Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ORC1
Идентификаторы
ПсевдонимыORC1 , HSORC1L, PARC1, субъединица 1 комплекса распознавания происхождения
Внешние идентификаторыOMIM : 601902 MGI : 1328337 HomoloGene : 31221 GeneCards : ORC1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение ORC1
Геномное расположение ORC1
Группа1п32.3Начинать52 372 829 п.н. [1]
Конец52 404 423 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 4 (мышь)
Chr.Хромосома 4 (мышь) [2]
Хромосома 4 (мышь)
Геномное расположение ORC1
Геномное расположение ORC1
Группа4 | 4 C7Начинать108 579 423 п.н. [2]
Конец108 614 833 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE ORC1L 205085 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание ДНК
• нуклеотид связывания
• хроматина связывания
• ГО: 0001948 связывание белка
• АТФ связывания
• репликации ДНК происхождения связывания
• ион металла связывания
Сотовый компонент• ядерный комплекс распознавания репликации
• клеточная мембрана
• ядрышко
• комплекс распознавания ориджина
• ядро клетки
• ядерная хромосома, теломерная область
• нуклеоплазма
• цитозоль
Биологический процесс• Фаза G1
• Репликация ДНК
• Регуляция транскрипции, участвующая в переходе G1 / S митотического клеточного цикла
• Инициирование репликации ДНК
• Переход митотического клеточного цикла G1 / S
• GO: 0007067 митотический клеточный цикл
• Контрольная точка репликации митотической ДНК
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4998

18392

Ансамбль

ENSG00000085840

ENSMUSG00000028587

UniProt

Q13415

Q9Z1N2

RefSeq (мРНК)

NM_001190818
NM_001190819
NM_004153

NM_001014425
NM_011015

RefSeq (белок)

NP_001177747
NP_001177748
NP_004144

NP_035145

Расположение (UCSC)Chr 1: 52.37 - 52,4 МбChr 4: 108,58 - 108,61 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Признание Первый комплекс субъединица 1 представляет собой белок , который у человека кодируется ORC1 гена . [5] [6] Он тесно связан с CDC6 , и оба являются одним и тем же белком у архей . [7]

Функция [ править ]

Комплекс распознавания ориджина (ORC) представляет собой высококонсервативный белковый комплекс из шести субъединиц, необходимый для инициации репликации ДНК в эукариотических клетках. Исследования на дрожжах продемонстрировали, что ORC специфически связывается с источниками репликации и служит платформой для сборки пререпликационного комплекса , который включает дополнительные факторы инициации, такие как белки Cdc6 и Mcm . Белок, кодируемый этим геном, является самой большой субъединицей комплекса распознавания источника. В то время как другие субъединицы ORC стабильны на протяжении клеточного цикла , уровни этого белка меняются в течение клеточного цикла, что, как было показано, контролируется убиквитин-опосредованным протеолизом.после инициации репликации ДНК. Установлено, что этот белок избирательно фосфорилируется во время митоза . Сообщается также, что он взаимодействует с гистонацетилтрансферазой 2 MYST (MYST2 / HBO1), белком, участвующим в контроле подавления транскрипции. [6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что ORC1 взаимодействует с:

