• цитоплазма • цитозоль • комплекс регулятора транскрипции • нуклеоплазма • ядро клетки • митохондрия
Биологический процесс
• регуляция транскрипции на основе ДНК • поддержание популяции соматических стволовых клеток • негативная регуляция молчания генов с помощью миРНК • коммит клеточной судьбы, участвующий в формировании первичного зародышевого листка • спецификация судьбы энтодермальных клеток • морфогенез анатомической структуры • транскрипция мРНК с промотора РНК-полимеразы II • регуляция асимметричного деления клеток • негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция зависимого от метилирования молчания хроматина • развитие многоклеточных организмов • определение судьбы сердечных клеток • ответ на ранение • сигнальный путь BMP, участвующий в индукции сердца • регуляция экспрессии гена • регуляция сердечной индукции посредством регуляции канонического сигнального пути Wnt • развитие бластоцисты • положительный результат регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • позитивная регуляция импорта белка SMAD в ядро
Окт-4 ( октамеры -связывающего фактора транскрипции 4), также известный как POU5F1 ( домен POU , класс 5, фактор транскрипции , 1), представляет собой белка , который у человека кодируется POU5F1 геном . [5] Oct-4 представляет собой фактор транскрипции гомеодомена семейства POU . Он критически участвует в самообновлении недифференцированных эмбриональных стволовых клеток . [6] Как таковой, он часто используется в качестве маркера недифференцированных клеток. Экспрессия Oct-4 должна строго регулироваться; слишком много или слишком мало вызовет дифференциацию клеток.[7]
Связывающий октамер фактор транскрипции 4, OCT-4, представляет собой белок фактора транскрипции, который кодируется геном Pou5f1 и является частью семейства POU (Pit-Oct-Unc). [8] OCT-4 состоит из мотива октамера, определенной последовательности ДНК AGTCAAAT, которая связывается с их генами-мишенями и активирует или деактивирует определенные выражения. Эти экспрессии генов затем приводят к фенотипическим изменениям дифференцировки стволовых клеток во время развития эмбриона млекопитающего. [9] Он играет жизненно важную роль в определении судьбы как внутренних массовых клеток, так и эмбриональных стволовых клеток и обладает способностью поддерживать плюрипотентность на протяжении всего эмбрионального развития. [10]Недавно было отмечено, что OCT-4 не только поддерживает плюрипотентность в эмбриональных клетках, но также обладает способностью регулировать пролиферацию раковых клеток и может быть обнаружен при различных раковых заболеваниях, таких как опухоли поджелудочной железы, легких, печени и семенников в половых клетках взрослых. . [11] Другой дефект, который может иметь этот ген, - диспластический рост в эпителиальных тканях, который вызван нехваткой OCT-4 в эпителиальных клетках. [12]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Выражение и функция
2 Ортолога
3 Структура
4 Последствия болезни
5 Плюрипотентность в развитии эмбриона
5.1 Модель животных
6 Роль в перепрограммировании
7 В эмбриональных стволовых клетках
8 Во взрослых стволовых клетках
9 См. Также
10 Ссылки
11 Дальнейшее чтение
12 Внешние ссылки
Выражение и функция [ править ]
Фактор транскрипции Oct-4 изначально активен как материнский фактор в ооците и остается активным в эмбрионах на протяжении всего доимплантационного периода. Экспрессия Oct-4 связана с недифференцированным фенотипом и опухолями. [13] Нокдаун гена Oct-4 способствует дифференцировке , демонстрируя роль этих факторов в самообновлении эмбриональных стволовых клеток человека. [14] Oct-4 может образовывать гетеродимер с Sox2 , так что эти два белка связывают ДНК вместе. [15]
Эмбрионы мышей с дефицитом Oct-4 или низкими уровнями экспрессии Oct-4 неспособны формировать внутреннюю клеточную массу , теряют плюрипотентность и дифференцируются в трофэктодерму . Следовательно, уровень экспрессии Oct-4 у мышей жизненно важен для регуляции плюрипотентности и ранней дифференцировки клеток, так как одна из его основных функций - удерживать эмбрион от дифференцировки.
