMID 9205132 .
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
- Бур Дж., Бонтен-Сюртель Дж., Гросвельд Дж. (1998). «Сверхэкспрессия нуклеопорина CAN / NUP214 вызывает остановку роста, дефекты ядерно-цитоплазматического транспорта и апоптоз» . Мол. Клетка. Биол . 18 (3): 1236–47. DOI : 10.1128 / mcb.18.3.1236 . PMC 108836 . PMID 9488438 .
- Мартинес Н., Алонсо А., Морагес, доктор медицины, Понтон Дж, Шнайдер Дж. (1999). «Белок комплекса ядерных пор Nup88 сверхэкспрессируется в опухолевых клетках». Cancer Res . 59 (21): 5408–11. PMID 10554006 .
- Гулд В.Е., Мартинес Н., Оручевич А., Шнайдер Дж., Алонсо А. (2000). «Новая, связанная с ядерными порами, широко распространенная молекула сверхэкспрессируется в онкогенезе и развитии» . Являюсь. J. Pathol . 157 (5): 1605–13. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 64798-0 . PMC 1885726 . PMID 11073820 .
- Ву Х, Каспер Л.Х., Манчева Р.Т., Манчев Г.Т., Спрингетт М.Дж., ван Дерсен Дж.М. (2001). «Нарушение нуклеопорина NUP98 FG вызывает избирательные изменения в стехиометрии и функции комплекса ядерных пор» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (6): 3191–6. DOI : 10.1073 / pnas.051631598 . PMC 30629 . PMID 11248054 .
- Гулд В.Е., Оручевич А., Зентграф Х., Гаттузо П., Мартинес Н., Алонсо А. (2002). «Nup88 (кариопорин) при злокачественных новообразованиях и дисплазиях человека: корреляция иммуноокрашивания срезов тканей, цитологических мазков и анализа иммуноблоттинга». Гм. Патол . 33 (5): 536–44. DOI : 10.1053 / hupa.2002.124785 . PMID 12094380 .
- Гриффис Э. Р., Сюй С., Пауэрс М. А. (2003). «Nup98 локализуется как на ядерной, так и на цитоплазматической сторонах ядерной поры и связывается с двумя различными субкомплексами нуклеопоринов» . Мол. Биол. Cell . 14 (2): 600–10. DOI : 10.1091 / mbc.E02-09-0582 . PMC 149995 . PMID 12589057 .
- Агудо Д., Гомес-Эскер Ф., Мартинес-Аррибас Ф., Нуньес-Вильяр М.Дж., Поллан М., Шнайдер Дж. (2004). «Сверхэкспрессия мРНК Nup88 связана с высокой агрессивностью рака груди» . Int. J. Рак . 109 (5): 717–20. DOI : 10.1002 / ijc.20034 . PMID 14999780 . S2CID 28081933 .
- Шнайдер Дж., Линарес Р., Мартинес-Аррибас Ф., Морагес, доктор медицины, Нуньес-Вильяр М.Дж., Паломар М.А., Понтон Дж. (2004). «Развивающиеся куриные эмбрионы экспрессируют белок, который гомологичен белку комплекса ядерных пор Nup88, присутствующему в опухолях человека» . Int. J. Dev. Биол . 48 (4): 339–42. DOI : 10.1387 / ijdb.031748js . PMID 15300515 .
- Бернад Р., Энгельсма Д., Сандерсон Н., Пикерсгилл Н., Форнерод М. (2006). «Нуклеопориновый субкомплекс Nup214-Nup88 необходим для CRM1-опосредованного экспорта 60 S в прерибосомные ядра» . J. Biol. Chem . 281 (28): 19378–86. DOI : 10.1074 / jbc.M512585200 . PMID 16675447 .
- Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. DOI : 10,1038 / NBT1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .