Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
PAPSS1
Белок PAPSS1 PDB 1x6v.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1X6V , 1XJQ , 1XNJ , 2OFW , 2OFX , 2PEY , 2PEZ , 2QJF

Идентификаторы
ПсевдонимыPAPSS1 , ATPSK1, PAPSS, SK1, 3'-фосфоаденозин 5'-фосфосульфатсинтаза 1
Внешние идентификаторыOMIM : 603262 MGI : 1330587 HomoloGene : 81740 GeneCards : PAPSS1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек) [1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение PAPSS1
Геномное расположение PAPSS1
Группа4q25Начинать107 590 276 п.н. [1]
Конец107 720 234 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 3 (мышь)
Chr.Хромосома 3 (мышь) [2]
Хромосома 3 (мышь)
Геномное расположение PAPSS1
Геномное расположение PAPSS1
Группа3 G3 | 3 61,05 смНачинать131 564 768 п.н. [2]
Конец131 643 671 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• трансферазной активности
• нуклеотид связывания
• нуклеотидилтрансфераза активность
• каталитическую активность
• связывание АТФ
• киназной активности
• Сульфат adenylyltransferase (АТФ) активность
• белок гомодимеризация активность
• adenylylsulfate активности киназы
Сотовый компонент• цитозоль
Биологический процесс• развитие скелетной системы
• метаболизм
• фосфорилирование
• ассимиляция сульфатов
• процесс биосинтеза 3'-фосфоаденозина 5'-фосфосульфата
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

9061

23971

Ансамбль

ENSG00000138801

ENSMUSG00000028032

UniProt

O43252

Q60967

RefSeq (мРНК)

NM_005443

NM_001289477
NM_001289478
NM_001289479
NM_011863

RefSeq (белок)

NP_005434

NP_001276406
NP_001276407
NP_001276408
NP_035993

Расположение (UCSC)Chr 4: 107,59 - 107,72 МбChr 3: 131,56 - 131,64 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Бифункциональные 3'-5'-phosphoadenosine phosphosulfate синтетазы 1 представляет собой фермент , который у человека кодируется PAPSS1 гена . [5] [6] [7]