  • CDC45-родственный белок [8] и
  • CDC6 , [8] [9]
  • Цикл клеточного деления 7-родственный белок - киназа , [8]
  • Циклинзависимая киназа 2 , [10]
  • MCM2 , [8]
  • MCM4 , [8]
  • MCM6 , [8]
  • MCM7 , [8]
  • MYST2 , [11]
  • ORC2 , [8] [12] [13] [10]
  • ORC4 , [8]
  • ORC5 , [8] и
  • SKP2 . [10]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000085840 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028587 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Эк Т, Okumura К, Амин A, Ishiai М, Эйбы М, Ноги М, Тагучи Н, гурвицева Дж, Мураки Y, Ханаок F (сентябрь 1996). «Картирование человеческого гомолога (ORC1L) гена субъединицы 1 комплекса распознавания дрожжевого происхождения на полосу 1p32 хромосомы». Геномика . 36 (3): 559–61. DOI : 10.1006 / geno.1996.0511 . PMID 8884289 . 
  6. ^ a b «Ген Entrez: комплекс распознавания происхождения ORC1L, субъединица 1-подобная (дрожжи)» .
  7. ^ Ausiannikava, Дарья; Аллерс, Торстен (31 января 2017 г.). «Разнообразие репликации ДНК в архее» . Гены . 8 (2): 56. DOI : 10.3390 / genes8020056 . PMC 5333045 . PMID 28146124 .  
  8. ^ a b c d e f g h i j Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». Журнал молекулярной биологии . 327 (1): 111–28. DOI : 10.1016 / s0022-2836 (03) 00079-2 . PMID 12614612 . 
  9. ^ Saha P, Chen J, Thome KC, Lawlis SJ, Hou ZH, Hendricks M, Parvin JD, Dutta A (май 1998 г.). «CDC6 / Cdc18 человека связывается с Orc1 и циклин-cdk и выборочно удаляется из ядра в начале S-фазы» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2758–67. DOI : 10.1128 / mcb.18.5.2758 . PMC 110655 . PMID 9566895 .  
  10. ^ a b c Méndez J, Zou-Yang XH, Kim SY, Hidaka M, Tansey WP, Stillman B (март 2002 г.). «Большая субъединица комплекса распознавания происхождения человека разлагается убиквитин-опосредованным протеолизом после инициации репликации ДНК». Молекулярная клетка . 9 (3): 481–91. DOI : 10.1016 / s1097-2765 (02) 00467-7 . PMID 11931757 . 
  11. ↑ Iizuka M, Stillman B (август 1999). «Гистонацетилтрансфераза HBO1 взаимодействует с субъединицей ORC1 человеческого белка-инициатора» . Журнал биологической химии . 274 (33): 23027–34. DOI : 10.1074 / jbc.274.33.23027 . PMID 10438470 . 
  12. ^ Фуджита М, Ishimi Y, Накамура Н, Kiyono Т, Tsurumi Т (март 2002). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих» . Журнал биологической химии . 277 (12): 10354–61. DOI : 10.1074 / jbc.M111398200 . PMID 11779870 . 
  13. ^ Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Келли TJ (июль 2001). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека» . Журнал биологической химии . 276 (28): 26666–73. DOI : 10.1074 / jbc.M102493200 . PMID 11323433 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Гэвин К.А., Хидака М., Стиллман Б. (декабрь 1995 г.). «Консервативные белки-инициаторы у эукариот». Наука . 270 (5242): 1667–71. Bibcode : 1995Sci ... 270.1667G . DOI : 10.1126 / science.270.5242.1667 . PMID  7502077 . S2CID  43633493 .
  • Охтани К., ДеГрегори Дж., Леоне Дж., Херендин Д. Р., Келли Т. Дж., Невинс Дж. Р. (декабрь 1996 г.). «Экспрессия гена HsOrc1, гомолога ORC1 человека, регулируется пролиферацией клеток через фактор транскрипции E2F» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (12): 6977–84. DOI : 10.1128 / mcb.16.12.6977 . PMC  231701 . PMID  8943353 .
  • Саха П., Чен Дж., Том К.С., Лоулис С.Дж., Хоу Ж.Х., Хендрикс М., Парвин Дж. Д., Датта А. (май 1998 г.). «CDC6 / Cdc18 человека связывается с Orc1 и циклин-cdk и выборочно удаляется из ядра в начале S-фазы» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2758–67. DOI : 10.1128 / mcb.18.5.2758 . PMC  110655 . PMID  9566895 .
  • Иидзука М., Стиллман Б. (август 1999 г.). «Гистонацетилтрансфераза HBO1 взаимодействует с субъединицей ORC1 человеческого белка-инициатора» . Журнал биологической химии . 274 (33): 23027–34. DOI : 10.1074 / jbc.274.33.23027 . PMID  10438470 .
  • Цзян В., Макдональд Д., Хоуп Т.Дж., Хантер Т. (октябрь 1999 г.). «Комплекс протеинкиназы Cdc7-Dbf4 млекопитающих необходим для инициации репликации ДНК» . Журнал EMBO . 18 (20): 5703–13. DOI : 10.1093 / emboj / 18.20.5703 . PMC  1171637 . PMID  10523313 .
