Признание Первый комплекс субъединица 2 представляет собой белок , который кодируется ORC2 (ORC2L) гена в организме человека. [5] [6]
ORC2 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | ORC2 , ORC2L, субъединица 2 комплекса распознавания происхождения | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 601182 MGI : 1328306 HomoloGene : 4512 GeneCards : ORC2 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 2: 200.91 - 200.96 Мб | Chr 1: 58.46 - 58.51 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Субъединица 2 комплекса распознавания происхождения | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
Символ | ORC2 | |||||||
Pfam | PF04084 | |||||||
ИнтерПро | IPR007220 | |||||||
|
Функция
Комплекс распознавания ориджина (ORC) представляет собой высококонсервативный белковый комплекс из шести субъединиц, необходимый для инициации репликации ДНК в эукариотических клетках. Исследования на дрожжах показали, что ORC специфически связывается с источниками репликации и служит платформой для сборки дополнительных факторов инициации, таких как белки Cdc6 и Mcm. Белок, кодируемый этим геном, является субъединицей комплекса ORC. Этот белок образует сердцевинный комплекс с ORC3 , ORC4 и ORC5 . Он также взаимодействует с CDC45L и MCM10, белками, которые, как известно, важны для инициации репликации ДНК. Было продемонстрировано, что этот белок специфически связывается с источником репликации вируса Эпштейна-Барра в клетках человека и считается необходимым для репликации ДНК из вирусного источника репликации. [6]
Взаимодействия
Было показано, что ORC2 взаимодействует с:
- CDC6 , [7] [8]
- DBF4 , [7]
- MCM10 , [9]
- MCM2 [7]
- MCM4 , [7]
- MCM5 , [7]
- MCM6 , [7]
- MCM7 , [7]
- ORC1 , [7] [10] [11] [12]
- ORC3 , [7] [11] [13] [14] [15]
- ORC4 , [7] [11] [13] [16]
- ORC5 , [7] [11] [13] [17]
- ORC6 , [7] [11] и
- Белок репликации А1 . [7]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000115942 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026037 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Takahara K, Bong M, Brevard R, Eddy RL, Haley LL, Sait SJ, Shows TB, Hoffman GG, Greenspan DS (октябрь 1996 г.). «Мышиные и человеческие гомологи дрожжевого ориджина репликационного комплекса распознавания субъединицы ORC2 и хромосомная локализация родственного человеческого гена ORC2L». Геномика . 31 (1): 119–122. DOI : 10.1006 / geno.1996.0018 . PMID 8808289 .
- ^ а б «Ген Entrez: комплекс распознавания происхождения ORC2L, субъединица 2-подобная (дрожжи)» .
- ^ Б с д е е г ч я J к л м Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Биол . 327 (1): 111–28. DOI : 10.1016 / s0022-2836 (03) 00079-2 . PMID 12614612 .
- ^ Мендес Дж, Стиллман Б. (ноябрь 2000 г.). «Ассоциация хроматина человеческого комплекса распознавания происхождения, cdc6 и поддерживающих белков минихромосом во время клеточного цикла: сборка пререпликационных комплексов в позднем митозе» . Мол. Клетка. Биол . 20 (22): 8602–12. DOI : 10.1128 / mcb.20.22.8602-8612.2000 . PMC 102165 . PMID 11046155 .
- ^ Идзуми М., Янаги К., Мизуно Т., Йокои М., Кавасаки И., Мун К.Ю., Гурвиц Дж., Ятагай Ф., Ханаока Ф. (декабрь 2000 г.). «Человеческий гомолог Saccharomyces cerevisiae Mcm10 взаимодействует с факторами репликации и диссоциирует от ядерных структур, устойчивых к нуклеазам, в фазе G (2)» . Nucleic Acids Res . 28 (23): 4769–77. DOI : 10.1093 / NAR / 28.23.4769 . PMC 115166 . PMID 11095689 .
- ^ Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T., Tsurumi T. (март 2002 г.). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих» . J. Biol. Chem . 277 (12): 10354–61. DOI : 10.1074 / jbc.M111398200 . PMID 11779870 .