Три прайм-phosphoadenosine 5-прайм-phosphosulfate ( PAPS ) является сульфат донор для всех ко - субстрат сульфотрансфераза (Sult) ферментов (Xu и др., 2000). SULT катализируют сульфатную конъюгацию многих эндогенных и экзогенных соединений, включая лекарства и другие ксенобиотики . У человека PAPS синтезируется из аденозин-5-прайм-трифосфата (ATP) и неорганического сульфата двумя изоформами, PAPSS1 и PAPSS2 (MIM 603005). [Поставляется OMIM] [7]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000138801 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028032 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Girard JP, Baekkevold ES, Амальрик F (май 1998). «Сульфатирование в венулах высокого эндотелия: клонирование и экспрессия синтетазы PAPS человека». FASEB J . 12 (7): 603–12. DOI : 10.1096 / fasebj.12.7.603 . PMID 9576487 . S2CID 19530341 .  
  6. ^ ul Haque MF, King LM, Krakow D, Cantor RM, Rusiniak ME, Swank RT, Superti-Furga A, Haque S, Abbas H, Ahmad W., Ahmad M, Cohn DH (октябрь 1998 г.). «Мутации в ортологичных генах при спондилоэпиметафизарной дисплазии человека и брахиморфной мыши». Нат Жене . 20 (2): 157–62. DOI : 10,1038 / 2458 . PMID 9771708 . S2CID 13108930 .  
  7. ^ a b «Ген Entrez: PAPSS1 3'-фосфоаденозин 5'-фосфосульфатсинтаза 1» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Венкатачалам К.В. (2004). «Человеческая 3'-фосфоаденозин 5'-фосфосульфат (PAPS) синтаза: биохимия, молекулярная биология и генетический дефицит» . IUBMB Life . 55 (1): 1–11. DOI : 10.1080 / 1521654031000072148 . PMID  12716056 . S2CID  37733913 .
  • Янагисава К., Сакакибара Ю., Суйко М. и др. (1998). «Клонирование кДНК, экспрессия и характеристика человеческого бифункционального фермента АТФ-сульфурилаза / аденозин-5'-фосфосульфаткиназа». Biosci. Biotechnol. Биохим . 62 (5): 1037–40. DOI : 10.1271 / bbb.62.1037 . PMID  9648242 .
  • Венкатачалам К.В., Акита Х., Стротт, Калифорния (1998). «Молекулярное клонирование, экспрессия и характеристика бифункциональной 3'-фосфоаденозин-5'-фосфосульфатсинтазы человека и ее функциональных доменов» . J. Biol. Chem . 273 (30): 19311–20. DOI : 10.1074 / jbc.273.30.19311 . PMID  9668121 .
  • Курима К., Варман М.Л., Кришнан С. и др. (1998). «Член семейства сульфат-активирующих ферментов вызывает брахиморфизм у мышей» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (15): 8681–5. DOI : 10.1073 / pnas.95.15.8681 . PMC  21136 . PMID  9671738 .
  • Венкатачалам К.В., Фуда Х., Кунин Е.В., Стротт CA (1999). «Сайт-выбранный мутагенез консервативного нуклеотидсвязывающего мотива HXGH, расположенного в домене АТФ-сульфурилазы бифункциональной 3'-фосфоаденозин-5'-фосфосульфатсинтазы человека» . J. Biol. Chem . 274 (5): 2601–4. DOI : 10.1074 / jbc.274.5.2601 . PMID  9915785 .
  • Бессет С., Винкур Дж. Б., Амальрик Ф, Жирар Дж. П. (2000). «Ядерная локализация синтетазы 1 PAPS: путь активации сульфата в ядре эукариотических клеток». FASEB J . 14 (2): 345–54. DOI : 10.1096 / fasebj.14.2.345 . PMID  10657990 . S2CID  9024784 .
  • Xu ZH, Otterness DM, Freimuth RR, et al. (2000). «Человеческая 3'-фосфоаденозин-5'-фосфосульфатсинтетаза 1 (PAPSS1) и PAPSS2: клонирование генов, характеристика и хромосомная локализация». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 268 (2): 437–44. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.2123 . PMID  10679223 .
  • Fuda H, Shimizu C, Lee YC и др. (2002). «Характеристика и экспрессия человеческих бифункциональных изоформ 3'-фосфоаденозин-5'-фосфосульфатсинтазы» . Биохим. Дж . 365 (Pt 2): 497–504. DOI : 10.1042 / BJ20020044 . PMC  1222679 . PMID  11931637 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Харджес С., Шейдиг А., Байер П. (2004). «Экспрессия, очистка и кристаллизация человеческой 3'-фосфоаденозин-5'-фосфосульфат синтетазы 1». Acta Crystallogr. D . 60 (Pt 2): 350–2. DOI : 10.1107 / S0907444903027628 . PMID  14747722 .
  • Лэнсдон Э.Б., Фишер А.Дж., Сегель И.Х. (2004). «Человеческая 3'-фосфоаденозин-5'-фосфосульфатсинтетаза (изоформа 1, мозг): кинетические свойства доменов аденозинтрифосфатсульфурилазы и аденозин-5'-фосфосульфаткиназы». Биохимия . 43 (14): 4356–65. DOI : 10.1021 / bi049827m . PMID  15065880 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Харджес С., Байер П., Шейдиг А.Дж. (2005). «Кристаллическая структура синтетазы 1 человека PAPS показывает асимметрию в связывании субстрата». J. Mol. Биол . 347 (3): 623–35. DOI : 10.1016 / j.jmb.2005.01.005 . PMID  15755455 .
  • Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Cell . 122 (6): 957–68. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID  16169070 . S2CID  8235923 .
  • Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Genome Res . 16 (1): 55–65. DOI : 10.1101 / gr.4039406 . PMC  1356129 . PMID  16344560 .
  • Секулич Н., Конрад М., Лави А. (2007). «Структурный механизм субстратного ингибирования аденозин-5'-фосфосульфаткиназы домена 3'-фосфоаденозин-5'-фосфосульфатсинтетазы 1 человека и его разветвления для регуляции ферментов» . J. Biol. Chem . 282 (30): 22112–21. DOI : 10.1074 / jbc.M701713200 . PMID  17540769 .


  • v
  • т
  • е