  • Тацуми Ю., Цуримото Т., Сирахиге К., Йошикава Х., Обусе С. (февраль 2000 г.). «Ассоциация комплекса распознавания 1 человеческого происхождения с ДНК хроматина и ядерными структурами, устойчивыми к нуклеазам» . Журнал биологической химии . 275 (8): 5904–10. DOI : 10.1074 / jbc.275.8.5904 . PMID  10681582 .
  • Том К.С., Дхар С.К., Кинтана Д.Г., Дельмолино Л., Шахсафаэй А., Датта А. (ноябрь 2000 г.). «Подмножества субъединиц комплекса распознавания происхождения человека (ORC) экспрессируются в непролиферирующих клетках и связываются с белками, не являющимися ORC» . Журнал биологической химии . 275 (45): 35233–41. DOI : 10.1074 / jbc.M005765200 . PMID  10954718 .
  • Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (июль 2001 г.). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека» . Журнал биологической химии . 276 (28): 26666–73. DOI : 10.1074 / jbc.M102493200 . PMID  11323433 .
  • Ламан Х., Питерс Дж., Джонс Н. (декабрь 2001 г.). «Циклин-опосредованный экспорт человеческого Orc1». Экспериментальные исследования клеток . 271 (2): 230–7. DOI : 10.1006 / excr.2001.5360 . PMID  11716535 .
  • Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T., Tsurumi T. (март 2002 г.). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих» . Журнал биологической химии . 277 (12): 10354–61. DOI : 10.1074 / jbc.M111398200 . PMID  11779870 .
  • Ладенбургер Э.М., Келлер С., Книпперс Р. (февраль 2002 г.). «Идентификация области связывания для белков 1 и 2 комплекса распознавания происхождения человека, которая совпадает с точкой начала репликации ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (4): 1036–48. DOI : 10.1128 / MCB.22.4.1036-1048.2002 . PMC  134626 . PMID  11809796 .
  • Мендес Дж., Зоу-Ян XH, Ким С.И., Хидака М., Танси В.П., Стиллман Б. (март 2002 г.). «Большая субъединица комплекса распознавания происхождения человека разлагается убиквитин-опосредованным протеолизом после инициации репликации ДНК». Молекулярная клетка . 9 (3): 481–91. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (02) 00467-7 . PMID  11931757 .
  • Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». Журнал молекулярной биологии . 327 (1): 111–28. DOI : 10.1016 / S0022-2836 (03) 00079-2 . PMID  12614612 .
  • Охта С., Тацуми Ю., Фудзита М., Цуримото Т., Обусе С. (октябрь 2003 г.). «Цикл ORC1 в клетках человека: II. Динамические изменения в комплексе ORC человека во время клеточного цикла» . Журнал биологической химии . 278 (42): 41535–40. DOI : 10.1074 / jbc.M307535200 . PMID  12909626 .
  • Тацуми Ю., Охта С., Кимура Х, Цуримото Т., Обусе С. (октябрь 2003 г.). «Цикл ORC1 в клетках человека: I. Регулируемые клеточным циклом колебания ORC1 человека» . Журнал биологической химии . 278 (42): 41528–34. DOI : 10.1074 / jbc.M307534200 . PMID  12909627 .
  • Абдурашидова Г., Данаилов М.Б., Очем А., Триоло Г., Джелиова В., Радулеску С., Виндини А., Рива С., Фаласки А. (август 2003 г.). «Локализация белков, связанных с источником репликации ДНК человека в клеточном цикле» . Журнал EMBO . 22 (16): 4294–303. DOI : 10,1093 / emboj / cdg404 . PMC  175794 . PMID  12912926 .
  • Рамачандран Н., Хейнсворт Э., Бхуллар Б., Эйзенштейн С., Розен Б., Лау А.Ю., Уолтер Дж. К., Лабер Дж. (Июль 2004 г.). «Самособирающиеся белковые микрочипы» . Наука . 305 (5680): 86–90. Bibcode : 2004Sci ... 305 ... 86R . DOI : 10.1126 / science.1097639 . PMID  15232106 . S2CID  20936301 .
  • Lidonnici MR, Rossi R, Paixão S, Mendoza-Maldonado R, Paolinelli R, Arcangeli C, Giacca M, Biamonti G, Montecucco A (октябрь 2004 г.). «Субъядерное распределение самой большой субъединицы комплекса распознавания происхождения человека во время клеточного цикла» . Журнал клеточной науки . 117 (Pt 22): 5221–31. DOI : 10,1242 / jcs.01405 . PMID  15454574 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q13415 (субъединица 1 комплекса распознавания происхождения человека) в PDBe-KB .
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9Z1N2 (субъединица 1 комплекса распознавания происхождения мыши) в PDBe-KB .