ДНК-связывающие домены, участвующие в регуляции транскрипции ключевых процессов развития эукариот; может связываться с ДНК как мономеры или как гомодимеры и / или гетеродимеры специфическим для последовательности образом.
59
Последствия болезни [ править ]
Oct-4 участвует в онкогенезе взрослых половых клеток. Было обнаружено, что эктопическая экспрессия фактора у взрослых мышей вызывает образование диспластических поражений кожи и кишечника. Дисплазия кишечника возникла в результате увеличения популяции клеток-предшественников и усиления транскрипции β-катенина за счет ингибирования клеточной дифференцировки. [16]
Плюрипотентность в развитии эмбриона [ править ]
Модель животного [ править ]
В 2000 году Нива и др. использовали условную экспрессию и репрессию в мышиных эмбриональных стволовых клетках для определения потребности в Oct-4 для поддержания способности к развитию. [7] Хотя определение транскрипции часто рассматривается как бинарная система контроля включения-выключения, они обнаружили, что точный уровень Oct-4 управляет 3 различными судьбами ES-клеток. Увеличение экспрессии менее чем в 2 раза вызывает дифференцировку в примитивную энтодерму.и мезодерма. Напротив, репрессия Oct-4 вызывает потерю плюрипотентности и дедифференцировку трофэктодермы. Таким образом, критическое количество Oct-4 необходимо для поддержания самообновления стволовых клеток, а повышающая или понижающая регуляция индуцирует дивергентные программы развития. Изменения уровней Oct-4 независимо не способствуют дифференцировке, но также контролируются уровнями Sox2 . Снижение Sox2 сопровождает повышенные уровни Oct-4, чтобы способствовать мезэндодермальной судьбе, при этом Oct-4 активно ингибирует эктодермальную дифференцировку. Подавленные уровни Oct-4, которые приводят к эктодермальной дифференцировке, сопровождаются увеличением Sox2, который эффективно ингибирует мезэндодермальную дифференцировку. [17] Нива и др. предположили, что их выводы установили роль 4 октября какглавный регулятор плюрипотентности, который контролирует преданность клонов и иллюстрирует сложность критических регуляторов транскрипции и, как следствие, важность количественного анализа.
Факторы транскрипции Oct-4, Sox2 и Nanog являются частью сложной регуляторной сети с Oct-4 и Sox2, способной напрямую регулировать Nanog путем связывания с его промотором, и необходимы для поддержания самообновляющегося недифференцированного состояния внутренней клеточной массы. бластоцисты, линии эмбриональных стволовых клеток [18] (которые являются клеточными линиями, происходящими из внутренней клеточной массы) и индуцированные плюрипотентные стволовые клетки. [15] В то время как дифференциальная повышающая и понижающая регуляция Oct-4 и Sox2, как было показано, способствует дифференцировке, понижающая регуляция Nanog должна происходить для продолжения дифференцировки. [17]
Роль в перепрограммировании [ править ]
Oct-4 является одним из факторов транскрипции, используемых для создания индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК), вместе с Sox2 , Klf4 и часто c- Myc (OSKM) у мышей [19] [20] [21], демонстрируя его способность индуцировать состояние, подобное эмбриональным стволовым клеткам. Эти факторы часто называют « факторами перепрограммирования Яманаки ». Этот эффект перепрограммирования также был замечен с факторами перепрограммирования Томсона , превращающими человеческие фибробластные клетки в ИПСК через Oct-4, наряду с Sox2, Nanog и Lin28 . Использование факторов репрограммирования Томсона позволяет избежать избыточной экспрессии онкогена c-Myc.[22] Позже было установлено, что только двух из этих четырех факторов, Oct4 и Klf4, было достаточно для репрограммирования нейральных стволовых клеток взрослых мышей. [23] Наконец, было показано, что для этого преобразования достаточно одного фактора, Oct-4. [24] Более того, в то время как Sox2, Klf4 и cMyc могут быть заменены соответствующими членами их семей, более близкие родственники Oct4, Oct1 и Oct6 , не способны индуцировать плюрипотентность, тем самым демонстрируя исключительность Oct4 среди факторов транскрипции POU. [25]Однако позже было показано, что Oct4 можно полностью исключить из коктейля Yamanaka, а оставшиеся три фактора, Sox2, Klf4 и cMyc (SKM) могут генерировать iPSC мыши с резко увеличенным потенциалом развития. [26] Это говорит о том, что Oct4 увеличивает эффективность перепрограммирования, но снижает качество получаемых ИПСК.
