Nanoarchaeum equitans

Nanoarchaeum equitans
Две клетки Nanoarchaeum equitans (и ее более крупный хозяин Ignicoccus )
Научная классификация
Домен:	Археи
Тип:	Наноархей
Заказ:	Наноархей
Семья:	Nanoarchaeaceae
Род:	Наноархей
Разновидность:	N. equitans
Биномиальное имя
Nanoarchaeum equitans Huber et al. 2002 г.

Nanoarchaeum equitans - это вид морских архей, который был обнаружен в 2002году Карлом Стеттером в гидротермальном источнике у побережья Исландии на хребте Кольбейнси . Он был предложен как первый вид в новом типе. Штаммы этого микроба были также найдены на Приполярном Середина океанического хребта , и в Obsidian Бассейн в Йеллоустонском национальном парке . Поскольку он растет при температурах, приближающихся к температуре кипения, примерно до 80 градусов по Цельсию, он считается термофилом . Лучше всего растет в среде с pH 6 и концентрацией солености 2%. Наноархейкажется облигатным симбионтом на археоне Ignicoccus ; чтобы выжить, он должен контактировать с организмом-хозяином. Nanoarchaeum equitans не может синтезировать липиды, но получает их от хозяина. Его клетки имеют диаметр всего 400 нм , что делает его одним из самых маленьких известных клеточных организмов и самым маленьким известным археоном.

Н. equitans " геном состоит из одной круговой хромосомы , и имеет среднюю GC-содержание 31,6%. В нем отсутствуют почти все гены, необходимые для синтеза аминокислот , нуклеотидов , кофакторов и липидов , но он кодирует все, что необходимо для восстановления и репликации. В общей сложности 95% его ДНК кодирует белки или стабильные молекулы РНК.

N. equitans имеет небольшие придатки, выходящие из его круговой структуры. Поверхность ячейки покрыта тонким S -образным слоем в форме решетки , который обеспечивает структуру и защиту всей ячейки.

Геном [ править ]

Mycoplasma genitalium (размером 580 т.п.н., с 515 генами, кодирующими белок) считалась клеточной единицей с наименьшим размером генома до 2003 года, когдабыла секвенирована Nanoarchaeum (491 т.п.

С генетической точки зрения Nanoarchaeum отличается тем, что его последовательность РНК 16S не обнаруживается наиболее распространенными методами. Первоначальное исследование одноцепочечной рибосомной РНК показало, что организм, скорее всего, принадлежит домену архей . Однако, его отличие от существующих фил , эвриархеоты и Crenarchaeota , была так велика , как разница между фил. Поэтому ему был придан собственный тип, названный Nanoarchaeota . Однако другая группа (см. Ссылки) сравнила все открытые рамки считывания с другими археями. Они утверждают, что исходный образец, только рибосомная РНК, был смещен иНа самом деле Nanoarchaeum принадлежит к типу Euryarchaeota. ^[1]

Секвенирование генома наноархей выявило обширную информацию о биологии организма. Гены нескольких жизненно важных метаболических путей отсутствуют. Наноархей не может синтезировать большинство нуклеотидов , аминокислот , липидов и кофакторов . Клетка, скорее всего, получает эти биомолекулы от игникокка . Однако, в отличие от многих паразитических микробов, в наноархее есть множество ферментов репарации ДНК, а также все необходимое для репликации , транскрипции и трансляции ДНК.. Это может объяснить, почему в геноме отсутствуют большие участки некодирующей ДНК, характерные для других паразитов.

Также под вопросом способность организма производить собственный АТФ .

Наноархей не обладает способностью превращать водород и серу в энергию, как это делают многие термофилы. Он имеет пять субъединиц АТФ-синтазы, а также пути окислительного дезаминирования . В настоящее время неизвестно, получает ли он энергию от биологических молекул, импортированных из игникокка , или напрямую получает АТФ. Геном и протеомный состав N. equitans отмечены признаками двойной адаптации - одна к высокой температуре, а другая к облигатному паразитизму (или симбиозу).

См. Также [ править ]

• Археи
• Candidatus Carsonella ruddii , Rickettsia и другие протеобактерии
• Игникокк
• Микоплазма

Ссылки [ править ]

• Хубер, Харальд; и другие. (2002). «Новый тип архей, представленный наноразмерным гипертермофильным симбионтом». Природа . 417 (6884): 63–67. DOI : 10.1038 / 417063a . PMID  11986665 .(Эта статья представляет собой первое открытие наноархея .)
• Уотерс, Элизабет; и другие. (2003). «Геном Nanoarchaeum equitans: понимание ранней эволюции архей и производного паразитизма» . PNAS . 100 (22): 12984–12988. DOI : 10.1073 / pnas.1735403100 . PMC  240731 . PMID  14566062 .(В этой статье описывается последовательность генома Nanoarchaeum .)
• Брошье, Селин; Грибальдо, S; Zivanovic, Y; Confalonieri, F; и другие. (2005). «Наноархеи: представители нового типа архей или быстро развивающейся линии эвриархей, связанных с Thermococcales?» . Геномная биология . 6 (5): R42. DOI : 10.1186 / GB-2005-6-5-R42 . PMC  1175954 . PMID  15892870 .(Недавняя работа, предполагающая, что наноархей не является новым типом архей, а представляет собой тип эвриархей.)
• Дас, Сабьясачи; и другие. (2006). «Анализ генома и протеома Nanoarchaeum equitans: показания для гипертермофильной и паразитарной адаптации» . BMC Genomics . 7 : 186. DOI : 10.1186 / 1471-2164-7-186 . PMC  1574309 . PMID  16869956 .(В этой статье описывается анализ генома и протеома Nanoarchaeum .)

Дальнейшее чтение [ править ]

Ди Джулио, Массимо (1 января 2013 г.). «Является ли Nanoarchaeum equitans палеокариотом?». Журнал биологических исследований .

Внешние ссылки [ править ]

• Страница таксономии NCBI для Nanoarchaeota
• Древо жизни наноархей
• Страница LSPN для Nanoarchaeota ^{[ постоянная мертвая ссылка ]}
• Страница MicrobeWiki для наноархей