Никастрин

NCSTN

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
4UPC , 5A63 , 4UIS , 5FN3 , 5FN4 , 5FN5 , 5FN2 , 2N7R , 2N7Q

Идентификаторы

Псевдонимы

NCSTN , ATAG1874, никастрин

Внешние идентификаторы

OMIM: 605254 MGI: 1891700 HomoloGene: 41029 Генные карты : NCSTN

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 1 (человека) ^[1]

Группа	1q23.2	Начинать	160 343 316 п.н. ^[1]
Группа	1q23.2	Конец	160 358 952 п.н. ^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 1 (мышь) ^[2]

Группа	1 H3 \| 1 79,54 см	Начинать	172 066 013 п.н. ^[2]
Группа	1 H3 \| 1 79,54 см	Конец	172 082 795 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Онтология генов
Молекулярная функция	• активность пептидазы • связывание с белками GO: 0001948 • активность эндопептидазы
Сотовый компонент	• Гольджи • мембрана • фокальной адгезии • меланосомы • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • лизосомальных мембраны • эндоплазматический ретикулум • внеклеточного экзосом • неотъемлемый компонент мембраны • азурофильных гранул мембраны • гамма-секретазы комплекс • цитоплазматических везикул мембраны • цитоплазматический везикулы • цитоплазма • митохондрия • лизосома • ранняя эндосома • синаптический пузырек • эндосомная мембрана • макромолекулярный комплекс • сарколемма • синапс • синаптическая мембрана • неотъемлемый компонент пресинаптической мембраны
Биологический процесс	• Паз сигнальный путь • эфрин рецептора сигнального пути • миелоидной клеточного гомеостаза • процессинг белка • ГО: 0048554 положительное регулирование каталитической активности • метаболический процесс амилоида-бета • пролиферации эпителиальных клеток • протеолиз • Т клеточной пролиферации • мембранный белок эктодомен протеолиз • мембранный белок внутриклеточной протеолиз домена • позитивная регуляция апоптотического процесса • процессинг рецептора Notch • катаболический процесс белка-предшественника амилоида • образование бета- амилоида • процесс метаболизма белка-предшественника амилоида • дегрануляция нейтрофилов • развитие мозжечка • процессинг рецептора Notch, лиганд-зависимый • путь передачи сигнала рецептора дофамина • путь передачи сигнала рецептора глутамата • обучение или память • миелинизация центральной нервной системы • поведение взрослых • белок-предшественник амилоида процесс биосинтеза • позитивная регуляция процесса биосинтеза белка-предшественника амилоида • процесс метаболизма белков в клетке • процесс апоптоза нейрона • гибель нейронов • клеточный ответ на ион кальция • регуляция долгосрочной синаптической потенциации • краткосрочная синаптическая потенциация
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


23385


59287

Ансамбль


ENSG00000162736


ENSMUSG00000003458

UniProt


Q92542


P57716

RefSeq (мРНК)


NM_001290184 NM_001290186 NM_015331 NM_001349729


NM_021607

RefSeq (белок)


NP_001277113 NP_001277115 NP_056146 NP_001336658


NP_067620

Расположение (UCSC)

Chr 1: 160.34 - 160.36 Мб

Chr 1: 172.07 - 172.08 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Nicastrin , также известный как NCSTN , является белком , который в организме человека кодируется NCSTN гена . ^[5]^[6]^[7]

Функция [ править ]

Никастрин (сокращенно NCT) - это белок, который является частью белкового комплекса гамма-секретазы , который является одной из протеаз, участвующих в процессинге белка-предшественника амилоида (АРР) в короткий пептид- амилоид бета, связанный с болезнью Альцгеймера . Другими белками в комплексе являются PSEN1 (пресенилин-1), который является каталитически активным компонентом комплекса, APH-1 (дефектный передний глоток 1) и PEN-2 (усилитель пресенилина 2). ^[8]Сам по себе никастрин не является каталитически активным, но вместо этого способствует созреванию и правильному перемещению других белков в комплексе, каждый из которых претерпевает значительные посттрансляционные модификации, прежде чем стать активным в клетке. ^[9] Никастрин также был идентифицирован как регулятор неприлизина , фермента, участвующего в деградации бета-фрагмента амилоида. ^[10]

