Стоп-кодон


В молекулярной биологии (в частности , в биосинтезе белка ) стоп-кодон (или кодон терминации ) представляет собой кодон ( триплет нуклеотидов в матричной РНК ), который сигнализирует об окончании процесса трансляции текущего белка . [1] Большинство кодонов в матричной РНК соответствует добавлению аминокислоты к растущей полипептидной цепи, которая в конечном итоге может стать белком; стоп-кодоны сигнализируют о прекращении этого процесса путем связывания факторов высвобождения , которые вызывают рибосомальноесубъединицы диссоциируют, высвобождая аминокислотную цепь.

В то время как стартовые кодоны нуждаются в соседних последовательностях или факторах инициации, чтобы начать трансляцию, одного стоп-кодона достаточно, чтобы инициировать терминацию.

Существуют вариации стандартного генетического кода , и альтернативные стоп-кодоны были обнаружены в митохондриальных геномах позвоночных , [2] Scenedesmus obliquus , [3] и Thraustochytrium . [4]

Ядерный генетический код является гибким, о чем свидетельствуют варианты генетических кодов, которые переназначают стандартные стоп-кодоны аминокислотам. [5]

В 1986 г. были представлены убедительные доказательства того, что селеноцистеин (Sec) был включен котрансляционно. Более того, кодон, частично направляющий его включение в полипептидную цепь, был идентифицирован как UGA, также известный как терминирующий кодон опала. [6] У прокариот и эукариот были идентифицированы различные механизмы переопределения функции терминации этого кодона. [7] Особое различие между этими царствами заключается в том, что цис-элементы, по-видимому, ограничены соседством с кодоном UAG у прокариот, в то время как у эукариот это ограничение отсутствует. Вместо этого такие места кажутся нежелательными, хотя и не запрещенными. [8]

В 2003 году в знаковой статье описывалась идентификация всех известных селенопротеинов у человека: всего 25. [9] Подобные анализы проводились и для других организмов.


Стоп-кодон (красная точка) гена MT-ATP8 митохондриальной ДНК человека и стартовый кодон (синий кружок) гена MT-ATP6 . Для каждого триплета нуклеотидов (квадратные скобки) указана соответствующая аминокислота (однобуквенный код) либо в рамке +1 для MT-ATP8 (красный), либо в рамке +3 для MT-ATP6 (синий ). ). В этой области генома два гена перекрываются .
Пример делеции одного основания, образующей стоп-кодон.