В эмбриональных стволовых клетках [ править ]
В экспериментах in vitro с эмбриональными стволовыми клетками мыши Oct-4 часто использовался в качестве маркера стволовости, поскольку дифференцированные клетки демонстрируют пониженную экспрессию этого маркера.
Oct3 / 4 может одновременно репрессируют и активировать промотор из Rex1 . В клетках, которые уже экспрессируют высокий уровень Oct3 / 4, экзогенно трансфицированный Oct3 / 4 приведет к репрессии Rex1. [27] Однако в клетках, которые активно не экспрессируют Oct3 / 4, экзогенная трансфекция Oct3 / 4 приведет к активации Rex1. [27] Это подразумевает двойную регулирующую способность Oct3 / 4 на Rex1. При низких уровнях белка Oct3 / 4 активируется промотор Rex1, в то время как при высоких уровнях белка Oct3 / 4 промотор Rex1 репрессируется.
Oct4 способствует быстрому клеточному циклу ЭСК, способствуя прохождению через фазу G1 , в частности, посредством ингибирования транскрипции ингибиторов циклин-зависимой киназы , таких как p21 . [28]
Нокаут CRISPR-Cas9 гена в эмбриональных стволовых клетках человека продемонстрировал, что Oct-4 необходим для развития после оплодотворения. [29]
Во взрослых стволовых клетках [ править ]
Несколько исследований предполагают роль Oct-4 в поддержании способности к самообновлению взрослых соматических стволовых клеток (т.е. стволовых клеток эпителия, костного мозга, печени и т. Д.). [30] Другие ученые представили доказательства обратного [31] и отвергают эти исследования как артефакты культивирования in vitro или интерпретируют фоновый шум как сигнал [32] и предупреждают о псевдогенах Oct-4, дающих ложное обнаружение Oct-4. выражение. [33]
Oct-4 также считается маркером раковых стволовых клеток . [34] [35]
См. Также [ править ]
Усилитель
Гистон
Прибновый ящик
РНК-полимераза
Сеть регулирования генов
Ссылки [ править ]
^ Б с ENSG00000206454, ENSG00000204531, ENSG00000237582, ENSG00000229094, ENSG00000233911, ENSG00000235068 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000230336, ENSG00000206454, ENSG00000204531, ENSG00000237582, ENSG00000229094, ENSG00000233911, ENSG00000235068 - Ensembl , май 2017
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024406 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
Перейти ↑ Takeda J, Seino S, Bell GI (сентябрь 1992 г.). «Семейство генов Oct3 человека: последовательности кДНК, альтернативный сплайсинг, организация генов, хромосомная локализация и экспрессия на низких уровнях во взрослых тканях» . Исследования нуклеиновых кислот . 20 (17): 4613–20. DOI : 10.1093 / NAR / 20.17.4613 . PMC 334192 . PMID 1408763 .
^ Молодые Lab- Ядро транскрипционный регуляторный Схемотехника в эмбриональных стволовых клеток человека Архивные 2009-06-28 в Wayback Machine в MIT
^ a b Нива Х., Миядзаки Дж., Смит АГ (апрель 2000 г.). «Количественная экспрессия Oct-3/4 определяет дифференцировку, дедифференцировку или самообновление ES-клеток». Генетика природы . 24 (4): 372–6. DOI : 10.1038 / 74199 . PMID 10742100 . S2CID 33012290 .
^ Зайнеддин, Дана и др. «Белок Oct4: больше, чем волшебный маркер стволовости». Американский журнал стволовых клеток, том. 3,2 74-82. 5 сентября 2014 г.
^ Пан, Гуан Цзинь и др. «Плюрипотентность стволовых клеток и фактор транскрипции Oct4». Cell Research, vol. 12, вып. 5-6, декабрь 2002 г., стр. 321–329., DOI: 10.1038 / sj.cr.7290134.