История [ править ]

Белок был назван в честь итальянской страны Никастро , что отражает тот факт, что болезнь Альцгеймера была описана в 1963 году после изучения потомков большой семьи, происходящей из страны Никастро, которая болела семейной болезнью Альцгеймера (FAD). ^[11]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что никастрин взаимодействует с PSEN1 ^[12]^[13]^[14]^[15]^[16] и PSEN2 . ^[12]^[16]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000162736 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: Версия Ensembl 89: ENSMUSG00000003458 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Entrez Gene: NCSTN никастрин" .
^ Нагасе Т, Н Секи, Ишикава К, М Охира, Kawarabayasi Y, Охара О, Танака А, Котани Н, Миядзима N, N Номура (октябрь 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток KG-1 и мозга» . Исследования ДНК . 3 (5): 321–9, 341–54. DOI : 10.1093 / dnares / 3.5.321 . PMID 9039502 .
^ Yu G, Nishimura M, Arawaka S, Levitan D, Zhang L, Tandon A, Song YQ, Rogaeva E, Chen F, Kawarai T, Supala A, Levesque L, Yu H, Yang DS, Holmes E, Milman P, Liang Y, Zhang DM, Xu DH, Sato C, Rogaev E, Smith M, Janus C, Zhang Y, Aebersold R, Farrer LS, Sorbi S, Bruni A, Fraser P, St George-Hyslop P (сентябрь 2000 г.). «Никастрин модулирует опосредованную пресенилином передачу сигнала notch / glp-1 и процессинг бетаAPP». Природа . 407 (6800): 48–54. Bibcode : 2000Natur.407 ... 48Y . DOI : 10.1038 / 35024009 . PMID 10993067 . S2CID 4339220 .
^ Kaether C, Хаас C, Steiner H (2006). «Сборка, торговля и функционирование гамма-секретазы» (PDF) . Нейродегенеративные заболевания . 3 (4–5): 275–83. DOI : 10.1159 / 000095267 . PMID 17047368 . S2CID 17324271 .
↑ Zhang YW, Luo WJ, Wang H, Lin P, Vetrivel KS, Liao F, Li F, Wong PC, Farquhar MG, Thinakaran G, Xu H (апрель 2005 г.). «Никастрин имеет решающее значение для стабильности и торговли, но не для ассоциации других компонентов пресенилина / гамма-секретазы» . Журнал биологической химии . 280 (17): 17020–6. DOI : 10.1074 / jbc.M409467200 . PMC 1201533 . PMID 15711015 .
^ Pardossi-Piquard R, Dunys J, Ю.Г., St George-Hyslop P, Алвес да Кошта C, Checler F (май 2006). «Активность и экспрессия неприлизина контролируются никастрином». Журнал нейрохимии . 97 (4): 1052–6. DOI : 10.1111 / j.1471-4159.2006.03822.x . PMID 16606360 .
↑ Feldman RG, Chandler KA, Levy LL, Glaser GH (октябрь 1963 г.). «Семейная болезнь Альцгеймера». Неврология . 13 (10): 811–24. DOI : 10,1212 / wnl.13.10.811 . PMID 14066996 . S2CID 32600780 .
^ a b Yu G, Nishimura M, Arawaka S, Levitan D, Zhang L, Tandon A, Song YQ, Rogaeva E, Chen F, Kawarai T, Supala A, Levesque L, Yu H, Yang DS, Holmes E, Milman P , Лян Ю., Чжан Д.М., Сюй Д.Х., Сато К., Рогаев Э., Смит М., Янус К., Чжан Ю., Эберсолд Р., Фаррер Л.С., Сорби С., Бруни А., Фрейзер П., Сент-Джордж-Хислоп П. (сентябрь 2000 г.). «Никастрин модулирует опосредованную пресенилином передачу сигнала notch / glp-1 и процессинг бетаAPP». Природа . 407 (6800): 48–54. Bibcode : 2000Natur.407 ... 48Y . DOI : 10.1038 / 35024009 . PMID 10993067 . S2CID 4339220 .
^ Хэффнер С, Frauli М, Topp S, Irmler М, Хофман К, Регул JT, Bally-Cuif л, Хаас С (августа 2004 г.). «Никалин и его партнер по связыванию Nomo являются новыми антагонистами передачи сигналов Nodal» . Журнал EMBO . 23 (15): 3041–50. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600307 . PMC 514924 . PMID 15257293 .
^ Baulac S, Lavoie МДж, Кимберли WT, Strahle Дж, Вольф М.С., Selkoe ди - джей, Ся Вт (ноябрь 2003 г.). «Функциональная сборка комплекса гамма-секретазы в сети Гольджи / транс-Гольджи: взаимодействия между пресенилином, никастрином, Aph1, Pen-2 и субстратами гамма-секретазы». Нейробиология болезней . 14 (2): 194–204. CiteSeerX 10.1.1.624.6715 . DOI : 10.1016 / S0969-9961 (03) 00123-2 . PMID 14572442 . S2CID 53205510 .
^ Гу У, Р Чен, Сандзе Н, Kawarai Т, Hasegawa Н, Дьюти М, Ли Вт, Жуань Х, Luthra А, Маунт - НТ, Тандон А, Фрейзер РЕ, St George-Хислоп Р (февраль 2003 г.). «APH-1 взаимодействует со зрелыми и незрелыми формами пресенилинов и никастрина и может играть роль в созревании комплексов пресенилин-никастрин» . Журнал биологической химии . 278 (9): 7374–80. DOI : 10.1074 / jbc.M209499200 . PMID 12471034 .
^ a b Ли С.Ф., Шах С., Ли Х, Ю Ц, Хан У, Ю Г (ноябрь 2002 г.). «APH-1 млекопитающих взаимодействует с пресенилином и никастрином и необходим для внутримембранного протеолиза белка-предшественника бета-амилоида и Notch» . Журнал биологической химии . 277 (47): 45013–9. DOI : 10.1074 / jbc.M208164200 . PMID 12297508 .