- ^ а б в г д Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (июль 2001 г.). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека» . J. Biol. Chem . 276 (28): 26666–73. DOI : 10.1074 / jbc.M102493200 . PMID 11323433 .
- ^ Мендес Дж., Зоу-Ян XH, Ким С.И., Хидака М., Танси В.П., Стиллман Б. (март 2002 г.). «Большая субъединица комплекса распознавания происхождения человека разлагается убиквитин-опосредованным протеолизом после инициации репликации ДНК». Мол. Cell . 9 (3): 481–91. DOI : 10.1016 / s1097-2765 (02) 00467-7 . PMID 11931757 .
- ^ а б в Дхар С.К., Дельмолино Л., Датта А. (август 2001 г.). «Архитектура комплекса распознавания происхождения человека» . J. Biol. Chem . 276 (31): 29067–71. DOI : 10.1074 / jbc.M103078200 . PMID 11395502 .
- ^ Мацуока С., Баллиф Б.А., Смогоржевска А., Макдональд Э.Р., Хуров К.Э., Луо Дж., Бакаларски К.Э., Чжао З., Солимини Н., Леренталь Ю., Шайло И., Гиги С.П., Элледж С.Дж. (май 2007 г.). «Анализ субстрата ATM и ATR выявляет обширные белковые сети, реагирующие на повреждение ДНК». Наука . 316 (5828): 1160–6. DOI : 10.1126 / science.1140321 . PMID 17525332 . S2CID 16648052 .
- ^ Пинто С., Кинтана Д.Г., Смит П., Михалек Р.М., Хоу Ж.Х., Бойнтон С., Джонс С.Дж., Хендрикс М., Велинзон К., Вольшлегель Д.А., Остин Р.Дж., Лейн В.С., Талли Т., Датта А. (май 1999 г.). «latheo кодирует субъединицу комплекса распознавания источника и нарушает пролиферацию нейронов и обонятельную память взрослых при мутанте». Нейрон . 23 (1): 45–54. DOI : 10.1016 / s0896-6273 (00) 80752-7 . PMID 10402192 . S2CID 781511 .
- ^ Quintana DG, Hou Zh, Thome KC, Hendricks M, Saha P, Dutta A (ноябрь 1997 г.). «Идентификация HsORC4, члена комплекса распознавания репликации человека» . J. Biol. Chem . 272 (45): 28247–51. DOI : 10.1074 / jbc.272.45.28247 . PMID 9353276 .
- ^ Quintana DG, Thome KC, Hou Zh, Ligon AH, Morton CC, Dutta A (октябрь 1998 г.). «ORC5L, новый член комплекса распознавания происхождения человека, удаляется при лейомиоме матки и злокачественных миелоидных заболеваниях» . J. Biol. Chem . 273 (42): 27137–45. DOI : 10.1074 / jbc.273.42.27137 . PMID 9765232 .
дальнейшее чтение
- Гэвин К.А., Хидака М., Стилман Б. (1996). «Консервативные белки-инициаторы у эукариот». Наука . 270 (5242): 1667–1671. DOI : 10.1126 / science.270.5242.1667 . PMID 7502077 . S2CID 43633493 .
- Саха П., Томе К.С., Ямагути Р., Хоу З., Веремович С., Датта А. (1998). «Человеческий гомолог Saccharomyces cerevisiae CDC45» . J. Biol. Chem . 273 (29): 18205–18209. DOI : 10.1074 / jbc.273.29.18205 . PMID 9660782 .
- Ритци М., Баак М., Мусал С., Романовски П., Ласки Р.А., Книпперс Р. (1998). «Поддерживающие белки минихромосомы человека и белок 2 комплекса распознавания происхождения человека на хроматине» . J. Biol. Chem . 273 (38): 24543–24549. DOI : 10.1074 / jbc.273.38.24543 . PMID 9733749 .
- Пинто С., Кинтана Д.Г., Смит П., Михалек Р.М., Хоу Ж.Х., Бойнтон С., Джонс С.Дж., Хендрикс М., Велинзон К., Вольшлегель Д.А., Остин Р.Дж., Лейн В.С., Талли Т., Датта А. (1999). «latheo кодирует субъединицу комплекса распознавания источника и нарушает пролиферацию нейронов и обонятельную память взрослых при мутанте». Нейрон . 23 (1): 45–54. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (00) 80752-7 . PMID 10402192 . S2CID 781511 .