^ Ву, Гуанмин и Ханс Р. Шёлер. «Роль Oct4 в раннем развитии эмбриона». Регенерация клеток, т. 3, вып. 1, 2014 г., DOI: 10.1186 / 2045-9769-3-7.
^ Саха, Субброто Кумар и др. «Систематический анализ изменения экспрессии главного фактора репрограммирования OCT4 и трех его псевдогенов при раке человека и их прогностических исходов». Научные отчеты об. 8,1 14806. 4 октября 2018 г., DOI: 10.1038 / s41598-018-33094-7
^ Hochedlinger, Konrad et al. «Эктопическая экспрессия Oct-4 блокирует дифференцировку клеток-предшественников и вызывает дисплазию в эпителиальных тканях». Cell vol. 121,3 (2005): 465-77. DOI: 10.1016 / j.cell.2005.02.018
^ Лойенги LH, Stoop Н де Леу HP, де Gouveia Brazão CA, Гиллис AJ, ван Roozendaal К.Е., ван Zoelen EJ, Вебер РФ, Wolffenbuttel КП, ван Dekken H, Хонеккер F, Bokemeyer C, Перлман EJ, Schneider DT, Kononen J, Sauter G, Oosterhuis JW (май 2003 г.). «POU5F1 (OCT3 / 4) идентифицирует клетки с плюрипотентным потенциалом в опухолях человеческих половых клеток». Исследования рака . 63 (9): 2244–50. PMID 12727846 .
^ a b Rodda DJ, Chew JL, Lim LH, Loh YH, Wang B, Ng HH, Robson P (июль 2005 г.). «Транскрипционная регуляция nanog с помощью OCT4 и SOX2» . Журнал биологической химии . 280 (26): 24731–7. DOI : 10.1074 / jbc.M502573200 . PMID 15860457 .
^ Hochedlinger K, Ямада Y, Борода C, Йениш R (май 2005). «Эктопическая экспрессия Oct-4 блокирует дифференцировку клеток-предшественников и вызывает дисплазию в эпителиальных тканях». Cell . 121 (3): 465–77. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.02.018 . PMID 15882627 . S2CID 1913872 .
^ a b Томсон М., Лю С.Дж., Цзоу Л.Н., Смит З., Мейснер А., Раманатан С. (июнь 2011 г.). «Факторы плюрипотентности в эмбриональных стволовых клетках регулируют дифференцировку в зародышевые листы» . Cell . 145 (6): 875–89. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.05.017 . PMC 5603300 . PMID 21663792 .
^ HEURTIER В., Оуэнс, Н. Гонсалес, И.др. Молекулярная логика Nanog-индуцированного самообновления в эмбриональных стволовых клетках мыши. Нац Коммуна 10, 1109 (2019). https://doi.org/10.1038/s41467-019-09041-z
^ Верниг М, мейсснеровский А, Бригадир Р, Т Brambrink, Ка - М, Hochedlinger К, Бернштейн BE, Йениш R (июль 2007 г.). «Перепрограммирование фибробластов in vitro в плюрипотентное состояние, подобное ES-клеткам». Природа . 448 (7151): 318–24. Bibcode : 2007Natur.448..318W . DOI : 10,1038 / природа05944 . PMID 17554336 . S2CID 4377572 .
^ Махерали Н., Шридхаран Р., Се В., Утикал Дж., Эминли С., Арнольд К., Штадтфельд М., Ячечко Р., Чье Дж., Яениш Р., Плат К., Хочедлингер К. (июнь 2007 г.). «Непосредственно перепрограммированные фибробласты демонстрируют глобальное эпигенетическое ремоделирование и широкое распространение ткани». Стволовая клетка . 1 (1): 55–70. DOI : 10.1016 / j.stem.2007.05.014 . PMID 18371336 .
^ Ю - J, Vodyanik М.А., Смуга-Отто К, Antosiewicz-Бурже - J, Frane ДЛ, Тянь S, Nie Дж, Jonsdottir Г.А., Ruotti В, Стюарт R, Slukvin II, Томсон JA (декабрь 2007). «Индуцированные линии плюрипотентных стволовых клеток, полученные из соматических клеток человека». Наука . 318 (5858): 1917–20. Bibcode : 2007Sci ... 318.1917Y . DOI : 10.1126 / science.1151526 . PMID 18029452 . S2CID 86129154 .