Внешние ссылки [ править ]

никастрин + белок в предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000162736 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Версия Ensembl 89: ENSMUSG00000003458 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] "Entrez Gene: NCSTN никастрин" .

[pmid9039502-6] Нагасе Т, Н Секи, Ишикава К, М Охира, Kawarabayasi Y, Охара О, Танака А, Котани Н, Миядзима N, N Номура (октябрь 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток KG-1 и мозга» . Исследования ДНК . 3 (5): 321–9, 341–54. DOI : 10.1093 / dnares / 3.5.321 . PMID 9039502 .

[PMI10993067-7] Yu G, Nishimura M, Arawaka S, Levitan D, Zhang L, Tandon A, Song YQ, Rogaeva E, Chen F, Kawarai T, Supala A, Levesque L, Yu H, Yang DS, Holmes E, Milman P, Liang Y, Zhang DM, Xu DH, Sato C, Rogaev E, Smith M, Janus C, Zhang Y, Aebersold R, Farrer LS, Sorbi S, Bruni A, Fraser P, St George-Hyslop P (сентябрь 2000 г.). «Никастрин модулирует опосредованную пресенилином передачу сигнала notch / glp-1 и процессинг бетаAPP». Природа . 407 (6800): 48–54. Bibcode : 2000Natur.407 ... 48Y . DOI : 10.1038 / 35024009 . PMID 10993067 . S2CID 4339220 .

[pmid17047368-8] Kaether C, Хаас C, Steiner H (2006). «Сборка, торговля и функционирование гамма-секретазы» (PDF) . Нейродегенеративные заболевания . 3 (4–5): 275–83. DOI : 10.1159 / 000095267 . PMID 17047368 . S2CID 17324271 .