- Цзян В., Макдональд Д., Хоуп Т.Дж., Хантер Т. (1999). «Комплекс протеинкиназы Cdc7-Dbf4 млекопитающих необходим для инициации репликации ДНК» . EMBO J . 18 (20): 5703–5713. DOI : 10.1093 / emboj / 18.20.5703 . PMC 1171637 . PMID 10523313 .
- Натале Д.А., Ли СиДжей, Сан WH, DePamphilis ML (2000). «Избирательная нестабильность белка Orc1 объясняет отсутствие комплексов распознавания функционального происхождения во время перехода MG (1) у млекопитающих» . EMBO J . 19 (11): 2728–2738. DOI : 10.1093 / emboj / 19.11.2728 . PMC 212765 . PMID 10835370 .
- Томе К.С., Дхар С.К., Кинтана Д.Г., Дельмолино Л., Шахсафаэй А., Датта А. (2001). «Подмножества субъединиц комплекса распознавания происхождения человека (ORC) экспрессируются в непролиферирующих клетках и связываются с белками, не являющимися ORC» . J. Biol. Chem . 275 (45): 35233–35241. DOI : 10.1074 / jbc.M005765200 . PMID 10954718 .
- Идзуми М., Янаги К., Мизуно Т., Йокои М., Кавасаки Ю., Мун К.Ю., Гурвиц Дж., Ятагай Ф., Ханаока Ф. (2001). «Человеческий гомолог Saccharomyces cerevisiae Mcm10 взаимодействует с факторами репликации и диссоциирует от ядерных структур, устойчивых к нуклеазам, в фазе G (2)» . Nucleic Acids Res . 28 (23): 4769–4777. DOI : 10.1093 / NAR / 28.23.4769 . PMC 115166 . PMID 11095689 .
- Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (2001). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека» . J. Biol. Chem . 276 (28): 26666–26673. DOI : 10.1074 / jbc.M102493200 . PMID 11323433 .
- Дхар С.К., Дельмолино Л., Датта А. (2001). «Архитектура комплекса распознавания происхождения человека» . J. Biol. Chem . 276 (31): 29067–29071. DOI : 10.1074 / jbc.M103078200 . PMID 11395502 .
- Дхар С.К., Йошида К., Мачида Ю., Хайра П., Чаудхури Б., Вольшлегель Дж. А., Леффак М., Йейтс Дж., Датта А. (2001). «Репликация вируса Эпштейна-Барра с oriP требует ORC человека и ингибируется геминином». Cell . 106 (3): 287–296. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00458-5 . PMID 11509178 . S2CID 12479646 .
- Идзуми М, Ятагай Ф, Ханаока Ф (2002). «Зависимый от клеточного цикла протеолиз и фосфорилирование человеческого Mcm10» . J. Biol. Chem . 276 (51): 48526–31. DOI : 10.1074 / jbc.M107190200 . PMID 11602595 .
- Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T, Tsurumi T. (2002). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих» . J. Biol. Chem . 277 (12): 10354–10361. DOI : 10.1074 / jbc.M111398200 . PMID 11779870 .
- Schaarschmidt D, Ladenburger EM, Keller C, Knippers R (2002). «Белки Mcm человека в начале репликации во время фазового перехода G1 в S» . Nucleic Acids Res . 30 (19): 4176–4185. DOI : 10.1093 / NAR / gkf532 . PMC 140533 . PMID 12364596 .
- Matheos D, Ruiz MT, Price GB, Zannis-Hadjopoulos M (2002). «Ku-антиген, ориджин-специфический связывающий белок, который связывается с белками репликации, необходим для репликации ДНК млекопитающих». Биохим. Биофиз. Acta . 1578 (1–3): 59–72. DOI : 10.1016 / S0167-4781 (02) 00497-9 . PMID 12393188 .
- Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (2003). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Биол . 327 (1): 111–128. DOI : 10.1016 / S0022-2836 (03) 00079-2 . PMID 12614612 .
Внешние ссылки
- PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для субъединицы 2 комплекса распознавания происхождения человека (ORC2).