^ Ким JB, Zaehres Н, У G, Джентиле л, Ко К, Себастиано В, Araúzo-Bravo МДж, Ruau D, Хан DW, Zenke М, Шёлер кадров (июль 2008 г.). «Плюрипотентные стволовые клетки, индуцированные из взрослых нервных стволовых клеток путем перепрограммирования с двумя факторами». Природа . 454 (7204): 646–50. Bibcode : 2008Natur.454..646K . DOI : 10,1038 / природа07061 . PMID 18594515 . S2CID 4318637 .
^ Ким JB, Себастьяно V, Wu G, Араузо-Браво MJ, Sasse P, Gentile L, Ko K, Ruau D, Ehrich M, van den Boom D, Meyer J, Hübner K, Bernemann C, Ortmeier C, Zenke M, Флейшманн Б.К., Заерес Х., Schöler HR (февраль 2009 г.). «Oct4-индуцированная плюрипотентность во взрослых нервных стволовых клетках». Cell . 136 (3): 411–9. DOI : 10.1016 / j.cell.2009.01.023 . PMID 19203577 . S2CID 1630949 .
^ Накагава М, Коянаги М, Танабэ К., Такахаши К., Ичисака Т., Аой Т. и др. (Январь 2008 г.). «Создание индуцированных плюрипотентных стволовых клеток без Myc из фибробластов мыши и человека». Природа Биотехнологии . 26 (1): 101–6. DOI : 10.1038 / nbt1374 . PMID 18059259 . S2CID 1705950 .
^ Величко S, Адачи K, Ким К.П., Hou Y, МакКарти CM, Wu G, Шёлер HR (декабрь 2019). «Исключение Oct4 из коктейля Яманака раскрывает потенциал развития ИПСК» . Стволовая клетка . 25 (6): 737–753.e4. DOI : 10.1016 / j.stem.2019.10.002 . PMC 6900749 . PMID 31708402 .
^ а б Бен-Шушан Э, Томпсон Дж. Р., Гудас Л. Дж., Бергман Ю. (апрель 1998 г.). «Rex-1, ген, кодирующий фактор транскрипции, экспрессируемый в раннем эмбрионе, регулируется посредством связывания Oct-3/4 и Oct-6 с сайтом октамера и нового белка Rox-1, связывающегося с соседним сайтом» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (4): 1866–78. DOI : 10.1128 / mcb.18.4.1866 . PMC 121416 . PMID 9528758 .
^ Ли J, Go Y, Кан Я, Хан YM, Ким J (февраль 2010). «Oct-4 контролирует развитие клеточного цикла эмбриональных стволовых клеток» . Биохимический журнал . 426 (2): 171–81. DOI : 10.1042 / BJ20091439 . PMC 2825734 . PMID 19968627 .
↑ Fogarty NM, McCarthy A, Snijders KE, Powell BE, Kubikova N, Blakeley P, Lea R, Elder K, Wamaitha SE, Kim D, Maciulyte V, Kleinjung J, Kim JS, Wells D, Vallier L, Bertero A, Turner JM, Niakan KK (октябрь 2017 г.). «Редактирование генома показывает роль OCT4 в эмбриогенезе человека» . Природа . 550 (7674): 67–73. Bibcode : 2017Natur.550 ... 67F . DOI : 10.1038 / nature24033 . PMC 5815497 . PMID 28953884 .
^ Например:
Тай MH, Чанг CC, Kiupel M, Webster JD, Olson LK, Trosko J.E. (февраль 2005 г.). «Экспрессия Oct4 в стволовых клетках взрослого человека: доказательства в поддержку теории канцерогенеза стволовых клеток» . Канцерогенез . 26 (2): 495–502. DOI : 10.1093 / carcin / bgh321 . PMID 15513931 .