[pmid15711015-9] Zhang YW, Luo WJ, Wang H, Lin P, Vetrivel KS, Liao F, Li F, Wong PC, Farquhar MG, Thinakaran G, Xu H (апрель 2005 г.). «Никастрин имеет решающее значение для стабильности и торговли, но не для ассоциации других компонентов пресенилина / гамма-секретазы» . Журнал биологической химии . 280 (17): 17020–6. DOI : 10.1074 / jbc.M409467200 . PMC 1201533 . PMID 15711015 .

[pmid16606360-10] Pardossi-Piquard R, Dunys J, Ю.Г., St George-Hyslop P, Алвес да Кошта C, Checler F (май 2006). «Активность и экспрессия неприлизина контролируются никастрином». Журнал нейрохимии . 97 (4): 1052–6. DOI : 10.1111 / j.1471-4159.2006.03822.x . PMID 16606360 .

[pmid14066996-11] Feldman RG, Chandler KA, Levy LL, Glaser GH (октябрь 1963 г.). «Семейная болезнь Альцгеймера». Неврология . 13 (10): 811–24. DOI : 10,1212 / wnl.13.10.811 . PMID 14066996 . S2CID 32600780 .

[pmid10993067-12] Yu G, Nishimura M, Arawaka S, Levitan D, Zhang L, Tandon A, Song YQ, Rogaeva E, Chen F, Kawarai T, Supala A, Levesque L, Yu H, Yang DS, Holmes E, Milman P , Лян Ю., Чжан Д.М., Сюй Д.Х., Сато К., Рогаев Э., Смит М., Янус К., Чжан Ю., Эберсолд Р., Фаррер Л.С., Сорби С., Бруни А., Фрейзер П., Сент-Джордж-Хислоп П. (сентябрь 2000 г.). «Никастрин модулирует опосредованную пресенилином передачу сигнала notch / glp-1 и процессинг бетаAPP». Природа . 407 (6800): 48–54. Bibcode : 2000Natur.407 ... 48Y . DOI : 10.1038 / 35024009 . PMID 10993067 . S2CID 4339220 .

[pmid15257293-13] Хэффнер С, Frauli М, Topp S, Irmler М, Хофман К, Регул JT, Bally-Cuif л, Хаас С (августа 2004 г.). «Никалин и его партнер по связыванию Nomo являются новыми антагонистами передачи сигналов Nodal» . Журнал EMBO . 23 (15): 3041–50. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600307 . PMC 514924 . PMID 15257293 .

[pmid14572442-14] Baulac S, Lavoie МДж, Кимберли WT, Strahle Дж, Вольф М.С., Selkoe ди - джей, Ся Вт (ноябрь 2003 г.). «Функциональная сборка комплекса гамма-секретазы в сети Гольджи / транс-Гольджи: взаимодействия между пресенилином, никастрином, Aph1, Pen-2 и субстратами гамма-секретазы». Нейробиология болезней . 14 (2): 194–204. CiteSeerX 10.1.1.624.6715 . DOI : 10.1016 / S0969-9961 (03) 00123-2 . PMID 14572442 . S2CID 53205510 .

[pmid12471034-15] Гу У, Р Чен, Сандзе Н, Kawarai Т, Hasegawa Н, Дьюти М, Ли Вт, Жуань Х, Luthra А, Маунт - НТ, Тандон А, Фрейзер РЕ, St George-Хислоп Р (февраль 2003 г.). «APH-1 взаимодействует со зрелыми и незрелыми формами пресенилинов и никастрина и может играть роль в созревании комплексов пресенилин-никастрин» . Журнал биологической химии . 278 (9): 7374–80. DOI : 10.1074 / jbc.M209499200 . PMID 12471034 .

[pmid12297508-16] Ли С.Ф., Шах С., Ли Х, Ю Ц, Хан У, Ю Г (ноябрь 2002 г.). «APH-1 млекопитающих взаимодействует с пресенилином и никастрином и необходим для внутримембранного протеолиза белка-предшественника бета-амилоида и Notch» . Журнал биологической химии . 277 (47): 45013–9. DOI : 10.1074 / jbc.M208164200 . PMID 12297508 .

[1]