Ким Дж.Х., Джи М.К., Ли Си, Хан ТХ, Ким Б.С., Кан К.С., Кан С.К. (сентябрь 2009 г.). Мэй Л. (ред.). «Регулирование поведения стромальных клеток жировой ткани с помощью контроля экспрессии эндогенного Oct4» . PLOS ONE . 4 (9): e7166. Bibcode : 2009PLoSO ... 4.7166K . DOI : 10.1371 / journal.pone.0007166 . PMC 2747014 . PMID 19777066 .
^ Ленгнер CJ, Камарго FD, Hochedlinger K, Welstead GG, Zaidi S, Gokhale S, Scholer HR, Tomilin A, Jaenisch R (октябрь 2007 г.). «Экспрессия Oct4 не требуется для самообновления соматических стволовых клеток мыши» . Стволовая клетка . 1 (4): 403–15. DOI : 10.1016 / j.stem.2007.07.020 . PMC 2151746 . PMID 18159219 .
^ Ленгнер CJ, Welstead GG, Jaenisch R (март 2008). "Регулятор плюрипотентности Oct4: роль в соматических стволовых клетках?" . Клеточный цикл . 7 (6): 725–8. DOI : 10.4161 / cc.7.6.5573 . PMID 18239456 .
^ Zangrossi S, Marabese М, Broggini М, Джордано К, Д Эрасмо М, Montelatici Е, Intini Д, Нери А, Пеше М, Rebulla Р, Lazzari л (июль 2007 г.). «Экспрессия Oct-4 в дифференцированных клетках взрослого человека ставит под сомнение его роль в качестве маркера чистых стволовых клеток» . Стволовые клетки . 25 (7): 1675–80. DOI : 10.1634 / стволовые клетки.2006-0611 . PMID 17379765 . S2CID 23662657 .
^ Ким RJ, Nam JS (июнь 2011). «Экспрессия OCT4 усиливает характеристики раковых стволовых клеток в мышиной модели рака молочной железы» . Лабораторные исследования на животных . 27 (2): 147–52. DOI : 10.5625 / lar.2011.27.2.147 . PMC 3145994 . PMID 21826175 .
^ Атласи Y, Mowla SJ, Ziaee SA, Bahrami AR (апрель 2007). «OCT-4, маркер эмбриональных стволовых клеток, высоко экспрессируется при раке мочевого пузыря». Международный журнал рака . 120 (7): 1598–602. DOI : 10.1002 / ijc.22508 . PMID 17205510 . S2CID 23516214 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Ламури FM, Кроитору-Ламори Дж., Брю Б.Дж. (2006). «Недифференцированные мезенхимальные стволовые клетки мыши спонтанно экспрессируют маркеры нервных и стволовых клеток Oct-4 и Rex-1». Цитотерапия . 8 (3): 228–42. DOI : 10.1080 / 14653240600735875 . PMID 16793732 .
Hough SR, Clements I, Welch PJ, Wiederholt KA (июнь 2006 г.). «Дифференциация эмбриональных стволовых клеток мыши после подавления OCT4 и Nanog, опосредованного РНК-интерференцией» . Стволовые клетки . 24 (6): 1467–75. DOI : 10.1634 / стволовые клетки.2005-0475 . PMID 16456133 . S2CID 27609337 .
Feldman N, Gerson A, Fang J, Li E, Zhang Y, Shinkai Y, Cedar H, Bergman Y (февраль 2006 г.). «G9a-опосредованная необратимая эпигенетическая инактивация Oct-3/4 во время раннего эмбриогенеза». Природа клеточной биологии . 8 (2): 188–94. DOI : 10.1038 / ncb1353 . PMID 16415856 . S2CID 23740530 .
Джеррард Л., Чжао Д., Кларк А.Дж., Цуй В. (2005). «Стабильно трансфицированные клоны эмбриональных стволовых клеток человека экспрессируют OCT4-специфический зеленый флуоресцентный белок и поддерживают самообновление и плюрипотентность» . Стволовые клетки . 23 (1): 124–33. DOI : 10.1634 / стволовые клетки.2004-0102 . PMID 15625129 . S2CID 21603127 .
Ременьи А., Линс К., Ниссен Л.Дж., Рейнбольд Р., Шёлер Х.Р., Вильманнс М. (август 2003 г.). «Кристаллическая структура тройного комплекса POU / HMG / ДНК предполагает дифференциальную сборку Oct4 и Sox2 на двух энхансерах» . Гены и развитие . 17 (16): 2048–59. DOI : 10.1101 / gad.269303 . PMC 196258 . PMID 12923055 .
Schoorlemmer J, Kruijer W (декабрь 1991 г.). «Octamer-зависимая регуляция гена kFGF в эмбриональной карциноме и эмбриональных стволовых клетках». Механизмы развития . 36 (1–2): 75–86. DOI : 10.1016 / 0925-4773 (91) 90074-G . PMID 1723621 . S2CID 8353907 .
Вей Э., Лайонс Г.Э., Шефер Б.В. (март 1994 г.). «Ген домена POU человека, mPOU, экспрессируется в развивающемся головном мозге и в определенных тканях взрослого человека» . Европейский журнал биохимии . 220 (3): 753–62. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1994.tb18676.x . PMID 7908264 .
Кроу-Рой Б., Амаду С., Буиссу С., Клейтон Дж., Верне С., Рибушон М. Т., Понтаротти П. (май 1994 г.). «Локализация гена OTF3 в области человеческого МНС класса I с помощью физического и мейотического картирования». Геномика . 21 (1): 241–3. DOI : 10.1006 / geno.1994.1249 . PMID 8088794 .
Гийодо Т., Маттей М.Г., Депетрис Д., Ле Бутейлер П., Понтаротти П. (1993). «Гибридизация in situ локализует человеческий OTF3 на хромосоме 6p21.3 -> p22 и OTF3L на 12p13». Цитогенетика и клеточная генетика . 63 (4): 212–4. DOI : 10.1159 / 000133537 . PMID 8500351 .
Абдель-Рахман Б., Скрипач М., Рапполи Д., Пергамент Е. (октябрь 1995 г.). «Экспрессия генов, регулирующих транскрипцию, в человеческих доимплантационных эмбрионах». Репродукция человека . 10 (10): 2787–92. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.humrep.a135792 . PMID 8567814 .
Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E , Мур Б., Моррис М., Парсонс Дж., Прейндж С., Рифкин Л., Рольфинг Т., Шелленберг К., Бенто Соарес М., Тан Ф, Тьерри-Мег Дж., Треваскис Э., Андервуд К., Уолдман П., Уотерстон Р., Уилсон Р., Марра М (сентябрь 1996 г.). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком» . Геномные исследования . 6 (9): 807–28. DOI : 10.1101 / gr.6.9.807 . PMID 8889549 .
Инамото С., Сегил Н., Пан З. К., Кимура М., Рёдер Р. Г. (ноябрь 1997 г.). «Фактор сборки циклин-зависимой киназы-активирующей киназы (САК), MAT1, нацелен на и усиливает активность САК на доменах POU факторов транскрипции октамера» . Журнал биологической химии . 272 (47): 29852–8. DOI : 10.1074 / jbc.272.47.29852 . PMID 9368058 .
Николс Дж., Зевник Б., Анастассиадис К., Нива Х., Клеве-Небениус Д., Чемберс I, Шелер Х., Смит А. (октябрь 1998 г.). «Формирование плюрипотентных стволовых клеток в эмбрионе млекопитающих зависит от фактора транскрипции POU Oct4». Cell . 95 (3): 379–91. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81769-9 . PMID 9814708 . S2CID 12892299 .
Гонсалес М.И., Робинс Д.М. (март 2001 г.). «Oct-1 предпочтительно взаимодействует с рецептором андрогена ДНК-зависимым образом, что способствует привлечению SRC-1» . Журнал биологической химии . 276 (9): 6420–8. DOI : 10.1074 / jbc.M008689200 . PMID 11096094 .
Butteroni C, De Felici M, Schöler HR, Pesce M (декабрь 2000 г.). «Скрининг фагового дисплея показывает связь между специфическим для зародышевой линии фактором транскрипции Oct-4 и множественными клеточными белками». Журнал молекулярной биологии . 304 (4): 529–40. DOI : 10.1006 / jmbi.2000.4238 . PMID 11099378 .
Эзаши Т., Гош Д., Робертс Р.М. (декабрь 2001 г.). «Репрессия Ets-2-индуцированной трансактивации промотора тау-интерферона Oct-4» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (23): 7883–91. DOI : 10.1128 / MCB.21.23.7883-7891.2001 . PMC 99954 . PMID 11689681 .
Гуо Ю., Коста Р., Рэмси Х., Старнес Т., Вэнс Дж., Робертсон К., Келли М., Рейнболд Р., Шолер Г., Хромас Р. (март 2002 г.). «Факторы транскрипции эмбриональных стволовых клеток Oct-4 и FoxD3 взаимодействуют, регулируя экспрессию энтодермального промотора» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (6): 3663–7. Bibcode : 2002PNAS ... 99.3663G . DOI : 10.1073 / pnas.062041099 . PMC 122580 . PMID 11891324 .
Looijenga LH, Stoop H, de Leeuw HP, de Gouveia Brazao CA, Gillis AJ, van Roozendaal KE, van Zoelen EJ, Weber RF, Wolffenbuttel KP, van Dekken H, Honecker F, Bokemeyer C, Perlman EJ, Schneider JT, Kononen , Sauter G, Oosterhuis JW (май 2003 г.). «POU5F1 (OCT3 / 4) идентифицирует клетки с плюрипотентным потенциалом в опухолях человеческих половых клеток». Исследования рака . 63 (9): 2244–50. PMID 12727846 .
Ван П., Бранч DR, Бали М., Шульц Г.А., Госс П.Е., Джин Т. (октябрь 2003 г.). «Гомеодоменный белок OCT3 POU в качестве потенциального активатора транскрипции для фактора роста фибробластов-4 (FGF-4) в клетках рака молочной железы человека» . Биохимический журнал . 375 (Pt 1): 199–205. DOI : 10.1042 / BJ20030579 . PMC 1223663 . PMID 12841847 .
Ременьи А., Линс К., Ниссен Л.Дж., Рейнбольд Р., Шёлер Х.Р., Вильманнс М. (август 2003 г.). «Кристаллическая структура тройного комплекса POU / HMG / ДНК предполагает дифференциальную сборку Oct4 и Sox2 на двух энхансерах» . Гены и развитие . 17 (16): 2048–59. DOI : 10.1101 / gad.269303 . PMC 196258 . PMID 12923055 .
Rajpert-De Meyts E, Hanstein R, Jørgensen N, Graem N, Vogt PH, Skakkebaek NE (июнь 2004 г.). «Экспрессия развития POU5F1 (OCT-3/4) в нормальных и дисгенетических гонадах человека» . Репродукция человека . 19 (6): 1338–44. DOI : 10,1093 / humrep / deh265 . PMID 15105401 .
Матин М.М., Уолш-младший, Гокхале П.Дж., Дрейпер Дж.С., Бахрами А.Р., Мортон I, Мур HD, Эндрюс П.В. (2005). «Специфический нокдаун экспрессии Oct4 и бета2-микроглобулина посредством РНК-интерференции в человеческих эмбриональных стволовых клетках и клетках эмбриональной карциномы» . Стволовые клетки . 22 (5): 659–68. DOI : 10.1634 / стволовые клетки.22-5-659 . PMID 15342930 . S2CID 35018708 .
Баал Н., Райзингер К., Яр Х, Боле Р. М., Лян О, Мюнштедт К., Рао К. В., Прейсснер К. Т., Зигмунт М. Т. (октябрь 2004 г.). «Экспрессия фактора транскрипции Oct-4 и других эмбриональных генов в CD133-положительных клетках пуповинной крови человека». Тромбоз и гемостаз . 92 (4): 767–75. DOI : 10.1160 / TH04-02-0079 . PMID 15467907 .
Внешние ссылки [ править ]
Октябрь-4 + Транскрипция + Фактор в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
FactorBook POU5F1
Генерация iPS-клеток из MEFS посредством принудительной экспрессии Sox-2, Oct-4, c-Myc и Klf4
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другие
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
ШАПКА
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также дефицит фактора транскрипции / корегулятора